Vibrio ziniensis: G5S32_06085
Help
Entry
G5S32_06085 CDS
T07449
Name
(GenBank) cadherin-like domain-containing protein
Organism
vzi
Vibrio ziniensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_5
Cadherin_4
Big_9
HemolysinCabind
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIH41579
UniProt:
A0A6G7CHL1
LinkDB
All DBs
Position
1:1329905..1334395
Genome browser
AA seq
1496 aa
AA seq
DB search
MDKSSLLSIANLAINQMIVIDKNGDLKIATIGEKLPEGTVIIQRGDEMISNDEFVTKIIG
PNNEPQNVSDDVAQLLSALEEGQDPTQLGDELAPAAGGSQGSSLTDSASVERSASETIAT
TSFSTTGFESLGFSQTQSLALISLTSTSSNSAEIVTQNSAPNAENDTITVNEDTSITIDV
LNNDIDEDGDALTIVSATVSEDEGTIEIVDGKLVFTPAENFNGEVSIEYTITDNQGGTDT
AQVTVTVNAVNDAPTTTSVDLGSVEEDGSVLITTAQLLANASDIESDTLFISGLTASRGS
LVDNGDGTWTYTPEADDDSAVSFSYTITDNGTTDGESDPQSVSGSATLDITPVNDAPTTS
AVNLGSVEEDGSVLITTAQLLANASDIESDTLFISGLTASRGSLVDNGDGTWTYTPVADD
DSAVSFSYTITDNGTTDGESDPQSVSGSATLDITPVNDAPTTTSVDLGSVEEDGSVLITT
AQLLANASDIESDTLSISGLTASSGSLVDNGDGTWTYTPVADDDSAVSFSYTITDNGTTD
GESDPQSVSGSATLDITPVNDAPTTTSVDLGSVEEDGSVLITTAQLLANASDIESDTLSI
SGLTASSGSLVDNGDGTWTYTPAANDDNVSFSYTITDNGETNGVADPKSVQGSAVLEVNN
IPTIDLNFDTSEDATHSVSVSAETSGTDVIGYYIVNDDGTISQKGAIVSTNNWNSASYED
GIAALLASGGTVYLFAVTLTSSSVIAAVSNGDFDVNSDGTVTVSSSSSSSSTVTSTALDD
LLDVANLGLVVSNNTLTSTNDDVEVTYDSRTNTYTVSIDGVSYEGVTVSSGGSIVLDDFR
VVINDDGDINIGIEDWTDNDYNDLAITFSGYDVGVDADVSGTVGVPVSIVSENIAIGDDE
NAISSVTLTVSTVDGELFIGGSAIDSETSTVIVSGQEYVVSISNGTYTFTSIDDSGNEVS
ATTEQYEELLQSITYSSEIEGYGTITITVTDDAGQTATATSTIYVESDGSSDSIHIQDDT
LSYSQSYGGNGETVQYNNGGNHTVEIELDSSVSTITVSLADKDSGKNGNEYGQWTVYGEN
EDGTINYDSVIAYGTFSVDDDGGISDAVVTYPQDGSFTVEVDGSSITISSGSTVIENVVF
SAVSPGSHYYVTGYSTSYAITNNTITIAAATLLANDTTTSGATLSLLASSLTSDDSNVSD
IAYDETTGSIIITLVDGVSSSDDSVDISFSYKATDGTLISDAATVTLSATSNGSDTSHSF
EGFTGDIDSAINEYASANYDYAYYSHNTYGTSGNDHIVGYNYYSDTLASGDGDDWIQGQS
GSDIIDAGDGDDLLQGGSGNDTLYGGDGNDILVGGNDEGYYCVSDNDKLYGGDGNDVLIG
GSGHDILTGGDGSDLFVLGSGSENSDTIVDFDSEEDAIDISDLLDVGSSDDIQSYIEAHI
TISTDSEGAYTLEVTDSSGCSSTSYDAATFGQDSNIGSGDIISVIFNNQEYKVTVD
NT seq
4491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaagttctttattatcaatcgcaaatttagcaataaatcaaatgattgtgatt
gacaaaaatggcgatttaaaaatagcaactattggcgaaaaattgcctgaaggaacggta
atcatccaaagaggcgatgagatgatttctaatgacgaatttgtcactaaaatcatcggt
ccaaataatgagcctcaaaatgtgagtgacgatgttgcacagttactttctgctttagaa
gaaggacaggatccgacacagcttggtgatgaactagctcctgcagctggaggcagtcaa
ggctcctcacttacagattctgcaagtgttgaacggtcagcttcagaaactattgctaca
acaagttttagcactacaggatttgaatctttgggcttttctcaaacccaaagtctagcg
ttgattagtcttaccagtaccagctcaaactctgcagaaatcgtcactcaaaatagtgca
ccaaatgctgaaaatgacaccataactgtaaatgaagatacatcaataacaattgacgta
ttgaataacgatattgacgaggatggtgatgcattaactattgtgtctgcaaccgtttct
gaagacgaaggtaccatcgaaattgtcgatggcaagttagtctttactccagctgaaaat
ttcaatggtgaagttagtattgaatacacaattactgacaatcaaggtggtactgataca
gcgcaagtaactgtcacggttaatgcggtcaatgacgcgccgaccaccacctctgtcgac
ttgggcagtgtggaagaagacggctcggtgctcatcaccaccgcgcagctgctggctaac
gcgtccgatattgaaagcgatactctctttatcagcgggttgaccgcgagccgcggcagt
ctggtggacaacggcgacggcacctggacctatacgccagaggctgacgacgacagcgcg
gtgagctttagctacaccatcacggacaatggcaccaccgacggcgagagcgatccgcaa
tcggtgagtggcagcgccacgttagacattacgccggtcaatgacgcgccgaccacctcg
gccgtgaacttgggcagcgtggaagaagacggctcggtgctcatcactaccgcgcagctg
ctggctaacgcgtccgatattgaaagcgatactctctttatcagcgggttgaccgcgagc
cgcggcagtctggtggacaacggcgacggcacctggacctatacgccggtggctgacgac
gacagcgcggtgagctttagctacaccatcacggataatggcaccaccgacggcgagagc
gatccgcaatcggtgagtggcagcgccacgttagacattacgccggtcaatgacgcgccg
accaccacctctgtcgacttaggcagtgtggaagaagacggctcggtgctcatcaccacc
gcgcagctgctggctaacgcgtccgatattgaaagcgatactctctccatcagcgggttg
accgcgagcagcggcagtctggtggacaacggcgacggcacctggacttatacgccggtg
gctgacgacgacagcgcggtgagctttagctacaccatcacggataatggcaccaccgac
ggcgagagcgatccgcaatcggtgagtggcagcgccacgttagacattacgccggtcaat
gacgcgccgaccaccacctctgtcgacttaggcagtgtggaagaagacggctcggtgctc
atcaccaccgcgcagctgctggctaacgcgtccgatattgaaagcgatactctctccatc
agcgggttgaccgcgagcagcggcagtctggtggacaacggcgacggcacctggacttat
acgccggcagctaacgatgacaacgtgagctttagttacaccattactgataatggtgag
actaacggtgttgctgatccaaaatctgtacaaggaagtgcagttttagaggtaaacaat
attccaacaattgatttgaactttgatacatctgaagatgcgactcactcagtttccgta
agtgccgaaacgagtggtacagatgttattggttattatattgttaatgatgacggcaca
ataagccaaaaaggagctattgtgtctactaataactggaattctgcttcttatgaagat
gggattgcagcattactggcatctggcggaactgtatatctctttgctgttaccttaaca
tcgagctctgtcattgctgccgtaagcaatggtgattttgacgtaaatagtgatggtact
gttactgtatcaagctctagctcatcatcatctacagtaacctctacagctctagatgac
ctgttggatgttgctaacctcggtcttgtagtgagtaataatactctgacttcaactaat
gatgatgttgaagttacttatgatagccgtaccaatacttatacagttagcatcgatggg
gtgtcttacgagggtgtgactgttagttctggcggaagcattgtgttggatgatttcaga
gtagtgatcaatgatgatggtgatatcaatattggtattgaagattggacggacaatgat
tacaacgatttagctattactttctcaggctatgatgttggtgttgatgcagatgttagc
ggtacggtaggtgtccctgtatcgattgtgagtgaaaacatagccattggtgatgatgaa
aacgcgattagctcggtgacattaacggtttcaaccgtggatggcgaactgtttataggt
ggcagtgctattgatagcgaaacatcaacagttattgtgagtggtcaagaatatgttgtt
agtatttctaacggtacttacacatttacctctattgacgatagcggtaatgaagtatcc
gcaactaccgaacagtatgaagaactgttgcaatctattacttatagcagcgagatcgaa
ggctacggcactattactatcacagtaactgatgatgcagggcagactgctactgcgaca
tccacaatttatgtcgaatctgacggttctagcgattctattcatattcaggatgacacg
ttgagctactctcagagttacggtggtaatggtgaaaccgttcaatacaacaatggtggc
aatcataccgtggagattgagcttgattcttctgtatcgactattacagtctctttagct
gataaagatagtgggaaaaatggtaacgagtacggtcaatggacggtttacggtgaaaac
gaagacggtacaatcaactacgattcggttatcgcatacggtacatttagcgttgacgat
gatggtggtatttccgacgcagtcgtgacgtacccacaagatgggtcgtttacagtagag
gtggatggtagttcaattactattagtagtggttcgacggtaattgaaaatgtggttttt
tcagcggtgagtccaggtagccattactatgtaacaggctatagtacgagttacgctatt
actaataatacgattactatcgctgctgctacgttgctggccaatgacaccactactagt
ggtgctacattgtccctactagcaagttcgttaaccagcgatgattcaaatgtgagtgat
atcgcttatgatgaaaccacaggcagcattatcattacgttagttgatggtgtgagttct
tctgatgattctgttgatatttccttcagttacaaagctactgatggcaccttgatatca
gatgccgccactgtaactctatcagcaacatccaacggctctgatacctctcatagtttt
gaaggttttacgggggacattgatagtgctatcaatgagtatgcatctgccaattatgac
tatgcatattattcgcacaatacatacggtacatcaggaaatgaccatatcgtaggttac
aactattatagtgacactttagctagtggtgatggtgacgattggatacaagggcaaagt
ggcagtgatattatcgatgccggtgatggtgatgacttgctacaaggtggtagtggcaat
gacaccctgtacggcggtgacggtaacgatattcttgttggtggcaacgatgagggatat
tactgtgtatccgacaacgataaactttatggtggtgacgggaatgacgtcctgataggt
ggaagtggtcatgacatcttaacaggtggtgatggaagcgacttgttcgtgcttggctca
ggttctgaaaattcagacacaatagtggattttgattcagaagaagatgcaattgatatt
tcagatttacttgatgtcggaagcagtgatgatattcagagttatatagaagcacatata
actatttctactgatagtgaaggggcttatacgttggaggtaaccgattcatctggatgc
agttcaacctcgtatgatgcagcgacgtttggtcaagattcgaatatagggtctggagac
attatctcggtcatatttaacaaccaagagtataaagtgactgttgattag
DBGET
integrated database retrieval system