Vitreoscilla stercoraria: LVJ81_01370
Help
Entry
LVJ81_01370 CDS
T08153
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis/export family protein
KO
K01991
polysaccharide biosynthesis/export protein
Organism
vst
Vitreoscilla stercoraria
Pathway
vst02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vst00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
LVJ81_01370
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vst02000
]
LVJ81_01370
Transporters [BR:
vst02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LVJ81_01370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLBB_2
Poly_export
SLBB
Wza_C
DUF3821
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOO92726
LinkDB
All DBs
Position
293990..295162
Genome browser
AA seq
390 aa
AA seq
DB search
MNVNFKILGTRTVKSVKNIVLISSMVASLAACTVPGSALKINNKNVVAQSDQHVSIDELV
DIYPITPLLVQRLQKPALHSKENIALLQAKQKYQYRVQAGDVLRVTVWDHPQLMAPVGVV
PVSSSRDMPTTAGQVIHEDGRIYYPYVGAISVAGKTTTEIRRIVTQRLAGYIKNPKVEVD
VVQYRSQRVYVSGAVRASNQLPITNVPLTLLDAINNVGGYNENADIQNIKITRDGRDLAV
SLYDLMQHGDLSQNLLLKDGDVVYVPNNERMKVHILGEVQAQKTLRMEPAGMTLTAALGA
ANGLNNNIANAKGVFVIRAESGMSNNKIGKIYQLDLSDASAHVLGAQFQLEPNDVVYVTA
APVARWNRVLSNIFPSVSSLLAVSNSVGSF
NT seq
1173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaatgttaattttaaaattttgggtacacgcacagtgaaatcagtaaagaatattgtt
ttaattagttccatggtagccagcttagctgcttgtacggttccgggttctgcactcaaa
attaataataaaaatgttgtagcacaatcagatcaacacgtcagtattgatgagttggta
gatatttatcctattacacctttattggttcagcgtttgcaaaaacctgcgttgcattca
aaagaaaatattgcattattgcaagccaagcaaaaataccaatatcgtgtacaagctggc
gatgtattgagagtgactgtttgggatcatcctcagttgatggctccagttggggttgta
cctgtgtcatcttctagagatatgccaacaactgctggtcaagttatacatgaagatggt
cggatttattatccttatgtgggcgctatttctgttgcaggtaaaaccacgactgaaatt
cgtcgtatcgtcactcagcgtttggcgggctatattaaaaatcctaaagttgaagttgat
gtggttcaataccgttcgcaacgagtgtatgtttctggtgcagtgagggcatctaatcaa
ttgcctattacgaatgttcctttaactttgttagatgccattaataatgtgggcggttac
aatgaaaatgcggacatccaaaatattaaaatcactcgtgatggtcgagatcttgcagtt
tctttgtatgatttgatgcaacacggtgatttaagccaaaacttattgttgaaagatggc
gatgtggtttatgtacctaataatgagcgtatgaaagtgcacattttaggagaagtacag
gcgcaaaaaacgttgcgtatggaacccgctggcatgacattaacggctgctttaggtgca
gccaatggcttgaataataatattgctaatgccaaaggtgtttttgtgattagagctgaa
agtggtatgtcaaataataaaataggtaaaatttaccaactggacttatctgatgccagt
gctcatgtcttgggagcgcagtttcaactagagcctaatgatgtggtttatgtaactgcg
gctcctgtggcacgttggaatcgcgttttatctaatattttcccttcagtatcaagttta
ttggcggtaagtaattcggttggtagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
