Wolbachia endosymbiont of Wiebesia pumilae: HUB92_02210
Help
Entry
HUB92_02210 CDS
T07687
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'
KO
K13797
DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
wew
Wolbachia endosymbiont of Wiebesia pumilae
Pathway
wew03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wew00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
HUB92_02210
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
wew03021
]
HUB92_02210
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
wew03400
]
HUB92_02210
Enzymes [BR:
wew01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
HUB92_02210
Transcription machinery [BR:
wew03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
HUB92_02210
DNA repair and recombination proteins [BR:
wew03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
HUB92_02210
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb2_1
Biotin_lipoyl_2
RPOC_hybrid
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTP61755
LinkDB
All DBs
Position
421963..430476
Genome browser
AA seq
2837 aa
AA seq
DB search
MVDSSYMYASGAFVPRVSYSRSIDLKDSLLDLVKVQKESYDSFTPKNKGNERLEVIFHTI
FPINDPLRRATIEFISCRVDDPKYDESECIKRGVTFSAQVIASIRLVVMQDGISLDEYKS
IKESGDHSKLATVVKSIEEQKVHFCGLPMMTDKGTFIINGVEKVIVSQMHRSPGVFFDSD
KGKTYNSGKLIYSARIIPYRGSWLDIEFDVKDHLYFRVDRKRKLPISVLLKALGLSNNDI
LDRFYEKIKYVKHKDGWKVPFVPDKFKGVRLPFDLMDIEGNVLLKANVRITSRLAKKLYD
NELKEYLVPFNSICGLFLAEDLMDSASSTKILSAGESIKLEDIKKLELLSVDEISVLNID
NLFVGPYILNTLFLDENMSYQDALYEIYRVLRPGEVPVLEIVEEFFRNLFFSPEYYDLSN
IGRLKLNSYLGLNYDEDLTVLTHEDIIEIVKKIVLLRDGQGSVDDIDHLGNRRVRSVGEF
IENQFRTGLLKLERAIVDSMSTSSLDKVSPSDFINPKVLTNVLRDFFNSSQLSQFMDQTN
PLSEITHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLINSLAIYA
RINKYGFIESPYRKVVNRVVTDQIEYLSAIDEGSHHIADTSVKLDENNCFVDDMLYCRYA
GSFVMVSSDQVSYIDVSPKQVISVAASLIPFLENDDANRALMGSNMQRQAVPLLKPTAPL
VATGMESFVASGSGAVVLAKRDGIVDSSDSNSIVIRAFDKERVNYLDVDIYHLRKFQRSN
HNTCINQRPLVCVGDYVKKGDVIADGPAINSGELALGKNLLVAFMSWQGYNFEDSIIISS
EVVKKDLFTSIHIEEFDCVVHDTPLGSEKITRAIPGVNEENLYHLDDSGIVKIGTRVGPG
YILVGKVTPKPSLSLPPETKLLMTIFGEKSFDCADSSLYTSPDVEGTVIDVQVFTRRGVE
ENERALLIKQKEINDFEEERDYIINVTSEYFYDELKKLLINSGSQDREKFDSIEREQWWG
IGLKNQSISEQVKSLKKDFDEKVSHAIAQFKRKVEKLHEGYDLPQGVSMSVKVFIAVKHS
LQPGDKMAGRHGNKGVISRVVPVEDMPYLEDGTPVDIILNPLGVPSRMNVGQILETHVGW
ACRKLGEKVSNILDEINKIKSAFCKGIRSLNDDNFTQFAVAYLDNKKIENIDDDEITASV
LNTPNKNALNDELNELVENYLNSCKSSYSNLRNFLIEVYSYGSNVSICNDIRNISDNNLI
EFARKLRDGVPVAAPVFEGPKDEQIAKLFELAGLDNSGQAVLYDGCSGEKFDRKVTVGYM
YMLKLHHLVDGKIHARSVGPYSLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEM
LTVKSDDINGRVKIYESIIKGDSNFECGIPESFNVMIKELRSLCLNVDLKQNDVVIEDIS
HTNIAQPFNEVSISIASPESIKRISCGEIEDVSTANYRTFKVEKGGLFCPKVFGPVNDDE
CLCGKYKKRRHRGRICEKCGVEVTSSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGALLD
MSLRDIENILYSDNYIVIDPLVSPFEKGEIISEKAYNEAKDSYGIDSFVAMQGVEAIREL
LTRLDLHEIRKDLRLELESVASEIRRKKIIKRLRIVENFIKSGNRPEWMILTTIPILPPD
LRPLVSLESGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLRKLLSLNPPEIMIRNEKRMLQEAVDSLFD
NSRRNTLVNKAGAVGYKKSISDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLNQCG
LPKRMALELFKPFVYSKLKMYGMAPTIKFASKLIRAEKPEVWDMLEEVIKEHPVLLNRAP
TLHRLGIQAFEPILIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDGDQMAVHVPISLEAQLEARVLMMST
NNVLSPSNGRPIIVPSKDIVLGIYYLTLQEPKEDNLPSFGAFCEVEHSLSDGTLHIHSSI
KYRMEYINSSGETHYKTVCTTPGRLILWQIFPKHENLGFDLINQILTVKEITGIVDLVYR
NCGQSATVAFSDKLMVLGFEYATFSGVSFGRCDMVIPETKATHVDHARGEIKKFSMQYQD
GLITRSERYNKVIDEWSKCTDMIANDMLKAISIYDGNSKYNSVYMMVNSGARGSTSQMKQ
LAGMRGLMTKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLADTALKTANSGYLTRR
LVDVSQNCIVTKHDCKTKNGLVVRATVEGSTIVASLESVVLGRTAANDIYNPVTKELLVK
AGELIDEDKVKQISIAGLDVVKIRSPLTCEISPGVCSLCYGRDLATGKIVSIGEAVGVIA
AQSVGEPGTQLTMRTFHIGGVMTRGVESSNIIASINAKIKLNNSNIIIDRNGNKIVISRS
CEVVLIDSLGSEKLKHSVPYGAKLCVDESGSVKIGDKVAEWDPYTLPIITEKTGTVSYQE
LKDGISITEVMDESTGISSKVVKDWKLHSGGANLRPRIVLLDDNGKVMTLASGVEACYFI
PIGAVLNVQDGQKVHAGDVITRTPRESVKTRDITGGLPRVIELFEARRPKEHAIVSEIDG
YVAFSEKDRRGKRSILIKPVDEQISPVEYLVSRSKHVIVNEGDFVRKGDLLMDGDPDLHD
ILRVLGLEALAHYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHLEVILKQMLQKVEITDPGDTMYLVGES
IDKLEVDRKNDAMSNSGKRPTHYLPILQGITRASLETSSFISAASFQETTKVLTEAAFCG
KSDPLSGLKENVIVGRLIPAGTGLIMNKIRALSLCDNVDKYEKYFDIETYDEEWLMDNGC
HLHSGEEESVVAYDQSN
NT seq
8514 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgattcttcttatatgtacgcttctggtgcttttgttcctagagtttcttattct
aggtcgattgatttaaaagattctttattggatttggttaaggttcaaaaagaatcatat
gattcttttactcctaagaataagggtaatgaaagacttgaagttatctttcatacaatc
tttccaataaatgatcctttgcgtagggctactattgagtttataagttgtagggtagat
gatcctaagtatgatgaatctgagtgtataaagcgtggtgtaactttttctgctcaggtt
attgcttctatacgtcttgttgttatgcaggatggtatttctcttgatgaatataaatcg
attaaagagagtggagatcattctaaacttgcaaccgttgtaaaatctatagaagagcag
aaagtccacttttgtgggttgcctatgatgactgataagggcactttcatcattaatggt
gtggaaaaagttatcgtctcacaaatgcataggtctcctggtgtattttttgatagcgat
aagggaaaaacttacaattctggtaaattgatctattctgctagaattattccttatagg
ggttcttggcttgatattgaatttgatgttaaagaccatttgtattttcgtgttgataga
aaaagaaaattgccaatttcagttttattaaaggcgttgggtctatcaaataatgatata
ctcgatagattttatgagaaaataaagtatgtaaaacataaagatggttggaaagtgcct
tttgttcctgataaatttaaaggagtgaggctgcctttcgacttaatggatattgaaggt
aatgtgctgcttaaagctaacgttcgtattacctcaagactagctaaaaagctatatgat
aatgaattgaaagagtatctggttccgtttaattctatatgtggtttattcctcgcagaa
gatttaatggatagtgctagctctacgaaaattttatctgctggtgaatctataaagctg
gaagacataaagaagcttgagttattatctgtagatgaaatatcagtgttgaacatagat
aatttgtttgttggaccttatatattaaatacgcttttcttagatgaaaacatgtcttat
caggatgcactatatgaaatatatagagttttgcgtcctggtgaagttcctgttttagag
atagtagaagagtttttccgtaatcttttcttcagtccggaatattatgatttgtctaac
attggtaggttgaagcttaactcttaccttggattaaattatgatgaggatttaactgtt
ttaacgcatgaagatattattgaaattgtgaaaaaaatagtattgttacgtgacggtcaa
ggatctgtagatgatattgatcatttaggaaacagaagagtaagatcagttggagagttt
atagaaaatcaatttagaactgggttgttgaaattggaacgcgcaatagttgattctatg
tccacttctagtttagataaagtttctccatctgattttattaatccaaaagtgttaact
aatgtcttaagagatttcttcaattcttctcaattatctcaatttatggatcagactaat
ccgttatctgaaataacacataaaagaaggttatccgcgttaggtcctggcggtttaaca
agagaacgggcaggatttgaggtgcgtgatgttcatccaactcattatggaagaatttgc
cctattgagactcctgaagggcaaaatatagggttaatcaacagcttagctatatacgcg
cgtattaataaatatggtttcattgaaagcccttatagaaaagtagtcaatagggttgtt
actgatcaaattgagtatctttctgctatagacgaaggctcacatcatatagctgacact
agcgtaaagcttgatgaaaataattgctttgttgatgacatgctatactgtagatatgct
ggtagcttcgtcatggtaagtagcgaccaagttagttacattgacgtatctcctaagcag
gtaatatcagttgcagcttccttgattccatttttagaaaatgatgatgctaatagagca
ttaatgggctcaaatatgcaacgtcaggccgtacctttattgaagcctaccgctcctctg
gttgctactggtatggagtcttttgtagcttctggctctggtgctgtagttttagcaaaa
cgcgatggcatagttgatagttctgatagtaactctatagttatacgtgcttttgataaa
gaaagggttaactacttggacgtagatatttatcatctaaggaaatttcagcgttctaac
cataatacttgtattaatcaaagaccgctagtgtgcgtaggtgattatgttaaaaagggt
gatgtaatagctgatggtcctgcaattaacagtggtgagttggcgcttggtaaaaatttg
ctagtcgcttttatgtcttggcaaggttataattttgaagactctattattatttctagt
gaagttgttaaaaaagatctctttacttctattcatatagaagaatttgactgtgttgta
catgatacccctttaggatcagaaaaaataactcgtgctatacctggtgttaatgaagaa
aatctatatcacttggatgatagtggtatagtgaaaattggtacaagagttggtccaggc
tatattctggtaggtaaagttacacctaaaccttctctttcattgcctcctgaaacgaag
ttattaatgacaatttttggtgaaaagtcattcgattgtgcggattcctctttatataca
tctccagatgttgaagggacagtaattgatgtacaagtctttacacgcaggggggttgaa
gaaaatgaaagggcattactcatcaaacaaaaagagataaatgactttgaggaagagcga
gattatataatcaatgttactagtgaatatttctatgatgaactgaagaaacttcttatt
aattctggttctcaagatcgagaaaaatttgactctattgaacgtgagcaatggtggggt
ataggattaaaaaaccaatccatttctgagcaagttaagagcttaaaaaaagattttgat
gaaaaagtatcacatgcaatagcacagtttaagcgaaaagtagaaaaattacatgaaggt
tatgacctgcctcaaggtgtgtcgatgtcagtaaaagttttcattgctgtgaaacatagt
ctgcaaccaggggataaaatggctggtagacatggaaataaaggtgtgatttctcgagtt
gtgccagtggaagatatgccttatttggaagatggtactcctgttgatattattcttaac
cctcttggtgttccttcacgaatgaatgtagggcaaatactggaaacgcatgtaggttgg
gcttgtagaaaattaggggaaaaggtaagtaatattctcgatgagatcaataagatcaaa
agtgctttttgcaagggaattaggtcccttaacgatgataattttacacaatttgcagta
gcataccttgataataaaaaaattgaaaatattgatgatgatgaaataacggcttctgtt
ttaaatacacctaataagaatgcactaaatgacgagttgaatgagttagtagagaactat
ttgaactcttgtaaaagttcatacagcaatttacgtaacttcctgattgaggtttatagc
tatggcagtaacgtatctatctgtaatgatattcgtaatattagtgataataatctcatt
gaatttgcacgcaaattacgtgatggcgttcctgttgctgcacctgtatttgagggtcca
aaagatgaacaaatagcaaaattatttgaacttgctggtttagataactctggacaagct
gtattatatgacggttgcagtggtgaaaaattcgaccgcaaggttacagttggttacatg
tacatgcttaagttgcaccacttggttgatggtaaaattcatgcgcgttcagtagggcct
tatagtttggttactcaacaacctcttggaggaaaatctcattttggtggtcagcgtttt
ggtgaaatggaatgttgggcattacaagcctatggtgctgcttatactttgcaggaaatg
ttaactgtgaagtctgatgatattaatggtagagttaagatttatgaatcgataataaaa
ggtgacagtaattttgaatgtggaattcctgaatcctttaatgtgatgataaaagaacta
cgttctttatgtttaaatgtagatttaaagcaaaatgatgtagtgattgaagatatatct
cacactaacattgcacaaccttttaatgaggttagcatatcgattgctagccctgaaagt
attaagcgtatatcttgtggtgagatagaagatgtttcaactgcaaattatcgtacgttc
aaagttgagaaaggtggattattttgccctaaggtttttggccctgtcaatgacgatgaa
tgtttatgtggaaaatacaaaaaaagaagacacagaggtcgcatatgcgaaaaatgcgga
gtagaagttacatcttctaaagtaagaagagaaaggatgggtcatatagagcttgcatct
cctgttgctcatatatggtttttgaaatcgcttccttcaagaattggagcattattggat
atgtctctcagagatattgagaatattttatatagcgataattatatcgtaatagatcct
cttgtttcgccttttgaaaaaggtgagattattagtgaaaaagcttataatgaagctaaa
gatagctatgggatcgatagttttgtagctatgcaaggtgttgaagctataagagagttg
ctaacgcgccttgatttacatgaaattaggaaggatttaagactagaattagaatctgtt
gcttctgagataagaagaaagaaaattataaagagattgcgtattgttgaaaacttcatt
aaatctggaaataggcctgagtggatgatacttacaactatacctattttaccacctgat
ttgcgtcctttggtatcgcttgagagtggtcgtcctgcagtttctgatctgaatcatcat
tataggactattattaatagaaataacaggttgaggaaattgttgagcttaaatcctcct
gagattatgattcgtaatgaaaaaaggatgttacaagaagcagttgattctctttttgat
aatagtcgtcgtaatactttggtaaataaagctggtgctgttggatataaaaagtccatt
agtgatatgttaaaaggaaaacagggtcgttttcgccagaacctcttaggaaaaagggta
gactactctggacgttctgtaatagttgttggtccaactttgaaactaaatcagtgtgga
ttaccaaaaagaatggctcttgaactattcaaaccttttgtttactcaaagcttaagatg
tatggtatggctccaactattaagtttgctagtaagttgataagagcagaaaaaccagaa
gtttgggatatgcttgaagaggtaataaaagagcatcctgttttgttgaatagagcgcct
acgctacatagacttggtattcaggcttttgagccaatccttattgaaggcaaagcaata
cagcttcatccgcttgtctgtacggcgtttaatgctgattttgatggtgatcaaatggca
gtgcatgtgccaatttcattggaagctcagcttgaagctagggtgttgatgatgtccact
aataacgttttaagtccttctaatggcagaccgattatagttcctagtaaagatatagta
cttggtatatattatctgactttacaagaacctaaggaagataatttaccatcttttggt
gctttttgtgaagttgagcattccttgagtgatggtactttacatattcattctagtata
aagtataggatggagtatattaatagcagcggtgaaactcactataaaactgtttgtaca
actcctggccgtttaatattatggcaaatttttcctaagcatgagaatctaggcttcgat
ctaataaatcagatattaacagtcaaggaaataactggtatagttgatttggtatatcgt
aactgtggtcaaagtgctacagtggcattttctgataaattaatggtacttggctttgag
tatgccacattttctggtgtctcttttggtcgttgtgatatggttatacctgaaactaaa
gctacacatgttgatcacgcgaggggtgaaattaagaaattctctatgcaatatcaagat
gggctaataactagaagtgagaggtataacaaggttatagatgaatggtctaagtgtacg
gatatgatagctaatgatatgttaaaagcaatatctatatatgatggaaatagtaagtac
aactcagtgtatatgatggttaactctggtgcaaggggttctacttcacagatgaaacag
ctagcaggaatgcgagggctcatgaccaaaccttctggtgagattatagaaacacctata
atttctaatttccgtgaaggattgaacgtatttgaatactttaattctactcacggtgcg
cgtaaaggtttagctgacactgcacttaaaactgcaaactctggatacttaactcgtcgt
ttagttgatgtatctcaaaattgcatagttacaaagcatgactgtaaaacaaaaaatggt
cttgttgtgagagctacagttgaaggaagtactatagttgcatctctagagagtgttgtg
ctgggtagaacagctgcaaatgatatatataacccagtgacaaaagaattattagtaaaa
gcaggggaattaattgatgaggataaagtaaagcaaatcagcattgcaggtcttgatgtt
gtaaaaattagatcgcctttaacttgtgaaataagtcctggtgtatgttctttatgttat
ggaagagaccttgcaactggtaaaattgtttcaataggtgaagcagttggtgttatagct
gctcaatctgttggagagccaggtactcagttaacgatgcgtacttttcatataggtgga
gtaatgactagaggcgttgaatcctcgaatattatagcttctattaatgctaaaataaag
ttaaacaatagtaatataattatagatagaaacggaaataaaattgtgataagccgttcc
tgtgaagtcgtgttgattgatagccttggtagtgagaagttgaagcacagtgtaccttac
ggcgctaagctttgtgtagatgagagtgggtcagtaaaaattggcgataaagttgcggaa
tgggatccttatacattgcctattatcacggagaagactggtacagtgtcttatcaggaa
ttaaaagatggaatttcgatcactgaagtgatggatgaatctacaggaatatcaagcaaa
gtagtaaaagactggaaattgcattctggtggagctaatttacgtcctcgtattgtgctg
cttgacgataatggtaaagtaatgacactcgcaagtggcgttgaagcatgttattttata
ccaatcggtgcagtgctcaatgtacaagatggccagaaggttcatgcaggtgatgttatt
acaagaacaccaagagagtcagttaaaactcgtgatattactggtggtttaccgagggtt
atagagttatttgaagcacgtcgtcctaaagagcatgctattgttagtgagatagatggc
tatgtagcgttttctgaaaaagaccgtagaggaaaacgcagtatattaattaaacctgta
gatgaacaaatttctccagttgaatatttggtatcaagaagtaagcatgtaatagtcaat
gaaggtgattttgtacgtaaaggtgatctattgatggatggtgaccctgatctccatgat
attttacgtgtgcttgggttagaagctttagcgcactatatgatttctgaaatacagcaa
gtttatagattgcagggtgttcgtatagacaataagcatttagaggtgatcttaaaacaa
atgctacaaaaagtggaaattactgatcctggtgatactatgtacttggttggcgaaagc
attgacaagctggaagttgataggaaaaatgatgctatgagtaactctggcaaacggcct
actcattatcttcctattctgcaggggattactagggcaagtcttgaaactagctccttt
atttctgctgcctctttccaagagacaacaaaagtacttacagaagcagcattctgcggg
aagagtgatcctttaagtggattaaaagaaaatgttatagtaggaagattaattcctgct
ggtacaggtttgattatgaataagatcagagcactttcactttgtgataatgtggataaa
tatgaaaaatattttgatattgaaacttatgacgaggaatggttgatggataatggttgt
catttacactctggtgaggaagagagcgtagtggcatacgatcagtcgaattga
DBGET
integrated database retrieval system