Wolbachia endosymbiont of Drosophila mauritiana: EJB00_04890
Help
Entry
EJB00_04890 CDS
T07604
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'
KO
K13797
DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
wdm
Wolbachia endosymbiont of Drosophila mauritiana
Pathway
wdm03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wdm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
EJB00_04890
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
wdm03021
]
EJB00_04890
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
wdm03400
]
EJB00_04890
Enzymes [BR:
wdm01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
EJB00_04890
Transcription machinery [BR:
wdm03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
EJB00_04890
DNA repair and recombination proteins [BR:
wdm03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
EJB00_04890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb2_1
RPOC_hybrid
Biotin_lipoyl_2
Peptidase_M23
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QCB63930
LinkDB
All DBs
Position
complement(1016271..1024790)
Genome browser
AA seq
2839 aa
AA seq
DB search
MVDSSYMCASSAFVPRVSYSRSIDLKDSLLDLVKVQKGSYNSFTPNNESNERLKAIFHTI
FPISDPLHRATIEFLNCRVDDLKYSESECIKRGITFSAQVIASIRLVIMQDGVSLEKYQE
IKEGDDHSKLATVIKSAEEQEVRFCELPMMTDKGTFIINGVEKVIVSQMHRSPGVFFDSD
KGKTYNSGKLIYSARVIPYRGSWLDIEFDVKDHLYFRIDRKRKLPISVLLKALGLSNNDI
LNRLYEKIEYIKHKSGWKVPFFPDKFKGVRLPFDLKNVEGNVLLKANVRITSKLAKNLYD
NGLKEYLIPYDSICGLFLAEDLIDSASSTKILSAGESIKLEDIKKLELLSIDKISVLNID
NVSVGPYILNTLFLDENMSYENALYEIYKVLRPGEVPVLKIVEEFFRNLFFSLEYYDLSN
IGRLKLNSCLGLNYEENLTTLTHEDIIEIIRKIVLLRDGQGSVDDIDHLANRRVRSVGEF
IENQFRTGLLKLGRAVVDSMSTSSLDKVSPSDFINPKVLTNVLRDFFNSSQLSQFMDQTN
PLSEITHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLINSLAIYA
RINKYGFIESPYKKVVNKVVTDQIEYLSAIDEGLYYIADTSAKLDENNCFVDDMLYCRYS
GTFVMVNSNQVSYIDLSPKQVISVAASLIPFLENDDANRALMGSNMQRQAVPLLKPTAPL
VATGMESFVASGSGAVVLAKRGGIVDSSDSNSIVIRAFDKEGINYLDVDIYHLRKFQRSN
HNTCINQKPLVHVGDCVKEGDVIADGPAINSGELALGQNLLVAFMSWQGYNFEDSIIISS
EVVKKDLFTSIHIEEFECVVHDTPLGSEKITCAIPGVNEENLYHLDDSGIVKVGTRVGPG
YILVGKVTPKHSLSLPPETKLLMTIFGEKSFDCVDSSLYTSPDIEGIVIDVQVFTRRGEE
ENERAFLIKQKEANDFEKERDHIINVINQYFYDELRKILINSGSQDRESINFIEREGWWD
IGLKNQSISKQVENLKKDFDEKVSHAITNFKRKVEKLHEGYDLPQGVSMSVKVFIAVKHS
LQPGDKMAGRHGNKGVISRVVPVEDMPYLEDGTPIDIILNPLGVPSRMNVGQILETHVGW
ACKKLGEKVGNILDEINKIKRAFCEAIRSLSDDDFVKFAALYLDNKKFEDINDDEITASI
LDTPNKDELNNELTTLVENYFNSCKDAHSSLRHFLIEVYSCGSNLSICNNIRDINDNHLI
EFAYKLRNGIPVTAPVFEGPKDEQIVKLFELAGLDNSGQVVLYDGCSGEKFDRKVTVGYM
YMLKLHHLVDGKIHARSVGPYSLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEM
LTVKSDDINGRVKIYESVIKGDSNFECGIPESFNVMIKELRSLCFNVDLKQNDIVIEDIS
HTNIAQSFNEVSISIASPESIKRMSYGEITDVSTANYRTFKVEKGGLFCPKVFGPVNDDE
CLCGKYKKRRHRGRICEKCGVEVTSSKVRREKMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGALLD
MSLRDIESILYSDNYVVIDPLVSSFEKGEIISEKAYNEAKDSYGVDSFIAMQGVEAIREL
LTRLDLHEIRKNLRQELESVASEIRRKKIIKRLRIVENFIKSGNRPEWMILTAIPILPPD
LRPLVSLESGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLRKLLSLNPPEIMIRNEKRMLQEAVDSLFD
NSRRNTLVNKAGATGYKKSISDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLNQCG
LPKRMALELFKPFVYSRLKIYGMAPTIKFASKLIRAEKPEVWDMLEEVIKEHPVLLNRAP
TLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDGDQMAVHVPISLEAQLEARVLMMSI
NNVLSPSNGRPIIVPSKDIVLGIYYLTLQQLKEDDLPLFCAFCEVEHSLNNGTLHIHSRI
KYKMEYINSDGNIQYKIIFTTPGRLILWQIFPKHENLSFDLINQVLTVKEITSIVDLVYR
SCGQSATVVFSDKLMTLGFEYATFSGTSFSRCDMVIPETKATHVDYTRGEIKKFSAQYQD
GLITKSERYNKVIDEWSKCTDIIANDMLKAISVYDENSKYNSIYMMVSSGARGSTSQMKQ
LAGMRGLMTKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLADTALKTANSGYLTRR
LVDVSQNCIVTKHDCKTKNGLIVRAIVEGSTIVASLESVVLGRTAANDMYNPVTKELLLK
AGELIDEDKVKQINIAGLDAIKIRSPLTCEISPGVCSLCYGRDLATGKIVSIGEAVGVIA
AQSVGEPGTQLTMRTFHIGGVMTRGVESSNIIASINARIKLNNSNIIIDKNGNKIVISRS
CEIVLIDSLGSEKLKHSVPYGAKLYVNEGELVKIGDKVAEWDPYTLPIITEKSGTISYQD
LKDGISITEVMDESTGISNRVVKDWKLHSGVANLRPRIALLDDNEKVITLSSGVEACYFI
PVGAVLNVQDGQKVHAGDVITRTPRESVRTRDITGGLPKVIELFEARRPKEHSIVSEIDG
YVMFSEKDRRGKRSIVIKSVDEQASPVEYLVSRSKHVIVNEGDFVRKGDLLMDGDPDLHD
ILRVLGLEALAHYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHLEVILKQMLQKVEITDPGDTMYLIGEN
IDRLEIDRENDAMNNSGKRPAHYLPILQGITRASLETNSFISAASFQETTKVLTEAAFCG
KSDPLSGLKENVIVGRLIPAGTGLVMNKVKALSLCENIDKYEKYFDIETYDEKLLSDNSY
QLHSDEEESVVALHYDQSN
NT seq
8520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgattcttcttatatgtgtgcttctagtgcttttgttcctagagtttcttattcc
aggtcgattgatttaaaagattctttgttggatttggttaaagtccaaaaggggtcatat
aattcctttactcctaataatgagagtaatgaaagacttaaagctatctttcatacaatt
tttccaatatctgatcctttgcatagggctactatcgaatttttgaattgtagggtagat
gatcttaaatatagtgaatctgaatgtataaaacgtggtataactttttctgctcaggtt
attgcttctatacgtcttgttattatgcaggatggtgtttctcttgaaaaatatcaagag
attaaagaaggtgatgatcattctaagcttgcaactgttataaaatctgctgaagagcag
gaggttcgcttttgtgaattgcctatgatgactgataaaggtactttcatcatcaatggc
gtagagaaagttatcgtttcacaaatgcatagatctcctggagtgttttttgatagtgat
aagggaaaaacttataattctggcaaattgatctattctgctagagttattccttataga
ggttcttggcttgatattgagtttgatgttaaagatcatttgtattttcgtattgataga
aagagaaagttgccaatatcagttttattaaaggctttgggcttatcaaataatgacata
cttaatagactttatgaaaaaatagagtatataaaacataaaagtggctggaaagtacct
tttttccctgataaattcaagggagtgaggcttcctttcgatttaaagaatgttgaaggc
aatgtgttacttaaagctaatgttcgtattacttcaaaattagctaaaaatctatatgat
aacgggttgaaagagtatctaattccttatgattctatatgtggtttatttcttgcagaa
gatttaatagatagtgctagttctacaaaaatcttatctgctggtgaatctataaaatta
gaggatataaaaaagcttgaattattatctatagataaaatatcagtgttgaacatagat
aatgtttctgttggaccttacatattaaacacacttttcttagatgaaaatatgtcttat
gagaacgctctatatgaaatatataaagttttgcgtcctggtgaagttcctgttttaaag
atagtagaggagttttttcgtaatcttttcttcagtctggaatattatgatttgtctaac
attggtagattaaaacttaactcttgtcttgggttaaattatgaggaaaatttaactact
ttaacacatgaagacattattgaaattataagaaaaatagtattgttacgtgatggtcaa
ggatctgtagatgatattgatcatttagcaaatagaagagtccgttcagttggagagttt
atagaaaatcaatttagaactggattattaaaattgggacgggcagtagttgattctatg
tctacttctagtttagataaagtctctccatctgattttataaacccaaaagtgttaacc
aatgtcttaagagattttttcaattcttcccaattatctcaatttatggatcagactaat
ccattatctgaaataacacataaaagaaggttgtcggcgttaggtcctggtggtttaaca
agagagagggcgggatttgaagtgcgtgatgttcatccaactcattacggaagaatttgc
cctattgagactcctgaggggcagaatataggcttaattaacagcttagctatatacgct
cgtattaataaatatgggtttattgaaagtccttataagaaagtagttaataaggttgtt
actgatcaaattgagtatctgtctgctatagatgaaggtttatattatatagccgatacc
agcgcaaagcttgatgaaaacaattgctttgttgatgatatgttatactgtaggtattct
ggtacctttgtaatggtaaatagtaatcaagtaagttacattgatttatctcctaagcag
gtaatatcggttgctgcttctttaattccatttttagaaaatgatgatgctaatagagcg
ttaatgggttcaaatatgcagcgtcaagctgtacctttattgaagcctactgctcctttg
gttgctactggtatggagtctttcgtagcttctggctctggtgctgtagttttagcaaaa
cgtggtggcatagttgacagctcagatagtaactctatagttatacgtgcttttgacaaa
gaaggaattaactacttggatgtagatatttatcatctaagaaaatttcagcgttctaac
cataatacttgtattaaccagaaaccactggtgcatgtaggtgattgtgttaaggaaggt
gatgtgatagctgatggtcctgctattaatagcggtgaattggcacttggccaaaacttg
ctagtcgcttttatgtcttggcaaggttataattttgaagactcaatcattatttctagt
gaagttgttaaaaaagatctatttacttctattcatatagaagaatttgaatgtgttgta
catgacactcctttagggtcggaaaaaataacttgtgccatacccggtgttaatgaagaa
aatctttatcacttggatgatagtggtatagtaaaggttggtacaagagttggtccaggt
tatattttggtggggaaagttacacctaagcattctctttcattgcctcctgagacaaaa
ttgttaatgacaatttttggtgaaaagtcattcgattgtgtggattcctctttatataca
tctccagatattgaagggatagtgattgatgtgcaggtctttacacgcagaggggaagaa
gaaaacgaaagagcgtttcttattaagcaaaaagaggcaaacgactttgagaaagaacga
gaccatataatcaatgttattaatcaatatttctatgatgaattaagaaaaattcttatt
aattctggctctcaagatcgagaaagtattaattttattgaacgtgagggatggtgggat
ataggattgaaaaaccaatctatttctaagcaagttgagaacttaaaaaaagattttgat
gaaaaagtatcacatgcaataacaaactttaagcgaaaagtagaaaaattgcatgaaggc
tatgatctgcctcaaggtgtgtcgatgtcagtaaaagtttttattgctgtaaaacatagt
ttacagccaggggataaaatggctggtagacatggaaataaaggtgtgatttctcgagtt
gttccagtagaagatatgccttatttagaagatggtactcctattgatattattcttaac
cctcttggcgttccttcacgaatgaatgtagggcaaatattggaaacgcatgtaggttgg
gcttgtaaaaaattaggagaaaaagtaggcaatattcttgatgagatcaataaaatcaaa
cgtgctttttgtgaggcaattagatctctcagtgatgatgattttgtaaaatttgcagca
ttatatcttgataataaaaaatttgaggatattaatgatgatgaaataacggcttctatt
ttagacacgcctaataaggatgaattaaataatgaattgactacattagtagagaattat
tttaactcttgtaaagatgcacacagtagtttacgtcacttcctgattgaggtttatagt
tgtggcagtaatttatctatttgtaataacattcgcgatattaatgataatcacctcatt
gaatttgcgtataagttgcgtaatggcattcctgttactgcacctgtatttgaaggtcca
aaagatgaacaaatagtaaagctatttgaacttgctggattggataactctgggcaagtt
gtattatatgatggttgctcgggtgagaagtttgatcgcaaagttacagttggttacatg
tacatgcttaagttgcatcacttagtagatggtaaaattcatgcgcgttcagtaggacct
tatagcttagttactcaacaacctcttggaggaaagtctcattttggtggtcagcgtttt
ggtgaaatggaatgttgggcattgcaagcctacggtgctgcttacactttgcaggaaatg
ttaactgtgaagtctgatgacattaatggcagggttaagatttatgaatcggtaataaaa
ggtgacagtaactttgaatgtggaattcctgaatcctttaatgtcatgataaaagagttg
cgttccttgtgttttaatgtggatttgaagcaaaatgacatagtaattgaagatatatct
catactaatatcgcacaatcttttaatgaggttagcatttccattgctagccctgaaagt
attaaacgtatgtcttatggagagataacggatgtttcaactgcaaactaccgtacattc
aaagttgagaaaggtggattattttgtcctaaagtttttggtcctgtcaatgatgatgaa
tgtttatgtggaaagtacaaaaaaagaagacataggggccgtatatgcgaaaaatgtgga
gtagaagttacatcttctaaagtaagaagagaaaaaatgggtcatatagagcttgcatct
cctgttgctcatatatggtttttgaagtcacttccttcaaggattggagcattattagat
atgtctcttagagatatcgaaagtattttatatagtgataattatgttgtaatagatcct
cttgtttcctcttttgaaaaaggtgaaattattagtgagaaagcttataatgaagctaaa
gatagctatggggtcgatagctttatagctatgcaaggtgttgaagctataagagaattg
ctaacacgccttgatttacatgaaattaggaagaatttaagacaggagttagagtctgtt
gcttctgaaataagaagaaagaaaattataaagagattacgtattgttgaaaattttatc
aagtctggaaacagacctgagtggatgatacttacagctatacctattttaccacctgac
ttgcgtcccttggtatcgcttgaaagtggtcgacctgcagtttctgatttaaatcatcat
tatagaactattattaatagaaataatagattgagaaaattgttaagtttaaatcctcct
gagattatgattcgtaatgagaaaagaatgttacaagaggcagttgattctctttttgat
aatagtcgtcgtaatactctagtaaataaagctggcgctactggatataaaaagtctatt
agcgatatgctgaaaggaaagcaaggtcgtttccgtcagaatcttttaggaaaaagggta
gattactctggacgttctgtaatagttgttggtccaactttgaaactaaatcagtgtgga
ttaccgaaaagaatggctcttgagttattcaaaccttttgtttactcaaggcttaaaata
tatggaatggctccaactattaaatttgctagtaagttaataagagcagaaaagccagaa
gtttgggatatgcttgaagaagtaataaaagagcatcctgttttgctaaatagagcgcct
acgctacataggcttggtattcaggcttttgagccagtccttattgaaggtaaagcaata
caacttcatccacttgtttgtacagcatttaacgctgactttgatggtgatcaaatggcg
gtacatgtgccaatttcattggaagctcaacttgaagctagagtgttgatgatgtcaatt
aataacgttttaagtccttctaatggaagaccgatcatagttcctagtaaagatatagtg
cttggtatatactacctaactttacagcaacttaaggaggatgatttaccacttttctgt
gctttttgtgaagttgagcattccttaaacaacggtactttacatattcattctcgtata
aagtacaaaatggaatacatcaatagcgatggaaacattcagtataaaattatttttaca
actcctggacgtttaatattatggcagatttttcctaaacatgagaatctaagcttcgat
ttaataaatcaggtattaacagttaaggaaataactagcattgttgatttagtatatcgt
agctgcggtcaaagtgctacagtggtattttctgataaattgatgacacttggctttgag
tatgctacattttctggtacttcttttagtcgttgcgatatggtcatacctgaaactaaa
gctacacacgttgattatacaaggggtgaaattaagaaattttctgcacagtatcaagac
ggactaatcactaaaagtgagaggtataataaagttatagatgagtggtctaagtgcaca
gatataatagcgaatgatatgttaaaagcgatatctgtgtatgatgaaaatagtaagtac
aattcaatatatatgatggttagctccggtgcaagaggttctacttcccagatgaagcag
ttagcaggaatgcgagggttaatgaccaaaccttctggtgaaattatagaaacacctata
atttctaattttcgcgaaggattaaatgtatttgaatactttaattctactcacggtgcg
cgtaaaggtttagctgatactgcacttaaaactgcaaattctggatacttaactcgtcgc
ttggttgatgtatctcaaaattgcatagttacaaaacatgactgtaaaacgaaaaatggc
cttattgtaagagctatagttgaaggtagtactatagttgcatctctagagagtgttgta
ctgggtagaacagctgcaaatgatatgtataacccagtaaccaaagagttattattaaaa
gcaggggaattaattgatgaagataaagtaaagcaaatcaacattgcaggtcttgatgct
ataaaaattagatcgcctttaacttgtgaaataagtcctggtgtgtgttctttgtgttat
ggaagagaccttgcaactggtaaaattgtttcaataggtgaagcagttggtgttatcgct
gctcaatctgttggagagccaggtactcagttaacgatgcgtactttccatataggtggg
gtaatgactagaggtgttgaatcctcgaatattatagcttctattaatgctagaataaaa
ttaaacaatagtaatataattatagataaaaacggaaataaaattgtgataagccgttcc
tgtgaaatcgtcttaattgatagccttggtagtgaaaaattgaagcacagtgtgccttat
ggtgctaaactttatgtaaatgagggtgagttagtaaaaattggtgataaagttgcggaa
tgggatccgtatacactacctattattacggaaaagagtggtacaatatcttaccaggat
ttaaaagatggaatttcaatcactgaagtgatggatgaatctacaggaatatcaaataga
gtagtaaaagattggaaattgcactctggtgtagcgaatttacgtcctcgtattgcactg
cttgatgataatgaaaaagtaataacactttcaagtggtgtggaagcatgttactttata
ccagttggtgcagtgcttaatgtacaggatggccaaaaggttcatgcaggtgatgttatc
acaagaacgccgagagagtcagttagaactcgtgatattactggtggcttgcctaaggtt
atagaattatttgaagcacgtcgtcctaaagagcattctatcgttagtgaaatagatggc
tatgtaatgttctctgaaaaagaccgtagaggaaaacgcagtatagtaattaaatctgta
gatgagcaagcttctccagttgagtatttagtatcaagaagtaagcatgtaatagtcaat
gaaggtgattttgtgcgtaaaggtgatttattgatggatggcgatcctgatcttcatgat
attctacgtgtgcttgggttagaagcgttagcacactatatgatttctgaaatacagcaa
gtttatagattgcaaggtgtgcgcatagataacaagcatttagaagtgatcttaaagcaa
atgctacaaaaagtagaaattaccgatcctggtgatactatgtacttaattggagaaaat
atcgacaggctggaaattgatagagaaaatgatgctatgaataactctggaaaacgacct
gctcattatcttcctattctgcagggcattactagagcaagccttgaaactaattccttt
atttctgctgcttctttccaagaaacaacaaaagtacttacggaagcagcattttgcgga
aagagtgatcctttgagtgggttaaaagaaaatgttatagtaggaagattaattcctgct
ggtacgggtctggttatgaataaggtgaaagcactttcgctttgtgaaaatatagataaa
tatgaaaaatattttgatattgagacttatgacgaaaaattgctgagtgataatagttat
caattacattctgatgaagaagagagtgtggtggcattgcactatgatcagtcaaattga
DBGET
integrated database retrieval system