Weissella viridescens: IE337_04950
Help
Entry
IE337_04950 CDS
T06991
Name
(GenBank) KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein
Organism
wvr
Weissella viridescens
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_lysozyme2
Choline_bind_1
YL1_C
Choline_bind_3
KxYKxGKxW_sig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOD86795
LinkDB
All DBs
Position
complement(996495..1000553)
Genome browser
AA seq
1352 aa
AA seq
DB search
MSHIKMYKSGKFWVSSAVATLGAAAALVGGAGTTAQADATDANAQKTVDGATTVNEPQTD
ETGRVQVQINAAMAQNPTNAMSTTDETQTQAETVTPEVNSEVETTTKEAEVQETQVESST
DTQSATKEETADVNSDAQSVATDTPAKADDVKSNDQSIETETQDVQADDHEVKSDSDDTA
TDSEAVKSDDQGTKTGSDNATDDVKLDDQGTKTGSDNATDDVKSDDQGTKTDSDNATDDV
KSDDQENITEDQKPTTEVNTPEASNKTAEPKSVTPAPVVKKKTVAKPKVATPAKATTAKA
KPVLAAQTYNYSATQKANAIYIYKFFSARGWSRNAIAGMLGNMAVESYILPDITEIGGGG
GYGLVQWTPASKLINWCRANGLDYRTLYGQCMRIQYEFTNGIQYYPIWSSLTASQYMKSK
MSAFDLAMVFMNNYERPYDTYQPNRGNIANYWYNFLASQEKKTGYHNENGKTYYYDNNGN
KISGFRKFGNNQIEYYNPTTKVRLQNGYVTTNGNTYFFGSNGAAITGFRWGAPNPKTGYR
ALQYYDTKTHIQYKNKWHTQNGKTYFFDGKGWAQDGFRTGGANPKTGYRALQYFDPTTRV
QFKNKWLTTGGKTYFFDNRGWATEGFRWGAPNPKTGYRALQYFDPTTRVQYKNKWVTSNG
KTYFFNGKGWAQDGFRWGGANPKTGYRAFQYFDPTTRIQYKNKWLTVGGKTYLFDNRGWA
VEGFRDAEVNPKTGVRGLQYFDPTTHVLYKNKWLTTGGKTYFFNEKGLATEGLRWGGANE
KTGYRALQYFDPTTRVQFKNKWLTTGGKTYFFDNRGWATEGFRWGAPNPKTGYRALQYFD
PTTRVQYKNKWVTSNGKTYFFNGKGWAQDGFRWGGANPKTGYRAFQYFDPTTRIQYKNKW
LTVGGKTYLFDNRGWAVEGFRDAEVNPKTGVRGLQYFDPTTHVLYKNKWLTTGGKTYFFN
EKGLATEGLRWGGANEKTGYRALQYFDPTTRVQFKNKWLTTGGKTYFFDNRGWATEGFRW
GAPNPKTGYRALQYFDPTTRVQYKNKWVTSNGKTYFFNGKGWAQDGFRWGGANPKTGYRA
FQYFDPTTRIQYKNKWLTVGGKTYLFDNRGWAVEGFRDAEVNPKTGVRGLQYFDPTTHVL
YKNKWLTTGGKTYFFNEKGLATEGLRWGGANEKTGYRALQYFDPKTKVQYKNKWLTINGN
TYFFNNKGWATEGLRWGGANEKTGYRALQYFDPTTRAQVKNREMKLDGKTYYFDNKGWAL
DGLIIGAANPTTGARTIKYYDPKTRAQVFNQHVKVSGVVYYMNANGVAANGLITMPDGSF
EYYQDYKQVTNRTLTINGKRYTFDANGRGKLA
NT seq
4059 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcacattaaaatgtataaaagcggtaagttttgggtgagttccgctgttgccaca
cttggtgcagcagcagccctagttggcggtgctggtacaacagctcaagccgatgcaacc
gatgcgaatgcgcaaaaaacagttgatggtgctacgaccgtaaacgaacctcaaactgat
gaaacaggccgtgtgcaagtgcaaattaatgctgcaatggcacaaaatccaacgaatgcg
atgtctacaaccgatgagacacaaacgcaagctgaaacagttacaccagaagtcaattct
gaagtagaaaccactacaaaagaagcagaagttcaagagacacaggttgaatctagtaca
gatacacaaagtgccacaaaagaggaaactgctgatgtgaactcagatgcgcaaagtgtt
gccacagatacaccggccaaagctgacgatgtaaaatcaaatgatcaaagtattgaaact
gaaacgcaagatgtacaagcagatgatcatgaagtgaagagcgattcagacgataccgcc
actgattcagaagctgtgaagtcagatgatcaaggtacaaagactggttcagataatgct
actgacgatgtgaagttagatgatcaaggcacaaagactggttcagataatgctactgac
gatgtgaagtcagatgatcaaggcacaaagactgattcagataatgctactgacgatgtg
aagtcagatgatcaagagaacattactgaagatcaaaagccaacaacagaggttaacaca
cctgaggcgtcaaataaaacagcggaacctaaatcagttacaccggccccagttgttaag
aaaaagactgttgctaagcctaaagtggccacaccagccaaggctacgacagcaaaggca
aagcctgtcttagctgcacaaacatacaactattcagctacacaaaaagccaatgctatc
tatatttacaagttcttttcagcacgtggttggtcacgtaacgccattgctggaatgctt
ggaaatatggctgttgaaagttatattttgccagatatcactgaaattggtggtggtggt
ggctatggtctagtgcaatggacgccagcaagtaagctaattaattggtgtcgtgcgaat
ggcttagattaccgaacgttgtacggacaatgtatgcgaattcaatatgaatttactaat
ggtattcaatactatccaatctggtcaagtttaacagctagtcaatatatgaagagtaaa
atgtcggcatttgacttagcaatggtgttcatgaataactatgaacgtccatatgatacg
taccaaccaaatcgtgggaatatcgctaattactggtacaatttcttagctagtcaagaa
aagaagaccggctaccacaatgaaaatggtaaaacttattactacgataataatggaaat
aagattagtggattccgtaagtttggaaacaaccagattgaatattacaatccaacaact
aaggtgcgtcttcaaaatggatatgtaacaacaaatggaaacacatacttctttgggtca
aatggtgctgctataactggattccgttggggtgctccaaatccaaagactggttatcgt
gcgttgcaatactacgatacaaagactcacatccaatacaagaataagtggcatacgcag
aacgggaagacttacttctttgatggtaagggttgggctcaagatggtttccgtactgga
ggagccaatccaaagaccggatatcgtgcgttgcaatactttgatccaacaacccgtgtt
caatttaagaataagtggctaacaactggtggtaaaacttatttctttgacaacagaggc
tgggcaactgaaggcttccgttggggtgctccaaatccgaagacgggataccgtgcacta
caatacttcgatccaacaacgcgtgttcaatacaagaacaagtgggtaacatcaaatggg
aagacttacttctttaatggtaagggttgggcccaagatggtttccgctggggtggtgca
aatccaaagacgggataccgtgctttccagtactttgatccaacgacgcgtattcaatac
aagaataagtggttaacagttggtggaaagacttacttattcgataatcgaggttgggcc
gttgaaggcttccgtgatgctgaagttaatcctaaaactggtgttcgcggcttgcaatac
tttgacccaacaactcacgtactatataagaataagtggttaacaactggcggaaagacc
tacttctttaatgagaagggacttgccactgaaggattacgttggggtggtgccaatgaa
aagaccggatatcgtgcgttgcaatactttgatccaacaacccgtgttcaatttaagaat
aagtggctaacaactggtggtaaaacttatttctttgacaacagaggctgggcaactgaa
ggcttccgttggggtgctccaaatccgaagacgggataccgtgcactacaatacttcgat
ccaacaacgcgtgttcaatacaagaacaagtgggtaacatcaaatgggaagacttacttc
tttaatggtaagggttgggcccaagatggtttccgctggggtggtgcaaatccaaagacg
ggataccgtgctttccagtactttgatccaacgacgcgtattcaatacaagaataagtgg
ttaacagttggtggaaagacttacttattcgataatcgaggttgggccgttgaaggcttc
cgtgatgctgaagttaatcctaaaactggtgttcgcggcttgcaatactttgacccaaca
actcacgtactatataagaataagtggttaacaactggcggaaagacctacttctttaat
gagaagggacttgccactgaaggattacgttggggtggtgccaatgaaaagaccggatat
cgtgcgttgcaatactttgatccaacaacccgtgttcaatttaagaataagtggctaaca
actggtggtaaaacttatttctttgacaacagaggctgggcaactgaaggcttccgttgg
ggtgctccaaatccgaagacgggataccgtgcactacaatacttcgatccaacaacgcgt
gttcaatacaagaacaagtgggtaacatcaaatgggaagacttacttctttaatggtaag
ggttgggcccaagatggtttccgctggggtggtgcaaatccaaagacgggataccgtgct
ttccagtactttgatccaacgacgcgtattcaatacaagaataagtggttaacagttggt
ggaaagacttacttattcgataatcgaggttgggccgttgaaggcttccgtgatgctgaa
gttaatcctaaaactggtgttcgcggcttgcaatactttgacccaacaactcacgtacta
tataagaataagtggttaacaactggcggaaagacctacttctttaatgagaagggactt
gccactgaaggattacgttggggtggtgccaatgaaaagaccggatatcgtgccttgcaa
tacttcgatcctaaaaccaaagttcaatataagaacaagtggttgacaattaatggtaat
acctatttctttaataataagggctgggctactgaaggattacgttggggtggcgcaaat
gaaaagactggataccgtgctttgcagtactttgacccaacaacgcgtgcacaagttaaa
aatcgtgagatgaagcttgatggaaagacctactactttgacaataagggttgggctttg
gatggcttaattattggcgctgcaaatccgacaacgggtgcacgtacaatcaagtattat
gatccaaagactcgcgcacaagtctttaaccaacatgtgaaggttagtggtgttgtttac
tacatgaacgcaaatggtgtggcggctaatggtttgattaccatgccagatggtagcttt
gaatactatcaagactacaagcaagtaacaaaccgtactttgactattaatggaaagcgt
tatactttcgatgccaatggacgtggaaaactagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
