Aliivibrio salmonicida: VSAL_I2829
Help
Entry
VSAL_I2829 CDS
T00782
Name
(GenBank) membrane associated response regulator, histidine kinase
Organism
vsa
Aliivibrio salmonicida
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_4
PAS_8
HATPase_c_2
PAS
PAS_10
DUF6468
EIF3I
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAQ80513
UniProt:
B6EN95
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3063960..3067406)
Genome browser
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MTQGWIVVPVSLAYLGLLFLIAWYGDRQKGWLSRYRPWIYSLSIAVYCTSWTFYGTVGQA
TSNPWSFLPIYLAPILVFVFAWRFLARIILIAKREHITSIADFIAARYGKSQGLAGVITV
IAVIGILPYIALQLRGITMGLDLVAPNLAQDLGYQDGHISWFVSGALAIFTILFGTRHID
TTEHHRGLMMAVAFESIVKLVAFLSVGGFILYLAYSEPTVDLITVAKDTYQSPNLITLLF
HTLLTMAAIICLPRQFHTTVVENEQAQDLRTARWVFPLYLLLMGLFVLPISWAGQGLLSG
GVSDSFVISVPLSIGAEHMALLAFVGGTSAASGMVIVSTIALAIMVSNDLVLPLLLRRVR
TTSRTFGHFSKLLVTIRRLLIVLLLVGAWGFYQALDSIDSLSVIGLLAFAAIAQFAPALI
GGLYWRQGNKKGVYAGLAIGFVLWLITLMSQTQMLAGSAENNFLLWIITPPNWLQNLEVK
TSDWGMMLSLSLNAMLFIFVSSVTRASLSERLQAAAFVGAPLPESEDVSVYQTRVTVAEL
EMLASRFVGRKRARKAFRQFAQQHGDALLPQQQASSQLIRHTERVLAGVFGASSSRLVLT
SALQGRNMQLEEVATIVDEASELYDFSRGLLQGAIEHISQGIAVVDKQMKLVAWNQRYLE
LFTFPAGLIQVGRPIADVIRHNAEQGLCGPGDPEVHVKRRVEHLERGTRHVSSRIRADGQ
VIEVQGNPMPNGGFVMSFTDITVFRQAEKALKETNESLEFRVHERTKELEKLNQRLVGAT
QSAEKASHSKTRLLAAVSHDLMQPLNAARLFASSLSEVAKDGETKKISGHIESALGAAEE
LIGDLLDISRLEAGKLETNVHGFSLHHMLSNLEAEFGALAKQQGIDFSVIHSDVVVESDP
KLLRRVLQNFLTNAFRYNPEGKVVLGARRIEGKIRLDVWDSGIGIPEEKQQAIFEEFTRV
DQSRADQGLGLGLAIARGISHVLGHTISLRSWVNNGSVFSVTLDRGVVLESDAPTITQKP
ELPLSSVRVLCVDNEPDILIGMESLLERWGCEVKTATDLMGSLRCLEEGWVPDVIFSDYR
LDNDRTGLEVLQQCRLRLGNNFEGVMISADKTEDLLESIKSNGFGFIAKPVKPLKLRSVL
NRHTTSAV
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacacaaggatggatcgtcgtgccagtttcgctggcttatttaggattgctattttta
attgcctggtatggtgatcgtcaaaaagggtggttatcgcgttatcgcccgtggatttac
agtctttctattgcggtttactgcacctcttggaccttttatggcacggtaggccaagcc
actagcaacccgtggtcttttcttcctatttatcttgcccccattcttgtgtttgttttt
gcatggcgttttttagcccgaattattctgattgcaaagcgagagcacattacgtccatt
gctgattttattgcggctcgttacggtaaatctcaaggtttagccggtgtgattacggtc
attgcggtgattggtattcttccttatattgcgttgcaattacgagggatcaccatgggg
ctcgatcttgttgctcctaatttagctcaggatttaggttatcaagatggccacatttct
tggtttgtcagtggtgcattagcgatttttactattctatttggtactcgacatatagat
accactgaacatcatcgtggattgatgatggcagtggcctttgaatccattgttaagctt
gttgcctttctttcggttggtgggttcattttatatttggcgtattcagagccaacggtc
gatctgattaccgtagcaaaagacacctatcaatcgcctaatctaattaccttattgttt
catacgttattaacgatggcggcgataatttgtttgcctcgtcagttccacacaacagtg
gtggagaatgaacaagcgcaagacttaagaactgcacgctgggtctttcctctttattta
ttattgatgggattatttgtcttacctatctcatgggcaggacagggattgctctctggt
ggcgttagtgactcttttgtcattagcgtgccattgtctattggcgctgaacacatggca
ttacttgcttttgttggagggacttcagcggcgagtgggatggtgatcgtctcgaccatt
gcacttgcgattatggtttcgaatgatttagtcttgcctttactcttacgtagagtaaga
accacgtctcgaacctttgggcatttttctaaattattagtgacgattcgtcggttattg
atagttctattattagttggcgcatggggtttttatcaagcgttggattcaatcgattct
ctttctgttattgggttattggcgtttgctgcaatcgcgcaatttgcaccagcacttatt
ggtggtttgtattggcgacaaggaaataaaaaaggagtctatgcgggtttggcgattggc
tttgtgctgtggttaatcacgctgatgagtcagacgcaaatgttagcgggcagtgctgag
aataattttttattgtggatcattactccgcctaattggctgcaaaatctggaagttaaa
acgtccgattggggaatgatgttgagcttaagtttgaatgccatgttgttcatttttgtt
tcttctgttactcgagcgtcgttaagtgagcgtttacaagccgcggcttttgttggtgct
cccttgcctgaaagtgaggatgtaagcgtataccaaactcgcgtgacagtggctgaactt
gaaatgttagcgtcccgttttgtcgggcgaaaaagagcaagaaaagcatttcgtcagttt
gctcagcagcatggtgatgcgttacttccacagcaacaagccagctctcaattgattcgt
catacagagagagtgctcgccggagtatttggtgcctcttcttctcgcttggtactgacg
tctgctttgcagggacgaaatatgcaacttgaagaggtcgcaaccattgttgatgaggct
tctgaactttatgattttagtcgtgggttattgcaaggagcgatcgaacacataagccaa
ggcattgctgtggttgataagcagatgaagctagtggcatggaatcaacgctatttagag
ttatttacgtttccagcaggacttattcaagtcgggcgtccgatagcggatgttatccga
cataatgcagaacaagggctttgtgggccgggtgatcctgaagtgcatgttaagcgacga
gttgagcatttagagcgaggcactcgacacgtttcttctcgaattcgagcagatggacag
gttattgaagtgcaaggtaacccgatgccaaacggtggttttgtgatgagctttaccgac
atcacggtatttagacaggcagaaaaagccctaaaagaaaccaatgaaagcctagaattt
cgagtgcatgaacgaaccaaagaattagaaaaattgaatcagagattggtgggcgctacc
caaagtgcagaaaaagcctcgcactcaaaaacacgattattagcggcggtgagtcatgat
ttaatgcagcccttgaatgccgctcgcttgtttgcgtcttcattaagcgaagtcgctaaa
gacggtgagacaaagaaaatatcagggcatattgaaagtgcattaggggcggcagaagag
ttaatcggcgatttattggatatttctcgtttagaagcgggtaagttagaaaccaatgtt
cacggtttttcactccaccatatgctctctaatttagaagccgaatttggtgcgttagca
aaacaacaaggcatcgatttttcagtgattcattctgatgtggtggtggaatccgatccg
aaattattacgtcgagtattacagaacttcttaaccaacgcctttcgatataaccccgaa
ggcaaagtggtactgggtgcgagaagaatcgaaggtaaaattcgtctggatgtatgggac
agtggtattggtattccagaagaaaaacaacaagccatttttgaagagtttactcgtgtc
gatcaaagcagagctgatcaaggattaggattagggttagcgattgcgagagggatctct
catgtgctcgggcatactatttctctgcgttcatgggtgaataacggctctgtattttct
gtcacattggatcgtggtgtggtgcttgaaagcgatgcgcctaccataacccaaaagcct
gaattgccattaagttcggttcgtgtgttgtgtgtggataatgaacccgatattttgatt
ggtatggaatcgctacttgaacgttggggttgtgaagtcaaaacggcgacggatttgatg
ggcagtttacgttgcttagaagagggttgggtacccgatgtcatcttctcagattaccga
ttggataacgaccgaaccggcttagaagtattacaacaatgccgcttacgtttaggaaat
aactttgaaggggtaatgatcagtgcagataaaactgaggatttactagaaagtattaaa
agtaatggttttggttttattgcaaagccagtcaaaccgttaaaattaaggtctgtgtta
aatcgccatactacctcagcggtttag
DBGET
integrated database retrieval system
