Vigna unguiculata (cowpea): 114182115
Help
Entry
114182115 CDS
T06017
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g39680
Organism
vun
Vigna unguiculata (cowpea)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
DYW_deaminase
PPR_3
PPR_1
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114182115
NCBI-ProteinID:
XP_027924690
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(5015193..5022977)
Genome browser
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MGCYMKRAKMNLSHKFKELVNILKLSATSKSLRLGKTIHAQLLVCNQTSKDSDIIQINSL
INLYSKCGQLEYAKKLFDRMPQRNLISWSVLMAGYLHKGDVLEVLGLFRNLVSLDSACPN
EYIFTIVLSCCANSGRVQEGKQCHGYLFKSGLLLHQYVKNALVHVYSRCFHVDSALQILE
TVPGNDVFSYNSILSALVESGCREEVEKVLNMMVDECVSWDGVTHVNMLCLCSHIGDLQL
GMQIHAQLMKTGLVFDVFVISALIDMYGKCCKVLNAKKHFDDLQDRNVVAWTAMLTAYLQ
NGYFEETLNLFPRMELEDTHPNEFTFAVLLNACANLVALTYGDTLHGRIMKLGFKNHLIV
GNALVNMYSKSGNVDSSYSVFSNMIYKDVITWNAMICGYSHHGLGKQALLVFQDMMSAGE
CPNYVTFIGILSACAHLALVQEGFYYFDQLMKELNIEPGLEHYTCMVSLLCRDGQLYEAE
NFMKTKTQVKWDVVAWRTLLNACHVHRNYSLGKLIAETVILMDPHDVGTYTLLSNMYAKA
RKWDGVVNIRKLMRERNIKKEPGASWLGIRNDTHVFVSEGSNHPESTQIYEKIQELLAMI
KPLGYVPDVGAVLHDVEEEQKEGYLSYHSEKLALAYGLMKIPPPGPIRIIKNLRMCDDCH
IAVKLISKVTNRLIVVRDANRFHHFRDGLCTCNDHW
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggtgctacatgaaaagggcaaagatgaatttgagtcacaagttcaaagaacttgtt
aacattttgaaactctctgccacttcaaagagtctgaggttgggcaaaacaatccatgcc
caattgcttgtttgcaaccaaacttcaaaagacagtgacatcattcaaataaattcactg
atcaatctatactctaaatgtggtcaattggagtatgccaaaaagctgtttgacagaatg
ccccagagaaacctgatttcttggagtgttttaatggcggggtatttgcacaaaggagat
gttttggaagtacttgggctattcaggaacttggtttcattggacagtgcatgccccaat
gagtatatttttaccattgttctttcttgttgtgcaaacagtgggagagtccaagagggg
aagcaatgtcatgggtatttgtttaagtccggtttattgttgcatcaatatgtgaagaat
gcacttgttcacgtgtactctaggtgctttcatgtggactcagccttgcagattttggaa
acagtgcccgggaatgatgtgttttcttataattctatcttgagtgcacttgtggaatca
gggtgtagagaagaagttgaaaaggttctgaacatgatggtggatgaatgtgtgtcttgg
gatggtgttacacatgtaaatatgttgtgcctttgttctcatattggagatttgcaattg
ggtatgcagattcatgcacagttgatgaagactggtttggtatttgatgtctttgttatt
agtgcactgatagacatgtatgggaaatgttgtaaagttctaaatgcgaaaaagcatttt
gatgacttgcaagatcggaatgtggttgcatggactgccatgttgactgcatatttgcaa
aatggatattttgaggaaactttgaatctatttccaaggatggagctagaggatacgcat
ccaaatgagttcacttttgcggttcttctaaatgcttgtgcaaatttggttgcactaaca
tatggtgatacattacatggtcgtataatgaaattagggtttaagaatcatctcattgtt
ggaaatgctttagtaaatatgtattccaagagtggcaatgttgattcttcatatagtgtg
ttctcaaatatgatatataaagatgtgattacatggaacgctatgatatgtggttattcc
catcatggacttggtaaacaagctttactagtgtttcaagacatgatgtctgctggagag
tgtccgaactatgtaactttcattgggatactttctgcttgtgctcatttggctcttgtg
caagaagggttctactattttgatcaactaatgaaggaacttaatattgagcctggattg
gaacattacacgtgtatggtttctcttttgtgtagggatggccaactttatgaggctgaa
aattttatgaagacaaaaacacaagtcaagtgggatgttgttgcttggcgtactttgctt
aacgcatgccatgttcatcgaaactatagtttagggaagttaattgcagaaactgtgata
ctgatggaccctcatgatgtaggaacatatacattactatcaaacatgtatgccaaggca
aggaaatgggatggagtagtgaatattagaaaattgatgagggaaaggaatattaagaag
gaacccggtgcgagttggctaggtataagaaatgatactcatgtctttgtttcagaagga
agcaatcatccagaatctactcagatctatgagaaaattcaagagttgttggcaatgatt
aagccattggggtatgtgcctgatgttggtgctgtgctgcatgatgtggaagaggaacaa
aaggaaggttatcttagctatcacagtgagaagctagcattagcatatggcctcatgaaa
atacctccaccagggccaatccgaataataaaaaaccttaggatgtgtgatgattgtcac
attgctgtaaaattgatctctaaggtcacaaataggttgatagttgtaagagatgctaac
cgttttcatcattttagagatggattatgcacatgcaatgatcactggtag
DBGET
integrated database retrieval system
