Vespula pensylvanica (western yellowjacket): 122633479
Help
Entry
122633479 CDS
T07720
Name
(RefSeq) sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1-like isoform X1
KO
K24469
sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1
Organism
vps
Vespula pensylvanica (western yellowjacket)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
vps04990
]
122633479
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
vps04990
]
EGF-like domain-containing proteins
hEGF domain-containing proteins
122633479
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sushi
VWA
Pentaxin
HYR
Ephrin_rec_like
EGF
Laminin_G_3
VWA_2
EGF_TEN
hEGF
EGF_2
EGF_3
Laminin_G_2
DUF1194
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122633479
NCBI-ProteinID:
XP_043677340
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(4531903..4542465)
Genome browser
AA seq
2224 aa
AA seq
DB search
MIKMLMSYWRIFLLINGASFLFAKYSNISEFRSSDTFKIRTTDDIDLISTTWNHGKEENN
NNQYLHHSFESNSKMIRRKADLLSHLLKIHIDRLRNETDEVELVFLVDGSGSIGLNNFRS
ELNFVKKLLSEFTVEPLTTRVAIVTFGGRRNINRNVDQISKTGSDNHKCYLLNRQLNNIS
YTGGGTYTRGALFEALAILEKGREAAKKVIFLITDGFSNGGDPRPVADLLKNAGVMIFTF
GIRTGNVKELHDIASNPGYTHSYFLDSFAEFEALARRALHHDLKTGKYVPVAVSSDCDIL
CMNNEMNKVREKNCCDDLAICSCGITTGHYACICPVGFFGSGFKGSCQPCPNGTYASGYI
SGDSTSICIPCPDVNHVTLKVPATTVEDCVCAFGFTTDGKKCEVITCPKLKVPENGYLVK
ANACSNVVNAACGIRCRIGFQLTGDSIRLCEKDGTWSGNEPQCSLKTCPALRAPLHGRVR
CQHDEVYQDRMKEDLTSYPIDTRCQFRCDVGYQLRGSKVRNCLPVSRWDGLETTCKPIKC
EPLKQLANGMIFPTNCTGPEKLSFAMNCTILCKEGYKLEGPRSRFCGGRAGVWSQRCSVN
RCVDSTPPVIACPSSITIESLPNKNYAYVNWAVPEATDNDSDSVVVWSKPHIVLPRKMKI
GTRTIVYVAQDASRNKAKCKFQVKVIDKEPPMVENCIDPPVIFSDRENGAINVTWNEPGF
YDNSKLPIRIEQSHRLEDNVFPIGKTQIIYNATDMYGNIANCILNITVKNVCKNVTLPSD
KRINCLYNSNQTSQCITTCNEGYELVQETSYLGPVNEDMPFKCNSENETSNDYVISDCLE
SEQLKTVYVEGNIALEGDTKSFCNNSTNLRELTDRITEDLRSKLIDICNNDVECNLVSFD
PECEDDFFTSKNLYSSLVRFRRDERKDEDKIKRKKEKIEIKFKFIGKIIKENPDNPKKAL
QKLRDKIQMMTHSGELNLLNNKTNQEIAKLALNLHIVFGEIQDFCEPGSIPRKHTCIKCP
LGTFHDTSARQCRPCPFGEYQDVSGSIQCKQCPEHTYTRRMRTKSLQECISVCQPGYYSK
RRHHGSIISVEPCMSCTFGFYQPKYGQITCLPCPANTTTQNRGSITINECINLDITKNDI
CYTKPCLNDGQCLEKEDEDYICECRDYYVGTQCEIFQNPCKSSPCLNEGLCIVHEANKNM
PYYCSCKSAYTGQNCEVYIDECTHNPCQNDGKCVSTENDYVCICKDGFEGDFCETSVNYC
DLMPCEKGSTCNIVNQTWYCSCISGFLGRRCNLLPCDWLPCHENSICINIMEKNATRNSY
RCECPIGYTGKDCTKKIDYCSSSPCKNGGQCKSISFNYTCICPLSFIGNNCEIELTSDYI
MHFVRSSTTNYVMMKGPIKNISQLTITVWLQSMDTFNYGTVLSYATHDEDNALTVTDYNG
FVLYINGHEVVTDIKVNDGYWHFLCITWENTNGSWNIFLDGILKDSGTNLAKGLTIPGNG
SFIIGQEQDRMGGGFSESESFVGNITLLDIWDSTFTNDYIMHLYRTCEKYYGTLFTWSHI
LEHMYGDIMIINSQFCRGCSLPVVPFKGNVNTTEDLLEATYYCDTGYVLKFGGKEQQVLR
RKCLKNGEWEGSDIPKCLKVKCGFPGYFPRGYIRGWSYFFGDEIYYSCISGYELHGSVRR
ICKSNGKWSGLPPLCIGVTCKSLLAPENGDIEYIIEENERDDITILQAGQQIEFKCNSGF
RLVGEKYLTCLETGIWNHDNPVCIPYSCPPPIKIEHGYMKVITNGNEKSFSSSKFKENST
NDPFARNYFYGDTIEYFCDPGYKFENNNSSTMFILQCSNNGLWSSYFPNCTLIKCPWPNP
VEEGKIFLSIKGNLTLEIPTVSEGSYWTQHFNDKELKENFVLNTEIIVTCNSGYTLIGKN
SRICSNEGIWIPDNQICEPRKCSVSNHLVSRFLNINALNNVHNKSEKYKEESYKNMNNSY
GNIHFYIEGDIYNKRILMTCQNNMSHSNAFTGDDKLNITWICNESNQWKLVNFLQYNNKF
IQIHDSKNETCEGVLCATFINITNINMNDLKNAIDIFTFSCQRNYVLEGTETLTCHSNGT
WSAMPLCKHMTCRNPILPFNTVLKQNGTDYNVDDIIHFECIPGYRIFGQSTAKCLSNGKW
SKMRGRCSKISCGKPVVPPGIIVQGPSYLFREQLAYICPNGKKVGSITCKSDGKWSDPPQ
CTNK
NT seq
6675 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaatgttaatgtcatattggagaatatttctattaatcaatggagcttctttt
ctctttgcaaagtattccaacataagcgaatttcgatcaagcgatactttcaaaattcgt
accaccgatgatatcgatttaatatcgacaacttggaatcatggcaaggaagagaataat
aacaatcaatatctgcatcatagtttcgagagtaatagcaaaatgatccgacgaaaagcg
gacttgttatcacatcttttaaagatccatatagatcgcttgagaaacgagaccgacgag
gtagaactcgtattcctcgtggatggatctggctcaattggtctaaacaattttcgtagc
gaactcaatttcgtaaagaaacttttatcggaatttacggtagagcctttaaccaccaga
gttgcaatcgtcacgtttggcggaagaagaaacatcaatcgtaacgttgatcaaatatcc
aaaactggaagcgataatcataaatgttatttacttaacaggcaacttaacaacatcagt
tataccggtggtggaacgtatacgcgtggtgcactttttgaagctctcgctattcttgag
aaaggtcgggaagcagcaaaaaaggtaatatttctgataaccgatggcttcagtaatggc
ggagatccacgtcctgttgctgatcttttgaagaatgctggcgttatgatatttaccttt
gggatacgtacgggcaatgtaaaggaacttcacgatatcgccagtaatcctggatacact
cacagttattttttggatagtttcgccgaattcgaagcgttggctcgtcgtgctttacat
catgatttgaaaacaggaaaatatgtacctgtggcagttagcagtgattgcgatatttta
tgtatgaacaatgaaatgaacaaagttagagagaaaaattgttgcgatgatttagcgatc
tgttcgtgcggcataacaaccggtcattacgcttgtatttgtccggtaggattttttggc
tctggttttaaaggttcttgccaaccatgtccaaatgggacgtacgcttccggctatatt
tctggggattcaacgtctatctgtataccttgtccagatgttaatcacgtcactttgaaa
gtacctgctactacggtggaagattgtgtttgtgcttttggcttcaccactgatgggaaa
aaatgtgaagttataacatgcccgaaattaaaagtaccagaaaatggatatctggtgaaa
gcgaatgcctgtagcaacgtggtaaacgctgcttgtggtataagatgtagaattggattt
caattgaccggtgatagtattcgactttgtgaaaaagacggaacttggtctggtaatgaa
ccacaatgttcactaaagacttgcccagcactgcgagcaccgctacatggaagagttcgt
tgtcaacacgacgaagtttatcaggatcgaatgaaggaagatttaacttcgtatccgatc
gatacgcgttgccaatttaggtgcgatgtcggctaccaattgcgaggaagtaaagttcga
aattgtttgcctgtttcgcgttgggatggtctggaaacaacttgcaaaccgattaaatgt
gaacccctaaagcaattagcaaatggtatgatcttccctacgaactgcacgggtcctgaa
aagttatccttcgcgatgaactgtactattttgtgcaaagaaggatacaagttggaagga
ccacgaagtaggttctgcggtggacgtgcaggtgtttggtcacaacgttgcagcgtcaat
cgttgcgtagatagcactccaccagtcattgcatgtccatcttccataaccattgagagt
ttgcccaataagaattatgcctatgttaactgggctgtaccagaagctactgataacgac
agcgattccgttgttgtgtggagcaaaccacacattgttcttccacggaagatgaaaatt
ggtactcgtactatcgtttatgtagcgcaagatgccagtaggaataaagcaaaatgtaaa
ttccaggtcaaagtgatcgataaggaaccaccgatggtcgaaaattgtatagatcctcca
gtgatattttctgatcgtgaaaatggagcaattaatgtcacctggaacgagccaggattt
tacgacaattcgaagctaccgataagaattgagcaaagtcatcgactagaggataacgtg
tttccaattggtaaaacacaaattatatataatgctaccgatatgtacggaaatattgcg
aattgtatattaaacatcactgttaaaaatgtatgcaagaatgttacattaccttcagac
aagcgcataaattgtttatacaattcgaatcaaacgtcacaatgcataactacctgcaat
gaaggctacgaattggtgcaggagacatcgtatcttggccctgtgaatgaggatatgcca
tttaaatgtaactcggaaaatgaaacttcgaatgattatgttatatctgattgcttggaa
tccgaacaactaaaaactgtatatgtagaaggaaatatcgctcttgaaggcgatactaaa
tcgttctgtaataactcaacaaatcttcgggaattaaccgatcgtattactgaagactta
agatcgaagctaatcgatatctgcaataatgacgttgaatgtaatctcgtgagctttgat
cctgaatgcgaagacgacttttttacttcgaaaaatttatactcaagtttggtaagattt
cgaagggatgaaagaaaagatgaagataaaattaagaggaaaaaagaaaagatcgaaatt
aagtttaaattcattggaaagataattaaagaaaatccagacaatccaaaaaaagcattg
caaaagttaagagataagatacaaatgatgacacattctggagaactgaatctactaaat
aataagactaatcaagagatagctaaacttgcacttaatttgcacatagtatttggagaa
atacaagatttttgtgagcctggcagtatacctagaaagcatacttgcataaaatgtcct
ttaggtactttccacgatacttccgcacgacaatgtcgaccatgcccttttggagagtat
caagatgtaagcggatccatacaatgcaaacaatgtcctgaacatacttacactagaagg
atgcgtacaaaatcattacaagagtgtatatctgtttgtcagccaggatattattccaaa
cgtagacatcatggatctattatatctgtagaaccttgtatgtcttgtacttttggcttt
taccaaccaaaatatggtcaaataacatgtttaccatgtccggcgaatacaactactcaa
aatcgtggttctataactataaatgaatgcataaatcttgatataacaaaaaatgatatt
tgttatacaaaaccttgtttgaacgatggtcaatgtttagaaaaagaagatgaagattat
atttgtgaatgtcgtgattattatgttggcacacaatgtgaaatatttcaaaatccatgt
aaatcttcaccatgcttaaatgaaggattatgcattgtacatgaagctaataaaaacatg
ccatattattgttcttgtaaaagtgcttatactggacaaaattgtgaggtttatatcgat
gaatgtactcataatccttgtcaaaatgatggaaagtgtgttagcacagagaatgactac
gtatgtatatgtaaagatggtttcgaaggtgatttctgtgaaacttctgtaaattattgt
gatctaatgccttgtgaaaagggatcaacatgtaacattgtgaatcaaacatggtattgt
tcttgcatatctggctttttaggacgtcgttgtaatttattaccatgtgattggcttcct
tgtcatgaaaattctatttgtataaacatcatggaaaaaaatgcaacaagaaatagttac
agatgcgaatgtccgattggatatactggaaaagattgcacaaaaaagatcgattactgt
agtagttcaccttgcaaaaatggtggacaatgtaaaagtatatcttttaattatacttgt
atctgtcctctatcatttataggaaataactgtgaaattgaattgacatccgattatatc
atgcattttgtgagatccagtacaactaattatgtgatgatgaaaggtccaataaaaaat
atatcacagttgactattactgtgtggttgcaatccatggacacttttaattatggtact
gtactttcatatgctacacatgatgaagataatgcgcttacagtaacagattataatggt
tttgtattatatatcaatgggcatgaagtagtaaccgacattaaagttaatgatggttat
tggcattttctttgtattacatgggagaatactaatggatcttggaatatttttcttgat
ggaatacttaaagattctggtacaaatttagcaaagggtttaactattccaggtaatgga
tccttcattattggacaagaacaagatcgaatgggtggtggtttttctgaatcagaatca
ttcgtgggtaatattacattattagatatttgggattcgacttttacaaatgattatata
atgcacttatatagaacatgtgaaaaatactatggcactctttttacatggtctcacata
ttggaacatatgtatggagatattatgatcataaacagccaattttgtcgtggttgctct
ctaccagttgtaccatttaaaggtaacgtaaatactacagaagatttattagaagcaact
tattattgtgatactggatatgtgcttaaatttggtggtaaagaacaacaagtactaaga
aggaaatgtcttaaaaatggtgaatgggaaggatctgatatacctaaatgtcttaaggta
aaatgcggctttcctggatattttccacgcggttatataagaggctggtcatattttttc
ggagatgaaatttattattcttgtatcagtggctatgaactccatggaagcgtacgtcga
atatgcaaatcaaatggaaaatggagtggattaccacctctttgtattggagtaacatgt
aaaagtttactggcaccagaaaatggagatatagagtacataatagaagagaatgagaga
gatgacattacaattttgcaggcaggacaacaaattgaatttaaatgtaattccggattt
cgtttggtcggagaaaaatatctaacatgtttagaaactggtatatggaatcatgataat
ccagtttgcattccttacagttgtccaccgccgataaagatagagcatggttacatgaaa
gtaattactaatggaaatgaaaaatcttttagttcttccaaattcaaagaaaattctact
aatgacccttttgccagaaactacttttatggtgatactattgaatatttttgtgatcct
ggttataaattcgaaaacaataattcttctacaatgtttattctgcaatgttccaacaat
ggtttgtggtctagttactttccaaattgcactcttattaaatgtccttggccaaaccca
gtagaagaaggaaagatatttttaagtataaaaggcaatttgaccttggagattccaaca
gtttcagaaggatcatattggacacaacatttcaacgataaagaattaaaagagaatttt
gttcttaatacagaaattattgttacttgcaattcaggatatacattaataggtaaaaat
agtagaatatgtagcaacgaagggatttggattccagataatcagatttgtgaaccacgt
aaatgttcagtttctaatcatttagtttcacgatttcttaatatcaatgcactgaataat
gtgcataataaaagtgaaaaatacaaagaagaaagttataaaaatatgaacaattcttat
ggaaatattcacttttacattgaaggagatatttataataaaaggattcttatgacgtgt
caaaataatatgagtcattcaaatgcttttactggtgatgacaaattaaatattacatgg
atttgtaacgaaagtaatcaatggaaactcgtgaattttttacaatataataataaattt
atacaaatacatgattcgaaaaatgaaacatgcgaaggagtactgtgtgctacattcatt
aatattaccaatatcaatatgaatgatttaaaaaatgctattgatatctttacctttagt
tgtcaaagaaactatgttcttgaaggcactgaaacattaacgtgtcattcaaatggcaca
tggtctgctatgcctttgtgtaaacatatgacttgtcgaaatccaatattaccatttaat
acagtattaaaacaaaatggaactgattataatgttgatgatataattcattttgaatgt
atacctggatatcgaatttttgggcaatcaactgcaaaatgtctttctaatggaaaatgg
tccaaaatgcgcggcaggtgttctaaaatatcgtgcggcaaacctgtagtaccacctggt
ataattgttcaggggccatcttatttatttcgagaacaacttgcttatatttgtcctaat
ggtaaaaaggtaggttcaattacttgtaaatccgatggaaaatggagcgatcctccacaa
tgtactaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
