Winogradskyella sp. PG-2: WPG_0391
Help
Entry
WPG_0391 CDS
T03603
Name
(GenBank) long-chain-fatty-acid--CoA ligase
Organism
win
Winogradskyella sp. PG-2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
4HBT_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAO74621
LinkDB
All DBs
Position
405723..408641
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MKNEIDKKSLLSQWKKQKDKTTPTTPKITKVPDGEAIPLSRGQERLWFLQQLYPDNSFYN
HAESFTILGDLNVEYLSKSFDLIIEQHDVLKSYFPVEEGKTTIKINSDFKLTINQQDFSE
LSLQDAKQKATNFIEKEIVTPFNLNTPPLIRVSLTKLSNSHHILSINIHHIIIDEWSMKN
ISNLLSKYYTTLSNNEIIETAKPQIQYQDFAYWEQHRTLPSKQIDYWKTKLSGTIPVLEL
HTDYRRPLQPTFNGGHYTSNLSKKDSEDLLAFAKIMKTTPFVIALSLFKTLLYRYTKQKD
ILIGLPITNRDHKSLQNLIGFFVDTVVLRTKFEGHSTFTQLVSKVRKNTLEAFSNKAIPF
DYLVKELLPNRSLAMNPFFQVMFVYNNEERDSNFGPDIEFKKEEDILLKSSKFDLTLFVN
EKDGLLSTTFEFATDLFDTSTIKRFSEHYNLLVQAVISNSDVSISELPMLTKQENDLFTS
TKAVKNNSFSTSTGIHHIIEDIVKKHPYNTAVSFGSKSLTYEDLNNKAIALAHVILANKN
EEDTIIGLSIERSTAMIVGLLAILKAGCAYLPIDPDYPAERIDFILKDAKVNCIITQDKL
IPIFNNFNADLISIDNLKNVNSHKLPTVSNSNLAYVIYTSGSTGNPKGVPITHKNIINST
AGRLDFYDSNPTAFLLMSSISFDSSKAGIFWTLCTGGNLVISEIRLEQDIEQIETVIEEQ
KISHTLMLPSLYHLIIEHSDIQKLKTLTTVIVAGEVCSVSLAKKHFSFLPRVDLYNEYGP
TEATVWCIAHKISEEDVIHGTIPIGNSVTHADIQLLDSELRPVPFGAIGELFIGGQSLSG
YYINRPDLTKATYIKNNNGKLFYKTGDIAKYNYKGTIEFLGRIDQQVKIRGYRVELDEIE
HTLNTNKMIKKAVVVIETTDKNINLDPNEIIETSNLAELLNMHLKEQDIDKLIGSIKALD
TNEKEYLLNQIK
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatgaaatagataaaaaatcgcttcttagccagtggaaaaaacaaaaagataaa
actactccaaccacacctaaaattacaaaggtacctgatggtgaagctatcccgctgtct
agagggcaagaacgcctttggtttcttcagcaattatatcccgataattcgttttataat
catgcggaatcatttacaatacttggtgatttaaatgtagaatacttatcgaaaagtttc
gacttaattatcgagcaacatgatgttctaaaatcttatttccctgtagaagaaggaaaa
actacaattaaaattaactctgattttaagctaacaataaatcagcaagatttcagtgag
ttatcattacaagatgcgaaacagaaagcaactaactttattgaaaaggaaattgtaact
ccttttaatctaaatacacctccacttattcgtgtatctcttacaaaactatctaactca
catcatattttatcgataaacattcatcatattattatagacgaatggtctatgaaaaat
ataagtaatttattatcaaagtattacacaacactttctaataatgaaataatagagacc
gccaaaccacaaattcaatatcaagattttgcttattgggaacaacatagaacattacca
tcaaaacaaattgattattggaagacgaaattatctggtacaattcctgtactagaatta
cacactgattataggcgacctttacagcctacattcaatggaggacattatacgtctaat
ttgtctaaaaaagattcagaggatttattagcatttgctaaaataatgaaaacaactcct
tttgtgattgcgctttcgcttttcaaaacgttgctatatagatacactaaacaaaaagat
attttaattggactaccgattaccaatagagatcataaatccttgcaaaatttaattggt
ttcttcgttgatactgttgttttgcgtacaaaatttgaaggtcacagcacctttacacaa
cttgtttctaaagtccgtaaaaatactttagaagcattttctaacaaagcaattcctttc
gattatcttgttaaggagttgttaccgaataggtctttagcaatgaatccattttttcaa
gtcatgtttgtttataacaatgaagaacgagactctaattttggtccagatattgagttt
aaaaaagaagaagatattcttttaaaatcttctaaattcgatttaactctatttgtaaat
gaaaaagatggtttattgtctacaaccttcgaatttgcaacggatttatttgacacatcc
acaattaaacgtttttcagagcattacaatcttttagtgcaggctgtgatttctaattca
gatgtttcaatttccgagttaccaatgcttactaagcaagaaaatgatttatttacttca
actaaagcagtaaaaaacaattcctttagcacctccacaggtatacatcatattatagag
gatatagtaaaaaagcatccttataatactgctgtatcatttggttcaaaatcattaacc
tatgaagatttaaataacaaagcaattgctttagcgcatgttatacttgcaaataaaaac
gaagaagatactattattggcttatcaatagaacgctcaacagcaatgattgttggatta
ttagcgattctaaaagcaggatgcgcatatttaccgattgatccagactatcctgcagaa
cgaattgattttattttaaaagatgcaaaagtaaattgtattattacacaagataagtta
attccaattttcaataattttaatgctgatttgatttctattgataatctcaaaaacgta
aattctcataaattacctacagtttcaaattctaatttagcttatgttatttatacctct
ggaagtacaggaaatcctaaaggagttcctattacacataaaaatattataaattctact
gctggtcgtttagacttttatgatagcaatcctactgcgtttttattaatgtcatctatt
tcttttgacagttctaaagcaggaattttctggacactttgtacaggtggaaatctagta
atttcagagatacgattagaacaagatattgaacagattgaaacggttatagaagagcaa
aagataagtcatacattgatgttgccgtctttataccacttgattattgagcattcagac
atacaaaagcttaagactttaactactgtaatagtagcaggagaggtctgttcagtatcc
ttagctaaaaagcatttttcttttttaccaagagtggatttatataatgaatacggtcca
actgaggcaacagtttggtgtattgctcacaagatttctgaagaggatgtaatacatgga
actattccaattggtaatagcgttactcatgcagatatacaacttctagattctgaactt
agaccagttccttttggtgctataggagaactctttattggaggccaaagcttgtctggt
tattatataaacagaccagatttaactaaagcaacttatataaaaaacaataatggtaag
ttattttataaaacgggagatatagctaaatacaattataaaggaactattgaattttta
ggacgtatagatcagcaagttaaaatcagaggttatcgtgtagagcttgatgaaatagag
catacattaaatactaataaaatgataaaaaaggctgtcgttgttattgaaaccacggat
aaaaacataaacttagatcctaatgaaataatagaaacctcaaatcttgctgagttattg
aatatgcatctaaaagagcaagatattgataaattaattggctctataaaagcattagac
accaatgaaaaagaatacttattaaatcaaatcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system