Weissella paramesenteroides: CO680_06970
Help
Entry
CO680_06970 CDS
T05120
Symbol
addA
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddA
KO
K16898
ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
wpa
Weissella paramesenteroides
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wpa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
wpa03400
]
CO680_06970 (addA)
Enzymes [BR:
wpa01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CO680_06970 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
wpa03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
CO680_06970 (addA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
DEAD
AAA_12
ResIII
AAA_30
HetE-N
Taeniidae_ag
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATF41800
LinkDB
All DBs
Position
complement(1396718..1400527)
Genome browser
AA seq
1269 aa
AA seq
DB search
MKFTDSQSAAIKTKGRNVLVSASAGSGKTRVLVERVMQRLLAGENVNEFLIVTFTEAAAS
EMKERLEGAIRSELIASVGEQRQHLLKQLRLLNIANISTLHAFALRLIEQYHYTIDLDPQ
FRLMDDAERTLVMLEVYNTLLEEQYANDNEQHAFATFAAQFTTSTTDDRALQEATFSLYD
FATARPDAVNWLDHLSDLYQVDQEDFTSSQFYQAQLKPQILKELQGIVDRSAVLVAQAPD
TMDEAPAVNRLLNLQADETAYQQALTLVQNEANDWNTVQQTIKHIDLMSWGVDTQGKRKN
FTKKHDPELKIAWDRVKDEREALKKRFTIVLEKYFVLDQAGLVLAIQGAGRVIDRLVKLT
KDFSTDFLTEKLRRKVLDFNDLEHFALQIVSQEKVKAELQERYTEIMVDEYQDTNQLQEA
ILHEITSGDNLFQVGDIKQSIYKFRQADPTLFAGKLATYPSDTISEVITLQENFRSQPNV
TNFINYIFAQAMSRSLGDIEYTGEAELVAGADYYPEELPKKAELLLYLDDANQDESPADA
EVDAEADTLASDAPYTKATGQIRLTALKIQELMQSKFEIFDRQAQKKRPVNYGDITILVP
TKGQNLDVLDVFREMNIPIMIDGTENYFQTTEISVIMSFLQVIDNPHQDIPLVAVLRSPL
YDIGENGLALIRAQTPEEDFYTAVKNLANDDEIDTIGDISPALVKNTQTQVQRFLADLAV
FRDLAVQNQIVTLLWAIYNRTGWLDYVGGLPSGAQRQANLHALYDRASAYQKSSFVGLYQ
FINYVTQLQSHDKDLGEADANVAQDSVSLMTIHHSKGLEFPIVFLLNATRTMISQRETQG
SIILDAQAGGGMNYVDLQHHLKLITPQHEYIAQVKRQNAYAEQLRVLYVALTRAEQQLFI
VGAYDNVDKLWQTWQQSAGVTEWMLPDTVRLAGKSFMDLLGMTLIRHPQAPEQFAPLRGY
DVNDVMQFDEIRTKTPKNAFAFDLEVINTQDLVNRVANYQPLSDDIVDTKDVTETSAEEN
TDWQSVLQFAYPYETATRATAYQSVSEIKRLFEDPDLAEGRQLLDRRLVTDDLAGLRMTD
EELPEPDFMQESATRLSSAAIGTATHLVMQRLDLTKGVPTEVVIRTLIQQLVNEKLIDDK
IAPLISVAKIGRFFNDSPLGKQMIQHADSLRREVPFSLLLDAKRLYRAFDGDDKVLVHGI
IDGYFQVDDEIWLFDYKTDHVSQQAATNILTKRYAGQLNIYAQALVAMGLPMPKRFIYAI
NAEKLIRLS
NT seq
3810 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttactgattctcaatcagccgccattaaaacaaagggacgtaatgtgttggta
tcagcttctgcaggttctgggaaaacccgtgttttggttgaacgtgtgatgcaacgatta
ttggctggtgaaaatgttaatgaatttttgattgttacatttacagaagcagccgccagt
gagatgaaagaacgtttagaaggtgccattcgttcagaacttattgcgagcgttggtgaa
cagcgacaacatcttttaaaacagctacggctattaaatattgctaatatttcaaccttg
catgcttttgcgctacggttaattgaacaatatcactatacaattgacttagatccacag
tttcggttgatggatgatgcagaacgtactttggttatgttagaggtatacaacacttta
ttagaagaacagtatgctaatgataatgaacaacatgctttcgcaacgttcgcagcgcaa
tttacgacgagtacaacagatgatagggcattacaagaagcaactttctctctgtatgat
tttgcgactgctcgaccagatgcagttaactggctggaccatttatcagatttatatcaa
gttgatcaggaagattttacaagcagccaattttatcaagcacagttaaaaccacaaatt
ttaaaagaattacagggcattgttgataggtctgcagtgttggttgcacaagccccagat
acgatggatgaggcgccagcagttaatcggttattaaatttacaggctgacgaaactgcc
tatcaacaggcattgacattggtacaaaatgaagccaatgattggaatacggtgcaacaa
actatcaaacacattgatttgatgagttggggagttgatacgcagggaaagcgcaaaaat
ttcacaaagaagcatgaccctgaactaaaaattgcttgggatagagttaaagatgaacgt
gaagcgctaaagaaaagatttacaatagtactggaaaaatattttgtattagaccaagca
ggtttggtgttagcgattcaaggtgctggcagggtgattgaccgtttggtgaagttaacg
aaagactttagcacagacttcttaactgaaaaattacgacgaaaagtattagattttaat
gatttagagcactttgccttgcagatcgttagtcaggaaaaagtaaaggctgaattgcaa
gaacgttacactgaaattatggttgacgaataccaggatacgaatcaattacaggaagcg
attttgcatgagattacttcgggtgacaatttgttccaggttggtgatattaagcaatcc
atttataaatttcggcaagctgatccaacattatttgcgggtaaacttgccacatatcca
tcggatacaattagtgaggtgattacacttcaagaaaatttccgctcacaacccaacgtg
acgaattttattaactatatttttgcgcaagctatgagtcgttcattaggagatattgaa
tatactggtgaagccgaattagttgctggtgcagattattatcctgaggagttacctaaa
aaggcagaattgttgctttatttagatgatgcaaatcaagatgagtcgcccgctgatgca
gaagtagatgcagaagcggacacgctagcctctgatgcaccttataccaaagcaactggg
caaattcgattgacagcgttgaaaattcaagaattgatgcaatcaaaatttgaaattttt
gatcgccaagcgcaaaagaaacgacctgtcaattacggcgacataaccatattggtacca
acgaaaggacaaaatttagatgtcttagatgtctttcgtgaaatgaatattcctatcatg
attgatgggactgagaattatttccaaaccactgaaatttcagtgattatgagtttctta
caagtgattgataatccacatcaagatattccattggtagctgtgttacgttcgccattg
tatgatattggggaaaacggcttggcgcttattcgtgcacaaacaccagaagaagatttt
tatactgcagtcaagaatttagcaaacgacgacgaaatcgatacgattggcgatatttcg
ccagcattagtgaaaaacacacaaacacaagtacaacgtttcttagcagatttagcagta
tttcgtgatttggccgtgcaaaatcaaattgtcacattgttgtgggctatctataatcga
acgggttggttggactatgttggtgggttgccttcaggtgcacaacgacaagcaaatttg
catgcgctatatgatcgtgcatcagcgtatcaaaagagtagttttgttggtttatatcaa
tttattaattacgtgacacagctacaaagtcacgataaagatttgggtgaagcagatgcc
aatgtggcgcaagacagtgtgtccttaatgacgattcatcattctaagggattggaattt
ccgattgtttttctattaaatgcgacccgcacaatgatcagtcagagggaaacacaagga
agtataattctcgatgcgcaagctggtggtgggatgaattatgttgacttacaacatcat
ttgaaattaattacaccgcaacatgagtatattgcgcaagtgaaacggcaaaatgcatat
gctgaacagttgcgtgttttgtatgttgctttaacccgtgcggagcaacaattgtttatt
gttggtgcttatgataacgtcgataaattatggcaaacttggcaacaaagtgctggtgta
acagagtggatgctgccagatacagttcgtctagccggtaaatcatttatggacttgttg
gggatgaccttaatccgccatccccaagcaccagaacaattcgcgccattacgtggttat
gatgtaaatgacgttatgcaatttgatgagatacggacaaagacacctaaaaatgcgttt
gcatttgatttagaggttattaacacgcaggatttagtcaatcgtgtagcaaattatcag
ccacttagcgatgatatagttgatacaaaagatgttacagaaacatcggcagaggaaaac
accgattggcaatctgtgctccaatttgcgtatccgtatgaaacggccacccgagcaacg
gcctatcaatctgtatcagaaattaaacgattatttgaagatcctgatttggctgaaggt
cgtcaattgttagaccgacgtttggtgacggatgatttagctggtttacgtatgactgat
gaagaattacctgaacccgatttcatgcaagaatccgcaacacgattatcttcggctgca
attggaacggcgacccatttagttatgcagcgccttgatctcacaaagggtgtccccact
gaagtagtcattagaacgctcattcaacagctagtgaatgaaaaattgattgatgataaa
attgcaccattaatttcggttgctaaaattggtagattctttaatgactcgccacttggc
aaacaaatgattcaacatgcggattcattacgacgagaagtaccattttcattgctattg
gatgctaagcggttatatcgtgcctttgatggcgatgataaagtgttagtgcatggaatt
attgacggttatttccaagtagatgatgaaatttggttgtttgattataaaacagaccat
gtatctcaacaagcagcaacgaacattttaacaaaacgctatgctggacaattaaacatc
tatgcgcaagcattggtagcaatggggttaccaatgccaaaacgattcatttacgcaatt
aatgccgaaaagttaattcggttatcgtag
DBGET
integrated database retrieval system