Vigna unguiculata (cowpea): 114187555
Help
Entry
114187555 CDS
T06017
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
vun
Vigna unguiculata (cowpea)
Pathway
vun03015
mRNA surveillance pathway
vun03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vun00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
114187555
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
114187555
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
vun03041
]
114187555
Spliceosome [BR:
vun03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
114187555
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
zf-RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114187555
NCBI-ProteinID:
XP_027931632
LinkDB
All DBs
Position
6:21283434..21287459
Genome browser
AA seq
521 aa
AA seq
DB search
MSGAYGQDGGGSAPPSYGASGGYGSGGGSYGGGTYGGGGAGGGYGGTDGGGGYGAKNSGN
GGGYGGNDGGGYGGRSGYGGNDGGGYGGRGGGQGGRGGGGFGGGYGGRGGGGGGGGGYQG
GDRGGRGGGRGGGGRGGSGRDGDWRCPNQSCGNVNFARRVECNKCGAPCPNPNSSNERGG
SGGGGGGFSRGGGGGGGGGGGYGNNRGGRSGNYDGGRGNDYNSGGGRSGNYDGGRGNDYN
SGRGGSNDGRGGSYRGNQGREDGSYGQVPAPNAQSYGGAGGSFPPSYNSYGGNASYGTDA
VPPPSSYTGGPNSYPPSYGGNAGGYGGDNQGDGRSGGRSGPPSGYDNSYGAGNRGGFGGS
PAEPPAAVKQCDENCDDTCDNSRIYISNLPPDVSIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQ
WPWNIKIYTDENGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYKISVAMAEKSAPRAPP
AYNQGGNRGGYGGDRRRDNYRDGGGSGPDRRDHYGNRSRPY
NT seq
1566 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagcatacggtcaagacggcggtggctctgcgccaccgtcatatggagccagc
ggcggatacggttccggtggtggtagttatggaggcggaacctatggagggggcggtgct
ggtggaggatatggtggtacggatggcggtggtggttacggagcgaaaaacagcggaaac
ggcggcggatatggtggtaacgatggcggaggttatggaggaaggagtggctacggtgga
aacgatggcggaggctatggaggaagaggcggtggtcaaggtggccggggaggtggagga
ttcggtggtggatatggcggtcgaggtggaggtggaggtggcggtggcggatatcaaggt
ggtgatcgcggaggtcgaggtggcggtcgcggcggaggcggccgtggcggcagcggcaga
gatggagactggcgttgccctaaccaaagttgtgggaatgtgaactttgcgagaagggtt
gaatgtaacaaatgcggtgctccttgtcctaatccgaatagttccaatgaacgtggtgga
agtggtggcggtgggggtggttttagtagagggggaggtggcggtggcggtggcggtggg
ggttatggtaacaatcgagggggaagatctgggaactatgatggagggagaggtaatgac
tataacagtggagggggtcgatctgggaactatgatggtggaaggggtaatgactacaat
agtggaaggggtggtagtaatgacggtagaggtggttcatatagaggtaatcaaggtaga
gaagatggtagctacggtcaagttcccgctcctaatgcccaatcttatggtggtgctggt
ggaagcttcccaccctcttacaattcttatggtgggaatgcaagttatggaactgatgca
gttcctccaccttcaagttatactggcggacctaattcctatcctccatcatatgggggt
aatgccggtggttatgggggagataatcaaggggatgggcggagtggtggtagatctggg
cctccgtctggttatgacaatagttatggtgctggtaatcgaggtggatttggtgggtct
cctgccgagcccccagctgcagtgaagcagtgtgatgagaattgtgatgacacttgcgac
aactctagaatctacatctcaaaccttccaccagatgtgtcaattgaagaattgagggaa
ctttttggaggcattggacaagttggaaggataaaacagaagaggggctacaaagatcag
tggccttggaacattaagatttacactgatgagaatggaaataacaagggagatgcttgt
cttgcttatgaagacccttctgcagcacattcagctggcggtttttacaataattatgat
ttgaggggttacaaaatcagtgttgcaatggcagaaaaatctgctccaagagctccacct
gcttataaccaagggggcaataggggtggctatggtggagatagacgccgagacaactat
agagatggaggtggctctgggcctgataggcgtgatcattatggaaaccgttctcgtccg
tactag
DBGET
integrated database retrieval system
