Vibrio tapetis subsp. tapetis: A0557
Help
Entry
A0557 CDS
T05424
Name
(GenBank) putative DNA repair ATPase protein
KO
K19171
DNA sulfur modification protein DndD
Organism
vta
Vibrio tapetis subsp. tapetis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vta00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02048 Prokaryotic defense system [BR:
vta02048
]
A0557
Prokaryotic defense system [BR:
vta02048
]
DNA phosphothiolation system
Sulfur modification proteins
A0557
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
AAA_15
AAA_27
AAA_29
SMC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SON48536
UniProt:
A0A2N8Z9G1
LinkDB
All DBs
Position
A:566968..569013
Genome browser
AA seq
681 aa
AA seq
DB search
MKLIKIIIKNFRQFYGEQEINFSTDSERKITLFHGENNGGKTTLLNAIRWCLFQEFTSNF
HEKTNLVNETASLNGVSGFKVVLTLENNGVEYIIQRISESGSKKGQLSVYIINRGVKEFQ
SNPQFIINTIIPSDMAPFFFYQGEGDGGLTNENNFSYIKQSIKRILGFEVAEKALKDLDS
VLKVYNRNLAELDTTGVLEDLYFRQQQMSVKVDRNKNQINNLLSSISRREERLENAIQRL
INSNVDYVQQQAKILNGLEESLKYIDSELVSLSSEKNEKLSSSWALSSFTSKLRRFTIGS
IDTSELDLSHQFSVNKDLLRHILDINQCICNSDLDKSISKRDAIESLLGSAIDLKLKARW
KRVINLYDSLDNKPNLALKAMIELTRKQDQLLENKHKKQREIEEIEATIKSSKVDASEAK
LLQADREQLKLKLESDRNKLRNIEPLLKQEEAQLRSIKNEIATHEGSVPQAENLKNIVSA
TKKIIKLIESNLSDAEKGSDSIVLKKMQDFFSRVAFNENTVKSINGSFRIVNKHGIPQGV
GGGYQTMLSVSFIVSLIQYSKDRSNSKNYLLTPGTVAPFMADAILSEISLDHGREILGYI
TECVDQFILLLSQTQWREDSSDTLIREHIGREYNFVQNVMMSEKEWKGTYPTKLKVRNGE
YDVVRFNSSFVGTTIEEVQYV
NT seq
2046 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaattaagattattatcaaaaatttcagacagttttatggtgagcaagaaata
aatttttctacggacagtgaacggaaaataactctatttcatggagagaataatggaggt
aagacaacattgcttaatgctattcgctggtgtctatttcaagagtttacttctaacttt
catgaaaaaaccaacttggtcaacgaaacagcgagcctgaatggagttagtggttttaaa
gtggtattaactctggagaataatggagttgaatacattattcaacgcatatctgaatca
ggtagcaagaaaggtcagttgtctgtatatataataaataggggtgttaaggaatttcaa
agtaatcctcagtttattattaatacgattattccgtccgacatggctccatttttcttc
tatcaaggtgaaggtgacggcggattaactaatgagaataatttttcttacataaaacag
tcgataaaacggatcttgggctttgaagtagcagagaaagcgttaaaagacttagatagt
gttttaaaggtttataacagaaatttagctgaacttgatactactggagtgctcgaagat
ttatattttagacagcaacagatgtctgttaaagtagatagaaataaaaaccaaattaat
aatttgctttctagtatatctcgtagggaagaaaggctagaaaatgcaattcaaagattg
attaattcaaatgttgactatgtacagcaacaagcaaaaatattgaatggtttggaagaa
tcactaaaatacattgactcggaacttgttagtctttctagtgagaaaaatgaaaagctg
tcatcgtcctgggcattaagttcttttacgtcaaaattaagaaggtttactatcggatct
attgatacatctgagttagacctttcccaccaattttccgtaaataaagatctacttaga
catatattggatatcaatcaatgtatttgcaattcagatttggacaaaagcataagtaaa
cgtgatgcgatagagtcactattaggaagtgctattgatttgaagttaaaagctagatgg
aaaagggttattaacctttacgactcgctagacaacaagccaaatttggcactaaaagca
atgattgagctaactcgtaaacaagaccaattacttgaaaataagcataaaaagcaaaga
gagattgaagaaattgaggctactattaagtctagtaaagttgatgctagtgaagctaaa
ttattacaagcagatagggagcagcttaaattaaagttagaatccgacagaaataaattg
agaaatattgaacctctgttgaagcaagaagaagctcagttgagatctattaagaacgag
atagcgacccatgaaggctcagtaccacaagcagaaaaccttaagaatatagttagtgct
acgaaaaaaataatcaagctaattgagtcaaatctgagtgacgccgaaaaaggttctgat
tcaattgtattaaaaaaaatgcaagattttttctctcgtgtagcatttaatgaaaacaca
gttaaaagtatcaatggcagtttcagaattgtgaataaacatggtattcctcaaggagtt
ggtggagggtatcagactatgctttccgtttcctttattgtctcattaatacagtattcc
aaagaccgttcaaatagcaaaaactatttattaacaccagggacagttgcccctttcatg
gctgacgctatcctatcagagatatcactagatcatggtcgagagatattgggttatata
acagagtgtgtcgatcagtttattttattgttgtctcagacgcaatggagagaagatagt
tctgataccctaattagagaacacattgggcgtgaatataattttgtgcagaatgtaatg
atgagcgagaaagaatggaaaggaacttatccgactaagttaaaagttcggaatggagaa
tatgatgttgtaaggtttaatagtagctttgtaggcactaccatagaggaagttcaatat
gtctga
DBGET
integrated database retrieval system
