Xenorhabdus bovienii SS-2004: XBJ1_0342
Help
Entry
XBJ1_0342 CDS
T01186
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein; putative exported protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
xbo
Xenorhabdus bovienii SS-2004
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xbo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
xbo02000
]
XBJ1_0342
Transporters [BR:
xbo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
XBJ1_0342
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBJ79492
UniProt:
D3UYW4
LinkDB
All DBs
Position
349583..353326
Genome browser
AA seq
1247 aa
AA seq
DB search
MTFLLLVGLLLITIVGLVGTQTGLHFMINSAARWVPGLDIANVSGGWRDLTLKGVKYQMP
GVSVSADNLYLSLRLSCLKHSHLCVNALTTEGVAVSVNTADLPPSEKSPASEPLTELKTP
YPISLDLLSLKNIHVKVDDIVIALDEFKTGAQWREKQLTLKPTKISNLLVALPKTRPEQS
GTVQKGKQKPEPEKSLGETLKALFAKPFLAELPNVPIPLDIMAENIHGSQLRLTGDTDIT
INDLRLQASNQGQQVDVKTFSVSAPEGSLSLQGTAGLSEQWPVKLVIKSNTNLNELKGQK
LDLTLNGALLQQLNLALHLSGPIIANLSAQTELAKAGLPVRLTLESKQLQWPLTGEPEYR
LDGVKLRLNGKASGYDLSLRSDIKGRDIPPALLMLDAKGNEELLRLTRLRLSALQGKAEI
TGIVDWSKAISWNANLILDGINTAKQWPEWPAKMNGKMAIRGSLYGGSWQLQIPEIALDG
YVKQNIVKAHGKASGNAAGQWNIPQFDLTFGRNRLNVQGQLTDEKWKLDGEINAPQLNGL
LPGLSGVVIGNVKLRGNMKAPQIVADLNARNVRWQNDLKVDSATIKGDVRSAEQIEGQLS
VAVHQLKQADLIINNLMLNAKGTEKQHDLHLNIEGNPVSGQLALSGRFDRSQERWQGTIN
NTYFDTPVGEWRLNKAMVIDYLNPQQKVTIGTHCWLNPNAQICVPKPIEAGASGHAEVVL
KRFDLAMIQPFLDKMTQVKGVFSGNANVKWTAGQALPQAKVVLQGNGVQLHQMVEGAALP
VDFETLTVNAGLTNGKANVAWLFKLAGNGQLNGNVQVDDLEGRRKLSGNVDIRALSLKLI
KPILGKDEKAEGGLNANLRFGGNVKNPLLFGQLKTDDLQIVSHWLPFDITQGQLAIYFDG
VRSGLEGVIKTPKGQLNLNGNADWRNLNAWYAKIAANGEKLRVTVPPMVKIDVSPNLVLE
ATPDLLKLDGNVDIPWARITVQELPESAVGISSDEVMLDKNLQPIEKKKSSILVKSNLNI
RIGDDVRLNAFGLKAQLKGVLKVIQDKQGLGLNGQIDIPDGRFHAYGQDLLVRKGTIIFS
GPPEQPMLNIEAIRNPDSTANKVVAGVKVTGLADKPKVEIFSEPAKSQQEALSYLLRGEG
LEKSGSDNNQMTSMLIGLGVSQSGQLVGKIGETFGVSDLALDTQGVGDKSQVVVSGKITN
NLQVKYGVGIFDSLATLTLRYRVMPRLYLDAVSGIDQALDLLYEFEF
NT seq
3744 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttttctgctgcttgttggcctgctgctgataaccattgtgggattggttggcaca
caaaccggactgcattttatgattaacagcgcagcacgttgggttcccggactggatatc
gccaatgtcagcggaggatggcgtgatttaaccttaaaaggtgttaaatatcagatgccg
ggagtgagtgttagtgctgacaatttatacctttcgctacgtttatcctgcttgaaacac
agtcacctgtgtgtcaatgcgttaactacggaaggcgtggcagtctcggtgaatacggct
gatcttcctccatcagaaaagtcgcctgcatcagagccattgactgaattgaaaacaccg
tatcctatttcactggatttgctttctttgaagaatatccacgtcaaggttgacgatata
gtgattgcgttggatgaatttaaaacaggggcgcagtggcgggaaaaacagctgacattg
aaaccaacgaaaatcagcaatctattggttgctctgcctaaaacgcggcctgaacaaagc
ggtacagtgcaaaagggcaaacaaaagcctgaacctgaaaaatcattgggtgaaaccttg
aaagcgctatttgccaaacctttcttagctgaattgcccaatgttcctattcctctcgat
attatggcagaaaacattcatggcagtcagcttcgcctgacaggtgatacagatatcacg
attaatgatctacggttgcaagccagtaatcagggacagcaggttgatgtgaaaaccttc
agtgtaagtgcaccggaaggctcactttcgctacaggggacggcggggctatctgaacag
tggccagtcaaactggtgattaagagcaatacgaatctgaatgaactaaaaggacaaaag
cttgatttaaccctgaatggtgctctgttgcagcagcttaatctggcattgcatctttca
ggacctattattgccaatctgagtgctcagactgagttggcgaaggcgggtttgcctgta
cgcctgacattggaaagcaaacaacttcagtggccattgacgggtgaaccggaatatcga
cttgatggtgttaagcttcgactgaatggcaaagccagtggctacgatctctccctccgt
tcagatattaaaggtcgtgatattcctcctgcattactaatgttggatgcgaagggtaat
gaagaattgctcaggctaacccgtctgcgtctgtctgcattgcaggggaaagcggagatc
actggcatcgttgactggagcaaagcgattagctggaatgcgaacctgattctggatggc
atcaataccgctaaacaatggccagagtggccagccaaaatgaatggcaaaatggcaata
cgcggtagcttgtatggcggcagttggcaactccagatccctgaaattgctcttgatggt
tatgtgaaacagaatatcgtcaaagcacatggcaaggcgtctggcaatgcggcgggacaa
tggaatattcctcagtttgacctcacttttggccgtaataggctgaatgttcaagggcag
cttacagatgaaaagtggaagttggatggtgaaattaatgcgccacagttaaatggatta
ctgccaggattgtccggtgtggttatcggtaatgtgaaactgcgcggtaacatgaaagca
ccacaaatagtggcagatttaaatgcacgtaatgtgcggtggcagaatgatctgaaagtg
gatagcgccacgattaagggagatgtgcgctcggctgaacagattgaaggacagctctca
gttgctgttcatcaattgaaacaggcggatttaatcatcaataatttgatgctaaatgct
aagggcacggaaaagcagcatgatttacatttgaacattgagggcaaccccgtatcaggt
caattggcactcagtggtcgctttgaccgcagtcaggaacgctggcaaggaactatcaac
aatacctactttgatactcctgtcggtgagtggcgcctaaataaggcgatggtcattgat
tacctgaatccacagcagaaagtaacaataggaacacattgctggcttaacccgaatgca
cagatctgtgttcccaaaccgattgaggcgggagccagtggccatgctgaagtggtgctt
aaacgttttgatttggccatgattcagccattccttgataaaatgactcaagttaaaggc
gtgttcagcgggaatgccaatgtcaaatggacggcgggacaggctttgccacaggctaaa
gtcgtcttgcaaggaaatggggttcagcttcaccaaatggttgagggagctgcattacct
gttgattttgaaacgttaacagtgaatgcaggactaacaaatggtaaggcaaatgtggca
tggctatttaagctggcaggcaatgggcaattaaatggcaatgttcaggtggatgatctg
gaaggccgccgcaagctatctgggaatgtggatattcgagctctttctttaaagctgatt
aaaccgatcttgggtaaagacgaaaaagcggaaggaggcttgaatgccaacctgcgtttc
ggtggtaatgtaaaaaatccgctgttgtttggtcagcttaagacggatgaccttcaaatc
gtaagtcactggttaccttttgatatcactcaaggccagctagctatctattttgatggt
gtccgctctggcttggagggtgttatcaaaacgcctaaagggcagctgaaccttaacggc
aatgctgactggcgtaatttgaacgcatggtatgccaaaattgccgcgaatggtgaaaaa
ttgcgtgtgacagtgccgccaatggtgaaaattgatgttagccctaatttggtacttgaa
gctacgcctgatttactgaaacttgatgggaatgtggatattccgtgggcacgcattacg
gtgcaggaattaccagagtctgctgtgggtatttcttctgacgaagtcatgctagataaa
aatctccagccgatagaaaagaaaaaatcgtccattctggttaaaagtaacttaaatatt
cgcattggtgatgatgtccgtttgaatgcatttggtctgaaagctcaacttaagggggtc
ttgaaagtcattcaggataaacaggggctggggttgaatggtcaaattgatattccagat
ggtcgtttccatgcctacgggcaggatttgctggtacgcaagggcacaattatattttcc
ggcccgccggaacagccaatgctgaacattgaagcgatccgtaaccccgactcgacggcg
aataaggttgtcgctggtgtgaaagttacgggattggcggataaacccaaagttgaaatt
ttctctgagccagcaaaatcacagcaggaagcactgtcttatcttctgcgtggtgaaggt
ttggagaagagtggttctgacaataaccaaatgacttccatgctaattggtttgggcgtt
tcccaaagtggtcaattggttggcaagattggtgaaacttttggtgtttctgatttagct
ttagatactcagggtgtgggtgacaaatctcaggttgtcgtcagcggcaagataaccaac
aacttgcaggtgaaatacggtgttggtatttttgattctctggcgaccttgacattacgc
tatcgtgtaatgccaagattgtatctcgatgcggtatctggtattgatcaggctttagat
ctgctctatgagtttgagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system