KEGG   Wolbachia endosymbiont of Onchocerca ochengi: wOo_03680
Entry
wOo_03680         CDS       T02212                                 
Name
(GenBank) 30S ribosomal protein S1
  KO
K02945  small subunit ribosomal protein S1
Organism
woo  Wolbachia endosymbiont of Onchocerca ochengi
Pathway
woo03010  Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:woo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03010 Ribosome
    wOo_03680
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03011 Ribosome [BR:woo03011]
    wOo_03680
Ribosome [BR:woo03011]
 Ribosomal proteins
  Mitochondria/ Chloroplast
   Small subunit
    wOo_03680
  Bacteria
    wOo_03680
SSDB
Motif
Pfam: S1 Spt6_S1 S1_RRP5 EXOSC1
Other DBs
NCBI-ProteinID: CCF78091
UniProt: I7ITN4
LinkDB
Position
complement(316533..318185)
AA seq 550 aa
MNNNDPAVNLSTSIKKLSSNRFVEEVCQSQFEDQGNILFEGFFVKKVKEGDVVEGVVTQI
NPNDVVVDVGLKSDGRISIKELGCRDEVGVGSKIKVYVERIEDYYGNVALSREKAIRDEK
WHKLEEDAATQTEVSGIIKRSIKCGFIVDLGDGISAFLPMSHVDLKQARDAKHLIDTEQK
FIVLKVDKKQGNIVVSRKLVLEKLHAGEKIKFLESLNEGDIIEGKIKSITHYGVFVGIHE
SDVVGVVDGLLHITDISWSRVSHPSAVFTCGQTIKVKVIKIDKENAKVSLGIKQLEDNPW
HDIELRYPVGSVYKGHITSIEDYGIFVELKPGIEGLVHSSEITWVKNNLPISNLVTRGQE
VFVKILSIDTVKNRMSLSIKRCVSNPWQVFIDKYPPGSIVSGKIKNNTGLYISITFDDYE
IDENVEGTIYAQDISWSKNGLDQIKKYSVGDIIEAKVIRANVNRAKIYLGIKQIEHDPLI
ELIKKVKVGGKMQAIVSKREDSGLVVKVENDVTLLIDQEHLPENKKFSMSEEIEVEVLGI
EAYNIILSAK
NT seq 1653 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataataatgatccagctgtaaatctatcaactagtattaaaaaattatcgtcaaac
aggttcgtagaagaggtgtgtcaaagtcagtttgaagatcaaggtaatattttatttgaa
ggtttttttgtcaagaaagttaaagaaggagatgtagtagaaggtgtagttacacaaata
aatcctaacgacgttgtagttgacgttggcttaaagtctgatgggagaatttcaattaaa
gaactcggttgtagagatgaggttggtgttggttctaaaattaaggtgtatgtagaaaga
atcgaagattattatggtaacgtagctcttagtcgtgagaaagcaattagagatgaaaaa
tggcataagttggaagaagatgcagctacacaaactgaggtaagtggaattattaaacgt
tcaattaaatgcggctttattgttgatcttggcgatggaataagtgcttttttaccgatg
agccatgtggacttaaagcaagcgagagatgctaagcatcttattgatactgaacaaaaa
tttattgtgcttaaagtggataagaaacagggtaacattgtagtatcaagaaagctggta
ttagaaaaattgcatgctggtgaaaaaattaaatttttagaatccttaaacgaaggtgat
ataatagagggaaaaataaaaagcattactcattacggtgtatttgttggtattcatgag
tcagacgtagttggggttgtggatgggttattacatattacagatatttcttggagtaga
gtgagccatccatctgcagtttttacctgtggtcagactataaaagtcaaagttataaaa
atagataaagaaaatgcgaaagtttctctaggtataaagcaattagaggataacccttgg
catgatatagaattaagatatccagttggtagtgtgtataaaggtcatataacaagtata
gaggattatggaatatttgttgaacttaaacctggaattgaaggtttagtacactcgtca
gaaataacttgggttaagaataatttaccaattagtaatcttgtaaccagaggacaggaa
gtgtttgttaagattctcagtattgacactgttaaaaatagaatgagtttgagtattaag
aggtgtgtaagtaatccttggcaagtatttattgacaaataccctcctggctctattgtt
tctggtaagattaagaataatactggattatatatatctattacctttgatgattatgaa
atagatgagaatgtggaagggacaatttatgcacaggatataagttggtctaagaatggt
ttagatcaaataaaaaagtatagtgttggtgatataatagaagcaaaagtaataagggct
aatgtaaatcgagcaaaaatttaccttggtataaagcaaatagagcatgatcctcttata
gaattaataaaaaaagtaaaggtaggtggcaaaatgcaggctattgtgagtaagagggaa
gatagcgggttagttgttaaagttgagaatgatgtgactctcttaatagatcaagagcat
ctaccagaaaataaaaagttttctatgtcagaagaaatagaagtggaagtgttgggcatt
gaagcctataatataatactatctgctaaataa

DBGET integrated database retrieval system