Aliivibrio salmonicida: VSAL_I0350
Help
Entry
VSAL_I0350 CDS
T00782
Symbol
thiP
Name
(GenBank) thiamine transport system permease protein ThiP
KO
K02063
thiamine transport system permease protein
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
Pathway
vsa02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vsa00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
VSAL_I0350 (thiP)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vsa02000
]
VSAL_I0350 (thiP)
Transporters [BR:
vsa02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Thiamine transporter
VSAL_I0350 (thiP)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ78035
UniProt:
B6EPV1
LinkDB
All DBs
Position
1:381775..383397
Genome browser
AA seq
540 aa
AA seq
DB search
MKTNPLNSIPYIGYMIATVIVIFVGGAIGALLIASPSINVSLIWSDPYYIHITKFSFYQA
TLSTLFSVVLAVPTAYALSRRSFLGRGLLLKLCATTLVLPVLVGVFGLLAIYGNSGLLAK
VFAFFGGKLPFSIYGLNGILLAHVFFNYPFATRLFLQSLDSIPMEQHQLSAHLGLTGWNK
FNVVAWPRVKQQFPHVAGLVFMLCFTSFATVMALGGGPKSTTIELAIYQAIKFDFDLQAG
AILALWQMLLCAGLSLCIQRFSTSIAVDSATLGKPIIYQDSKRQKLWDKGWIILLTLFIL
PPLLMVVISGINSEVITVMTSSAFWSAFANSFIVAFCAALLAMVFGVLLLHTTRALRLNH
QRFLADKLDLIGTMILVTPGLVISTGLFLLLRNITDVFSMAIWIVILVNALMALPYVIKT
LAQPLLHMAQQYQLLCASLGLNGFTRFRLIEWRGLRKPMAHAFAFAFAIAFILSMGDLSA
IALFGSQDFRTLPLYLFQLLGSYQMEAAAVVSLCLLLLSVGVFSTVEWLFSSKNLQRENV
NT seq
1623 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacgaatcccttaaattctattccctatatcggctatatgatcgctactgtgatt
gttatttttgttggcggagctattggtgcattattaatcgcgtcacccagtatcaatgtc
agtttaatttggtccgatccttattatattcatataaccaaatttagtttttatcaagca
accctgtctacgttgtttagtgtggtacttgcggttccgacagcatatgcactatctcgt
cgctcttttttaggacgcggtctgttattaaagttgtgtgcgacgaccttggttttacct
gtgttagtaggggtttttggtttacttgctatttatggaaacagcggtctcttagctaag
gtgtttgcattttttggtggtaaattgccgttttctatttatggattaaatggcatttta
ctcgcgcatgtgttctttaattatccttttgcaactcgtttgtttttacaatcattagac
agtataccgatggagcaacatcagctttctgctcatctaggattgactggatggaataaa
tttaacgttgttgcatggccaagagtaaaacaacaatttccgcatgttgcaggcttggtg
ttcatgctttgctttaccagttttgcaaccgtaatggcattaggtggaggaccaaaatca
accacgattgaacttgctatttaccaagccattaaatttgattttgatttacaggccggc
gctattttagcgttatggcaaatgttgttatgcgcaggattatcgctgtgtattcaacgg
ttttctacgtcgattgccgttgacagtgcaacgctaggtaagcccattatctatcaagac
tcaaagagacaaaagttgtgggataaagggtggatcatattacttactctgtttatttta
cctccattactcatggttgttattagtgggataaattctgaagttattacggtgatgacc
tctagtgctttttggtcagcattcgctaattcattcattgttgctttctgtgcggcgcta
ttagcgatggtttttggggttttattgcttcataccactcgagcgttaaggcttaatcat
cagcgttttttggcggataaattagatttaattggtacgatgattttagttaccccagga
ttggttattagcacggggttgtttttgttgcttagaaacatcactgatgtatttagtatg
gctatttggatcgtcattttagtcaatgcacttatggcgcttccatacgtcataaagacg
cttgctcaacctttattgcatatggcacagcaatatcagttattgtgtgcgagtttagga
cttaatggttttactcgttttcgcttaattgaatggagagggttaagaaaaccgatggct
catgcctttgcctttgcctttgccattgcttttatcttatcaatgggtgatttaagtgcg
atagcgctttttggtagtcaggattttaggacattgccgctatatttatttcaattatta
ggcagttatcaaatggaagcggctgcggtggtttcactttgtttactcttattaagtgtg
ggtgtgtttagtacggttgaatggcttttttcatcaaagaatctacaaagagagaatgtg
taa
DBGET
integrated database retrieval system