Winogradskyella sp. J14-2: BWZ20_05550
Help
Entry
BWZ20_05550 CDS
T04714
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15836
formate hydrogenlyase transcriptional activator
Organism
wij
Winogradskyella sp. J14-2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wij00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
wij03000
]
BWZ20_05550
Transcription factors [BR:
wij03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
Other families
BWZ20_05550
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
AAA_lid_14
PAS_9
Sigma54_activ_2
PAS
PAS_4
GAF
PAS_8
PAS_3
AAA_5
AAA
GAF_3
HTH_8
AAA_2
PAS_10
Mg_chelatase
GAF_2
AAA_22
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APY07793
LinkDB
All DBs
Position
complement(1185366..1187738)
Genome browser
AA seq
790 aa
AA seq
DB search
MKDLQKNKPPKVKPQDLEEDYFLEIFKSSPAAKALSEFDSGAIVDVNESWENFTGYKRSE
VLGKTGVELNIINPSNLENLQEMLSESALIRSRKIEIYNKNGNKAYGLATFQLLENENTK
LVLTSIVDIGDLVKLTKELKVLTNFSNRLLESVYEAVFILDKDLKCIRINKAFKELTGYV
EKDVIGKKAPFPHWPLEEYDNIKQYFTAFLSGGSSRGQLTFKRVNGERLQVRISTTEILD
ENNKLLGYASTAVDISEQVKYQNSLIAKSKKATEKKNSILKLINLKDENIDEFLKEVTLI
SSNVLEVNRVSVWKFSDNQTKIECIKAYHSEQEEFLNNAVLKTENYPNYFDKLYEQKIVM
VVDVATNDAINEDYKKNYLNKFNIRSMLDAFIMGSEQPFGVICFEQMEQKRHWTPEEEQF
VTTVASVISLALEHNHRRKVQEELEHTNKKLKSSLAELNSLKNDLERQNVYLREEIDLVF
NYEDMVYGSALFSNVLTDVERVADTDATVFIYGETGTGKELIARAIHNNSDRKEKPLIKV
NCAAIPRELIESELFGHKKGSFTGAFSDKDGKFKLADGGTLFLDEIGELPLEMQPKLLRA
IQEFEIEPIGDSKVHKVDIRIISATNRNLKEDVKLKRFREDLYYRINVFPIHVPPLRERQ
EDIPILIEHFVNKFCKKYGKTIKFISQETRDALYNYDWPGNIRELENLIERAVILSNKNA
LVVPGFATSNKENPVDLSTLSLNEVQRLHIKQVLKKCNWKIEGSNGAAEALDIKPSTLRD
RMKKLGVAKS
NT seq
2373 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagatctacaaaaaaataagccacctaaagtaaaaccgcaagatttagaagaggac
tattttttagagatatttaagtctagtccagccgccaaggcattatctgagtttgatagt
ggtgccatagtagatgtcaatgaatcatgggagaactttacaggttacaaacgctcagaa
gttttaggtaagacaggtgtagaattaaatattattaacccctctaatttagagaactta
caagagatgctcagtgagtctgctttaataagatctcgcaaaatagaaatttataataaa
aatggaaataaagcatacgggcttgctacatttcaattattagaaaatgaaaataccaaa
ctagtacttacatcaattgtagatattggtgaccttgtaaaattaaccaaagagctcaaa
gtattaacaaatttttctaaccgtctcttagaaagcgtttatgaggccgtttttatactc
gacaaagacctaaagtgtataagaattaataaagcctttaaggaattaacaggttatgta
gaaaaagatgttattggtaagaaagcaccttttccgcactggccactcgaagaatacgac
aacattaagcaatactttacagcgtttttatctggtggatctagtagaggccaacttacc
tttaaaagagttaatggtgagcgcttacaagttcgtatttctacaacagaaattttggac
gagaataataagttacttggctatgcatctacggctgtcgatatttcagaacaagtaaag
tatcaaaactcattgattgccaaatcaaaaaaagccacagaaaagaaaaactccatttta
aagttaatcaatctaaaggacgaaaatattgacgagtttttaaaagaggtcacattgatc
tcttcaaatgtacttgaggtaaaccgcgtgagcgtttggaaatttagcgataatcaaaca
aaaatagaatgcataaaagcataccattcagagcaagaagaattcttaaataatgccgta
ctaaagacagaaaattatcccaattattttgataagttatatgaacaaaaaatagtaatg
gtagttgacgtcgcaactaatgatgccattaacgaagattacaaaaaaaattatttaaat
aagtttaatatacgctccatgctagatgcttttataatgggatcagaacaaccctttgga
gttatatgttttgagcaaatggagcaaaagcgtcactggacaccagaagaagaacaattt
gtaaccacagtagcaagtgttatttccttagccttagaacataaccatcgtagaaaagta
caagaagaactagagcatactaacaaaaaattaaaatcatcactagcagaactaaatagt
ttaaagaacgatttagaacgtcaaaatgtatatctgagagaagagattgatctggtattt
aattatgaagatatggtttatggcagtgcactatttagtaatgtattaaccgatgtagag
cgcgtagctgataccgacgctacagtctttatttatggcgaaacaggtacaggtaaagaa
ttaattgccagagctattcataacaatagtgatagaaaagagaaaccacttataaaggta
aattgcgctgcaataccaagagagttaatagagagtgaactatttgggcataaaaaagga
tcatttacaggagcatttagtgataaggacggaaaattcaagcttgcagatggtggcaca
ctctttttagacgaaataggagaattaccattagaaatgcaacctaaactacttagagca
atacaagagtttgagattgagcctattggagactcaaaagtgcataaggtagatattaga
ataatttcggccacgaacagaaacttaaaagaagatgttaagcttaaacggtttagagaa
gacttatattacagaattaatgtatttcctattcatgtaccacctcttagagaacggcag
gaggatatacctattttaatcgaacatttcgtcaataaattttgtaaaaaatatggaaag
actattaaatttatatcacaagaaaccagagatgcactctacaactacgattggcctggc
aacatacgcgagctagaaaaccttattgaacgcgctgtaattttaagtaataaaaacgct
ctggttgttccaggatttgccacgtccaataaagaaaacccagttgatttgtcaacatta
agtctaaacgaggtacaacgcttacatattaagcaagtattaaaaaagtgtaattggaaa
attgaaggctctaatggtgcagccgaagctttagatataaaaccaagtacgctaagagac
aggatgaaaaagctaggagtcgccaaatcctaa
DBGET
integrated database retrieval system