Virgibacillus pantothenticus: KBP50_13655
Help
Entry
KBP50_13655 CDS
T07430
Name
(GenBank) pullulanase
Organism
vpt
Virgibacillus pantothenticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpuA_C
PUD
Alpha-amylase
CBM_48
Gram_pos_anchor
Pullul_strch_C
GlgB_N
NOC3p
PFF1_TM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTY14959
LinkDB
All DBs
Position
complement(2932744..2935893)
Genome browser
AA seq
1049 aa
AA seq
DB search
MDLKEKRSGVKIIDNALIVDENVHPDETITVQATYDGYISQKEITIQPTNEQAKSDEQVT
QTIRIHYEREDQNYDGWNIWVWDDVAAPSEGWPDGAVSAAGIDEHGTYYDIQLAKDAEKI
GFLFVNKRSGEQTGNYHFSMLEHKEIFVKDGDEQVYTDPNGKIETALLFGEIVSKDTIQL
RFSSIKDLGLKKLLSDIVVQDENGNKINIINGKKVDQKVLEVNGEFAAINTSLTVTYGDK
TLKLTDSWKLIDELYAYDGDLGATLHTNGTATLKVWAPKAANVTVVLYDKGNQYKVIRDE
IPMQLGERGVWEVKLNKENTGLDNLKGYYYHYKMTHNGKTKLTLDPYAKSMAAWANPGNG
GKYSIGKAAIVDPSEIGPALNFANIDGFTKREDAIIYEVHVRDFTSDPAIEGELNARFGT
FSSFIDKLDYIKELGVTHIQLLPVMSYYFANEWDNDKRLLDWSSTGNNYNWGYDPHSYFS
LSGMYSENPDDPELRIAEFKRLIHEIHKRDMGVVLDVVYNHTAKVEIFEDLLPNYYHFMD
KDGTPRESFGGGRLGTTHAMSRKVLVDSVSYWVEEFKIDGFRFDMMGDHDAESIQVAYDR
AKQLNPNIIMIGEGWRTYVGDEGEKVVPADQDWMQHTDSVAVFSDEFRNELKSGFGSEGQ
PRFLTGGARNIQQIFDNVTANPHNFVADDPGDVVSYIAAHDNLTLHDVIAQSIMKDSEYH
EEEIHKRIRIGNAMVLTAQGKAFIHAGQEFGRTKQFRTETLEAPYKSTYMTDKEGKPFLY
PYFIHDSYDSTDAINKIDWKMATDKEQYPIQHATREYTAGLIKLRRSTDAFSLGTMEKIK
TNVKRIEAPEIQEEDLVIGYQASSSDGSEVYQVFVNADSKERKLTLKNTYLTKGKVIVDA
NTAGTEEIKHPTGVKIAANQIKLAPLTTVIVKMNHKNGDTEETDNTHTPGHNEPGQEKET
DKEQTTEVDKDKNKERGLNQDKNKERGNQDENKEQELNQDKKQMGEGNKVTKKQGEELPN
TATSFYNWLLAGFIFVLAGVGLYIYKRRK
NT seq
3150 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacttaaaagaaaaaagaagtggtgtgaagataattgataacgctttaattgtggat
gagaatgtccaccccgatgaaacaattactgttcaggcaacgtatgatggttatatttcg
cagaaagagataaccattcaaccgacaaatgagcaggctaaatccgatgaacaggttaca
cagacgattcgtatccactatgaacgcgaagaccagaattatgatggatggaacatttgg
gtatgggatgatgttgctgccccgtctgaagggtggccggatggagcagtaagcgctgct
ggcattgatgagcatggtacttactacgatattcaactagcaaaagatgcagagaaaatt
ggttttttatttgtaaataagcgtagcggagagcaaacaggaaattatcatttttcgatg
ttagagcataaagaaatttttgttaaagatggtgatgaacaggtgtatactgacccaaac
gggaaaatagaaacagcccttctttttggggaaattgtatccaaggatacgattcaattg
cgtttctccagtataaaagatttaggcttaaagaaattactaagtgacatcgtagtgcag
gacgaaaatgggaacaaaataaacataatcaatggcaagaaagtcgatcaaaaagtatta
gaggttaatggagaatttgccgctattaatacatcacttactgtaacttatggtgataaa
acgctaaaactaacagacagttggaagttaatagatgagctgtatgcttatgatggagac
ttaggtgcaacattacataccaacgggacagcaacgttaaaggtatgggcaccaaaagca
gcaaatgtaaccgttgtactatatgacaaaggcaaccaatataaagtaattcgcgatgaa
ataccaatgcaactaggtgagcggggcgtgtgggaagtaaagctcaataaagaaaatacg
ggcttggacaatcttaaaggctattattatcattataagatgacacataatggaaagaca
aagctaactcttgatccatacgcaaaatcaatggcagcatgggcaaatccaggaaatggt
gggaaatattcaataggaaaggcagcaattgtcgatccatctgagattggtccagcatta
aattttgctaatattgatggttttacaaagcgtgaagatgctattatttacgaagtccat
gtgagagatttcacatcagatcctgcgatcgaaggtgaactaaatgcccgatttggtaca
ttttcttcctttattgataaactggattatattaaagaattaggtgtcacacatattcag
ctgcttcctgtcatgagttattattttgctaatgagtgggataatgataagagattacta
gattggtcatcgactgggaataattataattgggggtatgatccacatagttatttttca
ctatctgggatgtattctgaaaatccggatgatcctgaactgcgaattgcggaatttaag
cggttaatccatgaaattcataaacgagatatgggtgtagttttggatgtcgtgtataac
catactgctaaagttgagatttttgaggatttgctgccaaattactatcattttatggac
aaggatggtactcctcgtgaaagctttggtggaggacgtcttggtacgactcatgctatg
tcacggaaagtactcgtcgattccgtctcatactgggtagaagaattcaaaattgacggt
ttccgctttgatatgatgggagatcacgatgcagaaagtattcaagtggcttatgataga
gcaaagcagttaaatccaaatataatcatgattggagagggatggcgaacgtacgttggt
gatgaaggagaaaaagtggtgccagcggatcaggattggatgcagcatacggatagtgtt
gctgttttctccgatgaatttagaaatgaattgaaatcgggttttggcagtgaaggtcaa
ccaagatttcttaccggtggggctagaaacattcaacaaatttttgataatgtcactgca
aatccgcataattttgtcgctgatgatcccggtgatgtcgtttcctatattgctgcacat
gataatttgacgttgcacgatgttattgctcaatcgattatgaaagactctgaatatcat
gaagaagaaatccataaacggataagaattggtaatgcgatggttttaaccgcacaaggg
aaagcctttatccatgctggtcaagagtttgggagaacaaaacagtttagaaccgagacg
ttagaagctccgtataaatcaacctatatgacagataaagagggaaaaccatttctttat
ccatatttcattcatgattcgtatgattctacggatgctattaataagattgattggaag
atggcaacggataaagaacaatacccgattcaacatgctacacgtgaatacacagcaggc
ttaatcaaactccgacgctcaaccgatgcgttttcgttagggactatggaaaagataaaa
acgaacgtaaaacgcatcgaagccccagaaattcaagaggaagatttagtgatcggatat
caggcatcgtcttctgatggttcggaggtgtatcaagtatttgtaaacgcagatagtaaa
gaacgtaaacttacgctaaagaatacgtatttgactaaaggaaaagtaattgtggatgcg
aatacagctggaacagaggaaattaagcatccgactggtgttaaaatagcagctaaccag
attaagttagcaccgttaacaactgttattgtaaagatgaaccataaaaatggggacaca
gaggagactgataatacacatacacctggtcacaatgaacctgggcaagaaaaggagaca
gataaagaacaaacgacggaagtggataaagataaaaacaaagaacgaggattgaatcaa
gataaaaataaagaacgagggaaccaagatgaaaacaaagagcaagaattaaatcaagat
aaaaaacaaatgggtgaaggaaataaagtaacgaaaaagcaaggagaagagcttcctaat
acagcaacttccttctacaattggctcttagctggcttcatattcgttcttgccggtgta
gggttatacatttataagcgaagaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
