Vespa velutina (Asian hornet): 124950045
Help
Entry
124950045 CDS
T09814
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 isoform X1
KO
K03002
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
vve
Vespa velutina (Asian hornet)
Pathway
vve03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vve00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
124950045
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
vve03021
]
124950045
Enzymes [BR:
vve01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
124950045
Transcription machinery [BR:
vve03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
124950045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpa2_4
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124950045
NCBI-ProteinID:
XP_047352101
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(1167292..1172542)
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MLSEPKLTNTSPDFGIPPDIQNPLLQSLGLPHVDSFNYMLEDGLSEAITDILPVYLQLAN
GDKIMLWIDNVTIHQPSVPTNVIGVKNYKIYPTECRQRGATYKGKIIVKLGWSVNGISQE
ILEKDLGDIPIMVKSNRCHLNKMNPSELIAHGEHEQEWGGYFIIKGHERLIRMLLMTRRN
YPIAIRRSGWKARGIQFSDLGLLLRSVRDDNTTSNNTLHYVTNGSVKLMFSHRKVLYYTP
LILILKCLIDVSDIFIYNALMAGCEDDLYYRGCILNMLRAVHEEDLHTHEQCKAYIGKMF
RVKFFELPQDSSDIEICDFIIKHCIAIHLDDPLDKFHLLAFMTKKLFAVANNKCAVEGAD
SVMMQECLLGGHLYLQVLKEKLYGWLTGLRILIMKRARNADAKYVLTLQEMLHITKYGGS
LESQMENFLSTGNLRTPTGLGLMQTSGLTIVAENINRMRYMSHFRAIHRGSFFQGMRTTE
TRQLLPDAWGFICPVHTPDGTPCGLLNHLTMNCIITKHPNPDLKAAIPTVLLDLGMLPIS
IADNWKDSYTVMLDGKLIGLIEDNIINRVSDNLRILKIKGKEVPSTMEIVLIPKKTIPAQ
YPGLYLFTNPARMMRRVMNLAAKKTELIGTFEQVYMDICITPEEAYDGLTSHQELAKTSF
LSNLACLIPMPDCNQSPRNMYQCQMGKQTMGTPCHTWKQQSETKLYRLQTPASPLFRPMH
YDKMGLDDFAMGTNAIVAVISYTGYDMEDAMIINKAAYDRGFAHGMVYKSEFIDLKDQKS
YFARDPNKPFLAEKLDTDGLPIPGSMIKENDYFYCYYDAEQSNYVTGKYHGKEDIYIDNV
KLCGTLNNNTPRRACITFRIPRNPSVGDKFASRAGQKGICSQKWPAEDLPFTETGLIPDI
VFNPHGFPSRMTIAMMIEVMAGKSAAVHGLVHDATPFRFDENETAVEFFGKLLERGGYNY
YGTERMYSGIDGREMTVDIFFGIVHYQRLRHMVSDKWQVRSTGPIDVLTRQPIKGRRRGG
GVRFGEMERDSLISHGCSFLLQDRLFHCSDKTTALVCQKCGTLLGPVLELSVNPTGITEK
KQKCRLCGDDESVKEIDIPYIFKYLVTQLTCCNINVKLSFVEK
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatctgaaccaaagttaaccaatacttctccagattttggaatacctccggatata
caaaatcctttattacaaagtttaggacttccacatgtagattcttttaattatatgtta
gaagatggactttctgaagcaattacagatatattaccagtttatcttcaacttgctaat
ggcgataaaattatgttatggatagataatgtaacgattcatcaaccatctgtccctact
aatgtaattggtgtaaaaaattataaaatatatcctacagagtgtagacaaagaggtgcc
acttacaaaggaaaaataatagttaaattaggatggtctgtcaatggtatttctcaagaa
atactcgaaaaagatttaggagatatacctattatggttaagtctaatagatgtcatctt
aataaaatgaatcctagtgaattaattgctcatggagagcatgaacaagaatggggtggc
tattttataattaaaggacatgaacgactcatacgtatgttattgatgacaagaagaaat
tatcctattgcaatccgaagatcaggttggaaagctcgaggtatccaatttagtgatctt
ggattacttttaagaagcgttcgagatgataatactacatcgaataatacattacattat
gttactaatggttctgtaaaattaatgttttcacatagaaaagttttatactatacacct
ctcatcttaatattgaaatgtttaattgatgtttcggatatttttatatacaatgcttta
atggctggttgtgaagatgatttatattatagaggttgtattttaaatatgttacgtgca
gtacatgaagaagacttacatacacatgaacaatgtaaagcatatattggaaagatgttt
cgagttaaattttttgaactacctcaagattcaagtgatatagaaatttgtgattttatt
attaaacattgcattgctatacatttagatgatccattagataaatttcatttacttgca
tttatgacaaaaaaacttttcgctgttgctaataataaatgtgctgtagaaggtgctgat
tctgtaatgatgcaggaatgtttattaggtggccatttatatttacaagtattaaaagaa
aaattatatggatggcttacaggtcttaggattttaattatgaaacgtgccagaaacgct
gatgctaaatatgttttaacattgcaggagatgttacatataacaaagtatggagggtct
cttgaatcacaaatggaaaattttttatctactggaaatttaagaacacctacgggttta
ggcttaatgcagactagtggacttacaatagttgcagaaaatattaatagaatgcgttat
atgagtcattttcgtgcaattcatagaggctctttcttccaaggaatgagaactacagaa
accagacaacttttacctgatgcttggggatttatttgtcctgtacatacaccagatggt
acaccatgtggtttattaaatcatttaactatgaattgtattattacaaaacatccaaac
cctgatttaaaagctgctataccaacagtattactagatcttggaatgttacctatttct
attgctgataattggaaagactcatataccgttatgttagatgggaaattaattggcctt
attgaagacaatataataaacagagtatcggataatttaagaatacttaagataaaaggc
aaagaagtaccatctacaatggaaatagtgttaattccaaagaaaactataccagctcaa
tatccaggattatatttattcactaatcccgcacgtatgatgagacgggtaatgaattta
gctgctaaaaaaacagaacttattggaacatttgaacaagtttatatggatatttgtatc
acgccagaagaagcctatgatggtctaacttctcatcaagaattagcaaaaacttcattt
ttaagtaacttagcatgtcttattcctatgccagactgtaatcaaagtccaagaaatatg
tatcagtgtcaaatgggtaaacaaacaatgggtacaccatgtcatacatggaaacaacaa
tctgaaacaaaattgtatagattacaaacaccagcaagtcctttattcagaccaatgcat
tatgataaaatgggcttagatgattttgctatgggtaccaatgcaatcgtagctgttatt
tcatatacaggatatgatatggaagatgcaatgattatcaacaaagctgcttatgatcga
ggttttgcccacggaatggtttataaatcagaatttatagatttaaaagatcagaaaagt
tactttgcacgagatccaaataaaccttttctcgcagaaaagctagatactgatggcttg
cctatacctggctctatgatcaaagaaaatgattatttttattgttactatgatgctgaa
caatctaattatgtaactggtaaatatcacggaaaagaagatatatacatagataatgta
aaattatgtggcactttaaataataatactccaagaagagcttgtattacatttcgtatt
ccaagaaatccaagtgttggtgataaatttgcttcaagagctgggcaaaaaggtatttgt
tcacaaaaatggccagccgaagatctaccattcactgagacaggtctaattccagatata
gtgttcaatcctcatggttttccaagtcgtatgacaatagcgatgatgatcgaagtaatg
gctggaaagtctgcggctgtacatggattagtacacgatgcaacaccatttagatttgat
gaaaatgaaacagcagttgagttctttggaaagttattagaacgtggaggctataattat
tatggtacagaaagaatgtattctggtatcgatggacgtgaaatgacagttgatatattt
tttggaattgtacattatcagagattacgtcatatggtctcagacaaatggcaggtaaga
agtactggtcccattgatgtcttaacgagacaaccaataaaaggacggagacgaggtggt
ggtgttcgatttggagaaatggaacgagattctttaatatctcatggatgttcatttctt
cttcaggatcgtcttttccattgctctgataaaacaactgctttagtttgtcaaaagtgt
ggaacgttattaggaccagtgttagaactatcagtaaacccaacaggtataactgaaaag
aaacaaaagtgtagactttgtggggatgatgaatctgtgaaagaaattgatattccttac
atatttaaataccttgtaactcaacttacttgctgcaatattaatgtcaaattatcattt
gtagaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system