Weissella paramesenteroides: CO680_00305
Help
Entry
CO680_00305 CDS
T05120
Name
(GenBank) haloacid dehalogenase
Organism
wpa
Weissella paramesenteroides
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
E1-E2_ATPase
Cation_ATPase_C
Cation_ATPase
Cation_ATPase_N
Hydrolase
Hydrolase_3
HAD
TMEM_230_134
DUF6684
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATF40582
LinkDB
All DBs
Position
complement(46578..49337)
Genome browser
AA seq
919 aa
AA seq
DB search
MQTDFNLDEILKSNADQVLGLLLASTNGLNTDDVKQRQEQYGPNVLEKAHQTPLIMSFLQ
NFISMMAILLWIAGGIAFIAGLTELGIAIWLVNLINGVFSFWQEFQAGKATAALNKLMTT
ETLVLRNGQQKMIPTDQLVPGDIVILNEGDRVPADIRLLDASGMRVDQSTLTGEVNPVSK
NTAIATEISNHAAVHNMVYMGTSLMQGHGRGVVVTTGMNTEFGKIARLTQTVHEKLSPLQ
KELNILTKQLSLLAVGIGIIFFFCAVFFVHYPVVASFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSL
AGAVSNMAREHALIKKLASVETLGSATVICSDKTGTLTQNAMTVAHLWTSVDSYHVTGEG
YQPNGTIFKGETALKGSDEPVLRELLLGGLLTDNAMIKENADHTFQIIGDPTEACLEVVA
QKGGLNVKALRQSHQKVDELPFNSNRKMMTVKVQANQSEAFNVYSKGAPNKVLDHCTTYL
TTDKQIKPLTDNIRRKIMAANDGYAAQALRVLAVAGRQLDDTDDFKTAEQNMTFIGLSAM
FDPPRNQVIEAIADCHRAHIKIIMITGDNGITAESIARKIGIVSHNDQMRVVTGGELTNL
SDEALKDALKGDVLFARMASEQKYRIIACLQDMGHVVAVTGDGVNDAPALKRADIGIAMG
RSGTDVAKEAADVILTDDNFASIVAAIKAGRGVYSNIRKFLLYILSSNVPEAFPSILFLL
SGGKIPLALTVMQILLIDLGTDMIPALGLGREPTEPTVMSQPPRKKAEHLITKNTILKAF
AWYGALSSILSASAFFFSNYLNGHSLNALVATGFDYRQATTLTLGTIIFCQMAVVLNCRY
DLNSLFYPHHNFWSNGLVYAGIVFEALLFIAVCYVPLLQSVFGTTPLILRDWLYLILLPM
PLILLNELRKYFLRKKQVA
NT seq
2760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagacggattttaatttagatgaaattctgaaaagtaatgctgatcaagttttaggt
ctcttactcgccagcaccaatggcttaaatactgatgatgtcaaacaacgtcaggaacag
tatggtccaaacgttcttgaaaaagcacatcaaacgccactaattatgtcatttttacaa
aacttcataagtatgatggcaatcttactttggattgctggaggcattgcctttatcgct
ggattaacagaattaggaattgccatttggcttgttaatctaatcaacggtgttttcagt
ttttggcaagaatttcaagctggtaaagcaactgccgcattaaataaattaatgaccaca
gaaactttagtcctacgaaacggccaacaaaaaatgataccaaccgatcagctggtaccc
ggcgatatcgttattttaaatgaaggtgatcgtgtgccggctgatattcgcctactagat
gcatcgggtatgcgtgttgatcaatccaccctaactggggaagttaatcctgtttcaaaa
aatactgcaattgcaacagagatttcgaaccatgctgctgtgcacaacatggtttacatg
gggacttcgctcatgcaaggtcatggtcgtggtgttgtcgtgacaactggtatgaataca
gagtttggcaagattgctcgcttaacacaaactgtgcatgagaaacttagcccattacaa
aaagaattaaatattttaacaaagcaactctcactactagcagttggtattggtatcatc
tttttcttctgcgctgtctttttcgttcactatccagtcgtagcttcatttatttttgct
ttaggtatgattgtcgccttcattccagaaggactgcttcctacggtaaccttatcctta
gcaggtgctgtttcaaacatggctcgtgaacatgcattaattaaaaagctagccagcgtc
gaaacccttggttctgcaacggtcatctgttctgataaaaccggaacactcacgcaaaat
gcgatgactgttgctcacctctggactagtgtagactcataccatgttaccggtgaaggt
tatcaaccaaatggtaccattttcaaaggtgagaccgctttaaaaggtagtgacgaacct
gttttgagagaactcttgcttggtggcttgttaactgataatgcgatgattaaagaaaat
gctgatcacacatttcaaattattggtgacccgactgaagcttgcttagaggtcgttgcc
caaaaaggtggtttaaatgttaaagcgctccgtcaaagccaccaaaaagttgatgaacta
ccctttaattctaaccgtaagatgatgaccgttaaagtacaagctaatcaatcagaagca
tttaatgtttacagtaaaggcgcccccaacaaggttttagaccactgtacaacttatctc
acgacagataagcagatcaagcccttaactgacaatatccgtcgaaaaataatggcagct
aatgatggctatgctgcccaagctcttcgtgtattagccgttgctggtcgacaactcgac
gataccgatgattttaaaactgccgagcaaaacatgacttttattggtttatctgccatg
tttgatccaccaagaaatcaagtcatcgaagcgattgctgattgtcatcgtgcccacatt
aagatcattatgattactggtgataatggcatcactgctgaatcaattgctcgtaaaatt
gggattgtgtcgcataatgaccagatgcgcgttgtgacaggtggtgagttaactaaccta
tccgatgaagcattgaaagatgccttaaaaggggatgtcctatttgctcgcatggcttcg
gaacaaaaatatcgtatcattgcttgtttacaagatatggggcatgttgttgctgtaact
ggtgatggcgtcaatgatgcacctgcactaaaacgtgctgatattggtatcgcgatgggc
agatctggaacagatgttgcaaaagaagctgctgacgtcattctaacagatgataatttt
gcttcaatcgttgctgcaattaaagctgggcgtggtgtatatagtaatattcgcaagttt
ttactgtatatcttaagctcaaatgtaccagaagcatttccatcgattctatttctatta
agtggtggtaaaattccacttgcattaaccgtgatgcaaattttgttaattgatttggga
actgatatgattcccgcgttaggcttgggtcgtgaaccaacagaaccaacagttatgtca
caaccaccaagaaaaaaggctgagcatctaattaccaaaaatacaattctaaaagctttt
gcttggtacggtgctttaagttcaattctgtccgctagtgcattctttttcagtaattac
ttaaatgggcatagtttaaatgctttagtcgctactggtttcgactatcgccaagcaacg
accttaacattaggaactattatcttctgtcagatggcggtcgtactaaattgtcgttat
gacttaaactcgctattttatccgcatcataacttctggtcaaatggattagtctatgcg
ggtatagtctttgaggcattactatttattgctgtatgctatgtaccgctgctacaatcc
gtttttggaaccacaccactaatcctacgtgattggctctatttgattctattacctatg
ccattaatcttattaaatgagttacggaagtatttcctacgtaaaaagcaggttgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system