Weeksella virosa: Weevi_1963
Help
Entry
Weevi_1963 CDS
T01441
Name
(GenBank) helicase domain protein
Organism
wvi
Weeksella virosa
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
SNF2-rel_dom
PLDc_2
ResIII
DEAD
AAA_22
nSTAND3
TK
AAA
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADX68641
UniProt:
F0P1C7
LinkDB
All DBs
Position
2107625..2110984
Genome browser
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
MPNNFITNNKQQKTLKTRLNTLISISDELKFLVGFFYFNGWSEIYLSLQKNPQQKLKLLV
GLQVCNYLGNIIEYAEQGEEDSSRDEVFQNYLISLGFALNNEEMDTEDFYNQVGFFVQMI
EEDRLEIRKTENPNHAKLYLFQYNEEYAHNLAKNGEFITGSSNLTRSGLRNQEEFNVEIS
DYGYENAVQYFDELWERATPITEHLENRKILIDFIKNKTQVATITPFEAYCLVIKTYLDL
QNQENEEVDLDSLLEKIDLKKFSYQSDAVNQAIQMIKEHNGCIIADVVGLGKSVIASMIA
RQMNKRGIIICPPGLMGDAEKKDSGWWEYLEKFGLHNWQVYSRGIIDRIADNIEGRDFEV
VIVDEAHYFRNQDTADYEALSMICRGKKVILLSATPFNNSPKDIEALLSLFTVPGKSTIT
LEDNLKGRFSRYNYEYKQLSIIYKNWNSADDKKRKQAENIYTTIIDENLPIDIKKVKERT
KILSNEIKRTISPVVIRRNRLDLKQDYVYANEIGELSVVKDPEEVFYYLDTEQDEFYDNI
ISKYFAENGVFTGAIYQPFSYEKILSDKLDEFGNRQYNQQKNLYDFMRRILVKRFESSFG
SFEKSIERFLQVHLLVKDFIDKTGKFILDRSFIDRIKDFEIEDIEANLEKYAAGDLKRKT
PKNNEVYDISTFQRRQEFLDDIASDIQLFEAIQKRLKDLKLVEKDPKQEEIIKKIKNLLV
NEPDRKIILFSEYVDTIHHLEKRFRKEFGNDVLICDGKVSKELAKNLNSDFNAQYKGSKT
NHFKILLTSDKLSEGFNLNRAGVIINYDIPWNPTRVIQRVGRINRIGSKVYDELFILNFF
PSLKGADIVKSREIAQQKMFLIHNALGEDAKIFDEDEEPTPAALGSKINSNPEEEGEVNT
ITKIRNIFSDLQKKHPEIIAKISQLPPRVKTAKSYPEYELNVLRRKGLSLFAQTVGKEES
RAIREIDFEELLQKIECKIDEPTLKLSSVFWNLYEEIKEFKPKYKMGRSEISLEQKAMEN
LRKSHKVIKDLKDEHLNFIQMLIKDLRYYHTLSMRSIRRIGGQELTDDKKSIRSFLEEIT
YLKQHLGENYLDDIESRTKSQSKEVIIAIENNDLKELFH
NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaacaattttattaccaataataaacaacaaaaaacgctcaagaccaggcttaat
acattaatcagtatcagtgatgaattgaagtttttagtaggatttttctacttcaatggc
tggtcagaaatttatttaagtcttcaaaaaaatccgcaacaaaaattaaagctgttagtc
ggattgcaggtctgtaattatctgggtaatatcatcgagtatgccgaacaaggagaagaa
gacagctcaagagatgaagtttttcaaaattatttgatttcattgggctttgcattgaac
aatgaagaaatggatacagaagacttctataatcaagtgggattctttgtacagatgata
gaagaagacagattggaaatacgtaagacagaaaacccgaaccacgccaaattgtatctg
tttcaatacaatgaagagtatgcacacaacttagctaagaatggggaatttattacagga
agtagcaacttaactcgttctggattaagaaaccaagaagaatttaatgtagaaatttca
gactatgggtatgaaaatgcggttcaatattttgatgaattatgggaacgagcaacgccg
attaccgaacatttggaaaaccgtaaaatactgattgactttatcaaaaataaaactcaa
gttgctacgataacaccttttgaagcctattgtctggttataaaaacctacctcgatcta
caaaatcaggaaaatgaagaagtggatttagatagtttgctagaaaaaattgatcttaaa
aaattcagttatcagtcagacgcagtaaaccaagcgatacaaatgataaaggagcataac
ggttgtatcattgccgatgtagtaggtttaggaaaatcggttattgcatcaatgattgcc
agacagatgaataagcggggcattattatttgtcctcctggattaatgggagatgccgaa
aaaaaagacagtggttggtgggaatatttagaaaagttcggattacataactggcaagtt
tacagtcgtggaattatagaccgtattgcggataatattgaaggtagagattttgaagta
gtgattgtggatgaagcccattattttcgcaatcaggatacagctgactacgaagcatta
tcaatgatttgtcgtggtaaaaaagtaattcttttgtcggcaactccatttaacaattca
cccaaagatatagaagcgttattaagcttatttactgtaccgggaaaatcaacgattacc
ttagaagataatctaaaaggtagatttagccgctataattatgagtataaacaattatct
atcatttataaaaattggaattctgctgatgacaagaaaagaaagcaggcagaaaatatt
tacacaacaataatagatgaaaacttgcccatagatataaaaaaggttaaagaacggaca
aaaattttatcaaatgaaattaaacgtaccataagccctgtggtaatacgacgaaatcga
ttggatttgaaacaggattatgtttatgctaatgaaattggagaactctctgttgtgaaa
gaccctgaagaagttttttattatttagatacggagcaagatgaattctatgacaatatc
atcagtaaatattttgccgaaaatggagtatttactggtgctatttatcagccgttcagc
tatgaaaaaatattaagtgataaacttgatgaatttggaaatagacaatacaatcagcag
aaaaacttatacgattttatgcgtcgtattttagtaaaacgattcgaatcttcttttggt
tcctttgaaaaatccatagaaaggttcttacaagtacatttattagttaaagattttatt
gataagaccggaaagtttattttagatcgttcgtttattgatcgaattaaagattttgaa
attgaagatattgaagctaatttggaaaaatatgcagctggggatctcaaacgtaaaact
cctaaaaataatgaagtttacgacattagcactttccaaagaaggcaagaatttttagat
gatatagcttcggatattcaattatttgaagctattcaaaaacggctgaaagatttgaag
ttagtcgagaaagatcctaaacaggaagaaattatcaaaaaaataaaaaatcttttagta
aacgagccagacagaaagattatcctattctcggaatatgtagataccattcatcatctc
gaaaaacgatttagaaaagaatttggaaatgatgttttgatatgtgatggtaaagtatca
aaagagttggccaaaaatctaaacagcgatttcaatgcacagtataaaggttcaaaaaca
aatcattttaaaatattgctaacctcggataagctgtctgaaggatttaatttgaacagg
gctggggttattatcaattatgatattccttggaaccccacacgtgttattcagcgtgta
gggcgtattaatcgtataggttctaaagtgtatgatgagttgtttattctgaattttttc
ccatcattaaaaggagctgacattgtaaaatcaagggaaatagcacagcaaaaaatgttc
ttgattcataatgctttgggagaagatgctaagatttttgatgaagatgaagaaccaaca
ccagctgcattaggatcaaaaatcaattctaaccccgaagaagaaggagaagtaaatacc
attaccaaaatcagaaatattttttcagacttacaaaagaaacatcctgaaattattgca
aaaatcagtcagttacctccaagggttaaaaccgctaaaagttatcccgaatatgaatta
aatgtattaagacgaaaaggattaagtttatttgctcagaccgtagggaaagaagaaagt
agagcaatcagagaaatagactttgaagaacttttacaaaaaatagaatgtaaaattgat
gaaccaacattaaaactttcatctgttttttggaatttgtatgaagagataaaagagttt
aaacccaaatataaaatgggcagaagtgaaatttctttagaacaaaaagcgatggaaaat
ttaagaaaatcacataaagtaattaaagatttaaaagatgaacatctaaatttcatccaa
atgctaataaaagacttacgttattatcatacgctttcaatgagaagtataagacgtatc
ggcggtcaagaattgactgatgataagaagtctatccgttcttttttggaagaaataaca
tatctaaaacaacatcttggagaaaactatctggatgacatcgaatccagaacaaaaagc
caaagtaaagaagtaataatagctattgagaacaatgatttaaaagaattatttcactaa
DBGET
integrated database retrieval system