Vespa velutina (Asian hornet): 124948535
Help
Entry
124948535 CDS
T09814
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat protein SHOC-2-like isoform X1
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
vve
Vespa velutina (Asian hornet)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_8
LRR_4
LRR_9
LRR_13
LRR_LRWD1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124948535
NCBI-ProteinID:
XP_047348227
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(4913043..4920139)
Genome browser
AA seq
610 aa
AA seq
DB search
MEKDNLKILVYQEQSESTVNQCWPCLIESSNKNSVPMNNYTKGSLNLKSILYIQNIYNSS
NKLLPNKLTNLIKLDLSDNYLKDLPDYLDLLKNLQHLILNNNQLSCLPSVIGNLEKLVSL
KVHNNNIKEIPENIGNLSNLEDLDLSSNKLRDIPGTYKMLNRLKYLSLANNNFMCTPDCL
RTGMCSLEMLDLSQNNHIMLNVPLCSIKIKRFYAKENDICPSFLNWIFTNKYYKLEEVLL
DYTVFQKFNFPSEEIPMLNITKLSMIQCQLSEQLLSEIIKRLKCPESLNIGNDEITKKGN
TFWVLPIKDIQDKSNLKEINLRKTNIPMIPKCINEFLTLVTIDASCNNITWLPDEICDLH
NLQNLIINNNLLVSLPDSIGQLASLKTLIASYNALTCLPSSMMHLNNLQFLDLYDNKFFT
ATDININMTCLQGIDLEQNYFSTNDLPSYENLRAVLLEYWIKEFREVGLKKESECSDDNE
SLHSFYSYKINDDELWLISRLQEVQNSSEWVEENWDDSENSADEFDPNEYWKPKLRQCSP
IFAYKRQILQSHFCPADLHAKSILKHFRQMLNNDTFSSNTEFETDLRWRIRSSRFLFSIQ
NERIKKGRGI
NT seq
1833 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaagataatctgaaaatattagtatatcaagaacaatctgagagcacagtaaat
caatgttggccatgtcttatagaatcgtctaacaagaattcagtaccaatgaacaattat
acaaagggatcactaaatcttaaaagtatcctatatatacaaaatatatataattctagt
aataaacttttgccaaataaattaactaatctaataaagttagatttatctgacaattat
ttaaaagatctacctgactatttggatctattaaaaaatctacaacatcttattctcaat
aataatcaactttcatgtttgccaagtgtaattggaaatctagaaaaattagtatcttta
aaggtacacaataataacataaaagaaattccagaaaatattggaaatttatcaaatctt
gaagatttggatttaagttctaataaattaagagacattccagggacgtataaaatgtta
aatagattaaaatatctttctcttgctaataacaattttatgtgtactcctgattgcctt
agaacaggaatgtgcagtttggaaatgttagatttatcacaaaataatcatattatgttg
aatgttccattatgcagtattaagattaaaagattttatgctaaagaaaatgatatctgt
ccatcatttttaaattggatatttactaacaaatattataaattggaagaagtattatta
gattatacagtgtttcagaaatttaattttccaagtgaagaaataccaatgttaaatatt
acaaaattatcaatgatacaatgtcaattgtctgaacaacttttgagtgaaattattaaa
agactaaagtgtcctgaaagtttaaatattggtaatgatgaaataacaaagaaaggaaat
acattttgggttttaccaattaaagatatacaagataaatctaacctgaaagaaataaat
cttcgtaaaacaaatattccaatgatacctaaatgcataaatgagtttctgactttggta
acaatagatgctagttgtaataacatcacttggttacctgatgaaatatgtgacttgcat
aatttacaaaatttgataataaataataacttattagttagtttgcctgactctattggc
caattggcatcacttaaaacattaatagctagttataatgcattaacttgtttaccaagt
tctatgatgcatttaaataatttacagtttctggacctttatgataataaattttttaca
gcaacagatattaatattaatatgacttgtttacaaggaatagatcttgaacaaaactat
ttttcaactaatgatttaccgagttatgaaaatttaagagctgtattattagaatattgg
atcaaagaatttagagaagttggtttaaaaaaggaatctgaatgcagtgatgacaatgaa
tctttacattcattttactcatataaaattaatgatgatgaactttggttaatctctaga
ttacaagaagtacagaattcttctgaatgggttgaggaaaattgggatgattcagaaaat
tcagcggatgaatttgatccaaatgaatattggaaaccgaaactccgacaatgttctcca
atctttgcttataaaagacaaattttacagtcacatttttgtcctgcagatttacatgct
aaatcaattttaaagcattttagacaaatgttaaataacgatactttctcttcgaatact
gaatttgaaacagatcttcgatggagaataagatcatcaagatttttgttctctattcaa
aatgaacgaattaaaaagggacgcggcatataa
DBGET
integrated database retrieval system