Vigna radiata (mung bean): 106772292
Help
Entry
106772292 CDS
T04126
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
vra
Vigna radiata (mung bean)
Pathway
vra03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vra00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
106772292
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
vra03019
]
106772292
Messenger RNA biogenesis [BR:
vra03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
106772292
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106772292
NCBI-ProteinID:
XP_014514079
UniProt:
A0A1S3V7G6
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(35506449..35510009)
Genome browser
AA seq
472 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEDKLKEHFGNYGDVLSTSVMREKNTGKPRGFGFVVFADPTIL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKKAFSREDQQISVTSRGGNSNSGMNSGNGGNIRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRQYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKSFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRMGGAGGGGSGIGGYQGYGASGGNQNAYDGRMDSSRYMQPQS
AAGGFPPYGSSAYSAPGYGYGPANNGIGYGAYGSYGGATAGYGGPAGATYGNPNVPNAAY
AGGPPGGPRSSWPAQAPSGYGSMGYGNTPPWGAPSGGAGSGGSGPGSAAAGQSPGGAAGY
GNQGYGYGGYGGSDSSYANSSAYGTVGGRTGSAPNNSVSGPGGSELTSSGGSGSYMSGGY
GDANGNSGYGNAAWRSEQTHASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1419 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaaattattcatcggtgggatatcgtgggacactacggaggac
aagctcaaggagcatttcggcaactacggcgacgttttgagcacttctgttatgcgagag
aagaacactggcaagcccaggggctttggtttcgtcgtcttcgcggatcccaccattctc
gatagggttctcgaggataaacatgtcatagatggcagaacggttgatgccaaaaaggct
ttctcaagagaggatcaacaaatttctgtcacctcgagaggtggaaattccaattctggc
atgaattctggaaatggaggaaacatcagaactaaaaagatatttgttggagggctgcct
cctaccctgactgaagaaaaatttcgccagtactttgagtcttatggacacgtgaccgat
gtagtagtcatgtatgaccagaatactggacggccacgaggatttggttttatttcattt
gatactgaggaggctgtcgatagggtattgcataaatcatttcatgatttaaatggtaaa
caagttgaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgccaatcctggtgcaagtggccgtatg
ggtggtgctggaggtggtggttctggaattggtgggtatcaaggatatggggcatctggt
ggtaaccaaaatgcatatgatggtcgaatggattctagtaggtatatgcagcctcaaagc
gctgcaggtggattccctccttatggttcttctgcctacagtgctcctgggtatggatat
ggtccggctaataatggtattgggtatggtgcatatggaagttatggtggtgccactgca
gggtatggtggacctgctggtgcaacatatgggaatcctaatgttcctaatgctgcttat
gctggaggtcctccagggggcccaaggagttcatggcctgctcaagcaccctctggttat
ggatctatgggctatgggaacactcctccttggggtgctccaagtggtggtgctggctct
ggtggcagtggtcctggttcagcagctgcaggtcagtcccctggtggagctgctggatat
gggaaccaaggttatggatatggtggatacggtggaagtgatagttcttatgcgaattca
agtgcatatggcactgttggtggacgaacagggagtgctccaaacaatagtgttagtggt
cctggtgggagtgaactaacaagtagtggtggcagtggtagctatatgagtggtggctat
ggggatgcaaatggaaattcaggttatggaaatgcagcttggagatcagaacaaactcat
gcatctggaaattatggaacaccacagggaaatggtggccaggttggttacggtggtggc
tatggtggtgctcagtctcgacaagcccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
