Entry |
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Name |
(RefSeq) DNA repair and recombination protein RAD54B-like
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KO |
K10877 | DNA repair and recombination protein RAD54B [EC:5.6.2.-] |
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Organism |
vps Vespula pensylvanica (western yellowjacket)
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Pathway |
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Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:vps00001]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
122632132
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:vps03400]
122632132
DNA repair and recombination proteins [BR:vps03400]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Rad54 family proteins
122632132
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SSDB |
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Motif |
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Other DBs |
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LinkDB |
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Position |
9:complement(2012308..2015837)
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AA seq |
813 aa
MSHKNNEEVDSLNNSVRSTSRVLSFFNKSKEVIIHNEVKNDSVILECDPELNTINKNERS
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MKIIEQFNSKTDDSKIFLLSAKAGGIGLNLPGASRLILFDSDWNPASDAQAMARIWRHGQ
KKSVYIYRLLMSGTIEEKIYQRQISKTNLSEVVVDANNLSSLKLSSSELKDLFTLTLNTD
SLTHDLMNCTCCDEVILNELSDECDDINKKEYTKNIIKKKQSQQNLTINQLLDWQHYRKP
FADNMMQELMLKQVSKHISFIFKNTITEKYESI |
NT seq |
2442 nt +upstreamnt +downstreamnt
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