Aliivibrio salmonicida: VSAL_I1516
Help
Entry
VSAL_I1516 CDS
T00782
Name
(GenBank) putative multidrug resistance protein
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vsa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vsa02000
]
VSAL_I1516
Transporters [BR:
vsa02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
VSAL_I1516
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
NDUF_B12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ79201
UniProt:
B6ELA1
LinkDB
All DBs
Position
1:1618507..1619874
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MKKILALAFPLIISQLVSMALVLTDVWMMSRLSVSALAGGGLGASIYFFIFIIASSTVGC
VANLIAIAYGQRLARPEYGNQQIRFAVKGAVLLSAVLSVILMFSFSYAPVILKAANQPEE
MITLAMEYVHALKWVMFPSLILLVLRGLTSALGNVRSIMVMSVITVILNVPISYVLTFQL
GMGLTGLGLGTAVAAFVVMIGYGMWVFKHHEYQEFAPWRNREEYSLKLMAPLLVMGLPIA
LAALLEHGLIYGGTLMAGTISIASLALHQILLQCLSFTWNFNFGFSQAAAILVGRDFGSE
NYAGIKQTSLHSFLLVTVLSVFLSTVFILWPEVIADLFLLDDGTNNMSALLSSVIWVVAL
CFIVDAWQLLAINLLRGMKIVSMPTVMTAIGYWVFGLPAAWFLMPLFGLAGIWAGIGVGL
GVTGVLLLMHLTVAIRRYGNVSSLPIHTANASGKI
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagatcttagctttagcattccctcttatcatctctcaattggtttcgatggca
ctggtgcttaccgatgtgtggatgatgtcgcgtttaagtgtttctgccttagcgggaggt
ggattaggtgcttctatttattttttcatttttattatcgcaagcagtactgtgggctgc
gttgcgaacttaattgccatcgcttatggccaacgtttggcaagacctgaatacggaaac
caacaaattcgctttgcggtaaaaggggcggttttattgtctgcggtgctcagcgttatc
ttaatgttcagtttttcatacgctcccgtgatactaaaagcggcaaatcaacctgaagag
atgatcacgctcgcgatggaatacgtgcatgcgttgaaatgggtgatgtttccgtcgtta
attttactcgtgttacgcggcttaaccagtgcgttgggaaacgtaagatccatcatggtg
atgtctgttattaccgttatcctaaatgtccctattagttatgttttaacgtttcaattg
ggaatgggattaaccggtttaggtttgggtaccgctgtagctgcttttgttgtgatgatt
ggttatggtatgtgggtctttaagcatcatgaatatcaagagtttgcaccatggcgcaat
agagaggaatattcacttaaattgatggcacctttattggtgatgggattgcctattgca
ttagccgcattacttgagcatgggttaatttatggcggtacactgatggcgggcactatc
agtattgcgtctttagctttgcaccaaatcttactgcaatgtttaagctttacatggaat
tttaattttggattttcgcaagccgcggctatattagtcgggcgtgattttggctcagaa
aattatgcaggcataaaacaaacgtcattgcatagttttttacttgtgacggtactcagt
gtcttcctctccacggtatttattctttggcctgaggttattgctgatttattcctgctt
gatgatggcacgaataacatgtcagcactgttgtcttctgttatctgggtggtggcgttg
tgttttattgtggatgcatggcaattattagcgattaacttattgcgaggaatgaagata
gtctcaatgcctacggtgatgacagcgattgggtattgggtatttggtttgcctgcggcg
tggtttttgatgccattgttcgggcttgccggaatttgggcaggtattggcgttggatta
ggcgttaccggggtgttattactgatgcatttaacggttgctattcgtcgctacggaaat
gtgagttctctacctattcatactgcaaatgcttctggtaagatttga
DBGET
integrated database retrieval system
