Weissella hellenica: EFA59_00185
Help
Entry
EFA59_00185 CDS
T06311
Name
(GenBank) DUF1542 domain-containing protein
Organism
whe
Weissella hellenica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1542
KxYKxGKxW_sig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDJ58040
LinkDB
All DBs
Position
44537..49126
Genome browser
AA seq
1529 aa
AA seq
DB search
MSPSIWGKEDNMKRVVKVQLDIRSHYKSYKIGKIWVTALAGITIGTMGFLGTANADQVTP
AQQSSNIQVNDNNIDRSYKLANTTEVTSQASDAVSTNSSSDEQMSPAMNSEAISSAVNSE
VTVVDNKNDKMDAVNEQSQATSETGEAQTSSSAAGMVDTETTTEKSQVETEQTPVATDET
VATTKTEQEPASQAMTETTISDNENVSVNKKEGAVPKTKDATEQVKQPAVAKVSVNASVP
VVQPKADDELPEGAVVVNTAEEFVNAIATGTSSDIYISSDIDLAGYKNGLLNLPTISVTS
HRDMTVQSTSDKRYKIDFNKFTFDMSSILIPTNRIYLKNLDLLGTNTSGIFSKADSYAIE
DVTYQGGTFISTNNSVDVLGTVTVNTTANGSPAISANEINFKAGSNFTGTTTNGDVLYTN
VDITNITNDHNGIFLENQSTVTLNPHGEGKYGIDASAADVIVNDGAELHINLDSINNAKT
SGAIHLHVLIESKINVEKNALLDIQSNGVPSVSAINISPDNLLNFSGKGQINVDSEGTFN
YVGQNMGDFVGSVFYITGGSTFNVNPNATFTAKIDGTGAVKLIDLGSAVSKGYFNIVQPK
HFLIDRTANTNDKTSFMTNGTLNFSKIKVMDDQGNYSDSLDKMNLNFSQFLGFYASNASD
VVGKTEAVETQINNQFQNNTKGILDVIRSGEDVFQENVALDKNNQLTANISNIMADSDAS
VQIQIKHADGSIDTLPAINIIASPYWRDTDKYGQLTDENGKFSFDLSNANLQNDDTIIIK
TTREFVTDNQEYSVDQLRLAQVQSDNKNTLIAYGEAQKQVITDLENISDEQRLAAQTAID
SEVAAGIDNIDKATTTVEADTAFNTGTNNIDDIVTDAVLVDSKLAAQIAIDNAAQSVKKN
LANNTNLTVDERSAISAKIDNVAMTAKNNIDSAATLAEVAAAQAAGEVAIGNVDQTGVTK
PTASAAIDSAAEAAKAAVAGNAELTAEEKATATAAIDAAAQTAKEAIANAITDAEVAAAQ
AAGEAAISNVDQTEVTKPTASAAIDSAAEAAKAAVAVNANLTEEEKATATAAIDAAAQTA
KEAIANTTTDAEVAAAQAAGETVIGNVDQTGVTKPTASAAIDSAAEAAKAAVAGNPGLTE
EEKATATAAIDAAAQTAKEAITNVTTDAEVAAAQAAGEAAISNVDQTEVTKPTASAAIDN
AVEAAKAAVAGNAGLTAEEKATATAAIDAAAQTAKEAITNATTDAEVAAAQAAGETAIGN
VDQTGVTKPTASAAIDSAAEAAKAAVAGNAELTAEEKATATAAIDAAAQTAKEAIANAIT
DAEVAAAQAAGEAAISNVDQTEVTKPTASAAIDSAAEAAKAAVAGNAGLTEEEKATATAA
IDAAAQTAKEAIANATTDAEVAAAQAAGEAAISNVDQTEVTKPTASAAIDSAAEAAKAAV
AVNANLTEEEKATATAAIDAAAQTAKEAITSATTDAEVAAAQAAGEAAISNVDQTGVTKP
TASAAIDSAAEAGNAGLTAEEKSNGNCSD
NT seq
4590 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgccttccatatggggaaaagaggataatatgaagcgtgtcgtaaaagtgcaatta
gatattcgttcgcattacaagtcatataaaattggtaaaatctgggttactgccttagca
ggaataacaatcgggacaatgggatttttggggactgctaatgctgaccaagtaacacca
gcacaacaaagttcaaacatacaagttaatgataataatattgatagatcttataagtta
gcaaatacaactgaagtgacaagtcaagcaagtgacgcagtatcaactaattcatcatca
gatgaacaaatgtcgcctgcaatgaatagtgaagctatcagttcggcagtaaatagcgaa
gtgacagtagttgataataaaaatgacaaaatggatgctgtaaatgagcaatcacaagct
acttctgagacaggcgaagcgcaaacgtcatcatcagcagcaggcatggtggatacagaa
acgacaacagaaaaatcgcaagtggaaacggaacaaacacctgtagcgacggatgaaaca
gtagctacaacaaagactgaacaagagccagctagtcaggctatgactgaaacaactatt
tctgacaacgaaaatgtaagcgttaacaagaaagaaggcgcagtgccaaagacaaaagat
gctactgaacaagtgaagcaacccgcagttgctaaagttagtgttaatgcctctgtgccg
gttgtgcaaccaaaagcggatgatgaattaccagagggtgcagtagtcgttaatacggca
gaagagtttgttaatgctattgcaaccggtacatcatcagatatttatattagttcagat
attgatttagcgggttataaaaatggtttattgaatttaccaacaataagcgtgacaagc
catcgtgatatgacagttcaatctaccagtgataaacgatataaaattgattttaataaa
ttcacatttgatatgtcgtcaattttaattccgacgaatcgtatttatttaaagaattta
gatctattaggaactaatacaagtggtattttcagtaaagccgatagttatgcaatcgaa
gatgttacttatcagggtggtacatttatttcaactaataatagtgttgatgttttaggg
actgtcactgttaatacaacggctaatggttcgcctgctatctcagcaaatgagattaat
ttcaaagcgggtagcaattttacaggaactactactaatggggatgtattgtatacaaat
gttgatattacaaatattaccaatgaccacaatggaatctttctagaaaatcaatcaacg
gttaccttaaatcctcacggggagggtaagtatggtattgatgcatcagcagctgatgtc
atcgttaatgatggtgcagaattacacattaatttagatagcattaataatgcgaagaca
tcaggtgctattcacctacatgtgttaattgaatcaaaaataaatgttgaaaagaatgca
ttattggatattcaatctaatggtgttccatctgtatcggcaattaatattagtccggat
aatttgttgaattttagtgggaaaggccaaataaatgttgatagtgagggaacattcaat
tatgttggtcaaaacatgggagactttgtaggtagtgtattttacattactggtggatca
acttttaatgttaatccgaatgccacttttactgctaaaattgatggaacaggtgccgtt
aagctaattgatttaggaagtgcagttagtaaaggatactttaatattgtgcaacctaag
catttcttaattgatcgaacggctaatactaatgacaaaacgtcatttatgactaacggt
actttgaatttttcaaaaattaaagtaatggatgatcaaggtaattattcggattctctt
gataaaatgaatttgaatttctcacaatttttaggattctatgcatcaaatgcatcagat
gtagttggtaaaactgaagcagttgaaacacaaattaacaatcaattccagaataatact
aaaggtattttggatgttattcgttctggtgaagatgtttttcaggaaaatgttgcatta
gataaaaataatcaattgacagctaatatttcaaatattatggctgatagtgatgcatcc
gttcaaattcaaattaaacatgctgatggctcaattgatacattgccagctattaatata
attgccagcccttattggcgtgatacagataagtatggtcaattaacagatgaaaatggt
aaattcagttttgatttgagcaatgccaatttacaaaatgatgacaccattattattaag
acaacccgtgagtttgtcacagataatcaagaatattctgttgatcaattacgtttagca
caggttcaatcagataataaaaatacgttgattgcttatggtgaagcgcaaaaacaagtt
attacagatttagaaaatatatcagatgagcaacgtttggcagcgcaaacagccatcgat
tcagaagttgcagcaggcatagataatattgataaggcgacaacaacagttgaagctgat
acagcatttaatactggaacgaataatattgatgatattgttaccgatgctgtgttggta
gatagtaaattagcagctcaaatagcaattgataatgcagcgcaatctgtaaaaaaaaac
cttgcaaataatactaatttaactgttgatgaacgtagtgcaatttcggctaagattgat
aatgttgcgatgactgcaaagaataatattgatagtgcagcaacacttgctgaagtagca
gctgcacaagcagctggcgaagtggcaattggcaacgttgatcaaacaggggtaacaaag
ccaacggcttcagcggcaattgacagtgcagccgaagcagcaaaggcagcagtagcagga
aatgctgaactaacagccgaagaaaaagcaacggcaactgcagcaattgatgcagccgca
caaacagcaaaagaagccatagctaatgcgataacagacgctgaagtagcagctgcacaa
gcagccggcgaagcggcaattagcaatgttgatcaaacagaggtaacaaagccaacggct
tcagcggcaattgacagcgcagccgaagcagcgaaggcagcagtagcagtcaacgcaaac
ttgacggaagaagaaaaagcaacggcaactgcagcgattgatgcagctgcacaaacagca
aaagaagccatagctaatacgacaacagacgctgaagtagcagctgcacaagcagccggc
gagacggtaattggtaatgttgatcaaacaggggtaacaaagccaacggcttcagcggca
attgacagcgcagccgaagcagcgaaggcagcagtagcggggaatcccggattaacggaa
gaagaaaaagcaacggcaactgcagcaattgatgcagccgcacaaacggcaaaagaagcc
ataacgaatgtgacaacggacgctgaagtagcagctgcacaagcagccggcgaagcggca
attagcaatgttgatcaaacagaggtaacaaagccgacggcttcagcggcaattgacaat
gcagtcgaagcagcgaaggcagcagtagcaggaaatgccggattaacagccgaagaaaaa
gcaacggcaactgcagcaattgatgcagccgcacaaacggcaaaagaagccataacgaat
gcgacaacggacgctgaagtagcagctgcacaagcagccggcgagacagcaattggcaac
gttgatcaaacaggggtaacaaagccaacggcttcagcggcaattgacagtgcagccgaa
gcagcaaaggcagcagtagcaggaaatgctgaactaacagccgaagaaaaagcaacggca
actgcagcaattgatgcagccgcacaaacagcaaaagaagccatagctaatgcgataaca
gacgctgaagtagcagctgcacaagcagccggcgaagcggcaattagcaatgttgatcaa
acagaggtaacaaagccaacggcttcagcggcaattgacagtgcagccgaagcagcaaag
gcagcagtagcggggaatgccgggttaacggaagaagaaaaagcaacggcaactgcagca
attgatgcagctgcacaaacagcaaaagaagccatagctaatgcgacaacagacgctgaa
gtagcagctgcacaagcagccggcgaagcggcaattagcaatgttgatcaaacagaggta
acaaagccaacggcttcagcggcaattgacagcgcagccgaagcagcgaaggcagcagta
gcagtcaatgcaaacttgacggaagaagaaaaagcaacggcaactgcagcgattgatgca
gctgcacaaacagcaaaagaagccataactagtgcaacaacggacgctgaagtagcagct
gcacaagcagccggcgaagcggcaattagcaacgttgatcaaacaggggtgacaaagccg
acggcttcagcggcaattgacagtgcagccgaagcaggaaatgccggattaacagccgaa
gaaaaaagcaacggcaactgcagcgattga
DBGET
integrated database retrieval system
