KEGG   Xylocopilactobacillus apis: KIMC2_08050
Entry
KIMC2_08050       CDS       T09716                                 
Symbol
mfd
Name
(GenBank) transcription-repair-coupling factor
  KO
K03723  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:5.6.2.4]
Organism
xak  Xylocopilactobacillus apis
Pathway
xak03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:xak00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    KIMC2_08050 (mfd)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:xak03400]
    KIMC2_08050 (mfd)
Enzymes [BR:xak01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     KIMC2_08050 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:xak03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     TRCF (transcription-repair coupling factor)
      KIMC2_08050 (mfd)
SSDB
Motif
Pfam: DEAD TRCF CarD_TRCF_RID UvrB_inter Helicase_C ResIII Cas3-like_C_2 UB2H REGB_T4
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDR56243
UniProt: A0AAU9DMV5
LinkDB
Position
834901..838365
AA seq 1154 aa
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NT seq 3465 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system