Entry |
|
Name |
(RefSeq) trafficking protein particle complex subunit 8
|
KO |
K20305 | trafficking protein particle complex subunit 8 |
|
Organism |
vps Vespula pensylvanica (western yellowjacket)
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:vps00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:vps04131]
122633831
Membrane trafficking [BR:vps04131]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
122633831
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
13:complement(1971424..1977113)
|
AA seq |
1442 aa
MAQCKLTPREFISNTFSPQIAAVCTSAADATCQKNNLSFVELLQPFCKLNTEGHFKDPQG
NIVTVRNLRLSIQDVNAHPPESSIARKMLNEAVSSAMCERTTVIRIGTVDLDIPLSVPWF
EAWREMFLSVQFPSDHEFTRHFLACMIIVSTADDNPLDKVQVMGSQLHQSIPGKLPKWFN
NNALRYYILIHDALLDDKIKAESVFTEMKNIYGANNCFLLQMNSRPPGQIDDNSHLPDPW
SQFLIKRTELSSGSEQNSSPRTPADTGGVSAMPNEVTTESEKSSQAGTPVVPQNNTLVSP
DVADTISLSSEMSEPSNVQLEVGQEAVSVTIHPLSPESDKLHNISSTTNIKAHIASNSPI
NANVWADSPNYIAAQHGARLSTQDLERLRSLITEFCLKSLLPYVEKQIGLLNDVISNKKG
VSRSLFSATRRLFGTNKPGAPGSAPLNAVIYTAESSELQLRRLGDLCFIFGHYSLAYQAY
HSAKRDFAGDQAWLYYAGALEMAGLSAFMQGEMNRKTIEYMDDAILTYSNSCKMPQFATR
ATLLSAECLKGRGLYGEAAKQLIRMTSEDSDLRSALLLEQAAYCFIGPKMMRKYAFHAVL
AGHRFSKAGQRKHSLRCYQQAYQVYNNRGWSLAEDHIHFTIGRQAASLKQVQESVKAFEK
LLNANSKQPAPQQAAFLREFLHIHNLLLQEDATNDQELPVLPLPLIDSNNVKVLYGHLCE
STEDSISASHVSLDDEDTDDVRWSKMEEILITEAQGTQPMIFKPSIILYSSISNNTVKPN
AVLNEPVHFSIELHNPLHISLPLSNVTLLWSFTSVNNTITNETNSETSESELVDTQVINS
IMLHPVCKQRIVLSLTPKQVGQVKVLGLKYNMSNPVHATLDPLVMNPTIFVAGKRLFEIK
GPKLKNIKEKPGIQMYAVDYRLEMNVIKKAPYIQIHFSKLSSEMFCGEIQKVEVTLKNIG
NAPLTNIYVTCVNAKLFSLGNEDILDEHSLKKSNKAVTKILLPSDKNNILNVGDVHKMPL
WIQAPHKKGSHRLDLLFYYENVDSESIPRHRLCRHTWHLEVLDSIQIKAIASRSAVFKDT
LPTLNMKMSVKNMNQIHDTITNEISILAVSCQSDTWSIFRSSVLPSNIIVHPQEMFHLLF
KLQKKFDNTAIFSNVSIIEDNKSDEISEIAYPFMNFVQKRYILPLDIHENAADMQLQLQE
INQKDNDPLLNTMMMNSALIVRWKNKIIENGYVVRQAIGQHHIDMKYLNQVYKYPKEMQV
EQSEYCGRLKIFGPDRNIPDLSITHNKEQFLGIDLQTNATMFCKNIITFSLSHLRQGEHN
FRENRLCIIPVTMYIQNHLQSKIDVRINTIGTSSDTQLPSIKTQLYSPHASTNFRYICHS
AINCCIESLAQNTIKLQAILSAPGTYNLAARIEVSVKIVNNREFIPQEWNMESICIMKNA
AV |
NT seq |
4329 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggctcaatgcaagttaaccccacgggaatttatcagcaataccttttcgccacaaatt
gctgcagtatgcacatctgctgccgatgcaacatgtcagaaaaataatttgtcatttgtc
gaacttttgcaaccattctgcaagttaaataccgaaggacatttcaaagatccgcaagga
aatattgtaaccgttcgaaatcttcgactttctatacaagatgttaatgcacatccacct
gaatctagcattgcaagaaaaatgttgaatgaggctgttagttcggcaatgtgtgaacgt
actactgttattcgtattggaacagttgatttagatattcctttatctgttccatggttt
gaagcatggagagaaatgtttcttagtgtgcagtttccttctgatcatgagtttacaaga
cattttcttgcttgcatgatcattgtttcaacagcagatgataatcctttagacaaagta
caagtaatgggttcacaattacaccaaagtattcctggaaaattaccaaagtggtttaat
aacaatgcattaagatattacatcctaatacatgatgccttactggatgataagatcaag
gcagagagtgtttttacagaaatgaaaaatatttatggtgctaataattgtttcctttta
caaatgaattcacgaccaccaggacaaattgatgataattcacacttaccggatccttgg
agtcaatttctaataaaacgtacagaattatcaagtggtagcgaacaaaatagttcacca
cgtactccagcagatacaggaggtgtatctgctatgccaaatgaagtcacaacagagtct
gagaaatcaagtcaagctggaacaccggttgttccacaaaataatacgttagtttctcca
gatgtagctgatacaattagtctttcttctgaaatgtcagaacctagtaatgtgcaatta
gaagttggacaagaagcagtgtccgtaactattcatcctcttagtccagagagtgacaag
ttacataatattagttctactactaatattaaagctcatatagctagtaattctccaatt
aatgccaatgtttgggcagattctccaaattacattgctgcacagcatggtgctcgatta
tctacacaagatcttgaaagactgagatcacttataacagaattttgtttgaagagttta
ttaccatatgttgagaaacaaattggtttattaaatgatgttatttcaaataaaaagggt
gttagtagatcactttttagtgcaacaagaagattattcggtacgaataagccaggagcg
ccaggatctgctccattaaatgctgtgatttacactgcagagtcttctgagttacaattg
cgtcgattgggtgatttgtgttttatatttggtcattattcgcttgcttatcaagcgtac
catagcgcaaaacgagattttgcaggcgatcaagcatggctttattatgcaggtgctcta
gaaatggctggtttaagtgctttcatgcaaggtgaaatgaatcgaaaaacaatcgagtat
atggatgatgcaatattaacttattcaaatagttgtaagatgccgcaatttgcaacgaga
gcaacattgctcagtgcagaatgcttgaagggtcgtggattatatggggaagcagcaaaa
cagttaattcgtatgacaagcgaagattctgatttgcgttctgctttacttctcgaacaa
gctgcttattgttttattggtccgaaaatgatgaggaaatatgcgtttcatgcagtctta
gctggacatagattctcgaaagcaggccaaaggaaacattctttaagatgttatcaacaa
gcttatcaggtatataataatagaggatggtcattagcagaagatcatatacactttacc
attggtaggcaagccgcttctttaaagcaagttcaagaatctgtcaaggcatttgaaaaa
ttattgaatgctaatagtaaacaaccggcaccgcaacaagctgctttcctacgagaattt
ttacatattcataatttattacttcaagaagatgctacaaatgaccaggagcttcctgtt
ttgcctttaccattaatagatagcaacaatgttaaagtattatatggccatttgtgtgaa
tcaactgaagatagtatttcggcgagtcatgtatcgctagacgatgaagatacagacgat
gttagatggtcaaaaatggaagaaatacttataaccgaagctcagggaacacaacctatg
atatttaagccatccattatattgtattcgagtataagtaataatactgtcaaaccaaat
gctgtcttgaatgagccagtgcatttttctattgaattacataatccactgcatatatca
ttaccattatccaacgtaactttattgtggtcatttactagcgtcaataatactattaca
aatgaaacaaattcggaaacgtcggaatcagaactggttgatacacaagtaatcaattca
ataatgttacatccagtttgtaaacaacgtattgtattatctctcacacctaagcaagta
ggacaggtaaaagtcttgggtttgaagtacaacatgtctaatccagttcatgcaacgcta
gatccacttgttatgaatccgacaatttttgttgctggaaaacgattgtttgaaattaaa
ggtcctaaattaaaaaatattaaagaaaaaccaggcatacaaatgtatgctgtggattat
agattagaaatgaatgtcatcaaaaaagctccatatatacagatccattttagcaaatta
tcatcagaaatgttttgtggagaaatacaaaaggttgaagtaactctaaagaatatagga
aatgcaccattaacaaatatttatgttacttgtgtcaatgctaagttattttcattagga
aatgaagatatacttgatgaacattcattgaagaaaagcaataaagctgtaacaaaaatt
ttgctaccttcagataaaaataatattttaaacgtaggtgatgttcataagatgccactg
tggattcaagcacctcataaaaagggaagtcatagattagatttacttttctattatgaa
aatgttgactctgaaagtattccaagacacagattatgcagacatacgtggcacttggaa
gtattggattcaatacaaatcaaagcaatcgcatccagaagtgcagtatttaaagatact
ttaccgacattgaatatgaaaatgtctgtaaaaaacatgaatcagattcatgatactata
acaaatgaaatttcaatattagctgtatcttgccaaagtgatacttggtcaatatttaga
tcatctgtccttccatctaatattatagtacacccacaagagatgtttcatttattgttt
aaattacaaaaaaaatttgataacacagcaatattctctaatgtatcaataatagaagat
aataagagtgatgaaatatcggaaatagcttatccattcatgaattttgtacaaaagaga
tatattttaccattagatatacatgagaatgcagctgatatgcaattgcaacttcaagaa
attaatcaaaaggataatgatcctcttctaaacactatgatgatgaattcggctttaatt
gttagatggaaaaataaaataatagaaaatggttatgttgttaggcaagcaattggtcag
catcatattgacatgaaatatttgaatcaagtttacaaatatccaaaagaaatgcaagta
gaacaaagtgaatattgtggacgtttgaagatatttggaccagataggaatataccagat
ttatcgattacgcataataaagaacaatttctaggaattgatcttcaaacgaatgcaact
atgttctgtaaaaatataataacattttctttaagtcatctcaggcaaggcgagcataat
tttagagaaaatagactttgcattataccagttacaatgtatatacaaaatcatctccaa
tcaaaaatagatgtcagaataaacaccattggaactagcagtgatactcaacttccaagt
attaagactcaactttattcaccacatgcttcgacaaactttcgatatatttgtcattca
gcgattaattgttgcatagagtctctcgcacagaatactataaaattgcaagctatatta
tcagctcctggtacatacaatttagcagcaagaatagaagtttctgtaaaaattgtaaat
aatagagaatttattcctcaagaatggaatatggaaagtatatgcattatgaagaatgca
gctgtataa |