Veillonella rogosae: OKW85_00200
Help
Entry
OKW85_00200 CDS
T08601
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
vrg
Veillonella rogosae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZG51063
UniProt:
A0AA47AB34
LinkDB
All DBs
Position
45013..47268
Genome browser
AA seq
751 aa
AA seq
DB search
MKRMCKTKLSLAIALTIASSVGQYVMAESTYVTKPEGAYLSATNGSKLSLGEVVGSTAGI
DADTGGTISVDNVRSIIPAGRHSFIISKNGGTVNVKAGLIQMGRLSKPVVIANGGTVNLG
VDGNTGNFTSHDMSIEGDVRIDGSATHPSEINIGLDSDEVFWTGFALNLADKNAKQPNHI
NVFLGQRGYWDHLYQGGLNGTGLSTMTTPSRVHRLVGSKNRSFENAVVQNEHNEIHIDKL
EGHVNFFYDINGEYDDTEDPAYTPPTKTYNGLTPESFWGGDIHITSAAPNAYAHVFSSQK
GLDVSSEENVNKILDNLAHKIYYHNYVNGERNLQGTVGIASNGAESARFKVLTEGYAKEG
AITWQADKNGQGKYVYGENKPAPAPKPEVKPTPKPEPKPQPKPTPKPEVKPTPAPAPKPE
VKPTPAPAPKPEVKPTPAPAPKPENNGHIHVVVGDFDTPHMRGARSAIMSNINGWRTLTD
NMYRPRVLQQGEPTGIWARVGGGKYSFNTTGIDTDTTYTRIQGGYDAKTSSGWTVGGQVS
YLRGNDDYVFNGTGKEKAFAVGAYGLKDLGKNQYIHIESQVGRASNDFTVRNEIGEKLSG
ETKANAYSIGARYGKTVKLSNGTYIEPQAQLSYTHFGGDSFNAGSMHVDQSGVSSTAGSL
GLEIGKNFGAGNIYTRIGVNHAFSGTVKTTYTSGTTTKYTSEDIKGTWTDLAFGGRYGFN
ANNSIFGDISTGLSGDYKAGWSVNAGFTHKF
NT seq
2256 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgtatgtgtaaaacaaaattatccttagcaattgcccttacaattgctagctct
gttggtcagtatgtaatggcggagagtacatatgttaccaaacctgaaggcgcatatctt
agtgccacaaatggtagtaaacttagtctcggtgaagtggttggtagtactgctggtatt
gatgcggatactggaggtacgattagtgtagataatgtgcgttctataattcctgcagga
cgtcactctttcattatcagtaaaaatggtggtactgttaatgttaaagctggccttatt
caaatgggaagacttagcaaacctgtagttattgctaatggtggcactgtaaatcttggc
gtagatggtaatacaggcaattttacgagccatgatatgtctattgaaggtgatgttcgt
atcgatggtagtgctactcatccatctgaaatcaatattggtttagacagtgacgaagta
ttttggactggttttgctcttaacttagcagataaaaatgcaaaacaaccaaaccatatt
aatgtgttccttggtcagcgtggttattgggatcatctttatcaaggtgggttaaatggt
actggcttgagtacaatgacaacaccaagccgtgtacatcgcttggtaggttctaaaaat
cgtagttttgaaaatgctgtagtgcaaaatgagcataatgaaattcatatcgataagtta
gaaggtcatgtaaacttcttttatgatataaatggtgagtatgacgatactgaagatcca
gcatatacaccaccaacaaaaacctataatggtttgactccagagtccttctggggtgga
gatattcatattacaagtgctgcacctaatgcgtacgcccatgtattctctagtcaaaaa
gggcttgatgtatcctctgaggagaatgtaaataaaattttagataacttggctcacaag
atttactatcataactatgtaaatggtgaaagaaaccttcaaggtactgtaggcattgct
tctaatggtgctgagtctgcacgctttaaggtgttgactgaaggttatgctaaggaaggg
gctattacttggcaagcagataaaaatggtcaaggtaaatacgtatatggtgaaaataaa
ccagctccggctccgaaaccagaggtaaaacctactccaaaacctgagcctaagccacaa
cctaagccaacaccaaaaccagaggtgaaaccaacaccagctccggcaccaaaaccagag
gtgaaaccaacaccagctccggcaccaaaaccagaggtgaaaccaacaccagctccagct
cctaaacctgagaacaacggtcatattcatgttgtggtaggtgattttgatacacctcat
atgcgtggcgctcgttctgctatcatgagtaatatcaatggttggagaacattgacagat
aatatgtatcgtccacgcgtattgcaacaaggcgaaccaacaggtatttgggctcgcgtt
ggaggtggtaaatacagcttcaatacaacaggtatcgacacagatactacatatacacgc
attcaaggtggttacgatgctaaaactagcagcggttggactgtaggtggacaagtttct
taccttcgtggtaatgatgactacgtatttaacggtactggcaaggaaaaagcctttgcg
gttggtgcgtacggtttgaaagatcttggtaagaaccaatatatccacatcgagtctcaa
gtaggtcgtgcttctaacgacttcactgttcgcaatgaaattggtgaaaaactttctgga
gagactaaagcgaatgcatactctatcggtgcacgctatggtaaaactgtgaagctttcg
aatggtacatacattgaaccacaagcacaattgagctacactcacttcggtggcgacagc
ttcaatgctggcagcatgcatgtagatcaatctggtgtgagcagcacagcaggtagtctt
ggccttgaaatcggtaaaaacttcggtgcaggtaatatctatactcgtataggtgtaaac
catgccttctctggcacagtaaaaactacttacacaagtggtactactactaaatacaca
tccgaagacattaaaggtacttggacagatctagctttcggcggccgctatggcttcaat
gcaaataacagcatcttcggtgacattagtacaggtctatctggcgactataaagctggc
tggtctgtaaatgcaggatttactcataaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system