Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_541p23
Help
Entry
Kpol_541p23 CDS
T01049
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14533
ribonuclease P protein component, mitochondrial [EC:
3.1.26.5
]
Organism
vpo
Vanderwaltozyma polyspora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
vpo03016
]
Kpol_541p23
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
vpo03029
]
Kpol_541p23
Enzymes [BR:
vpo01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.26 Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.26.5 ribonuclease P
Kpol_541p23
Transfer RNA biogenesis [BR:
vpo03016
]
Eukaryotic type
5'processing factors
Ribonucrease P
Kpol_541p23
Mitochondrial biogenesis [BR:
vpo03029
]
Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
Mitochondrial transcription and translation factors
Mitochondrial ribonuclease P
Kpol_541p23
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RPM2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5546029
NCBI-ProteinID:
XP_001645638
UniProt:
A7TIW8
LinkDB
All DBs
AA seq
1266 aa
AA seq
DB search
MMFKSIKNNRFASIKKFHNCSIRFNRKNFIVTNSNDFTFFFNDNVKYKRRRNHRFDNDND
FDYDFYNLIIRKFYFKNNNINPFNNNNNFVPILLTSDNDHFNNKNLKFYCNKKNYIHSNL
RNNSSGIDRFHNNLIKIKRRRKLLLSSNLKNNTIRYYQNNNIHLTKSKFFINKRNFHSNS
IIKNNEDKTIINDQINDLTNNTNNNNDSTINNINNDFPWEKDNEESLNKDTYLKAHMDSI
DKAFIKKDYNIINALYQSLKRNDCVPSIETYYKILYSIAHRDLDSDDINYKMFQILSCYE
DIIIKNKLKPTDEIYSVLLENLFKGSIISYENNNYKNGLDFFKIALNIFLQVYENHNLSN
DKVIKNFLISINYYPGNISFLQINQVFNKFNYKIEDNYKIYFQTLLNYSILINDEASFDL
LHKEFTIFSENNCIDNSFDYSIWQLIISGLIEIKQDFTLSTSILNLKLEESKSRDSTRVD
LSHLVSNYLISISKSNPSKSHTLWLAFKKLNWLPEFDYNFYLKMILNSKNNWNLTKMYYN
YIYPMKLSSSKIKIEGTSSNNLLKLPQSNDIQSTVDLNTIHDYLILKSIQSNDSEMVFKL
IQESLVKNLKFSYLNTYNEALNFLKERKYPIDSTINFIELHSTLICDSSKNQLNELNFNS
FVNASLSMFIDNHKFLVKFVESATFSNYCQSANLLDLTTITLLSTILKSVMGKSSDSIDS
YPTFLKLYSIFVMKFAELTLHDNSYEISQMELLNTFKSRIIENHCQLVQHYYDLNLNPRY
LPSEVLQSLSLSNFSKEIIDFYNGINYDTESLNSKVLCYGTIIRNSPDKGVIEFKKLLNK
GSSFDYDTYYTILSDKDLVKKVPVNQVIKNAIQACPTDSKCMEKLINTILFNANDNVLES
IFLDETMIRSHFVPYVNEINLSNLIQYSSREGGDFNSFLKMISFPERFSNIKNQTVYKSS
ISKIYNILFEKGQFGQISEYNNILPVLQLDLLLKSFIYNNDGEKFVSYFTSYEEQLSSKS
KVELKLEHSLFEGRKDKSIKLVQDAIKRKQLSVSDIADLRSLLGFVQCMNDNIKMTEDAI
ESEKPKNILQLSNLLCSKSDSYSNMVSIYQEYSHLTDNDQLLKAMLGRFIWYSRICTATP
NFEHKNLDRSMKNFLRFKCYLKKPLIYQSDLEKIIQIWTKVNTAMVDALLNNMIESLYLN
PETDILYLNNSLSYKFNKSSLKDLVQSLKLHYEENSLHNELTIKIDKSLRFINENLQQKN
IAFNLI
NT seq
3801 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtttaaatctattaaaaataatagatttgcctcaattaaaaaatttcacaattgt
tcaataagatttaacagaaaaaactttattgtaactaattcaaacgattttacctttttt
ttcaacgataacgtaaaatataaaagaagaagaaaccatagattcgataatgataacgat
tttgattacgacttttacaatttaattattagaaaattctattttaaaaataataatatc
aatccctttaataataacaataatttcgtacctattttattgacatcagataatgaccat
tttaacaacaaaaatttgaaattttattgtaataaaaaaaattatatccatagtaatcta
cgtaacaactcaagtggtattgacagatttcataacaatttaattaaaataaaaagaaga
agaaaattattgttatcttcaaatttaaaaaataacactattcgttactatcaaaataat
aatattcatttaacgaaaagtaagttctttattaataaaagaaattttcattctaattct
atcattaaaaataatgaggataaaactataattaatgaccaaattaacgacttgactaat
aataccaataataataatgacagtacaattaataatattaataatgatttcccttgggaa
aaagacaatgaagaatctcttaataaagacacttacttaaaagctcatatggactctatc
gacaaagcctttatcaaaaaggattataacattatcaatgccttataccaatctttgaaa
agaaatgattgcgtcccttcaattgaaacctattacaaaattctatattcaatcgctcat
cgtgatctagattcagatgatatcaattataaaatgttccaaattttatcttgttatgaa
gatattattattaaaaataaattaaagccaacagatgaaatttatagcgttcttttagaa
aatttatttaaaggttcaatcatttcttatgaaaataacaactataaaaatggcttggac
tttttcaaaatcgctttaaatatttttttacaagtttacgaaaatcataatttatcaaat
gataaggttatcaagaatttcctaatttctatcaattattatcctggtaatattagcttt
cttcaaattaatcaagtcttcaataaatttaattataaaatcgaagacaattataaaata
tacttccagactttgttgaattattccatcttaattaatgatgaggcttcttttgatctt
cttcataaagaatttacaatttttagtgaaaataactgcatagataactcttttgactat
tcaatatggcagttaatcatatctggtttaattgagatcaaacaggattttactttatca
acaagtattttgaacttaaaattagaagaatcaaaatctagggacagcacgagagtagat
ctatctcatttagtttcaaactacttgatatcaatctctaagtcaaatccatctaaatct
catactctatggctagcctttaagaaattgaattggttgccagaatttgattataacttt
tatttgaagatgattctaaattcaaaaaataattggaatttaacaaaaatgtattataat
tacatttatccaatgaaattgagttcttctaaaattaaaattgaaggcacatcctcaaac
aatttattgaaattacctcaatccaatgatattcagtccaccgttgatctaaatacaatt
catgattatttgatactgaaatcgattcaatcaaacgatagtgaaatggttttcaagcta
attcaggaatcattagttaaaaatttgaagtttagttatctgaatacctacaatgaggct
ctaaattttttgaaagaaaggaaatatcctattgattctacgataaattttatcgaatta
cactcgacactaatttgcgattcttcaaagaaccaactgaatgagctaaacttcaattca
tttgtcaacgcatcattatcaatgtttattgataaccataagtttttggtgaagtttgta
gaaagtgctactttctcaaactattgccaatcagcaaatctgttagacttaacaacgata
actcttctaagtactattctcaaaagcgtcatgggtaaatcatctgattctatagatagt
tatccaacctttcttaaattgtattccatttttgttatgaagtttgcagagcttacttta
catgataactcatacgagattagtcaaatggagcttttgaatacttttaaatccagaatt
attgaaaaccattgccaactagttcaacattattatgatttaaaccttaacccaagatac
ttaccttctgaagttttgcaatcattatcattatcgaatttttcaaaggagataatcgac
ttttataacggtattaattatgatacagagtccctaaactcgaaggtattgtgttatggt
acaataataagaaattcaccagataaaggagtcattgagttcaagaaattactaaacaaa
ggttcttcgtttgattacgatacttattatactatcctgtcagataaggatttggtcaaa
aaagtaccagttaatcaagttataaagaatgccatccaagcgtgcccaactgacagcaaa
tgtatggaaaagttaattaataccatcttgtttaatgccaatgacaacgttttagaatcg
atctttttggatgaaacaatgattagaagtcattttgtaccttacgtgaacgaaataaat
ttatccaatcttattcaatattcatcgagggaaggaggtgatttcaatagttttttgaag
atgataagttttcctgaaaggttttccaatattaagaatcaaacagtatacaaatcatcg
atttctaaaatctacaatatattgtttgaaaagggtcaattcggtcaaatttctgagtat
aataatatattaccagttttgcaacttgatttgttattgaagtcatttatttataacaat
gacggtgaaaaatttgtctcatactttaccagttatgaggaacagcttagttctaaatca
aaagttgaattaaagctcgagcattcattatttgaaggaaggaaggacaaatctattaaa
ttagtccaagacgccatcaaaaggaaacaattgagcgtaagtgacatcgctgatcttcga
agcttgcttggcttcgttcaatgtatgaatgacaatattaagatgacagaagatgctata
gaatctgagaagccaaaaaacattctgcaactttcaaatttgttgtgcagtaagtctgat
agttactcaaacatggtttctatttatcaggaatacagccatttaaccgacaatgaccag
ttattaaaggcaatgttgggaagatttatatggtactcaaggatatgcactgccactcct
aattttgaacacaaaaatttagatagaagcatgaaaaacttcttgagatttaaatgctat
ctaaaaaaacctttaatttatcagtctgatttagaaaaaattattcaaatatggaccaaa
gttaatacagcaatggtagatgcattgcttaataacatgatagaatcattatatttaaac
ccagaaaccgatatattatatttgaacaatagcttgagttataaattcaataagagctct
ttaaaggatttagtacaatcacttaaattgcattacgaagaaaattcattacataatgaa
ttaacgataaaaattgataaatctctgcgatttattaatgaaaatttacaacaaaaaaat
atagcatttaatttaatataa
DBGET
integrated database retrieval system