Aliivibrio salmonicida: VSAL_I0606
Help
Entry
VSAL_I0606 CDS
T00782
Name
(GenBank) putative signaling protein
KO
K20965
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
Brite
Enzymes [BR:
vsa01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
VSAL_I0606
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_4
PAS_9
PAS_8
PAS
Metal_resist
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ78291
UniProt:
B6ENF0
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(670270..672309)
Genome browser
AA seq
679 aa
AA seq
DB search
MSLAQIQHWLPLLTDNSPFLFAILDSDHKYVTVNNRYSEISGLNRESLCGRTDPEILGEH
FYSSLKSYYDRAFNGEKIEAEITLNDHRFETSLHFSLFPIEQDGNTYIVFHAVDTSERQL
LLNSLEESESKYRKLTELLTDAIFLLEGDIIVSANTASATILGFNKPSEFIGESIEQLFS
SPSKTKSLSELITALPSEQQLVVRSSANCATRAELSLSVEKTHVLGSTAHLVILKNKKPT
EKNVTICSPQVDLLTGIYNRHGFTHVIEKMIKEDIPFFMLYLDIDIDIDNFKNINDSLGH
HIGDRVLKEISTRLQKLLPKHAVVGHLGGDEFGIIFPKPEHNQILDQLAEKIINLINQPF
DLVHFSKRLACSIGSVQYPVDGTDARSLLQNADTAMYEAKDRGRNRLIKFHDQMNKEARM
RLWLEIELQKALQNNGLEVWYQPKVSARDFRINGAEALVRWKHPVEGYISPARFIPVAER
SGLIETLGKVVMREVFQTVKEWGNQGILPGRIAINLSPAQFGNPQLIEYMERLLKTTQVD
PNCITLELTESAVMSDGEHAIQMLDAIKKLGFTLSIDDFGTGYSSLAYLARFPVDELKID
RGFISEIDTLPKQITIIENVINLGKNLNMDIIAEGVETRQQAMLLSSLNCDSIQGFHFYK
PQPKQEIEALLVQNKRASS
NT seq
2040 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcttgctcaaatacaacattggcttcctttactaacagacaatagccccttcttg
tttgccattctggattcagaccataaatacgttacggtgaataaccgatatagtgagata
agtggattaaatcgagaatcactctgtggtcgaactgatcctgaaattttaggtgagcat
ttctattcttcattaaaatcctactatgaccgagcattcaatggcgaaaaaatagaagct
gaaatcaccttaaatgatcatcgctttgaaaccagtcttcattttagtttatttccaata
gagcaagatggtaatacttatattgtattccatgctgtcgatacatcagaacgacagctc
ttacttaattcattagaagagagtgagtcaaaatatcgtaagttaaccgagcttctcact
gatgcgattttcttattagaaggcgacatcatcgtttctgccaataccgcatcagccaca
atattagggtttaataaaccatcagagtttattggtgaaagcattgaacaattattcagt
tcaccatcaaaaactaaatcgttatctgaattaattactgctcttccttctgagcaacag
ctcgttgttcgaagctctgctaattgtgcaactcgtgctgaattgagtttaagtgtagaa
aagacgcatgttcttggtagtaccgctcatctggttatccttaaaaataaaaaaccaaca
gaaaaaaatgtaaccatttgctcacctcaagttgatcttttaactgggatttataaccgc
cacggttttactcatgttattgaaaaaatgatcaaagaagacattccatttttcatgctc
tatcttgatattgatattgatattgataattttaaaaacattaatgactctttaggccac
cacattggtgatagagtactaaaagagatatcgactcgcttacaaaaactgctaccaaaa
catgccgtagttgggcatttaggcggcgatgaatttggcattatctttccgaaaccagaa
cacaatcaaatccttgaccaacttgctgaaaagatcattaacttaataaaccaaccattt
gatttagtacacttttcaaaacgattagcttgctctattggcagtgttcaataccctgta
gatggaacagatgcccgcagtttgctacaaaatgcagatactgcgatgtacgaagcaaaa
gatcgtggtcgtaatcgtttgatcaaattccatgatcaaatgaataaagaagcaagaatg
cgtctatggttagaaatcgaattacaaaaagcactgcaaaataatggactcgaagtgtgg
taccaaccaaaagtaagtgcccgtgatttcagaattaatggtgcagaagccctcgttcgt
tggaaacatccggttgaaggttacattagccccgctcgatttattcctgtcgcagaacgc
tcaggtttaatagaaactctcggcaaagtggttatgcgtgaggttttccaaacggtaaaa
gaatggggtaaccaaggtattttacccggtcgtattgctatcaatttatctccagcacaa
tttggtaatccacaactcattgagtatatggaaagattactaaaaacgacccaagtcgat
cctaattgcattaccttggaattaacagaaagtgccgtaatgagtgatggtgaacatgcg
attcagatgctcgatgccattaaaaaactgggatttacactgtcgatagatgattttgga
acgggctattcttcccttgcttacttagcaagattccctgtcgatgaattaaaaatcgac
cgtggtttcattagtgaaattgatacactaccaaaacaaattaccattattgaaaacgtg
attaatctcggaaaaaacttaaatatggatattattgctgagggagtagaaacaagacaa
caagcaatgctactgtccagtttaaattgtgattcgatacaaggcttccatttctataag
cctcagccaaaacaagagattgaagcgctattagtacagaacaaacgcgcatcatcctag
DBGET
integrated database retrieval system