Winogradskyella sp. PG-2: WPG_1626
Help
Entry
WPG_1626 CDS
T03603
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
win
Winogradskyella sp. PG-2
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
OMP_b-brl_3
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAO75856
LinkDB
All DBs
Position
1785858..1788665
Genome browser
AA seq
935 aa
AA seq
DB search
MKKLCVFTLFSILTMCLSFGQEGNIQGVITDEQGLFVPYATVSITNLKKGTVSDSEGKFL
LLNVPSGTQTLRIEYLGFSDKEVQFEVKTDETVGVKVILTSETEALDSVLLTGFVGGQAK
ALNTQKNKQNITNIVSTDQIGKFPDANIGDAVKRIPGITMQVDQGEARNIIVRGLAPQLN
SVTLNGSRIPSAEGDNRNIQMDLIPADMIQQIEVNKAVTPDMDGDALGGSVNLVTRTAPE
GFRLSTTVGSGVSFITDKRILNGSFLLGDRSKDGKFGWMVSASILDNDFGSDNIEAEWTD
EFEFFDGTEVVEADVNPYTNVFEQRTYIVQRVRRSFSANFDYNFNTNNSIFFKSMYNWRD
DRENRYRLEHEILDGEDIEVGDFDIVNNLPTRFPVEVKRQTKGGIDSDRIQNARLEDQRM
QNYSLGGKHLAGGLQIDWMASYAKASEERLNERYAEFESEYIINNRISDSEFPLFTAVDS
NDFSNLSNFEYGEITEENQYTEEDLNVFVNIQLPADFFNEGDGFVKFGLRGRFKNKVRDN
NFFEFNLEDAFPTLADADSRDYSDLDYLAGSEYQAGIFADEAWLGKLSLSNGELVFDEFL
RANFDVEENVFAGYAMASQKVSNKLTVLAGLRIENTSITAKGNQIADEEDLEGTVTEESS
YTNVLPSVHLKYDLNPRTVLRFAWTNTLARPNYQDLVPSVDVVGGDEEIFLGNPELDPTT
SMGFDLMAEYYFKSVGILSGGLFYKDIQDFIYTSQFEDADTGFDVFQPQNGDGASIFGAE
IAFQRQLDFLPGFAKNFSIYLNYTYLTSTADGIRNEDGDERGDLDLPGTAPNMFNGSLAY
NDKKFNIRLSANYSDAYIDELGGSAFEDRYYDEQFLVDFNVSYAINPNLRVYADLNNLTD
QPLRYFQGISSRTMQAEYYGRRLTFGLKYDLFKRK
NT seq
2808 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactttgcgtttttacgttattttcaattttaaccatgtgtttatcctttggt
caagaaggtaatattcagggtgttataacagatgagcaagggctttttgtgccgtatgca
acagtatcaattacgaacttaaaaaaaggaactgtttcagattctgagggaaagttttta
ttgttaaatgtaccaagtggcacacaaacattaagaatagaatatttaggttttagcgat
aaagaagtacaattcgaagttaagacagatgagactgttggagttaaagtgattttgact
tcggagactgaagctttagacagtgttcttttaacaggttttgtgggtggacaggcgaaa
gccttgaatacacaaaaaaacaagcaaaatattactaacatcgtatctacagaccaaatc
ggtaagtttccagatgctaatattggtgatgctgtaaaacggattcctggtattactatg
caagtggatcaaggtgaagcgcgtaatattattgttagaggtttagcaccacaattaaac
tctgtaacattaaatggatcacgtattccttctgctgaaggtgataatcgtaatattcaa
atggatttaattcctgcggatatgattcaacaaatagaagttaacaaagctgttacgcca
gatatggatggagatgcacttggtggatctgtaaatttagtaacgcgtacagctcctgaa
ggttttagactgtcaactactgtaggttctggtgtaagctttataaccgataaaagaatc
ttaaacggttcatttttattaggtgatagaagtaaagatggtaagtttggatggatggta
tccgcttctattttggataacgattttggatccgataatattgaagcagagtggaccgat
gagtttgagttttttgatggaactgaagttgtagaagctgacgtaaatccttacactaac
gtttttgaacaacgtacttacatagtacaacgtgtaagacgtagtttttctgcaaacttt
gattataattttaatactaataactctatctttttcaagtctatgtataactggagagat
gatcgtgaaaatcgttatagattagagcatgaaattttggatggagaagatatagaagtt
ggtgattttgatattgttaataatttgccaactcgtttcccagttgaagtaaaaagacaa
actaaaggcggtattgacagtgacagaattcaaaatgctcgtttagaagatcaacgtatg
caaaattacagtttgggtggtaaacatttagctggtggattgcaaatagattggatggcg
tcttatgcaaaagcatcagaagaaagactgaatgaacgttatgctgaatttgaatctgag
tatattattaataatagaatatctgattctgaatttccattatttacagctgtagattct
aacgactttagtaatctatctaattttgaatatggagaaatcaccgaagagaatcagtat
acagaagaagatttaaatgtttttgtcaatattcaattaccagcagatttctttaatgaa
ggtgatggatttgtgaaatttggtttacgtgggcgttttaaaaataaggttagagataat
aatttcttcgaatttaatttagaagacgcttttccaacactagcagacgcggattctaga
gattattcggatttggattatttagctggtagtgaatatcaagcaggaatttttgcagat
gaagcttggttaggcaaattaagtttatctaatggtgaattagtttttgatgagttctta
agagcaaattttgatgttgaagagaatgtatttgctggttatgcaatggcaagtcaaaaa
gtatctaataaattaacagtattagcaggtcttagaattgagaatactagtattacggct
aaaggaaatcaaattgcagatgaagaagatttagaaggtacagtaactgaagaaagttcg
tatacaaatgtgttgccaagcgtacatctaaaatatgatttaaaccctagaacagtatta
agatttgcttggacaaatacactagcgagaccaaattatcaagatttagttccttcagta
gatgttgtaggaggagatgaagaaatatttttaggaaatccagaattagacccaacaaca
tcaatgggatttgatcttatggctgagtattattttaaaagtgttggtatactttcagga
ggattattttacaaagacattcaggattttatttatacttctcaatttgaagatgccgat
actggtttcgatgtatttcaaccacaaaatggggatggggcatcaatttttggtgcggaa
attgcatttcaaagacaattagatttccttccaggatttgctaaaaactttagtatttat
ctaaactatacgtaccttacttcaactgctgatggtattagaaatgaggatggtgacgag
cgtggtgatttagatttgccaggcactgcacctaatatgtttaatggttctttagcatat
aatgataagaaatttaatattcgtttatcagcaaattattcggatgcttatatcgatgaa
ttaggtggaagtgcttttgaagatcgttactatgacgagcaattcttagtagattttaac
gtgagctatgctattaaccctaatttgagagtttatgcagatttaaataatcttacagat
cagcctttacgatattttcaaggtattagcagcagaacaatgcaagcagaatattacggt
agacgtttaacttttggacttaagtatgacctatttaaaagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system