Wolbachia endosymbiont of Aedes aegypti: L0Z57_02530
Help
Entry
L0Z57_02530 CDS
T08054
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
weg
Wolbachia endosymbiont of Aedes aegypti
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF6443
FG-GAP_3
SpvB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJA57469
LinkDB
All DBs
Position
complement(497224..505755)
Genome browser
AA seq
2843 aa
AA seq
DB search
MPNFYKLSFAKQVLPFDEGVQLYQDNSRSGDPLQLYALHKEGLNGYRYDNNTWKETLSMR
GLHAQQIYFADVLGNGELMLIAKTKEGISFYQHKNNEFSLLNRTENFRNNGFGSVRDWNE
PGSIIKFGHFYRNQGLVGILTYRRNYGTKLFVVVKDLLQKQQYPIHTPKYDYTIPGNFSQ
AKFALSDLKQNGQENIIVHGNNGFNIYSFNQTHRLEHLIQVPSSAKSDDSEEELFFPNLT
GQSYRDIVVLNSSGLFVYQHNSSINNYGLIDYQPSFSKLKGWEQEYINSIQFEDIDLDGR
EDMLFTGPSGINLLSFNNRTNQWQSLLDNSELTISQRHSRVMKVLPASPPTTKHPIVFTK
YKNQLHLANIVEIEDSLSLEEELEIDNASSKVTTSKVVPQVSKVHLEEEKPHLLLRDQLD
DSSIIDAVNKNTGKLNFKLPLIDLSNLSSDLKLDVFYDGNSQIFGNLGLGWSLPQNFIMV
DHQASIFPEDKKYYVILQDLPQQLVFDSKNSTDNVYSFKLSNEQSDVQVRYYRDKERWEI
DSKGVKQSYGSAQNGAVGWGLKWKNWRGVGSSSTGQEQFANVWYLAQIEDENNNVLHCTY
DAINVEVASGKNFTREIYLKTISDDQGNNITFNYSDKDKSEYDLPPIVDKQGNINTQMVQ
TRYLSGYKVSTTNYQQDISFVYEVKDRKRLLSKIKQEGDSTNQPILQFSYSKSHMLEKVI
LPTGASVQFDYQLLEKDFSISVNERIAQKYDVGKDYRVDYVDDYVLVSYMDGQEKVVLRM
FNQEMTEELYSSLARKDSSKLPLLGRGGAKSYGVVLTGGFLAVVLSYSTDQELHLLRQEK
GKWLSKSYTFSEKTTINPGKGFMVVVDRDSAIEVISWNKDSKEWRKDKPFAESEVPLLLK
VFGRGFIFYDNDLLSIGYKDYEDRWRYNTIEAIPGVINDIEETLDKFDLDSKRRDDFFAF
FKSNALQVSNNLLFLNRWKTEGMKLYSVIDLFVLDSSYKLAKREQKKILQDDLNQISDWL
ENGSGSSFKLAYQIVNDKLKVVAKDVRGSIVDEIHKQTDNSNRRNDQKDEVLKDVTKSLE
DRAKKPFLLNPYKYLAFLNSQVVICNNTKLTFTGDNWKEGTVSEEELKQEKFSVPLDEKF
VLKKEDLNSSIKLYNKKSNDKEELVKELGVNQFNQTVIRYPIYLAYQPRDQRVSVIKFAN
DGNISRTDELSWSEKLSPFSNYQTLVTSENSGKTLVFRKQAGHLFPDPVITQVTVSFDDG
NKRITGYEYSKAKALGNIIYYENVSVVPGNDKESFGWIEETRDFGNQSRTEKRIFNSQKE
LIKIVNFENKQANATTVDKENLYLNTTLLDKTGRLEIAQFFPYEIADEEVGYYGFEGYEV
NRIGEKNSTFEKKWVFDEKDIIREGFSFTGRNYLSLSGKSLVGKFQPNDQSQEYIASCWV
RPHSEMFKLGDIVPYLKAVVSTENKNETVLPLGEVKLQVGNWFYLEVIVDLFYAKEVLKN
VNEVQTNKTLVEEENVKLTTSIIVAPSTNTTVDVDHVRFSPLKSSFKANVYTKQVTEVIS
ASGLVERQIYDKYQKQVGSISGYGELKELSTYTKSSSIGKITELKSSVIIQPENGFYEDF
ASDSFDERWKIDSADAWQISPGRLQHLTSGTHTLQLNSSDIDRASYGMRFYFSLQSDGSV
INFNNNLKVIRTGSKAEIAFSGRGQSIPLDGELLIVAEGKRIFVWVDGGLYFDGFLNASL
FNLEISGKARISDVIVFSKPSVEVTYFNELNEKVQEIVLESENAAIVKEYLYDELGREAI
ITQPVCIERTNVLAYYSDFVTNGNPYKANSVWKTGKLEGDAARIVGEYGYSQVKYCDNPL
NEECVVGLPGKEFSISGPYAKRFSSSLDNLFISNLFPASKNYSYRVEHKPGNVKDVSVFD
SKDNRVAWYISTPKSKSLLSTYEYGENGKLVKSLPPIYHEKVGTFYKMNSQLNSTSREEK
TLQDSLGVNISYDQRGKIINKTTPDSGKVENLYDKDGLLRFVLHYSNNEKIDNTVYFDYD
ELGRLRSTGEVISSTPKEELLSLELSGNNTRAYQEFYYSDAEHQPVLRGKIARAITFNSG
EPLIEESVLNIDKETISKRIVIPTKDSEKPVLIAVNKRYGAGKLREVEYPIDIQDRPLRI
NYQYDKLGRIEGIGVRGKEDLFASFTYNAYGQISSEVHLPDLEKNFTRQYSYNSAGFLIE
LKDKFLTEKVYYTNGSYGGYGYGDGTITRTEFQADWHENCDDSKLGLNEKSFVSEYVTSE
KSALCFRELKKGGYLNDNGHQAKVSSTMRGELPIICRYGSTGRHIQNTLGREGFPREYGH
SYDYGNYQELTKAKYFVGKEVPMPLQRDSFAREIPRMNETASRDIWERLKESCYLVEDNE
KVDVSLGHGKRGKSFIKGTLLDDLKSVNADYERYKLPLEEVLIEYFAQKRDLSSLKVSLR
DAFVRWGSIEEANANKIVKMLEEKGYLKNPFAKEFNEVLERYQPYVYEIVSVLSEHFANP
LGEAEFDVESYSIDANGNHGHFYTGFDRYEIDYRNNTNQVSNVKFQSFALSKMEQNFLVK
HDSRGNVIQALHKGIEQIDYHPVSNRATKIKLIDSRALEFYYDARGERVLKRVYDKAGET
IKEIHYIRDEFGRALVEREVTYIAGGLRPDVSVTAYIYGPRGLFGFIRNNEFYSVITDHE
GSIRLVVKGDEVVAAYDYLPYDNLMRKYESDPEGQISYRYTGQEWDEEIGLYNYHARFYD
PNIGRFYQIDPKEQYFSPYKYAGNSPVSMVDPDGELAFLVLLPFIIAGAMAGGYLGGAAA
NNRWDPTVWDFKSKETWLGLWIT
NT seq
8532 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaatttttataagttaagctttgccaagcaagtacttccttttgatgaaggggta
caactctatcaagataattctcgaagtggtgaccctttacaattgtatgctcttcataag
gaaggactgaatggctatcggtatgacaacaatacttggaaagagacactctccatgaga
ggtcttcatgctcaacaaatctattttgctgacgtgttaggaaatggagaactgatgttg
attgcaaaaaccaaagaaggaattagtttttaccagcataagaataacgagtttagtctc
ttaaatagaactgagaattttaggaacaatggttttggtagcgttcgtgactggaatgaa
cctggcagtattataaagtttggccatttttaccgtaatcaaggcttggttggaatatta
acttatcgaagaaactatggcacaaagctctttgtggttgtgaaggatttgcttcagaaa
cagcaatatccaattcatacacctaagtatgattatactattcctggtaatttttctcaa
gccaagtttgccttatctgatttaaaacaaaatggccaggaaaatattattgttcatggt
aataatggttttaatatatattcattcaatcaaactcaccgactagaacatctgatacaa
gtaccaagtagtgccaagtctgatgattctgaggaggagttattctttcctaatttaacc
ggccagtcttatcgtgatattgttgtattaaattccagcggactatttgtctatcaacat
aatagtagcatcaataattatggactgattgattatcagccttcattctcaaagttaaag
ggctgggaacaagaatatataaattccattcaatttgaagacatagatttagatggcaga
gaggacatgctctttactggcccgagtggaataaacttactttcatttaataatcgtact
aatcaatggcagtccttgttggataattctgagcttactatttctcagcgtcatagtcgt
gtaatgaaagttttgcctgctagccctccaactacaaaacatccgatagtgtttacaaag
tataagaatcaattgcacttagcaaatattgtagaaattgaagattcactatcattagaa
gaggaacttgagatagataatgcttcatctaaggtaacaacatcaaaggtagtgccacaa
gtatctaaggttcatcttgaagaagaaaagcctcatcttttacttagggatcaattagat
gactcttcgattatcgatgcggttaataaaaatacaggaaagctaaattttaaactgcca
ttaattgatttatcaaacctttcatctgatctcaagttagatgtgttttatgatggcaat
agtcaaatattcggtaatttgggtcttggttggtccttaccacaaaattttataatggtg
gatcaccaagcaagtatttttcctgaagataaaaagtattatgttattctgcaagatttg
ccacagcaattagtatttgattctaaaaattcaactgataacgtttattcctttaaatta
tcgaatgaacaatctgatgtacaggtgcgttattatagagacaaagaaagatgggaaata
gatagcaagggtgttaagcagagttacggtagtgctcaaaatggagctgttggttgggga
ttgaaatggaaaaattggcgaggtgtaggtagtagctccacaggacaagagcaatttgcc
aatgtctggtatttagctcaaatagaggatgaaaataataatgttctgcattgtacgtat
gacgcaattaacgttgaagtagcaagtggtaaaaactttaccagggaaatttacttaaag
accattagtgatgatcagggcaataatattaccttcaattactctgataaagacaaaagt
gagtatgatttacctcctatagtagataagcaaggcaatatcaatacacaaatggtgcaa
actcgttatcttagtggctataaggttagtactacaaactatcaacaagatatcagtttc
gtttatgaagtaaaagacagaaagcgtttattatctaaaattaagcaagaaggtgattcc
actaatcagccgattctacaattttcttacagtaaatcacatatgttggagaaagttatt
ttaccaactggtgcaagtgttcaatttgactaccaattgctggaaaaagacttctcaatt
tcagttaatgagaggattgcgcaaaagtatgatgtagggaaagactacagagtagattat
gttgatgattacgtacttgtgagttatatggatggacaagagaaagtagtcctcagaatg
tttaatcaagagatgacagaggagttgtactcttctctagcacggaaagattcatcaaaa
ttaccgctgttaggaaggggtggagcaaaatcttatggggttgttcttacaggtggtttt
cttgctgttgttttatcttatagtactgatcaagagttacatttactacgtcaagaaaaa
ggtaaatggttatccaaatcttacacttttagtgaaaaaacaacaatcaatcctggcaag
ggttttatggttgtagtagatcgtgactctgctatagaagtgattagctggaataaagat
tcaaaagagtggagaaaggataaaccttttgctgagtcagaagtaccactattgctcaaa
gtgtttggtagagggtttatcttttatgataacgatcttttgtcaataggatataaggat
tatgaagaccggtggcggtataatacaattgaagcaatacccggagtgattaatgatata
gaggaaacattagataaatttgatttagatagcaagcggcgtgatgattttttcgcattc
ttcaaaagtaatgcattgcaagttagtaataatttgttgtttctaaatagatggaaaacg
gagggaatgaagctttattctgtaatagacttatttgttctggatagtagttacaaatta
gctaaacgcgaacaaaaaaagattctacaagatgatttaaatcaaatttcagattggttg
gaaaatggtagtggaagttctttcaaacttgcttatcaaattgttaacgataaattgaag
gttgttgctaaggatgttcgtggtagtattgttgatgaaatacataagcaaactgataat
tctaatcgaagaaatgatcaaaaagatgaagttctcaaggatgtcactaaatctctagaa
gatcgtgcaaaaaagccttttctgctaaatccttataagtatcttgcatttctaaattca
caagtggtgatatgtaacaacaccaagctcacttttactggtgataattggaaggaaggt
acggtatctgaagaagagctgaaacaggagaaattttctgttccacttgatgaaaagttt
gttttgaaaaaggaagatctaaattcttccatcaagctgtataataagaagtcaaatgat
aaagaggagctggttaaagagctaggagtcaatcaattcaatcagactgtgataagatat
ccgatttacttggcttatcagccaagggatcaacgggtaagcgtgattaagtttgcaaat
gatggcaatattagtagaactgatgaattgtcttggtcagagaaattaagtccattcagt
aattatcaaacattagtaacgagtgaaaatagtggtaagactttggtctttcgcaaacag
gctggacatttatttcctgatcctgttattacacaagttacagtgagttttgatgatggt
aataagcgtattactggatatgaatatagtaaagcaaaagcgttaggtaatattatatat
tatgaaaatgtttctgtagttccaggcaatgataaggaatcttttggttggatagaagaa
accagagattttggcaaccaatctagaacagaaaaaagaatttttaactcacaaaaagag
ttgataaaaattgtaaattttgaaaataagcaagctaatgccaccacagtagataaggag
aatttatacttaaacactaccttattggataaaacaggaagactagaaatagcacagttt
tttccttacgaaatagcagatgaagaagttggttactatggctttgaaggttatgaggta
aatagaattggtgaaaaaaactccacatttgaaaagaaatgggtatttgatgagaaggat
ataataagagaaggtttttcatttactggaaggaactatttgagcttatcaggaaagtcc
ttggtagggaagtttcagccaaatgatcaaagtcaggaatacatagcatcatgctgggta
aggccacacagcgaaatgtttaaacttggtgatattgttccttatctaaaagcagttgtt
tcaactgaaaacaaaaatgagacggttttaccacttggtgaagttaagttacaggttggt
aattggttctatttagaggtaattgtagatttattttatgcgaaagaggttttgaaaaat
gtaaatgaagtacagacaaataaaactctagtagaagaagagaatgttaaattaacaaca
tctattattgtagctcctagtacaaacactactgttgatgtagatcatgttcgtttctct
ccactcaagagtagttttaaagctaatgtatataccaaacaggtgacagaagtgataagt
gctagcggattggttgagagacagatttatgataaatatcaaaagcaagtaggaagcatc
agtggatatggtgagcttaaagagcttagtacttatactaaatcctcaagtatcggtaaa
ataacagagctaaagagtagtgttataattcagcctgaaaatggtttttatgaggatttt
gcttctgactcatttgacgagcgttggaaaatagatagtgctgatgcttggcaaatttct
cctggaaggttgcaacatttaactagtggtacacataccttgcagttaaattcaagtgat
atagatcgtgcttcatatggaatgaggttttatttctcactacagtcagatggtagtgtg
atcaattttaataataatctaaaagtaatccgcacaggaagtaaagcggaaattgcattc
tcggggagaggtcaatctataccacttgatggtgaactactaatagttgctgagggtaag
cggatattcgtatgggtagatggaggtctatattttgatggttttttgaatgcttctctg
ttcaatttagaaattagcggtaaagcaagaataagtgatgtgattgtctttagtaagcca
agcgttgaggtaacttattttaatgaactgaatgaaaaggtacaggaaattgtattagaa
agtgaaaatgctgcaatagtgaaggaatatctgtatgatgagcttggtagagaagctatt
attacacaaccagtgtgtatagagagaactaatgttttagcttactattctgattttgtt
acgaatggtaatccttataaagcaaattcggtgtggaaaactggcaaattggagggtgat
gctgcaagaattgtaggagaatatggttacagtcaggttaaatattgcgataatccactg
aatgaggagtgtgtagtaggtttacctggcaaagagttttctatttcaggtccttatgcc
aaacgtttttcttcttcattagataatttgtttatcagcaatctctttcctgccagcaaa
aattatagttaccgtgtagagcataaacctggaaacgtgaaagatgtttctgtttttgac
agcaaggataacagagtagcttggtatatctccactccaaaaagtaaaagtttattaagc
acttatgaatatggtgagaatggcaagctagtaaagagtttaccgcctatttatcatgag
aaggtgggtactttttacaaaatgaattcacagcttaattctacgtctagagaggaaaag
actttgcaagattctttaggcgtaaatataagttatgaccaaaggggaaaaatcattaat
aaaacaacgccagattcagggaaagtagagaatttatacgataaggatggattgctaaga
tttgttttacactattctaataatgagaagattgataatactgtatattttgattatgac
gaactaggaagactgcgaagtacgggtgaagtaatttcttcaacgcctaaggaagagctg
ctgagtttagagctttctggtaataatacaagagcatatcaggaattttactatagcgat
gctgaacatcaacctgttctgcgtggaaagatagcaagagctattacgtttaatagtgga
gaacctcttattgaagaatcagtattaaatatagataaagaaactataagcaaacgtatc
gttattccaactaaagatagtgaaaagcctgtattgattgcagtaaataagagatatgga
gcagggaaattaagggaggtagaatatccaattgatattcaggatagacctttgaggatt
aactatcagtatgacaagcttggtaggattgaaggtattggtgtaaggggaaaagaagac
ctgtttgcaagttttacctataatgcttatgggcagatcagtagtgaggtgcacttacca
gatttagaaaagaactttacgcgtcaatatagttataattctgcaggctttttaattgaa
ctaaaagataaatttttaacggagaaggtttattataccaatggaagttatggtggttat
ggatatggtgatgggactattacacgcactgaatttcaagcagactggcatgaaaattgt
gatgatagtaaacttggattgaatgagaagtcctttgtaagtgaatatgtcacttctgaa
aaatcagcactttgttttcgcgagctaaagaaaggaggttatctgaatgacaatgggcat
caagcaaaagtttcttctaccatgaggggcgagctcccaattatttgcaggtatggttcg
actggtcgtcacattcaaaacaccttgggaagagaaggatttcctagagaatatggacat
agctatgattatggtaattatcaagagttaactaaggccaagtattttgtaggtaaggaa
gtgcctatgccgctgcagcgtgatagttttgctagagaaattcctagaatgaatgaaacg
gcctcacgtgatatttgggagagattgaaagagtcttgttatctagttgaagacaatgaa
aaggttgatgtatctttaggtcatggtaaaaggggaaaatcttttattaaaggcacactg
cttgatgatcttaaaagtgttaatgctgattatgaacggtataaattacctttagaagag
gtattgattgagtattttgctcaaaagcgggatttatcatcattgaaggtaagtttgcga
gatgcatttgtaaggtggggtagtattgaggaagcaaatgcaaataagattgtgaaaatg
ttagaagagaagggatacttaaagaatccttttgcaaaagaatttaatgaggtactggag
cggtatcagccatatgtttacgaaatagttagtgtgttgtcggaacattttgctaatcct
cttggtgaagcggagtttgatgttgagtcttatagtatagatgcaaacggtaatcatggg
catttttacactggatttgatcgttatgagattgactatcgtaataataccaaccaagtt
agcaatgtgaagtttcaatcttttgctttatctaaaatggaacaaaattttttagtgaaa
catgatagtcgaggaaatgtaattcaggctcttcacaaaggcattgagcagattgattat
catccagtatcaaatcgtgctactaaaataaaattaatagacagtagagcattagaattt
tactatgatgcacgtggtgaacgtgtactaaagagagtatatgacaaagcaggggaaaca
ataaaagaaatacactatataagagatgagtttggtcgagcattagtagaaagggaagtt
acttatattgctggaggtttgagaccagacgtatcagtaacagcatacatttatggtcct
agagggttgtttgggtttattaggaataatgagttttatagtgtaataactgaccatgaa
ggctcaataaggttagtggtaaagggtgatgaagttgtagcagcgtatgattacctacca
tatgataatttaatgcgtaagtacgaaagtgatcctgaaggtcaaatttcatatcgttat
acaggtcaagaatgggatgaagaaataggtttatataactaccatgcaagattttatgat
ccaaatattggaaggttttatcagattgatccgaaggagcagtactttagtccatacaaa
tatgctggtaactcaccggtatcaatggttgatccagatggagagcttgcctttttggtt
cttctaccatttataatagctggggctatggcaggaggttatttaggtggagctgcagca
aataatagatgggatcctacagtatgggattttaaaagtaaagagacttggcttggttta
tggatcacctga
DBGET
integrated database retrieval system