Aliivibrio salmonicida: VSAL_I0709
Help
Entry
VSAL_I0709 CDS
T00782
Symbol
lamB
Name
(GenBank) maltoporin precursor (outer membrane protein S)
KO
K02024
maltoporin
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vsa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vsa02000
]
VSAL_I0709 (lamB)
Transporters [BR:
vsa02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
VSAL_I0709 (lamB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ78394
UniProt:
B6EGW7
LinkDB
All DBs
Position
1:795907..797184
Genome browser
AA seq
425 aa
AA seq
DB search
MKLLPVAFAVTAALSSPIILAETELLDNIQLDDQQPLVISPETDIPDGIVFSGYARYGFH
FSDDTEKYVSADGQLIGNATGRLGYESNGGEFQFAKGFVSDNGTIWDVVLMLEHWGDEVG
LKKFYAGATNVFESQPNAYIWAGRDFHNRPQTGLNDYFWMQNDAQGAGIKNLEFGSVKFD
MAAVAQVDDNGGTGDSGNYAITSKLHDINLTDALALSLYANYGFSSKNTETDKDTQTCTG
TGLDKQCYVDDIDSYQLAIQLDHTYGAMTNKFVTRYGNNVDNNIFNKTEDLTTLLMQLEG
KLVISNQTNIEYLAGYQSLEDKNASQDDRANYSAIVRPTYAWNSIHSTWLEAGYSVVDFD
NQSGQNDAWKVTLSQNISFDMDSGARPMLRFYATVGDSNTEVDLTRGETGKQETFAVGAM
WEAWW
NT seq
1278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttattacctgttgcttttgctgttacagctgcactttcttcaccaatcattttg
gctgaaacagaattgctagataatattcaattagatgatcaacaacccttagttatttct
ccggaaacagacatacctgatggtattgtattttcagggtacgctcgttatggttttcac
ttttcagatgacacagagaaatacgtttctgctgatggtcaattgattggaaatgctacg
ggtcgtttaggttacgaaagtaatgggggggaatttcaatttgctaaaggattcgtctct
gataatggtacgatttgggatgtcgttttaatgttagagcattggggtgatgaagttggt
ttgaaaaaattctatgcgggggcgacgaatgtttttgaatcacaacctaatgcttatatt
tgggctggccgagatttccataatcgtcctcaaacagggttaaatgattacttttggatg
cagaatgatgctcaaggtgctggtattaaaaaccttgaatttggcagtgtaaaatttgac
atggcagcggttgcgcaagttgatgacaatggcggtactggtgatagcggaaattatgcg
attacctctaaattgcatgatattaacctgacagatgcattagcattatcactgtatgct
aactatggtttctcttctaaaaatacagagacagataaagatacgcaaacatgtacgggc
actgggctggataaacagtgctatgtggatgatattgattcataccaattagccattcaa
cttgatcatacttatggtgcaatgacgaataagtttgttactcgttatggcaacaatgtc
gataataatatctttaataaaacggaagatctaactacgttgcttatgcagttagaaggt
aagttggttattagtaatcaaaccaatattgaatatttagcaggttatcaatcgttagaa
gataaaaatgcaagtcaggatgaccgagcgaactacagtgcaattgtccgaccaacatat
gcatggaatagtattcattctacttggttggaagcgggttattctgtggttgattttgat
aatcaaagtggacagaacgacgcgtggaaagtcacactatctcaaaatatcagttttgat
atggactcaggagcacgcccaatgttgagattctatgcaacggttggtgattcaaatact
gaggtagatttaactcgcggagaaaccggtaagcaagagacatttgcagtgggtgcaatg
tgggaggcgtggtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
