KEGG   Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_2001p1
Entry
Kpol_2001p1       CDS       T01049                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14550  U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
vpo  Vanderwaltozyma polyspora
Pathway
vpo03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vpo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    Kpol_2001p1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:vpo03009]
    Kpol_2001p1
Ribosome biogenesis [BR:vpo03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    Kpol_2001p1
SSDB
Motif
Pfam: BP28CT U3snoRNP10 HEAT_HEATR1 HEAT_2 ARM_ARMC5 HEAT mTOR_dom HEAT_EF3_N HHD_RTEL1 EDC4_C EFR3_ARM
Other DBs
NCBI-GeneID: 5546790
NCBI-ProteinID: XP_001646359
UniProt: A7TGN8
LinkDB
AA seq 1768 aa
MSSLKDQLAQVAQSNSTVALDRKRRQKLHSASLIYNTKTAATQDYDFIYESALKALDELI
EIEPKFKVFQKTLFSETSMAIDRNVQTKDEIKDLDNAIFGFLMLASSKWQLTPTLYATEW
LVRRFQIHILNSEILLLSTLNFYQSPIFKRILDIVKLPPLFNPLSTFVRSDKNPSNMTIV
KLFNDNDFIKLYTNYLSKCIKHHMTYTNQLLFTTCCFINLIAFNSNNEEKLNQLIPILLE
VSAKLLASNSTDCQIAAHTTLVVLATSIQLNKNIILAAVETILSGLENADATKSALVAIC
KLFQTMKGTGNVDHLPMKLYKLFNNKYSLDNLIELLSTSDSPKADKFITCYLRAITRFDH
PKLTSVVKLLKAVTLEKFEVRLIITDLIHLSEIMEDKSNLIDVFTYFISINEDLVISCLK
SLNLTPDLFEIRLTTSLFKSNILNENTDATQLESEKIMGKNNKSVTFKAFLAKNSQFINT
SAKSMLVESDEKYCKLLSLFVESVGKGYPSGQFLTSFITTVEARMTFLLRIIVSPAAPTT
LRLIALTNISKYMSNIDKDSNVFTFVPCLLCALNDVSKNVRSNVKKILSQISKRPFTKHY
FLQNEIYGENNEIPMLSPKDGEAWLNKFLSDYVDDNYDISHLIIPKKNDTMYLVFWANQA
LFMPLPYPKMVLLNYLNKQGKASAFSNIFEPFMKTYLENRKTWVERCIANKTDIDQFESS
IADVISSKEKHQFMIDFIINVLNSEHESLANIIIARLIKVFTSLKFNHQLKIVETIVEAT
ISPEANYDAVAILQSLPLSTEIFISILKENKINSDSEIADFTKRRRRRSSTNKNALQKEE
VSLLAELHLRKITSILETLDKAKVTGSDVLLSHLFSILSDLETLGEDGGLPVLYAEETLA
SCMLNTIQSLKDNGISKLSNVRADVLISVIRSSQSPQVQNKLLLVVGSLATLSPETTLHS
VMPIFTFMGAHIIRQDNEFTASVVEKTILTIVPALLESNPANLRDEIEFLLITFTTALQH
VPKHRRVKLYSTLVQALGPNIAIAPFLFLVSQQYSNNVATFKLGEAKAFVEFTKSFMANF
DAIDQLNGINEFFKLIHSLMVESNVTERNAKFESRALFTNGILNFTDSEMLLFFKNAINF
VNNVIKENYMDYYDINASLKVRIYSMLLDVRTDGDIIKSVKSNFASVISSIIILVKEVNL
SIGHTSVEANESSSEVETTDYKVDTKSVLLEVLGNFMTILPIDDFIDSVLPLLESTTNED
VRYHVTLSISKKFESEPLDAVDAATKTINVLLDRVKVEENSVNILQVTLNSVSTLVAKFG
DKLDNSLINRILAIGTSYLSSDEKANLVSSITLITNSVQVLGIKAISFYPKIVRPILKIF
KEIREDKTLFLRHQLQLSILLLFAALIKRLPSFLNSNLYELFEVIFYSDEVEVTTRLSVI
SLVVENMDKKEILRTLNKIWNNSVCKSEDSIAISLFLSCLESTTDVIEKKVASTQSPVFF
KLLLSLFEYRSISSFDNNTISKIEATVHKIVNTYVLKLNDKVFRPLFVIVINWAFEAEGV
VNKNITEVERLTAFFKFFGKLQENLKGIITSYFTYLLEPTNTLLKRFISKDIADVNLQRL
VLISLTSSFRYDKDEYWNSTSRFELISESLVDQLTVIENVIGKYLSKAISSLTAKNSKVE
EHNKIMLKLLVNHMKSTCDSNEKLWAIRSLKLIYSKVGENWLVLLPQLVPTIAELLEDED
EEVEYEVRTGLVKVVENVLGEPFDRYLS
NT seq 5307 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcatcgttgaaagatcaattggctcaagtggcccagtcaaactctactgtagctttg
gatagaaaaagaagacaaaagttacattcggcttctctgatctataatacaaaaactgct
gccactcaagactacgatttcatttatgaatctgctctaaaggccctcgatgaattgata
gaaatagaaccaaaatttaaagtatttcaaaaaactctgttttctgaaacttcaatggca
attgatagaaatgttcaaacaaaagatgaaattaaagatttagataacgccatctttggt
ttcttgatgttagcctcttcaaaatggcagttgaccccaactttgtacgctacagaatgg
ttggttcgtcgtttccaaattcacatcttgaattcagaaattttgttattatcaacttta
aatttttaccaatcaccaatattcaaaagaattctagatatcgtcaagttgcctcctctt
ttcaaccctttgtcgacttttgtaagatcagataaaaacccttctaacatgacaattgtc
aaattgttcaacgacaatgatttcatcaagttatacacaaattatttaagtaaatgtatt
aaacatcatatgacttacacaaatcaattattgtttactacttgttgtttcatcaacttg
attgcattcaattcaaacaatgaagaaaagttaaaccaattgattcctatcttattagaa
gtatccgcaaaattattggcttcaaactcaaccgattgtcaaattgcggcacataccaca
ttagtcgtgttggctacttctatccaattgaataaaaatattattttagctgccgttgaa
actattttatcaggtttggaaaatgctgacgctacaaagtctgccttagttgcaatttgt
aaattattccaaactatgaagggtactggcaacgtcgatcatttaccaatgaaattatac
aagctatttaacaacaaatattccttggataatttgatcgaattattgtcaacttcagat
tctccaaaagctgataaatttatcacttgttatctaagggctattacaagattcgaccat
ccaaaattgacatctgttgtgaaattgttaaaagctgtcactttagaaaagtttgaagtt
agattgattatcactgatctaattcatttatctgaaattatggaagacaaatctaatttg
atagatgtgttcacttacttcatctcaattaatgaagatttggtcataagctgtttgaaa
tctttgaatctaacaccagatttgttcgaaattagattgactacctctttattcaaatca
aatatattgaatgaaaatacagatgctactcaacttgaatcagaaaaaatcatgggtaag
aataataaatctgtaacatttaaagctttcttagctaagaattcccaatttataaacact
agtgcaaaatctatgttggttgaatcagatgaaaaatactgcaagttactttctttattt
gtagaatccgttggtaaaggctatccatcaggtcaatttttgacttctttcatcactact
gttgaagcaagaatgacattcttattaagaatcattgtttcaccagctgcgccaactact
ttacgtttgatcgcattaacaaatatttcaaagtacatgagcaacattgataaagattca
aatgtcttcacatttgtaccatgtttgttgtgtgccttaaacgatgtatctaaaaatgtt
agaagtaatgtaaagaagattctatcacaaatctctaagagaccttttacaaaacattat
ttcctacaaaacgaaatttatggagaaaataatgagataccaatgttatctccaaaggat
ggtgaagcttggctaaacaaatttctatctgattatgtcgatgataattatgatatttct
catttaattattccaaagaaaaatgatacaatgtacttagtattttgggcaaaccaagct
ttatttatgccattaccttatccaaaaatggttttattgaactatttaaataaacaaggt
aaagcttcagcattttcaaatatttttgaaccatttatgaaaacatatttggaaaataga
aagacttgggttgagagatgtattgccaataaaacagatattgatcaattcgaatcatca
attgcagatgtcattagttcaaaagaaaaacaccagtttatgattgattttatcataaat
gtattgaattcagaacatgaatccctagccaatatcattatagcaagattaatcaaagtc
tttacttctttaaaatttaatcatcagctaaaaattgtggaaactattgttgaagctact
atttctccagaagcaaactacgatgctgttgcaattttacaatcacttccattatcaact
gaaatattcatttctattttaaaggaaaataaaattaactcagatagtgaaatcgcagac
ttcactaaaagaagaagaagacgttcttcaactaataagaatgcgctacaaaaggaagaa
gtttccttacttgcagaacttcatttaagaaagattacttcgattttggagactctagat
aaggctaaggttactggttctgatgttttgctttcacatttattttctattctatcagat
ttagaaacattaggtgaagatggtggtttaccagttttgtatgctgaggagacattagca
tcttgtatgttgaacactatccaatccttaaaggacaatggtatttctaaattgtccaac
gtaagagctgatgtgttgatttcagttattagaagttcccaatcacctcaagttcaaaat
aagctattattagtggttggatctttggctacattatcaccagaaactactttgcattct
gttatgccgattttcacatttatgggggcacatatcattcgtcaagataatgaatttact
gcaagtgtcgttgaaaaaaccattttaactatagttccagccttgttggagtctaaccct
gctaatttgagggatgagattgaattcttgttaattactttcacaacagcattgcaacac
gtaccaaaacatagaagagtcaagctgtattcgacattggttcaagcacttggaccaaat
attgccattgcaccatttttgtttttagtttctcaacagtactctaataatgttgctacc
tttaaactgggtgaagctaaggcttttgttgagtttactaaatcattcatggctaacttt
gatgcaattgatcaactaaatggtataaatgaattcttcaaattaatccactcattgatg
gttgaatctaatgtaactgaaagaaatgctaaatttgagtcaagagcattgtttaccaat
ggtattttaaatttcactgattcagaaatgcttttgttcttcaagaatgctattaacttt
gtcaataatgtaatcaaagaaaattatatggattactatgatattaatgcaagtttgaag
gttagaatttattctatgctgttagatgttagaacagatggagatatcattaaatctgtc
aaatcaaactttgcatctgtgatttcttctattataatattggtcaaggaagttaaccta
tcaattgggcatacatcagttgaagctaatgaatcttcatctgaagttgaaacgacggat
tataaagtggatactaagtctgttttattggaagttttgggtaatttcatgaccattcta
ccaatagatgacttcattgattctgttcttccattgttagaatcaacaactaatgaagat
gttagatatcatgtgacactatctatttccaagaagttcgaatcagaacctctcgacgca
gttgatgcagctactaagacaattaatgtattgttagatagggttaaagtcgaggaaaac
tctgtaaacatccttcaagttacattgaattcagtttcaacattggttgcgaaatttggt
gacaagcttgataattcattgataaaccgtattctagctataggtacatcctatttatct
tctgatgaaaaagccaatttggtttcttccataacattgattacaaatagtgttcaagta
ttaggtatcaaagccatttcattctatccaaagattgttcgaccaattctaaaaatattt
aaagaaattagagaggataagacattattcttgagacatcaattgcaattatcaatattg
ttgttgtttgccgccttgattaaacgtttaccaagctttttgaattctaatttgtacgaa
ctattcgaagtcatcttttattctgatgaagtagaggtaactactagattgtcagtaatt
tccttagttgtggaaaacatggataagaaagaaatcttgagaacgttgaataagatatgg
aacaatagtgtctgtaaaagtgaagattcaattgcgatttcattgttcttaagttgttta
gaatctactactgatgtaattgagaagaaagtcgcatctacacaatctccggttttcttc
aaattattgttatcattatttgaatacagatctatttctagttttgataacaacacaatc
agcaaaattgaagcaactgtgcacaagattgttaacacctatgttttgaaattgaatgac
aaagtatttagaccattgtttgtcattgttattaactgggcatttgaagctgaaggtgtt
gtcaataaaaatattactgaagttgaaagattgacagcattctttaaattttttggtaaa
ttacaagaaaatttgaaaggtatcattacctcttacttcacctatcttcttgaaccaacc
aatacacttttgaaaagattcatttccaaggacatcgccgatgtgaacttgcaacgtttg
gttttaatatctttaacttcctcatttagatatgataaagatgaatattggaactctact
tcaagatttgaattaattagtgaatctttagttgatcaattgacagttattgaaaatgtc
atcggtaaatacttgtccaaggccatcagttcgcttacagctaagaacagtaaagttgag
gaacacaataagattatgttgaaattattggttaaccatatgaaatccacttgtgactca
aatgaaaagttgtgggcaattagatctttgaaattgatatattctaaggtaggtgaaaac
tggctagtactattgcctcaacttgttccaacaatcgctgaattattggaagatgaagat
gaagaagtcgaatacgaagtaagaactggtctagtcaaggtcgtcgagaatgttctggga
gaaccatttgatagatatttaagctga

DBGET integrated database retrieval system