Vitis riparia (riverbank grape): 117918469
Help
Entry
117918469 CDS
T07274
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
vri
Vitis riparia (riverbank grape)
Pathway
vri03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vri00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
117918469
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
vri03019
]
117918469
Messenger RNA biogenesis [BR:
vri03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
117918469
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117918469
NCBI-ProteinID:
XP_034691047
LinkDB
All DBs
Position
7:23321959..23327719
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFVGGIPWDTTEEKLKEYFNQYGDVTQTVIMRDKTTGRPRGFGFVVFADPAVL
DAVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQHTSRPGNSNTGRSSGMGGNFKTKKIFVGGLPSTL
TEEGFRQYFETYGHVTDVVVMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHELNGKLVE
VKRALPKDANPGGGGRSGGYQGYGASGANTSAYEGRMDGNRFMPPQTTGGGFPPYSGYGA
PGYGYGAANSAVGYGGYGSYGVGGYGSANTGFGGPAGAYGNPNAPNAGYVSGPPGAMKSQ
WNNQTPSGYGASGYGSNAAYGATGPWNAPGGAGVSGPMGQSPSGASGYGSQGFGYGNYGG
SDGSYSGGYGAAGGRAGSAPSSGGSASGEQGTGGGYMGSGYGDANGNQGYSNAGWRSDPS
QGAAGYGGGYGGAQRQAQQQ
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcagacgaaggaaagctatttgtaggaggcataccatgggacactacagaggag
aagctcaaagagtactttaaccagtacggggacgtcacgcagacagttattatgcgggac
aagaccactggtcgacccagaggctttggctttgtggtattcgcagatcctgccgttctc
gatgcagttcttcaggagaagcacaccattgatggcaggacggtggaggctaaaagggct
ttatcaagagaagaacagcacacctccagacctggaaattctaatactggcagaagctca
ggcatgggaggaaattttaaaaccaaaaagatatttgttggagggttgccttccaccctt
actgaggaaggatttcgtcagtactttgagacttatggtcatgtaacagatgtagtagta
atgtatgaccaaaatactcaacgtccccgtgggtttggattcatatcctttgacactgaa
gatgcagttgatcgagttttacataagaccttccatgaattgaatggtaagcttgtagag
gtgaaacgagccctccctaaagatgcaaatcctggtggtggtggccgtagtggaggctac
caaggctatggtgcttctggtgctaatacaagtgcatatgaaggtagaatggatggtaat
agattcatgccacctcagaccactggtggtggtttcccaccatattctggctatggtgca
ccaggttatggctatggagcagcaaatagtgctgttggttatggtggttatgggagttat
ggtgttggtggttatggaagtgccaatactggatttggcggtcctgctggggcgtatgga
aacccaaatgctcctaatgctggttatgtaagtggcccacctggtgctatgaaaagccaa
tggaacaaccaaactccttctggatatggtgcttcaggctatggttcaaatgcagcctat
ggagctacaggtccttggaatgctccgggtggtgctggtgtttctggaccaatgggtcaa
tctccaagtggcgcttctggatatggaagtcaaggttttggatatggtaactatggtggg
agtgatggttcttattctgggggatatggggctgctggtgggcgtgctggaagtgcacct
agttctggtggtagtgctagtggagaacaggggacaggtggtggctacatggggagtggc
tatggtgacgccaatggaaatcaagggtattcaaatgccggctggaggtctgacccttca
caaggtgctgctggttatggtggtggctatggtggtgctcagaggcaggcccaacagcag
tga
DBGET
integrated database retrieval system
