Weissella koreensis: WKK_03295
Help
Entry
WKK_03295 CDS
T01577
Name
(GenBank) cell wall anchor domain-containing protein
Organism
wko
Weissella koreensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cna_B
SpaA
Big_8
SdrD_B
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEJ23533
LinkDB
All DBs
Position
complement(673180..679203)
Genome browser
AA seq
2007 aa
AA seq
DB search
MLKKLFCCLQIFIVSLSSLVSPIDVLASSLQQGSSLPKKIKIQYTQIRVQQNGQEIPANT
VVESQNQEIEVLYDWQIPDGQQIKANDYFMVNDIPKSFQAASALGLNIDVVDARGQVIAN
GQYNGHANKIKFIFKNDLPANDLKGYLKINFKATYNEKGWANFKINQQNYRIFDDRYQQR
DTPVTTNDLNDQYLPIKKSGRYDYDPKTKQLTYTWRIFLNHAKLNNDEFVIRDTLPEYLK
FDAENLSVHYGHLILKKDADNRIYVNNFNRQGEVSGEDISVKLVHDRELVIQGKVVPGYQ
YDYEISYTTSIGTDDANFKYLREGNDIKVKNVVQLEDNYGNVLGGDVTNLSFLATGQGVS
NYIEPGKLAIIKQGENDQKLLAGAKFSLYDQNNNLVKSNLKTDQNGYALVDNLKPGQYLL
KEMKAPVGYQIDNKDLTVQIDEGQLKTVTVKNKLQPTLTEVNGNLKWFDKHNLKNYRPQQ
VGVNLMQNGQLLKTTIVSAKDRWNYHFEKLPEFDENGQRYQYTVNESEIFKYKTKQDGFD
FIHVLNGTTSIQGQKIWQDQNNEAGLRPRKVEIELIRNKKVVQKIQIGAKNQWQYQFDNL
AQYDNRGREYKYDVAEVVNKNYVTQKDGYDFINVFKPIYIKIHGHKTWIDNDNAEKTRPK
QITVKLIKNGKMIHKKVITAHQKWNYEFNQLEKYDEKGDLNRYQIEEDPVKGYKTHIDGF
NLKNTLKDGQTKIQGKKIWQDDNDHDKFRPKEIILELMQANNVVATQIVTKQTQWQYVFK
KLPKYQNGVKLNYQVREKPVEYYQIKYKNNDIYNTLVGTTQVTGQKYWKDQDNKAGLRPK
KITIKLLQNGAIYRTAKIGAKDGWHYTFKALPKYDQLGKAYQYTVSENKVPGYDSRQQGN
DFINQIKPLIVVAAPDENLKHNTTTLNPVIYNEKVENNLVVPIIKPVDGEKSKQISLLIN
NETLEQQKNELTKKTSPLKIKTIHPMLHQANINVLPKQQWESVEEMIPFLMDYKMFSTTI
IEELNKPLKSGVQPEILRMPRILVETEINLNSTKLENKKNIDLSVIEEHIDASGKQIDFS
TRISEVPNIIELTKPVELEKLVEPENKPDLTKVEEKTEIPVVKEVIDDNGKDLELLTKEN
ELPNIIELTKPVELKQPVESENNPNSTKEEEKTEILVVKEEHNDNGKDLNLLTKENELPN
IIEVTKPVELKQTVETKDIPDSTKEEEKTEISVVEEENNDNGKDLKLLTKENELPNIIEV
TKAVELEKLVEPENNLDLTKVEEKAEIPVVKEENNDNGKDLKLLTKAIELPNIIEVTKSS
ELEKPVESKDIPYLTKVEERTEIPVVKEEIDNNSKDLEWLTKENELPNIIELTKPVELKQ
PVESENNPNSTKEEGKTEIPVVKEEIDDNGKDLELLTKANELPNIIEVTKAVELKQTVET
KDIPDSTKVEEKTEIPVVKEENNDNGKDIELLTKLNELPNIIELTKPVELKQPVEPENNP
NSTKVEEKTEIPVVKEEIDDNGKDLELLTKANELPNIIEVTKAVELEKLVEPENNLDLTK
VEEKAEIPVVKEENNDNGKDLKLLTKANEIPNIIELTKPVELKQTVEKKDIPDSTKEEEK
TEISVVKEENNDNGKDIELLTKLNELPNIIELTKPVELKQPVEPENNPNSTKVEEKTEIP
VVKDENNGKDIELLTKLNELPNIIELTKPVELKQPVEPENIPDSTKVEEKTEIPVVNDNG
KDIELLTKVNELPNIIEVTKVVELKKPAESKDILDLTKVEEKTEIPVVKEENNDNGKDLK
LLTKAIELPNIIELTNQVELKQPVESENKPNSAKVEEKAEIPVVKEKIDDVKNVELLMKS
NELSKTVENKQIIDLVIKPDSTKVEKVKSSDIVVVKKVSSTMEKQIGILNIVGLKTLVEN
KQTVIQKIDQRNINKMCIKNVIPITYLKVVKNQPKEMATVDVVKSKKLNYPKLPTTHSDI
QSCSFIRGIISLIIMSIVTFCWYFRKR
NT seq
6024 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaaaaaacttttttgttgtcttcaaatattcatagtgagtctaagtagcttagta
agcccaattgatgttttagcgagtagtttgcagcaggggtcttctctaccgaaaaaaatt
aagatccaatatacacaaatcagagtccaacaaaatggtcaggaaattccagctaatacg
gtggttgaaagtcaaaatcaggaaattgaagttttatatgactggcaaatacctgatgga
cagcaaattaaagcaaatgattattttatggttaatgatattcctaagtcctttcaagcg
gcgagtgctttgggattgaatattgatgttgtagatgccagaggacaagtgattgctaat
ggacaatataatggacatgccaataaaattaaatttattttcaaaaatgatttaccagcc
aatgatctaaaagggtatttaaagattaattttaaagcgacctataatgaaaaaggttgg
gctaattttaaaattaatcaacaaaattatcgaatttttgacgatcgatatcaacaacgt
gatacgcccgtgaccacaaatgatttaaatgatcagtatttaccaattaaaaaaagtgga
cgttatgattatgatccaaagactaaacaattaacttatacatggcgtatatttttaaat
catgccaaattaaataacgatgaattcgttattcgagatacccttcccgaatatttaaaa
tttgatgcggaaaatttaagcgtgcattatggacatttaattttgaaaaaggatgctgat
aatagaatctatgtaaataattttaatcgacagggagaggtctcaggagaagatatatcg
gttaagttagttcatgaccgagaattagtgattcaaggaaaggttgtgccaggttatcaa
tatgattatgaaattagttacactacatcaattggaactgacgatgctaattttaaatat
ttgcgtgagggaaatgacataaaggttaaaaatgtggtgcaacttgaagataattatggg
aatgttttgggtggtgatgttacaaatctatcgtttttggcaactggtcaaggagttagt
aattacattgaacctggcaaattggcgattattaagcaaggcgaaaatgatcaaaaatta
ttagcaggagctaaattcagtttatatgatcaaaacaataatttagttaaatctaattta
aaaacggaccaaaatggatatgctttggtagataatttgaaaccaggtcaatatctttta
aaagagatgaaagcgccagtggggtaccaaattgataataaagatttaactgtgcaaatt
gacgaaggacaattaaaaactgtcacagttaaaaataaattacagccaacgttaacagag
gtaaatggaaatttaaaatggttcgacaaacataatcttaaaaattaccggcctcagcaa
gttggagtaaatttaatgcaaaatggacaattattaaagactacaattgtcagcgctaaa
gatagatggaattatcattttgaaaaattacctgaatttgacgagaatggacaacgctat
caatatacagtaaatgaatcagagatatttaaatataagactaaacaagatggatttgat
tttattcatgttctaaatggaacgactagtattcaaggacagaagatctggcaggatcaa
aataatgaggcaggattacgtccacgaaaggttgaaattgaattaattagaaataaaaaa
gtggttcaaaagattcaaattggagcaaaaaatcaatggcagtaccaatttgataattta
gcacaatatgataatcgaggacgtgaatataaatatgatgtagcggaagtagtgaataaa
aattatgttactcaaaaggatggttatgattttataaatgtttttaaaccaatttatatc
aaaatccatggtcataaaacatggattgataatgataatgcagaaaaaacacgaccaaaa
caaattacagttaaattgataaagaatgggaaaatgattcataagaaggtgatcacagct
catcaaaaatggaattatgaatttaatcaattggaaaagtatgatgaaaaaggtgatttg
aatcggtatcaaattgaggaagacccagtgaaaggttataaaactcatattgatggtttt
aatttgaagaatactttgaaagatggtcaaaccaaaatacaaggaaagaaaatttggcag
gacgataatgatcatgataaattccgtcccaaagaaattattttagaattgatgcaagca
aacaatgtggtagcaactcaaattgtaactaaacaaactcagtggcagtatgtatttaaa
aaactacctaaatatcaaaatggtgtgaaattgaattatcaggttcgtgaaaaaccagtt
gaatattatcagattaaatataaaaataatgatatttacaatacgttagtgggaacaacc
caagtaacgggtcaaaagtattggaaagaccaagataataaagctgggttacgtcctaaa
aaaattacgatcaaattattacaaaatggagcaatttatcgaacggctaaaattggagct
aaagatggttggcattatacttttaaggcgttgcccaagtatgatcaattaggtaaagca
tatcaatatacagtttctgagaataaagttcctggttatgatagtagacaacagggaaat
gattttatcaatcaaattaaaccattaattgtggtagccgcaccagacgaaaatttgaag
cataatactacaacattaaatccagtgatttataatgaaaaggttgaaaataatctggta
gtgccaatcattaaaccagtcgatggagaaaaatcaaagcaaatatcgttactaataaat
aatgagacattagagcaacaaaaaaatgaactgactaaaaaaacaagtccgttaaaaata
aagactatacatccaatgttgcatcaagcaaatatcaatgttttgccaaaacagcaatgg
gaatcagtggaagaaatgattccgtttttgatggactataaaatgttttctacgacgata
attgaggaattaaataagccacttaaatcgggggtccaaccggaaatattacggatgccg
cgaatattggttgaaacggaaattaatcttaattcaactaagttggaaaataagaagaat
atagatctgtcagttatagaggaacatattgatgctagtgggaaacagatagatttttcg
acgagaataagtgaagtaccaaatatcattgaattgactaagccagttgaactggaaaaa
ctagttgaaccagaaaataagcctgatttaactaaggtggaagaaaaaactgaaataccg
gtagttaaagaagtaattgatgacaatggtaaagatttagaattgttgactaaggaaaat
gaactacctaatatcattgaattgactaagccagttgaacttaaacaaccagttgaatca
gaaaataatcctaattcgactaaggaagaagaaaaaactgaaatactcgtagtcaaagaa
gaacataatgacaatggtaaagatttaaatttgttaactaaggaaaatgaactacctaat
atcattgaagtgactaagccagttgaacttaaacaaacagttgaaacaaaagatattcct
gattcaaccaaggaagaagaaaaaactgaaatatcggtagtcgaagaagaaaataatgac
aatggtaaagatttaaaattgttgactaaggaaaatgaactacctaatatcattgaagtt
actaaggcagttgaactggaaaaactagttgaaccagaaaataatcttgatttaactaag
gtggaagaaaaggctgaaataccggtagttaaagaagaaaataatgacaatggtaaagat
ttaaagttgttaacgaaggcaattgaactacctaatatcattgaagtgactaagtcatct
gagcttgaaaaaccagttgaatcaaaagatattccttatttaactaaggtggaagaaaga
actgaaataccggtagttaaagaagaaattgataataatagtaaagatttagaatggttg
actaaggaaaatgaactgcctaatatcattgaattgactaagccagttgaacttaaacaa
ccagttgaatcagaaaataatcctaattcaaccaaggaagaaggaaaaactgaaataccg
gtagttaaagaagaaattgatgacaatggtaaagatttagaattgttgacgaaggcaaat
gaactacctaatattattgaagttactaaggcagttgaacttaaacaaacagttgaaaca
aaagatattcctgattcaaccaaagtggaagaaaaaactgaaataccggtagtcaaagaa
gaaaataatgacaatggtaaagatatagaattgttgacgaagttaaatgaactacctaat
attattgaattgactaagccagttgaacttaaacaaccagttgaaccagaaaataatcct
aattcaaccaaagtggaagaaaaaactgaaataccggtagttaaagaagaaattgatgac
aatggtaaagatttagaattgttgacgaaggcaaatgaactacctaatattattgaagtt
actaaggcagttgaactggaaaaactagttgaaccagaaaataatcttgatttaactaag
gtggaagaaaaggctgaaataccggtagttaaagaagaaaataatgacaatggtaaagat
ttaaagttgttaacgaaggcaaatgaaatacctaatatcattgaattgactaagccagtt
gaacttaaacaaacagttgaaaaaaaagatattcctgattcaaccaaggaagaagaaaaa
actgaaatatcggtagtcaaagaagaaaataatgacaatggtaaagatatagaattgttg
acgaagttaaatgaactacctaatattattgaattgactaagccagttgaacttaaacaa
ccagttgaaccagaaaataatcctaattcaaccaaagtggaagaaaaaactgaaataccg
gtagttaaagacgaaaataatggtaaagatatagaattgttaacgaagttaaatgaacta
cctaatattattgaattgactaagccagttgaacttaaacaaccagttgaaccagaaaat
attcctgattcaaccaaagtggaagaaaaaactgaaataccggtagtcaatgacaatggt
aaagatatagaattgttgacgaaggtaaatgaactacctaatatcattgaagtgactaag
gtagttgaacttaaaaaaccagctgaatcaaaagatattcttgatttaactaaggtggaa
gaaaaaactgaaataccggtagttaaagaagaaaataatgacaatggtaaagatttaaag
ttgttaacgaaggcaattgaactacctaatatcattgaattgactaatcaagttgaactt
aaacaaccagttgaatcagaaaataagcctaattcagccaaagtggaagaaaaggctgaa
ataccggtagttaaagaaaaaattgatgatgttaaaaatgtagaattattaatgaaatca
aatgaattatctaagacggttgaaaataaacaaataattgatttagtaattaagcctgat
tcaactaaagtagaaaaagtgaaaagttctgacatagttgtggttaaaaaagtatctagt
actatggaaaaacagattggaatattaaatatcgtcggattaaagacgttagtagaaaat
aagcaaacggttattcagaaaatagatcaacgaaatataaataaaatgtgtataaaaaat
gttattccaataacgtatttgaaagtagttaaaaatcagccaaaagaaatggcgacagtt
gatgttgttaaatccaaaaagttaaattatccaaaattaccgaccacacatagtgacatt
caatcatgctcttttattagggggataatcagcttgattataatgagcatagtaactttc
tgttggtattttcggaagcgataa
DBGET
integrated database retrieval system
