Vitreoscilla stercoraria: LVJ81_09045 Help Entry LVJ81_09045       CDS       T08153                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K21449   trimeric autotransporter adhesin Organism vst  Vitreoscilla stercoraria Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vst00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:vst02000]     LVJ81_09045 Transporters [BR:vst02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    LVJ81_09045 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  YadA_stalk YadA_head ESPR Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  UOO91776 LinkDB All DBs Position complement(1850901..1860374) Genome browser AA seq 3157 aa AA seqDB search MNKAYKVVYNETTGTYVAVAEIESSRGKSTKSQTSVTTRESALNSFQWQPLSKISTLLIP ILGGLGSLMVSNQASAIILEGDIACANGNTQTIVGPDGVTVYSSSPGNPIDGYLSPASTW STVAGCGADGGEGTTTYASTLYGAFTKATGNFAVAMGFDARSAGSAVAIGTQARASSQGS VAIGTSAKAQNVNAVAVGTNTIAGNQNDVVIGNNITSTSTLLTSSAEATSKEFGTIAIGN EVDVGGTRMVVIGNESGMTVGSGTDSHDSIAIGTQTRLNGQRVIAIGTGVNNIGINSIAM GSYSNVDFASQGGTAVGRETKLQNSFLGTAIGNQTHVVGSDGGTAVGDRHKVTNSGYAAA FGSRAEVTDSANAIAIGAATKVTGASNGIAIGRDSATSAENGLALGTASSTSGSASIAIG SNSKNPAANSIALGHKASIVNAQNVGAIVIGDNARSEYYGAAEQFVIAIGANSNSYAYSV ALGKEASADRGAYDAEGGSIAIGYRANTTDASRASIAMGVNSQVTSQYGVAIGTQSKASG ANATAMGHNALASRANSIVIGTNAVSNGVADSTVVIGDGASSVGDGSQGIIIGAKSSNND AVNSITIGHDASTYKGDAVVNIGYGANTSAGYSVTIGPNAASFGAISAQHQVTIGSGANT SAANAIAVGHSAASAGSKAAAFGYQSNASALSAMALGSQSTASGIYSVAVGDSSKAIDRY AIAMGYQSNASGPDSIAIGVGSAASGNQSIAVGYKNQVTGNNSGAFGDPNVISGNNSYAL GNNNTISGNSTHVLGNNNTAKGSSSYIIGNNSSTELSNDIAIGTEAKTGISTQPTEGFSG AQVAIGYKATTGTDGQIALGTMTNAGAVNHTIAIGTKATTTGNSSIAVGRNAASSGLNAA AVGVGATAVGSSSAAYGTNSNSEGGNSVAIGSAAHSASTNSIALGNTSEVTANNAIAIGS GAVASVANSVALGNGATTSAAVGTASTTLGNTTFNVAGTTPTGTVSVGKAGSERTVTNVA AGRVTATSTDAINGSQLYVVAAFADQGLNFTANSGGTVNRDLGQTLNIVGSLNNKALTIE PTSVAATAGQYSARNTQTVSDPTTGRIQIQFADRPTLSGVVLDGKDGQDAGIQFGKDGLS LKGVGVDGKDGITIVGANGKDGITFNKDGTITNVVQSTTPDGLATNKSVDDKVAANKALG LNFTGNTGPTLHRDLGQTLSIIGSAQTLNKSSDATKETTAGSYYARNLQTVTVVNSLTGD TTLQMLLADRPTFSGVVLDGKDGKDASIQFGKDGLSLKGVGVDGKDGITIVGANGKDGIT FNKDGTITNVVQSTGPDGLVTNKQLDDTKALGLNFTGNAGGTVHRNLGETLNIIGSAQGL NKTFDTATTGSTTGAYYSRNLQTVTDPITGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASIQFG KDGLSLKGVGVDGKDGITIVGANGKDGITFNQDGTITNVVQSTDPDGLVTNKQLDDTKAL GLNFTGNAGGTVHRNLGETLNIIGSAQSLNKTFDTATAGSTTGEYYSRNLQTVTDPNTGR VQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMTGANGKDGI SFNPDGTISNVTDGKNPGDVATKDQIDKLASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTLSIIGSAQN LNKAFDNAAAGSTTGEYYSRNLQTVTDPNTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASVQF GKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMTGANGKDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDVATKDQIDK LASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTLSIIGSAQNLNKAFDNAAAGSTTGEYYSRNLQTVTDP NTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMTGANG KDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDVATKDQIDKLASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTLSIIG SAQNLNKAFDNAAAGSTTGEYYSRNLQTVTDPNTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDA SVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMTGANGKDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDVATKD QIDKLASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTLSIIGSAQNLNKAFDNAAAGSTTGEYYSRNLQT VTDPNTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMT GANGKDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDVATKDQIDKLASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTL SIIGSAQNLNKAFDNAAAGSTTGEYYSRNLQTVTDPNTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKD GKDASVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGIQGMTGANGKDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDV ATKDQIDKLASGGLDFLGNAGGLVHRNLGQTLSIIGSAQNLNKAFDNAAAGSTTGEYYSR NLQTVTDPNTGRVQVQFADRPTLSGVVLDGKDGKDASVQFGKDGLSITGLGVNGKDGIGI QGMTGANGKDGISFNPDGTISNVTDGKNPGDVVNKGQLDDIASAGLDFTANSGALVHRDL GQTLGVIGSETGLNLAVDTSKNATASKYNSSNIQTVTTGNGIQVQFADRPEFSGLVVNGK DGKDASIQFTDSSGNKGTSLVGKPGADGAPGLTVVGKDGKDGVSFNNDGTISNVTDGTRP NDAVNKGQLDDIADGLTNSGLSFTDDAGTVIHRKLGETLGLTTTSVNMKTVVGKDGIAIN FSDRPEFSGLVVNGKDGKDASIQFTDPSGNKGASLVGKPGADGLPGLTVVGKDGKDGVSF NNDGTISNVTDGTRPNDAVNKGQLDDIASAGLDFTANSGALVHRDLGQTLGVIGSDKSLG LTHDTTGVATTGNYTAKNVQTVTTSNGLQVQFADRPEFSGLVVNGKDGKDASIQFTDPSG NKGASLVGKQGADGVPGLTVVGKDGKDGVSFNNDGTISNVTDGTRPKDAVNKGQLDDIAS AGLDFTANSGALVHRDLGQTLGVIGSETGLSLAVDTSKNATAGKYNSSNIQTVTTGNGIQ MQFADRPEFSGLVVNGKDGKDASIQFTDPSGNKGASLVGKQGADGVPGLTVVGKDGKDGV SFNNDGTISNVTDGTRPKDAVNKGQLDGVSDALTNSV NT seq 9474 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaacaaggcatataaagttgtctacaacgaaacaacgggaacctatgtggcggtcgcg gagattgaatcctcccgaggaaagtccactaagtcacaaacatccgtgaccacgcgagag tcggcattaaattcattccaatggcaaccattaagtaaaatcagtactttgctgattccg atattagggggattaggcagcttgatggtgtctaatcaggcatcggcaattattttagaa ggagatattgcgtgtgcgaatggtaatacgcaaaccattgttggtcctgatggtgtgact gtttacagctccagccctggcaatccaatagatggctatctttcacctgcatctacatgg tcgaccgttgcaggttgtggtgctgatggtggggaaggtacaactacttatgcaagtact ttatatggtgcttttactaaagccacaggtaattttgcagtagcgatgggttttgatgcg cgatcagcaggttcagcagtggctattggcacacaagcacgtgcgagcagccaaggttct gttgcaattggtacgagtgccaaggctcagaatgtcaatgcagtagctgtaggtaccaat actattgcgggtaaccaaaatgatgtggtgattggtaacaacattaccagtacatccact cttttaacttctagcgccgaagctacaagtaaagagtttggcactattgctattggtaat gaagtcgatgttggtggcacccgcatggtggtgattggcaatgagtcaggtatgactgtt ggcagtggcactgattcccatgacagtatcgccatcggtactcaaacacggcttaatggt caaagggtgattgccattggtacaggtgtgaataatattggtatcaacagtattgcaatg ggtagctattctaatgtggatttcgcttctcaaggaggaaccgcagtgggtcgtgagacc aaattgcaaaattcttttttaggaactgccattggtaatcaaactcatgttgtagggagt gatggtggtacggctgtgggtgaccgccataaagtaacgaacagtggttatgcagctgca tttggtagccgtgctgaagtgacggactcggcaaatgctattgcaataggtgctgctact aaagtaaccggggcttcaaatggtattgctattggtcgagattcagcgaccagtgctgag aatggattggcattgggtactgcatcttctacaagtgggtcggccagtattgcgataggc tctaactccaaaaatccagctgccaattcgattgcattaggacataaggcatctattgta aatgctcagaatgtaggtgctattgtcattggtgacaatgccagatcagaatattatggt gctgcggaacaatttgttattgccataggtgcaaatagcaacagctatgcttacagtgtc gcattaggtaaggaagcttcagctgatcgcggtgcttatgatgccgaaggtggttcgatt gcgattggttatcgtgctaatacgactgatgctagtcgagccagtattgcaatgggtgtc aattcacaggtaaccagtcaatatggcgtggctattggtacacaaagtaaagcatcgggc gctaatgcaactgcaatgggccacaatgctttggcatcacgagctaattctattgtgata ggtaccaacgcagtcagcaatggtgtggcggatagtacggttgtcattggtgatggcgct agctcagttggagatggtagtcagggtattattattggtgccaagagttctaacaacgat gctgtgaattccattaccattggtcatgatgcttcaacttataaaggtgatgcagttgtt aatatcggttatggtgccaatacttctgcaggttactctgtcactattggtcctaatgcg gcttcttttggtgcaatatctgctcagcatcaagtgacgattggtagtggtgctaatacc agtgctgcaaatgcgattgctgtgggccacagtgctgcttctgctggtagtaaggctgcg gcgtttggttaccaatctaatgcttctgctttgagtgccatggcacttggctctcaatct actgcttctggaatatattctgttgctgttggtgacagctctaaagcaatagacagatat gctattgccatgggttaccaatctaacgcatcaggtccagactctattgccattggtgtt ggcagtgccgcatctggcaatcaatccattgcggttggttataaaaaccaagtcacaggt aataattctggtgcttttggtgacccaaatgtaatcagtggtaacaattcgtatgctctt ggtaataataatacgatatcaggtaactcaactcatgtgctgggtaataacaatactgcc aaaggaagtagcagttatattattggtaataacagttcaaccgaactttctaatgatatt gctataggtacagaagcgaaaactggaatttctactcagccaaccgaaggttttagtggc gcgcaagttgcaattggttacaaagcaaccacaggcacagatggtcagattgctttgggt actatgactaatgccggtgctgttaaccatactattgcaattggtactaaagctacaaca acgggtaattctagtattgctgtgggtcgtaatgcagcatcaagtggactcaacgcagcg gcagttggtgtgggagctacggcagtaggaagttcttctgcagcatatggtaccaattct aattcagagggcggtaattcagttgctattggttctgctgcacattcagcctctaccaat tctatcgcgttaggcaatactagtgaggtaactgctaacaatgcaattgccataggtagt ggcgcagtcgcaagtgtagccaatagtgttgcattgggtaatggtgcaacgacttctgct gcggttggtactgcctcaacaacattgggtaatactacatttaatgtggcaggtactact ccaacgggtacagtaagtgtaggtaaagcaggttctgaacgaacagtcaccaacgttgct gcaggccgtgtaactgcaaccagcaccgatgccattaatggctctcaattatatgtggtg gctgcttttgctgatcaaggtttgaatttcacagccaactcaggtggtactgtgaaccgt gatttgggccaaactttgaatatcgtaggttctttgaataacaaagcgttaacaattgaa cctacatcagtggctgcaacggctggtcaatattcagctcgcaatacacaaaccgtttct gatccaactacaggacgtattcaaatccaatttgcagatcgcccaacactttcaggtgtg gtattagatggtaaagatggccaagatgctggaatacagtttggtaaagatggtttgtct ttgaagggtgttggtgttgatggtaaagatggtattaccattgttggtgcgaatggtaaa gatggtattacctttaataaagacggtaccattaccaatgtggttcaaagcacaactcct gatggtttggcaactaacaaatcagtagatgataaagtggcagccaataaagcattggga ttgaatttcactggtaatacaggtcctactttacaccgtgatttgggtcaaactttaagt attatcggttcggctcaaactttgaataagagcagtgatgcgaccaaagaaacgactgct ggctcttactatgctcgtaacttgcagacagtcacagttgtcaattcattgactggtgac acaacgttgcaaatgttattggctgatcgcccgacattctcaggtgtggttttggatggt aaagacggtaaagacgcttcgattcaatttggtaaagatggtttgtctttgaaaggtgtt ggtgttgatggtaaagatggtattaccattgtgggtgctaatggtaaagatggtatcacc tttaataaagatggcacgattaccaatgtcgtacaaagtacaggtcctgatggtttggtt accaataaacaattggacgataccaaagcacttggtctgaattttacgggcaatgcaggt ggaaccgttcatcgtaacttgggtgaaaccttaaacatcattggttctgctcagggtttg aataagacttttgatactgccactacaggttctacgactggtgcatattatagtcgtaac ttgcaaactgtgaccgatccaattacaggccgcgttcaagttcaatttgcagaccgtcca actttgtcaggtgtggttttggatggcaaagatggtaaggatgcttcgattcaatttggt aaagatggtttgtctttgaagggtgtgggtgttgatggtaaagatggtattaccattgtg ggtgccaatggcaaagatggcattacctttaatcaagatggcacgattaccaatgtcgta caaagtacggatcctgacggtttggttaccaacaaacaattggacgacaccaaagcactt ggtctgaattttacgggcaatgcaggtggaactgttcatcgtaacttgggtgaaacctta aacatcattggttctgctcagagtttgaataagacttttgatactgctactgcaggttct acgactggcgaatactacagccgtaacttgcaaaccgtgaccgatccaaatacaggccgc gttcaagttcaatttgcagaccgtccaactttgtcaggtgtggttttggatggcaaagat ggtaaagatgcatccgtacagtttggtaaagatggcttgtccatcacaggtttgggcgtc aatggcaaagatggcattggtattcaaggcatgacgggtgccaatggtaaagatggtatt tctttcaatccagatggcacgatttcgaatgtgaccgatggtaaaaatcccggtgatgtg gcgacgaaagaccaaattgacaaattggctagcggtggtttggatttcttaggcaatgct ggtggtttggtacaccgtaatttgggtcagactttgagtattattggctctgcccaaaac ttgaataaggcatttgacaacgcagctgcaggttctacgactggcgaatactacagccgt aacttgcaaactgtgaccgatccaaatacaggccgcgttcaagttcaatttgcagatcgt ccaactttgtcaggtgtggttttggatggcaaagatggtaaagatgcatccgtacagttt ggtaaagatggcttgtccatcacaggtttgggcgtcaatggcaaagatggcattggtatt caaggcatgacgggtgccaatggtaaagatggtatttctttcaatccagatggcacgatt tcgaatgtgaccgatggtaaaaatccaggtgatgtggcgacgaaagaccaaattgacaaa ttggccagtggcggtttggatttcttaggcaatgctggtggtttggtacaccgtaatttg ggtcagactttgagtattattggctctgcccaaaacttgaataaggcatttgacaacgca gctgcaggttctacgactggcgaatactacagccgtaatttgcaaactgtgaccgatcca aatacaggccgcgttcaagttcaatttgcagatcgtccaactttgtcaggtgtggtattg gatggcaaagatggtaaagatgcatcagtgcaatttggtaaagatggcttgtccatcaca ggtttgggcgtcaatggcaaagatggcattggtattcaaggcatgacgggtgccaatggt aaagatggtatttctttcaatccagatggcacgatttcgaatgtgaccgatggtaaaaat ccaggtgatgtggcgacgaaagaccaaattgacaaattggccagtggcggtttggatttc ttaggcaatgctggtggtttggtacaccgtaatttgggtcagactttgagtattattggc tctgcccaaaacttgaataaggcatttgacaacgcagctgcaggttctacgactggcgaa tactacagccgtaacttgcaaaccgtgaccgatccaaatacaggccgcgttcaagttcaa tttgcagaccgtccaactttgtcaggtgtggttttggatggcaaagatggtaaagatgca tccgtacagtttggtaaagatggcttgtccatcacaggtttgggcgtcaatggcaaagat ggcattggtattcaaggcatgacgggtgccaatggtaaagatggtatttctttcaatcca gatggcacgatttcgaatgtgaccgatggtaaaaatccaggtgatgtggcgacgaaagac caaattgacaaattggccagtggcggtttggatttcttaggcaatgctggtggtttggta caccgtaatttgggtcagactttgagtattattggctctgcccaaaacttgaataaggca tttgacaacgcagctgcaggttctacgactggcgaatactacagccgtaacttgcaaact gtgaccgatccaaatacaggccgcgttcaagttcaatttgcagaccgtccaactttgtca ggtgtggttttggatggcaaagatggtaaagatgcatccgtacagtttggtaaagatggc ttgtccatcacaggtttgggcgtcaatggcaaagatggcattggtattcaaggcatgacg ggtgccaatggtaaagatggtatttctttcaatccagatggcacgatttcgaatgtgacc gatggtaaaaatcccggtgatgtggcgacgaaagaccaaattgacaaattggctagcggt ggtttggatttcttaggcaatgctggtggtttggtacaccgtaatttgggtcagactttg agtattattggctctgcccaaaacttgaataaggcatttgacaacgcagctgcaggttct acgactggcgaatactacagccgtaatttgcaaactgtgaccgatccaaatacaggccgc gttcaagttcaatttgcagatcgtccaactttgtcaggtgtggttttggatggcaaagat ggtaaagatgcatccgtacagtttggtaaagatggcttgtccatcacaggtttgggcgtc aatggcaaagatggcattggtattcaaggcatgacgggtgccaatggtaaagatggtatt tctttcaatccagatggcacgatttcgaatgtgaccgatggtaaaaatcccggtgatgtg gcgacgaaagaccaaattgacaaattggctagcggtggtttggatttcttaggcaatgct ggtggtttggtacaccgtaatttgggtcagactttgagtattattggctctgcccaaaac ttgaataaggcatttgacaacgcagctgcaggttctacgactggcgaatactacagccgt aatttgcaaactgtgaccgatccaaatacaggccgcgttcaagttcaatttgcagatcgt ccaactttgtcaggtgtggttttggatggcaaagatggtaaagatgcatccgtacagttt ggtaaagatggcttgtccatcacaggtttgggcgtcaatggcaaagatggcattggtatt caaggcatgacgggtgccaatggtaaagatggtatttctttcaatccagatggcacgatt tcgaatgtgaccgatggtaaaaatccaggtgatgtcgttaataaaggacagttggatgat atcgcatcagctggcttggatttcactgcaaactctggtgcattggtacaccgcgacttg ggtcaaactttgggtgtgattggctcagaaactggcttgaatttggcagtggacacctct aaaaatgcaacggccagtaaatacaactcaagcaatattcaaactgtaaccacaggtaat ggtattcaggtgcagtttgcagatcgtcctgaattctcaggtttggttgtgaatggcaaa gatggtaaagatgcatcgattcaatttaccgattctagtggtaacaaaggtacctctttg gtgggtaaaccaggagctgatggtgcaccaggtttgactgttgtgggtaaagatggcaaa gatggtgtgagcttcaacaacgatggcacgatttctaatgtgacagatggtactcgtccg aatgatgctgtaaacaaaggtcaattggatgatattgctgatggtttgactaattcaggt ttgagttttactgatgatgcaggcactgtgattcatcgtaaattgggtgaaaccttgggc ttgaccaccacttcagtgaatatgaaaaccgtggttggaaaagatggcattgcgattaac ttctcagaccgtcctgaattctcaggtttggttgtgaatggcaaagatggtaaagatgca tcgattcaatttaccgatcctagtggtaacaaaggtgcctctttggtgggtaaaccagga gctgatggcttgccaggcttaactgtagtgggtaaagacggtaaagacggtgtgagcttc aataacgatggcacgatttctaatgtgacagatggtactcgtccaaatgatgcagtgaat aaaggtcaattggatgatatcgcttcagcaggtttggatttcactgcaaactctggtgca ttggtacatcgtgatttgggtcagactttaggtgtgattggctcagataagagcttgggc ttgactcatgatacgacaggcgttgccacaactggtaattatactgcgaaaaatgttcaa acagtgaccacaagcaatggtcttcaagttcagtttgcagaccgtcctgaattctcaggt ttggttgtgaatggtaaagacggtaaagatgcatcgattcaatttaccgatcctagtggt aacaaaggtgcctctttggtgggtaaacaaggagctgatggtgtgccaggtttgactgtt gtaggtaaagacggcaaagacggtgtgagcttcaacaacgatggcacgatttctaatgtt acagatggtactcgtccgaaagatgcagtgaataaaggtcaattggatgatatcgcatca gcaggtttggatttcactgcaaactctggtgcattggtacatcgtgatttgggtcaaact ttgggtgtgattggctcagaaactggcttgagtttagcagtggatacctctaaaaatgca acagcgggtaaatacaactcaagcaatattcaaacagtgaccacaggtaatggtattcag atgcagtttgcagatcgtcctgaattctcaggtttggttgtgaatggcaaagatggtaaa gatgcatcgattcaatttaccgatcctagtggtaacaaaggtgcctctttggtgggtaaa caaggagctgatggtgtgccaggtttgactgttgtaggtaaagacggcaaagacggtgtg agcttcaacaacgatggcacgatttctaatgtgacagatggtactcgtcctaaagatgca gtgaacaaaggtcaattggatggtgtgtcagatgcattaaccaattcggtttga

DBGET integrated database retrieval system