Wohlfahrtiimonas chitiniclastica: PE074_08130
Help
Entry
PE074_08130 CDS
T09056
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS assembly protein LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
wcn
Wohlfahrtiimonas chitiniclastica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wcn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
wcn02000
]
PE074_08130 (lptD)
Transporters [BR:
wcn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PE074_08130 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHR55062
LinkDB
All DBs
Position
complement(1666965..1669409)
Genome browser
AA seq
814 aa
AA seq
DB search
MKTIRQRNKLYIALVIGLMQAPLMAQTPQTGALGVCRISPLKQYLQPTDQVIEDGTVYLS
GNAADSDERYANVEGDIVAYYGNSRVDASRITLDRTTNVLSGRDQNIRYASDSVVLESKS
FTSRLNDKEYEGDDVTYYLHQAEAQGRAKYAISRQIEKTADFQGVTYSTCPTDEEVWQLS
AADLHLDENTGRGIAKHAKFALFGVPILYTPYFSFPIDDRRQTGFLFPTISYDRDGGLAI
RAPYYLNLAPNYDVTLNPGFYTRRGLILGAEARYLNTWQNSVFRFDFLPDDRRFKNQERA
RIAANDPKDPYSKKFHSTRWSVFFNQQLNLMPKLRGRILFQQVSDHRYVEDIQDAVGLLT
ETNLERVAELTYSDRNWQSTLRVQHYQVLDKVIIPEAPYARMPQWLLSGEWEQNGIIYGA
NVEAVQFRTHIKPNDRNKARPKSATRLDLLPYVGFRLENSWGFFEPKLAYRYTHYDLDYQ
DINGVAPNKPHNLHRGTSIFSIDTGIALERDVSFSSLFGGGNFIQTLEPRLFYLNVPYRR
QSDIPIFDTGNITPSYDNLFATNQFTGADRQSNANQLTTALTTRFINDETGVEHFRLSLG
QIYYFDQPRITINQDLLPKNECLKDYENNHRPGIGAIKCQSGRHSEWFVENHIVFSSDFS
SRVIWQWSPDAKRTTRLSYDLRYQPEPRKIINIAQRYDRTLTGTQKDWVTNQIDITSFWE
VNNNWAVVGRYNYSLEERRMNDSYMGFEYSDCCVATRVAARYYRSNLLDDKKSWKAYLQF
EFKGLGNVGQSTDSFWEESIPGYTAKYLSNTRGF
NT seq
2445 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaacaatacgtcagcgaaataaattatacattgcccttgtgattgggttaatgcaa
gcgcctttgatggctcaaacaccgcaaacgggtgctttaggcgtttgccgcatcagcccg
ttgaagcaatatttacagccgactgatcaagtgattgaggatggcacggtttatctctca
gggaatgctgctgacagtgatgagcgttatgccaatgtcgaaggcgatattgtggcgtat
tatggcaacagccgtgttgatgccagtcgcatcacgctagatcgtaccaccaatgtctta
tctggccgtgatcaaaacattcgttatgcctctgattctgtggtgcttgagtctaaaagc
ttcacctcgcgccttaatgataaagagtacgaaggcgatgatgtcacctattatttacac
caagcagaagcgcaagggcgcgcgaaatatgccatcagccgtcagattgaaaaaacagca
gatttccaaggtgtgacctattcaacgtgcccaacagatgaagaggtgtggcagttgtcc
gcagccgatctacatttagatgaaaacacagggcgcggcattgccaaacatgccaaattt
gcactctttggcgtcccgattttatacacgccatatttttcattccccattgatgatcgt
cgacaaacgggctttttattccccacaatctcttatgatcgcgatggtggcttagctatc
cgtgcaccttactatctaaatttagcaccgaattatgatgtgacgttaaatcccggattt
tatacgcgccgcggtttgattttaggggcagaagctcgctatttaaacacatggcaaaat
tcggtgttccgttttgattttttgccggatgatcgccgctttaaaaatcaagagcgtgcc
cgcattgctgccaatgatccaaaggatccatacagcaaaaaattccactcaacacgttgg
tcagtgtttttcaatcagcagttaaatttgatgcctaaattgcgtgggcgcatcttattt
caacaagtgtctgatcatcgctatgtggaagacattcaagatgccgtcggcttattgact
gaaacaaacttagagcgcgtggcagaactcacctattcagatcgcaattggcagagcaca
ttgcgtgtgcagcactatcaagtgttggataaagtgatcattccagaagcgccttatgcc
cgcatgccacaatggttattgagtggcgaatgggaacaaaatggcatcatttatggtgcg
aatgtggaggctgtacagtttagaactcacattaagccgaatgatcgcaacaaagcgcgt
ccgaaatctgcgacgcgtttagatttattgccgtatgtgggctttcgtttagaaaattcc
tggggcttttttgagccaaaattggcctatcgctacacccattatgatttagattatcaa
gacatcaatggcgttgcaccgaataaaccccataatttgcaccgcggcacctctattttc
agtattgatacaggaattgccttagagcgtgatgtgagctttagcagtttatttggtggc
gggaacttcattcaaacattagaaccccgtttattttacttgaatgtgccatatcgtcgt
caatcagacattccaatttttgacaccggcaacattacgccaagctatgacaatctattt
gccaccaaccaatttactggcgccgatcgtcagagcaatgccaatcagctcacaacggcg
ctcaccacacgttttattaatgatgaaacgggtgtggagcactttagattgtctttgggg
caaatttattattttgatcaaccacgcatcaccattaaccaagatttattgccgaaaaat
gagtgcttgaaagattatgaaaataaccatcgaccaggcattggggcaattaaatgccaa
agtggccgtcattcagaatggtttgtggaaaatcacattgtattttccagtgacttcagt
tctcgcgtcatttggcaatggtcaccggatgctaaacgcaccacgcgtttatcgtatgat
ttacgctatcaaccagaacctcgtaaaatcattaacattgcacagcgctatgatcgcacc
ttgacgggtacgcaaaaagattgggtgacgaaccaaattgacatcacatccttctgggag
gtgaataataactgggcagtggtggggcgttataactattcattagaagagcgccgcatg
aatgattcttatatgggctttgaatacagtgattgctgtgtggcaacacgtgtggcagcc
cgttattatcgcagtaatttactcgatgataaaaagagttggaaagcctatttacaattt
gagtttaagggcttaggtaatgttgggcagagcacagattctttctgggaagagagcatt
ccgggctatacagcaaaatatttaagcaatactcgcggattttag
DBGET
integrated database retrieval system
