Vibrio vulnificus CMCP6: VV2_1224
Help
Entry
VV2_1224 CDS
T00108
Name
(GenBank) Rhs family protein
Organism
vvu
Vibrio vulnificus CMCP6
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
FG-GAP_3
FG-GAP
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAO08121
UniProt:
A0A3Q0L006
LinkDB
All DBs
Position
II:1321903..1327833
Genome browser
AA seq
1976 aa
AA seq
DB search
MRLVNVEGQYGAAETEYRTLSDTYKKIVLHRSMQEPDSWFEVWDSNGVRSEFRPQHAPSG
QAPLTWFLTKKNDLSGNSISYHYKKNPNEINSRVYLSEIDYSAFKIRLNYENSNKTRVDY
IAGVKNVDNYRLTDISVFKDDETDPFLSVLADYDLNESQLDLLSKIRVARNGRSEIDAFR
IDWSSAGTNKFIDYKRVLSGDFSSEKYAVREFADIDGNGIPDFVGFAKDGVYVAFGEVGG
TYSAPQKLVRGYVEETGGWNVASHPRMLSDVNGDGKADIVGFANAGIYVSLSEGKTFKQG
TLWSNAYGASGGWTVQAHERMLADVNGDGFNDVVGFAHQGVYVSLSDGKTFSEPKLWISQ
FGNNQGWSNTYHIRTVADINGDGMADVVGFSHQGVNIALSTGNSFVDQGQDSLWLEGFGY
SQGWTKEHHIRQVKDVNGDGLADIIGFSHSGVKVSLSTGISLSGESLWSDHFGYAAGGWR
LGDHPRTLSDVNGDSIPDIIGFANDRVLTSLSLETGFATREEGIRAYGTRAGSWVPGRDL
RLSIDINADNKSDIIGAKEDGIYTAVSDFSSYKVVSITSSLGNQDSFEYGNLTDPDVYTV
GQHTTYPQKDIVTGTVVKSISSSNGVGGKNEILYKYEGKRTHLMGAGNLGFQKVHLFDKT
KNRVISTTYNQEVENTLLYTAIKEKFTCQFNSEAQFAFESCKEDSSNLIHSLANYWNTEK
AIGNQAQGRYVSPSPAYKSPFEPRQRYKQQLVKQVEKSWDLHGSLLKTVTSERAYDKWYG
NTLSEIISTQDHINGQWFSKSTKYKYKQPNTNNWLVGLLENKVTSFSGSELYSNNNSFFE
RTYDYEYDSKGNLIRKYEQKGTDLERSTVLSNFDRGLPRNVTEHWSGYLSKNILNKSSVQ
VNQKTTKFIYDKYGYVTQSINALGQKTLTQFDPIWGQVTRLTEIDGNTTTYHLDDWGREI
GIDLPSGAWSRVKYAKSSDDYNSIYLKSVSSNVSPLLEYRFDSKHREVGTIKGIYKGYSY
VFKKYNNKGEVIGSTIPSKLTSGADFINYTYDSLGRITEIVKPNGNVSSYRYYGFTTEMT
NSERQTTSTIVNAIGQKIEVKDDANNSVNYYYDGWGNLTKTSDPKKNEIIVEYNELGQRT
KLIDPDLGEIEYYSNGLDLVYKTVTNNKIIVTDFYDEIGRLIKKVDPDAPSGRHWIYNAK
GQLEKAYQPGYFEGYKYYPNGLVMEKSFGVQSNSYSQKYIYDLRGRLSKLEYGNEIVTTY
NYSQDNFLKEVYLSDRGVKEIGSKIWAIREIDAFGNHEEQYYGNELIVTKKYDDVTGYIK
NIITKRNSLYQDSLLETNYDFDSIGNLVYREERKRDQVNRVAYDFKTDLASYKRYDLVSS
DKITYDNLNRITSISSNKISFVKKSWQENYLFKLEDPCKYKDCGFISNKRPNFYAEPNIL
EPFVGATKYEPYFNKLISVDNPVLVGYSNDGFPTVDYSKSSILDVPIDPEPSSYNENYGV
VTLDYDVLGNITHKSDVGSYRYDGVKPHAVSAVSGKTNSSFTYDAQGNMLSGLGRVITGY
TSFNKPIEIRKGNASTRFQYGVNQQRYERIDRNENGVIQTIYLDSTEIIKQPNGQTTFRY
YIGDFAIFEKTVGKASSSVIRYLHKDHLGSVIAISNQNGEIEERFSYDAWGKRRSSSWNK
PDTSPSEVGRIGFTGHEMLDEVGLIHMNGRVYDPTIGRFLSADPFIQDEWFATQAFNRYS
YVQNNPLSYTDPTGYYVPKDTSESSTSSEQERNDYRQYERDRDRDRDRNEVAHTQAEVAK
SQNPTTVYNDEAYIQGILDARDPELGGQYAAGLFGGARVVKGAVEIGATARPFISRFFSK
VYAKIKSALGFGDDVSDAVNGVMKPEVSDQKLGNLVEDLYKGASTQNPIGTGSTADAIRH
ENKTGEPVGGKFHTIKGQQYANALKKWLRKNTDASASDRNAAQSMLDDLIDALGEE
NT seq
5931 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgactagtcaatgtagaagggcagtacggggctgctgaaacagaatatcgaacctta
agtgatacatataaaaaaatagtgttgcacagaagcatgcaagaacctgatagttggttt
gaagtatgggattctaatggggttagatcggagtttagacctcaacatgcaccttcaggc
caagcgcctttaacgtggttccttacaaagaaaaatgacttatctgggaattcgatttcc
tatcactataagaaaaaccctaacgaaattaactcccgagtttacctttcggagattgac
tacagtgctttcaagattcggttgaactatgaaaattcaaataaaactcgtgttgattat
atcgcaggagtgaagaatgttgataattatcgtttaacggacatttcagtattcaaggac
gacgaaaccgatccattcttatctgttttagcagattatgatctcaatgaaagtcagttg
gacttgttatcaaaaattagagttgcaagaaatgggcgttctgaaattgacgcatttagg
attgactggtcgagtgcaggaacaaataaatttattgattataaacgagttctttcaggg
gattttagttctgagaagtatgcagtaagggaatttgctgacatagatggcaacggtatt
cctgactttgttggttttgcaaaagacggcgtatatgtagcgtttggtgaagtagggggg
acgtactctgcaccgcaaaaattggtgagaggctatgttgaagaaactggtgggtggaac
gtagcaagccatccaagaatgctatctgatgtcaatggtgacggaaaagcagatattgta
ggttttgctaatgcaggtatctacgtctcactttctgaaggaaaaacattcaaacaagga
accctttggtcaaatgcgtatggtgccagtggtggatggaccgtccaagctcatgaacgt
atgttggccgatgttaacggtgatggatttaatgatgtcgtaggttttgcacaccagggc
gtttatgtttcactttctgatggtaagacattttcagagcctaaactttggataagccaa
tttgggaataatcaaggttggagtaatacgtaccatattcgtaccgtggctgatataaat
ggtgacggaatggcggatgtcgttggtttttctcatcaaggtgtcaatattgcactttcg
actggtaattcatttgttgatcaggggcaagattcgctttggttggagggtttcggttac
tcacaaggatggaccaaagagcatcatattagacaagttaaagatgttaatggtgatggc
ttagctgacattattggtttttcccattctggtgtgaaagtttctctctcaacaggtatt
agtctttcgggtgagtctttgtggagtgatcactttggatacgctgctggtggatggaga
cttggtgatcatcctcgaacattgagtgatgtgaacggggattcgataccagatattatt
ggtttcgcaaatgatagagtccttacttcgcttagcttggagactggctttgctacgaga
gaagaaggtataagagcctatggaacaagagctggcagctgggttcctggaagagattta
cgtttatcaatagacatcaacgcagataataaaagtgacataattggagctaaagaagac
ggcatatatacagctgtaagtgatttctcatcatataaagttgtatccatcacgtcgagt
ttaggaaaccaagattcatttgaatatggaaacctaaccgatccagatgtttacacagta
ggtcaacacaccacttatcctcaaaaagacattgtcactggtactgttgttaaatctatc
tccagtagcaatggtgttggtggaaaaaacgagatcctctacaaatacgaaggtaagagg
acgcatctgatgggggcaggaaacttaggttttcaaaaggttcacttattcgataaaaca
aagaatagagtaatttccactacttataatcaagaagtggagaatacactgttgtataca
gcaattaaggaaaaatttacgtgccagtttaatagcgaggcacagtttgcgtttgaatca
tgtaaagaagattcttctaatctcatacactcgttggctaattattggaacacagaaaaa
gcaataggtaatcaagctcaaggtcgatatgtctcaccaagtccggcatataagtcccct
tttgagccaagacaaagatataaacaacaattagttaaacaagttgaaaaaagttgggat
ttacatggttctttactaaaaacggttacatccgagagagcttatgataagtggtatgga
aataccctttcagaaataattagtactcaagaccatataaatgggcaatggttttccaag
tcaacaaaatataaatataagcaaccaaacacaaataattggttagttggtttgttagaa
aataaagtgacatctttttctggaagcgaattgtactcaaataacaactccttttttgaa
agaacttatgattatgaatatgattcaaaaggcaatctaatacgtaaatatgagcaaaaa
ggcactgatttagagcgctcaactgtactatcaaactttgatcgcggattacctagaaat
gtcacggagcattggtcaggatatctaagtaaaaatatattaaataagagttcagttcaa
gttaaccaaaaaacgactaagtttatatatgataagtatggatatgtaacacagtctatc
aatgctttgggtcagaaaacattgacacaatttgatcctatatggggtcaagttactcgg
ttaacagaaattgatggaaatactaccacttatcatcttgatgattgggggagagagatt
ggtattgatttgccatcaggggcgtggtcgagagttaaatacgcaaaatcgtcagatgac
tacaactccatctatctaaagtcggtatcttcaaatgttagtcctcttcttgaataccga
tttgacagtaagcatcgagaagtagggacaataaaaggaatatacaaaggttattcttat
gtatttaagaagtataataataaaggggaagtaattggctcaactatacctagcaaactc
actagtggtgccgattttattaattatacatatgatagtcttggccggataacagaaata
gtaaaaccaaatggtaatgtatcttcttatcgttactatggttttactacagaaatgact
aactcagagaggcaaactacttcaacaatagttaatgctatagggcaaaaaatcgaggtt
aaagatgatgcaaataacagcgttaactattactatgatggttggggtaatttgactaag
acgagtgatcctaagaaaaatgaaataattgtagaatacaacgaacttggtcaaaggacg
aagcttatcgaccctgatttaggtgaaattgaatattatagtaatggattagatctcgtt
tacaagacggttactaataataaaataatcgttacagatttttatgacgaaattgggcga
cttattaaaaaagttgatcccgatgctccttctggacgccattggatatataacgctaaa
gggcaactggagaaagcatatcaaccaggttacttcgaaggatataagtattaccctaat
ggtttagtaatggaaaaatcatttggtgttcaaagtaatagctatagtcaaaagtacata
tatgacctgagaggtagattatcaaaattagagtatggaaatgaaattgtcaccacttat
aattatagccaagacaactttttgaaagaggtgtacttatctgatagaggtgtcaaagag
attggttccaaaatttgggctattagagagatagatgcatttggaaatcatgaggagcaa
tactacggtaatgaattgatagtgactaagaagtatgatgatgtcactggttatattaaa
aatataattacaaagagaaatagcctatatcaagatagtttattagaaactaattatgat
tttgactcaatcggtaaccttgtatatcgtgaggaaagaaaaagagatcaagtcaatagg
gtggcatatgactttaaaactgatcttgcctcatacaagcgttatgacttggtttcatct
gataaaataacctatgataatcttaatagaattacttcgataagttcaaataaaatttct
tttgtaaaaaaaagttggcaggaaaattacctgttcaagttagaggatccttgcaaatat
aaagactgtggttttattagtaataaaaggcctaatttttacgctgaacctaacattctt
gaaccatttgttggtgctacaaaatatgaaccatatttcaataagctaatttcagtggat
aatcctgtgctagtaggttattcaaatgatggctttccaacggttgactattcgaaatct
agcattttagatgtaccaattgatcccgaaccatcaagctacaacgaaaattatggcgta
gtgacactggattatgatgttttgggtaacataacgcacaaatcggatgtcggttcatat
cgctatgatggagtcaaaccacatgctgtaagtgctgtttcaggtaaaacaaacagtagc
ttcacctatgacgctcaaggcaatatgctttctggtttgggaagggtgattactggatat
acttcgtttaataaacccattgaaataagaaagggaaatgcgtctactcgcttccaatat
ggggttaatcaacaacgttatgaacgcatagatcgcaatgaaaatggtgtcatccaaact
atttatcttgattcaacagagatcatcaaacaacccaatggccaaacgactttccgctac
tatatcggagatttcgctatctttgagaagacggttggcaaagcgtcgagctctgtaatt
cgatatcttcacaaagatcatctagggtcggtaattgccatttccaatcagaatggtgaa
attgaagaacgttttagttatgacgcttggggtaaacgccgcagtagctcttggaacaaa
ccggacacaagtccatcagaagtaggtcgcattggcttcactggccatgaaatgttagat
gaggttggtctcatccacatgaatggacgagtctacgacccaactatagggcgtttcctc
agtgcagatccatttattcaagatgaatggttcgcgacacaagcatttaatcgatactca
tacgtgcagaataaccctctcagttatactgacccaacaggttattatgttcccaaagat
acgtcagagtcttctacttcgagcgaacaagagcgaaatgattaccgccagtacgaacga
gatagagacagagatagagaccgaaatgaagtagctcatacacaagcagaagttgcaaag
tctcaaaatccaacaacagtctataatgacgaagcttatattcaagggatcttagatgct
agagatccagaacttggtggtcaatatgctgcgggtctttttggtggtgctagagttgta
aaaggggcggttgaaataggggccacagctcggccattcattagtcgatttttttctaag
gtgtatgcaaaaataaagagcgcgttaggatttggtgatgacgtatctgatgcagtaaat
ggagtaatgaagcctgaagtgtctgatcaaaaactgggtaatctggtagaagatctttac
aaaggagcaagcactcaaaaccctataggtacaggaagtactgctgatgcaattcgtcac
gagaataagaccggcgaacctgtgggtggtaagtttcatacaatcaaaggtcagcagtat
gcaaatgcgttaaaaaaatggctaaggaaaaatacggatgcttcggcatcagaccgcaac
gctgctcagtcaatgttagatgacttgattgatgctttaggagaggaatag
DBGET
integrated database retrieval system