Weissella hellenica: EFA59_01205
Help
Entry
EFA59_01205 CDS
T06311
Name
(GenBank) ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
whe
Weissella hellenica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
whe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
whe03400
]
EFA59_01205
Enzymes [BR:
whe01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
EFA59_01205
DNA repair and recombination proteins [BR:
whe03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
EFA59_01205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
Phage_lysozyme2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDJ58215
LinkDB
All DBs
Position
244483..248049
Genome browser
AA seq
1188 aa
AA seq
DB search
MALELLFGRASADHELALLERAQHILANDDQAEIFYLVPNHIKFETEIKVLNRLANLSGH
YGAAVSVPRVSVFSLSRLAWYYMQNDPLYQRATMSQNGLTMLVQTLLQKNKKSLELYGNL
LSKQGFIGQFTTQLLELKQSGVRWSEVNEMADQLTNQETLQMKLHDLATIGIDLDNELMQ
REQYLSSDLLLALRVYLATGKTDISHHYFLINDYSQMTSVEQSLVEALIMYSAGVILALP
ADDGAASLTQAAISENDLFYRPKKLGRQLRDFSIKHDIQVVTKTIEPQRKISSSMQAIES
FWIQYEQTGVTQTVYQADDVAVWQLHTRYQEVEQMARLIRQEVASGKRRYRDYLLMTRDL
GQYENIMPAVFERYNIPMFMDLDRPMAAHPLVAFLDKLLRLAPAYTITDVMSFLKTELFI
PADVSVADYREALTETENFVLAKNPGGWQWTNTNAWRYDRQAQVSDDKVTRERVASKDAQ
LSLIHDQISQVVAPFLKDLQHATNARDMAVKLYEFMTQIGIQKRLIDWRDTAIARGDLWA
AQQPEQVWRVFIDVLDDFATIFDQDTMTVVQMQEIFKAAFDNAKYAGIPATMDQVRISES
GIVQRTGYETVIVFGATNHNLPAVTRTKAILHDGDRDILQSILPEHVFLKETSEQQMAQE
SLLMYKAMMIADQRLIWTYATSDGDSGQQPSTYVTRIQKQFNLVVKQFDALPDPDSDDLT
PYVGTPISTIAQLVVVNRQAKLQQKDQIVLSSAWQNLTQQLQQIAPNKLRQLLGGLYYVN
EPELLQPALVTSLFGQELKVSISRLESYSRNPFEFFLQYGLKLQERQVLQLTPAEKGTLM
HALLEQVFQALIAQQKALGELTEQALQQLEQDMLQGLLKSDDPTYDIFNSSYRMGFLTKR
LADQVHETIMSMRRGQLDQGGVQTIGVEAGFGLPQSQLKPVMYEMPFGKVTVRGKIDRYD
LVTTAAGNFLTIIDYKSGARKFDYKKAYVGLELQLMTYWTAILINQQLLPASQMGGALFW
SLKNPWIEMKNVTGDTFTQMQDNAGQLMVEQGRYRGVLKNDEDYISRLESADEIVAPYAI
DRKKDGSFKAASDVVTDDDLDTLLLFNEFKIKEIAENILAGTFPLSPFKDGATSTGLMYS
PYTPVMMFDAMMGNKYNDISGALKDNEVLTAMKAFIAQYNQTSSQGEK
NT seq
3567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattagaattattgtttggtcgcgcaagtgctgatcatgagctagctttgttagag
cgggcacaacatattttagctaatgatgatcaagcagaaatattttatttggtgcctaat
cacattaaatttgaaacggaaattaaggttttaaatcgattggccaatttgtcgggacat
tatggtgcagctgtctcagtgccacgagtatccgtgttttccttgagccgtttagcatgg
tattacatgcaaaatgatccgttatatcaacgagcaacgatgtcacaaaatggcttaacc
atgttggtacaaacgttacttcaaaaaaataaaaagtctttagaactttatggtaatttg
ctatcaaagcaagggtttatcggtcaattcacgacccaattactagaattaaagcaatcg
ggtgtgcgttggtcagaagttaatgagatggctgatcaattaacgaatcaagaaacctta
cagatgaaattgcacgatttagcaacgattgggattgatttagataatgagttgatgcaa
cgtgaacaatatctaagtagcgacttgttgttagcgttacgcgtttatttagcaaccggt
aaaacagatatctcgcatcattactttttaattaacgattattcgcaaatgacatcagtg
gagcaaagtttagttgaagctttgattatgtatagtgcgggggttattttagcattacca
gctgatgatggtgcagcgagtttgacgcaagctgcaatcagtgaaaacgatttattttat
cgccctaaaaaattaggccgccaattacgtgatttctcaattaagcatgatattcaggtc
gtaacgaagacgattgaaccacaaagaaaaattagttcaagtatgcaggcaattgaatca
ttttggattcagtatgagcaaactggtgtcacgcaaacggtttatcaagctgatgatgtg
gccgtgtggcagttgcacacacgttatcaagaagttgaacaaatggcgcgactaattcgt
caagaagttgctagtggtaaacggcgttatcgggattatttgttgatgactcgtgattta
gggcaatatgaaaatattatgccagcagtttttgaacgctataatattcccatgttcatg
gatttagatcggccgatggcagctcacccattagtagcctttttagataaattattgcga
ttagcaccagcatacacaattactgatgttatgagttttttaaaaacagaattatttata
ccagcagatgtatcggtagcagattatcgcgaagcgctgacagaaactgaaaactttgtg
ctagctaaaaatcctggcgggtggcaatggacaaatacaaatgcctggcgctatgatcgg
caagcacaagttagtgatgataaagtaacgcgtgaacgagtagctagtaaagatgcgcaa
ttgtcgctgattcacgatcagattagccaagtagtagcgccatttttaaaagatttgcaa
catgcaacgaatgctcgtgatatggctgtaaagttgtatgaatttatgacgcaaattggt
attcaaaaacgtttgatagactggcgcgatacagcaattgcacgtggtgatttatgggca
gcccagcagcctgaacaagtttggcgggtctttattgatgttttagatgattttgccaca
atttttgatcaagacacgatgactgtcgtgcaaatgcaagaaatttttaaagcagctttt
gataatgccaagtatgcaggtattccagcaacgatggatcaagtgcggatttcagaaagt
ggtattgtacaacgaacgggatatgaaacagtcattgtgtttggggcaaccaatcataat
ttaccagctgttacccgtactaaagctattttgcacgatggtgatcgcgatatattacaa
tcaattttaccggaacatgtctttttaaaggaaacctccgagcaacaaatggcacaagaa
tcattattgatgtataaagcgatgatgatcgctgatcaacgtttgatttggacgtatgcg
actagtgatggtgatagtgggcaacaaccgtcaacgtatgtcacacggattcaaaaacaa
tttaatttagtagtaaagcaatttgatgctttaccagatcctgatagtgatgatttaaca
ccatatgttggtacgccaataagcacaattgcacaattagttgttgttaatcgacaagca
aaattacaacaaaaagatcaaatagtgctgagctcagcttggcagaacctgacgcaacaa
ctacaacaaattgcgccgaataagttaagacagttattgggcggtctttattatgttaat
gaacccgagctcttacaaccagcattagtgacatcattatttggtcaagaattaaaggta
tctatttcacgactagaaagttattcacgaaatccatttgaatttttcttgcagtatgga
ttaaaactacaagaacgccaagttttacaattaacaccagcagaaaaaggaacattaatg
catgcattgttagaacaagtattccaagcattaattgcacaacaaaaagccttaggtgaa
ctgaccgaacaggcgctacagcaattagaacaagacatgttacaaggccttttaaagagt
gatgatccaacctatgatatttttaatagttcatatcgtatgggctttttaacgaagcga
ttggctgatcaagttcatgaaacgattatgagtatgcgtcgggggcaactggatcaaggt
ggtgtacaaacaattggtgtagaagctggctttgggttaccacaaagtcaattaaaacct
gtaatgtatgaaatgccatttggtaaagtgaccgtccgaggcaaaattgatcggtatgat
ttggttaccacagcggctggtaattttttgacaattattgattacaaatcaggagctcgt
aaatttgattacaaaaaagcatatgttggtcttgaattgcagttaatgacatattggacc
gctattttgataaatcagcagttgttaccagcaagtcagatgggcggtgccttgttttgg
tcattgaaaaatccctggattgaaatgaaaaatgttacgggcgatacgttcacccaaatg
caagataacgcgggacaattaatggttgaacaaggtcgctatcgcggtgttttgaaaaat
gatgaggattatattagtcgtttagaaagtgctgatgaaattgtcgcaccctatgcgatt
gatcgtaaaaaggatggctcatttaaagcagctagtgacgtagtgactgatgatgatttg
gacacgctattgttatttaatgaatttaaaattaaagaaatcgctgaaaatatattggca
ggtacttttccattgtctccttttaaggatggtgctacgagtacaggattaatgtattca
ccatatacgccggtgatgatgtttgatgccatgatgggaaataaatataacgatattagt
ggtgcacttaaagacaatgaggttttgacggcaatgaaggcattcatcgcacagtacaat
cagacatcatcgcaaggagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
