Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_286p2
Help
Entry
Kpol_286p2 CDS
T01049
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
vpo
Vanderwaltozyma polyspora
Pathway
vpo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
Kpol_286p2
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Kpol_286p2
03041 Spliceosome [BR:
vpo03041
]
Kpol_286p2
Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
Kpol_286p2
Spliceosome [BR:
vpo03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
Kpol_286p2
Complex C
Kpol_286p2
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_PRP39_C
HAT_Syf1_M
HAT_PRP39_N
TPR_8
TPR_14
TPR_2
TPR_1
NRDE-2
Cas6b_C
TPR_MalT
TPR_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5542512
NCBI-ProteinID:
XP_001642367
UniProt:
A7TT96
LinkDB
All DBs
AA seq
840 aa
AA seq
DB search
MSSFPLNEEDLVFEYQLLKEPGNLIHWKRYLDVYIQQYKNLNSNDSKYKEDKRLLLSKIV
WLYKRIISQFPKDVNSYFEFVSFLYNCCDSNTKLQRLMLHYMVETLIPKLLQNGKNDKKL
QPFLLNLLNWTIATKDSYLIWKMLDYSLSLNSQFHSTVWKPVLSYVKENLNESILDNDMS
LKFYTNVLRRYLIVCPKNLDQIIYWLELIYKTKDFEIIKEVYDQYLHFDNYNMLKRKISS
LPFQLLENYMYTLHELSLDDQYLSMLENLTRDYSADDEHYFEIVELLSNQYIKLSNMKKF
NDLLRSQLKTAKSLQYWIKIYNLYLTLLQNWLNDILTIESRTDSNDNINENIEIYKNLII
HKDLMLSDFKISQNPNLIDNWFQKINSIDKLSGISSIEKLTMKFEVYANAIETINESFTS
LMPGDLGKLWCNYANLYWENNDFDSARTVYNTAIKVPFPFLKDLEDIWLNWSENEFSLSN
GDPSLSIKILERALSVEGNPELLFEKFKENKSLNHDKKSLIPSQTVLFTSLKLWSFYLDL
LESLYIDGCDSKTIESIIKAYERSITLKAATPLTFINYAHFLQKVNKIMESFQVYQRALS
SFPPSTQYFIWSTYLNEVIEQTTELSNEHVRELFDQSLSTLKTNNINCTTIVCMYSNFEE
TKMHMYKRSVDIIFNTLNECDSSTSPFSLELKDKISLWDLAIEKTRKLLGTMSLRPIYEK
CILSLPNSRVIPYIINFCKVEEELNEIYRAREILTFGSKLLPPSKNEDLWNYWDKFELNH
GDKSTYKEMLKLKKTLEDEMVIDTEEITKDEDKVQFIQSSTKPIKDRDEKLNPDELELDL
NT seq
2523 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagcttccctttaaatgaagaagatttggtttttgaatatcagcttttaaaggaa
ccaggaaatttaattcattggaaaagatatctagacgtatatattcaacaatacaaaaat
ttgaattctaatgatagtaaatataaagaagataaacgccttttattgagtaaaatcgtt
tggttatacaaaagaattatctcacaattcccaaaagatgttaattcatattttgaattt
gtttcatttttatataattgttgcgattcaaatacaaaattacaaagacttatgctacat
tatatggtagaaaccttaataccaaagttattgcaaaatggaaaaaatgataaaaagtta
caaccttttttgttaaacttattaaactggacaattgctacaaaggattcatatttgatt
tggaaaatgttagattattctctatctttaaattcacagttccattcaactgtttggaaa
cctgtattatcatacgttaaggaaaatttaaatgaaagcatcttggataatgatatgtcg
ttaaaattctatacaaatgtcttgagacgttacttaatcgtatgtccaaaaaatctagat
cagatcatatattggttggaattaatttataaaacaaaggattttgaaattattaaagaa
gtttatgatcaatatttacattttgacaattataatatgttgaaaagaaagatttcttct
ttaccttttcaacttttagaaaattatatgtataccctacatgaattatcattggacgac
caatatctttccatgttagaaaacttaacgagggattactcggcggatgatgaacattac
tttgaaattgtcgaattgttatctaatcaatatataaaattgtcaaatatgaaaaaattt
aacgacctactacggtcacaattaaagacagctaaatctttacaatactggatcaagatt
tataacttatacttaacccttttgcaaaattggttaaacgatatacttacaattgaatct
agaactgactctaatgataacataaatgagaacattgaaatttataaaaaccttattatt
cataaggatctgatgttatccgattttaaaataagtcaaaatccgaatttaattgataat
tggttccaaaaaatcaattcaattgataaactatcaggaattagttcaattgaaaagtta
accatgaagtttgaagtatatgctaatgcaattgaaactataaatgaaagttttacttcc
ctgatgcctggtgatttaggcaaattgtggtgcaattatgctaatctatattgggaaaat
aatgattttgattcagcaagaactgtttataataccgcaatcaaagttcctttcccattc
ttaaaagatttggaagatatttggttgaattggtcagagaatgaattctcattaagtaat
ggcgatccatctctttcaataaagatactagagcgtgcccttagcgtagaaggaaatcca
gagttactatttgaaaaatttaaggaaaataagtcattaaatcatgacaaaaaatctcta
ataccgtcacagactgttttgtttacttcactaaaactttggtcattttatttggatctt
ttagaatctttatacattgatgggtgtgattctaaaacaattgagtcgataataaaagca
tacgagagatcgataacactaaaagctgctacaccattgacttttatcaactatgctcat
tttttacaaaaagttaataagataatggaaagctttcaagtctatcaaagggccttaagt
tctttccctccaagtacccagtattttatttggtctacatatttaaatgaagtgatagag
caaactacagaattatcaaatgagcatgtccgtgagttatttgatcaatcgttgtctaca
ttaaagacaaacaatatcaattgtaccacaatagtatgtatgtatagcaattttgaggag
acaaaaatgcatatgtataaaaggagtgttgatataattttcaatacattaaatgaatgc
gattcctcgacatcacctttctcattagaattgaaagataagatttctctatgggatttg
gctattgaaaagactagaaaactattaggtacaatgtccttaagacctatttatgaaaaa
tgtatcctatctttaccaaattcgagggttatcccatatattattaatttttgtaaagtt
gaagaggaattgaatgaaatttatcgtgccagagaaatattaacatttggatcaaagcta
ttaccgccaagcaaaaatgaagacttatggaattattgggataaatttgaattgaatcat
ggtgataaatcaacttataaagaaatgttaaaactgaagaaaactttggaagacgaaatg
gttatagatacagaagaaataacaaaggatgaagataaagttcaattcattcaatcttca
actaaaccgattaaagatcgtgatgaaaaattaaatcctgatgagttggaattagattta
taa
DBGET
integrated database retrieval system
