Vicia villosa (hairy vetch): 131662131
Help
Entry
131662131 CDS
T09680
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
vvo
Vicia villosa (hairy vetch)
Pathway
vvo03015
mRNA surveillance pathway
vvo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vvo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
131662131
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
131662131
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
vvo03041
]
131662131
Spliceosome [BR:
vvo03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
131662131
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131662131
NCBI-ProteinID:
XP_058787810
LinkDB
All DBs
Position
LG3:complement(87334195..87337259)
Genome browser
AA seq
503 aa
AA seq
DB search
MSGGYGHDGGGGSAPSSYGASSGYGSAGGYGGGGGGGNYGGGGGGGGGGGNYGGGSAGGY
GGNESGGGYGSKGSGNGGGGGYGGGDGGSGGYGGRSGYGGNDGGGYGGRGGGGSRGSGGY
GGRAGGGGGFQGGDRGGRGGGGGRGGRGGGGSGRDGDWRCPNESCGNVNFARRNECNKCG
APCPTSGNDRGGGGGGYNRGGSGGGYGSNQGGRSGNYDGGRTNDHNGGRSSNSDGRGGGS
NRGGSYGGNQGRDDGGYGQAPPPSAAQSYGGGGNYPPTYGGNANYGTDAVPPPTSYTGGP
NSYPPSYGGNAGGYGGDNQGDARSGGRAAPPAGYDSGNRGGFGGAPAESAAPVKQCDENC
GDTCDNSRIYISNLPPDVTVDELQQLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDENGKN
KGDACLAYEDPFAAHSAGGFYNDYDLRGYKISVAMAEKSAPRAPQANNHGGNRGGYGGGG
DRRRDNSGPDRRDHYSGNRSRPY
NT seq
1512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagggtacggtcatgatggcggtggtggttctgcgccatcgtcctatggagct
agtagtggttacggttcagccggtggttacggaggtggtggaggtggcggaaattatgga
ggaggaggtggtggaggtggaggtggtggaaattatggaggaggcagcgccggtggttat
ggcggaaatgaaagcggtgggggttacggatcgaaaggtagcggaaacggaggcggcggt
ggatacggaggtggcgatggtggaagtggaggatatggcggaaggagtggatacggggga
aacgatggcggaggatacggtggaagaggcggcggtggcagtaggggaagtggtggatat
ggaggtcgagcaggtggtggtggtggatttcaaggtggagatcgtggtggtagaggtggt
ggtggtggtcgcggtgggcgcggcggtggtggaagtggccgagatggagattggcgttgc
cctaatgaaagttgtgggaacgtgaattttgctagaagaaatgagtgtaacaagtgtggt
gctccatgtcctaccagtggtaatgaccgcggcggcggcggtggtggatataatagagga
ggaagtggtgggggatatggcagtaaccaagggggtagatctgggaactatgatggaggt
agaactaatgaccataatggtggaaggagtagtaacagtgatggccgaggtggagggagc
aacaggggtggctcatatggtggtaatcaaggcagagacgatgggggctatggtcaagct
cctcctccttctgctgctcagtcttatggtggtggcggaaactaccctcctacttatggt
gggaatgcaaattatggaacagatgctgttcctccacctacaagctatactggtggacct
aattcatatcccccttcatatggaggcaacgctggtggttatggtggagataatcaaggt
gatgcacgaagtggtggtagggctgcgcctccagctggatatgacagcggtaatcgcggt
ggatttggtggagctcctgccgagtcagcagctccggtgaagcagtgcgatgagaattgt
ggggatacatgtgacaactctagaatctacatctcaaacttaccacccgatgtgactgtt
gatgaattgcaacaactttttggaggcattggacaagttggtagaattaagcagaagagg
ggttataaagatcaatggccttacaacataaagatttatactgatgagaatggaaaaaac
aagggtgatgcatgccttgcttatgaagatccctttgcagctcactccgctggcggtttt
tacaatgattatgatttgaggggttacaaaatcagtgttgcgatggcagagaaatctgca
cccagggctccacaagcaaataaccatgggggcaataggggtggctacggtggtggtgga
gataggcgcagagacaattctggccctgatcgacgggatcattatagtgggaatcgttcg
cgcccatactag
DBGET
integrated database retrieval system
