Vigna unguiculata (cowpea): 114176931
Help
Entry
114176931 CDS
T06017
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At3g14730
Organism
vun
Vigna unguiculata (cowpea)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
RPN7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114176931
NCBI-ProteinID:
XP_027917936
LinkDB
All DBs
Position
3:14766121..14768833
Genome browser
AA seq
632 aa
AA seq
DB search
MNGRTIIRAFIIPPQQQHYCLRLLCFSTSPSYNVQTCIATLQSCAHNANLSKGKELHSHL
LKNAFFGSPLAVTSLINMYSKCTLIDHSLRVFNYPTHLDKNVFAYNALIAGFVANALPQR
GFALYKQMRHLGIVPDKFSFPCVIRACGDIMEDLEVRKIHGLLFKFGLELDVFVGSALVI
TYLKFGLVQDAHEVFEALPVRDVVLWNAMVNGYAHIGRFEEALVVFRRMEREGVIPCRYT
VTGVLSIFSVTGDFDSGRAVHGFVTKRGYESSVVVSNALIDMYGKCKCVGDALSVFEVMV
ERDIFSWNSIISVHEHCGDHYGTLRLFDRMQVKGVQPDLVTITTVLPACTHLAALRHGRE
IHRYMVVNGLGKEESHKDFDYVLLNNALMDMYAKCGNVRDACTVFDNMREKDVASWNIMI
TGYAMHGYGDEALDIFCRMCEAEMVPNEISFVGLLSACSHAGMVKEGLGFLSEMESKYGA
SPSIEHYTCVIDMLCRAGRLMEAYDLVVRMPFKADPVGWRSLLAACRVHKEKDLAEIAGS
KVIELEPGHCGNYVLMSNVYGAVGRYEEVSEVRHTMKQQNVKKIPGCSWIELVNGVHVFI
TGDRTHPHTDSIYAGLNSLTVVLQEHGYAPFV
NT seq
1899 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatggaagaacaatcataagagccttcatcatccccccacaacagcaacattattgt
ctcaggttgctctgtttctcaacctcaccttcctacaacgtgcaaacatgcattgccacc
ctccaatcgtgtgcccacaatgcaaacctctccaagggcaaggaactccactcccacttg
ctcaaaaacgctttctttggatccccgctcgccgtcacaagcctcatcaacatgtactcc
aagtgcaccctcatcgatcactccctcagagtcttcaactaccctacccatcttgacaaa
aatgtctttgcctacaacgctctcattgctggtttcgttgcaaatgctcttccccaacgt
gggtttgctctatataagcaaatgagacatctgggtatcgttcctgacaagttcagtttt
ccgtgtgtcatcagagcctgtggcgatattatggaggatttggaggttaggaagattcat
gggttgttgttcaaatttgggttggagttggatgtgtttgttggcagtgcgctggtaatt
acctacttgaaatttggattggtgcaggatgcgcatgaggtgtttgaagcgttgcctgtg
agagatgttgtgctttggaatgcaatggttaatgggtacgcgcatattgggaggtttgag
gaggctttggtggtatttaggaggatggaacgagaaggggtgattccttgtagatacact
gttactggggtcttgtcgatattttctgtgacaggggattttgacagtggacgtgctgtt
catgggtttgtgacaaaaaggggctatgaatcaagtgttgttgtttctaacgcattgatt
gatatgtatgggaaatgtaaatgtgttggtgatgcgttgagtgtgtttgaggtgatggtc
gagagagatattttttcatggaattcgatcatatcagttcatgaacactgcggtgatcat
tacggaactttgaggctttttgatagaatgcaggtaaaaggggttcaacctgatttggtt
accattacaacagtacttccggcttgtactcatcttgcagcgctgaggcatggtagagag
atacataggtatatggttgtaaatgggttggggaaggaagaaagccacaaagattttgat
tacgttttgttgaacaacgctctgatggacatgtatgcaaaatgtggaaacgtaagagat
gcatgcacggtttttgacaacatgagggagaaggatgtggcctcgtggaacatcatgatc
acaggttatgcaatgcacggttatggtgatgaggcattagatattttttgccgtatgtgt
gaagctgaaatggtacctaatgaaatcagttttgtgggattactatctgcgtgcagccat
gctgggatggtgaaggaggggcttgggtttctatcagaaatggagtcaaagtatggtgct
tctccatccattgaacactacacttgtgtgattgacatgctttgtagggcaggaaggtta
atggaggcttatgatttagtggtaagaatgccatttaaggctgatcctgttggatggcga
tctctgctagcagcatgccgtgtccacaaggagaaggacttggctgagattgctggtagt
aaggtgattgaacttgagccaggtcattgtggaaactatgtgctgatgtcaaatgtttat
ggagcggttggtcgatatgaggaagtgtcagaggtgaggcatacaatgaagcaacaaaat
gtgaagaagatacctggttgtagctggattgaacttgtgaatggtgtgcatgtttttata
acaggtgataggactcatcctcatactgactctatttatgcaggcttaaactcattgaca
gttgttctgcaagagcatggttatgctccctttgtctag
DBGET
integrated database retrieval system
