Weissella koreensis: WKK_04105
Help
Entry
WKK_04105 CDS
T01577
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
wko
Weissella koreensis
Pathway
wko03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wko00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
WKK_04105
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
wko03400
]
WKK_04105
Enzymes [BR:
wko01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
WKK_04105
DNA repair and recombination proteins [BR:
wko03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
WKK_04105
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrB_inter
DEAD
CarD_TRCF_RID
TRCF
Helicase_C
ResIII
UB2H
MFD_D3
RecG_dom3_C
Cas3-like_C_2
AAA_7
DUF7440
PrpR_N
AAA_31
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEJ23695
LinkDB
All DBs
Position
845203..848724
Genome browser
AA seq
1173 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
