Vagococcus teuberi: BHY08_00395
Help
Entry
BHY08_00395 CDS
T04578
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
vte
Vagococcus teuberi
Pathway
vte03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vte00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
BHY08_00395
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
vte03400
]
BHY08_00395
Enzymes [BR:
vte01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
BHY08_00395
DNA repair and recombination proteins [BR:
vte03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
BHY08_00395
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRCF
DEAD
UvrB_inter
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
ResIII
Cas3-like_C_2
AAA_22
AAA_16
MFD_D3
RecG_dom3_C
IstB_IS21
ECM11
UB2H
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APB30439
UniProt:
A0A1J0A3D6
LinkDB
All DBs
Position
85449..88997
Genome browser
AA seq
1182 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gatggataa
DBGET
integrated database retrieval system
