Xenorhabdus budapestensis: HGO23_09700
Help
Entry
HGO23_09700 CDS
T07176
Name
(GenBank) trypsin-like serine protease
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
xbu
Xenorhabdus budapestensis
Pathway
xbu02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xbu00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
HGO23_09700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Trypsin
Big_13
Big_6
NtA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTL41542
LinkDB
All DBs
Position
2156925..2161985
Genome browser
AA seq
1686 aa
AA seq
DB search
MMIIRVIFILLLLFHCSNSFSDSALKSLPLKAIAGGEESCKDINSDKCKSWVVSIYYVDQ
KNEEKMLCTGSLIAPNYVLTAAHCEEVKAKNYYVISSYDKSKKVTASTYNFIKMEIPGAF
GPDPHDLAILKLDKPLELDGKYGRIRRFFNYDEAYEKLDSSYYQSSIYGYGYRGIDETTG
EPKRNSDNAQYYADVKIVFPAFDYFGNQGLIIAASKKEDLKPGVIQHGDSGGPIIWNDTI
IGVSSFGFEVASVKQKTDNKRDYPFFVVSDVTGKYNKLGFIDKFFPGKWFSQTMKQIWID
TPDWNAHLRKRDEDILVKGWGRPKSVIELIYSINDGQKKSFKCKDVVDNNGEWKCNIPNN
DFFTEINKEEEHNVIITAKESSDNLSESVSWREDSVQAKISSISKEFGIVYPADKSTVFT
KDFTIRGYADPGSTVELTLQSTVGGDFYTQDELCKGITDSQLIETTDYGFWSCTVNYSVI
EESEELSSETEWKITAIQKTDKLNIYDQVNILFKPKEIKRPNIKLIKDNLYSKYSKMLPF
DLGLDNAASFFCFFNQSYLDCNDVNDKMSRVYIPNKKVDGLNAGLRQFSIFAIQKIEHVD
PLDPVLWNRASELGGYLSPTFKDKNDINNPREIDSKDQQNQSFSGYGGDRQKYIWPNGDI
ILPSEYSINIKEEDKNIFSPIKLGEHRLFSSIPIYSGQNNLPVWDISLPYYSLKDGLYYV
EVADKYHPLGLEKFKKYWAGSPPERSYFRITTPEIKITTPSTGETSTVGTSSFLSGSSNV
PGDEVDVKRRRIDLFSPKLEGGNQGLVKETSICTGAVVSDNGNWQCDRPIIFSKGTYELT
AELIKEGKVVATDVTRLTVKDKNDDDDNPEEKLEIDNPKDNSTVDPDNPIRLSGKYGGSG
GSVGGGFGGFLSSLTGAVFGGVESLVGSALSSGLGFFWEFTIMPEAISGGDTYTLGMQET
KNGVHVGDPVILHFTIPIRITSPAKGAQYRLYDGITIEGQGSPGQLVLVAATKEFLPQGK
MTLPMSNEGIICFVTVDSTGKWACSHQPALTAINEGVFSLYAAQYKKTSSTEFGGTYERT
SQVTRKYEVTKTKIQITHPSHGAKITTLPFTIAGTGEKGAKVYIKGFGGTKDCNTAVDAS
GKWSCGPYQPEGGKYSVAAEQFIDNTLNSSSSVSFEVQTKTIKPVVITQPHNGGVYQHLE
NILPKGTGEPGTVVCLDKKALSQICQNGVTVDDKGHWEWIDGLDTSVRGEQKLAATAFLD
KIRQSTAKVTFEIVPAPGEIKLTVKSPKEAEIIKTPSYIFSGTMPGNAKTVTVKAVGGHD
DCSAKLNKEDYTWTCGPYSSVPGDYDVTIVDDAGSQIIRGFKVRYGANLQMRVLRPAEGE
QIATPTYAINGKGQAGARITVSLAGKQICEVDVDENQNWVCPDEIESKPGDYRILAQQWV
DNEPSGKPVTRNFEVIYISDITINPTAKPICTASSASKIAKSSEEFTPMMKSNGTISIPI
TGTATKGAYISLKATSENGDSRNCGPVQVSKTDGKWSCSLHNVQPGTYQIEATQSITVND
QLHKKMKEGNVDASVLSISVPSEGAVKVSYHPPIDVKVTGNALPKIKVSYNVQNDGDFFC
HRTLLPKEPFPPRDTKKGSIVADDQGYWHFDAKLSQFGKQNITVSAQFCGQFIQVERKFC
YRPYMR
NT seq
5061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgattattagagtaatatttatattgctacttttattccattgtagtaattcattt
tctgatagtgcacttaaatcgctacctttaaaggctattgcagggggagaagaaagttgt
aaggatattaacagcgataaatgcaagtcttgggtcgttagtatttattatgttgatcaa
aaaaacgaagaaaagatgttatgtaccggctcattgattgcaccaaactatgttctaacc
gctgcacattgtgaagaagtaaaagctaaaaattattatgtgattagttcatatgataaa
agtaaaaaagtcactgcatctacctataattttataaagatggaaattccgggggcattt
ggaccggatccgcatgatttagcgattttaaagctggataaaccgttagagttggatgga
aaatatggccgcattcgtcgtttcttcaattatgatgaagcttatgaaaaattagatagc
agttattatcaatcctctatttatgggtatggttatagaggaattgatgaaacaacaggc
gagccgaaaaggaatagcgacaatgctcagtattatgctgatgttaaaattgtttttcca
gcttttgattattttggcaaccaagggctgattatagcagcaagtaaaaaggaagattta
aaaccaggtgttatacaacatggggattccggtggtccgattatttggaacgatacaatt
attggagtgtcttcctttggatttgaggtagctagtgtaaaacaaaaaactgataataag
cgtgattatcctttttttgtcgtttcggatgttactgggaagtataataagctcggtttt
atcgataaattttttcctggcaaatggttttctcagacaatgaagcagatctggattgat
accccagattggaatgctcatttaagaaagagagatgaagatattcttgttaagggatgg
ggaagaccaaaaagtgtaatagaattaatttattctattaatgatggacaaaaaaaatca
tttaaatgtaaagatgttgttgataataatggagaatggaagtgtaacatcccgaataat
gattttttcactgaaattaataaagaagaagaacataatgtaattattacagctaaggaa
tcatctgataatttatcagaaagtgtatcgtggagagaagatagcgtacaagcaaaaata
tcttccatttcaaaagagtttggtattgtttatccagcagataaatcaacggtatttacg
aaggattttacgatacgtggatatgctgatcctgggtcaacagttgaacttacattgcaa
tctactgtaggcggtgatttctatacacaagacgaactatgcaagggaataactgatagt
cagttaatagaaacaacagattatggattttggtcatgtactgtaaattactcagttatt
gaagaatctgaagagcttagtagtgaaacagaatggaaaataacggcgattcaaaaaact
gataaattaaatatttatgatcaagttaatatactgtttaaacctaaagaaattaaaaga
ccaaatattaaactaattaaagataacttatacagcaagtacagtaaaatgttacctttt
gatctgggactagataatgccgcaagttttttttgtttttttaatcagtcatatttagac
tgtaatgatgttaatgacaagatgagtagagtttatattcctaataagaaagtagatgga
ttaaatgccgggttacggcaattcagtattttcgcaatacagaaaattgagcacgttgac
ccgcttgatccagtcttatggaatagagccagtgaactaggagggtatttaagcccaaca
tttaaggataaaaatgatattaataatccgagagagatagattccaaagatcaacaaaat
caatcattttctggctatggcggtgataggcaaaaatatatttggccaaatggtgatata
attttaccatcagaatattccataaacattaaagaagaggataaaaatattttttctccg
ataaaattaggtgaacatcggttattttcttctattccaatatattctgggcaaaacaat
cttcctgtttgggatatttctcttccatattattcattaaaagatggactttactatgtt
gaagtagcggataaatatcatccattgggattggagaaatttaaaaaatattgggcaggt
tcacctcctgaaagaagttatttccgaataacaactcctgaaattaaaattacaactccc
tctacaggtgagacaagcacagtgggtacttcaagttttttatcaggtagttctaatgtt
cccggagatgaagttgatgtcaaaaggcgcagaatagatcttttttcaccaaagttggag
ggaggcaatcaaggacttgttaaagagacctctatctgtacaggtgctgtggttagtgac
aatggtaactggcagtgcgacagaccaatcattttttctaagggtacttatgaactcact
gctgaattaattaaagaagggaaagtggttgccacagatgttacacgtcttactgttaaa
gataaaaatgatgacgatgacaaccctgaagaaaaacttgaaatcgataatcccaaggat
aattcaactgttgatccggataacccaatccgtctttctggtaagtatggtggttctgga
ggtagtgtaggcggcggatttggcggtttcttaagtagtttgaccggagcagtttttggc
ggtgttgaatctttggttggttctgccctcagcagtggtcttggcttcttttgggagttt
acgatcatgcctgaggctatttcaggcggagatacttataccttagggatgcaggaaact
aaaaatggggtacacgtcggagatcctgtcattttgcattttactatccctatacgtatc
acatctcctgccaagggagcgcaatatcgtctgtacgacgggattaccattgaaggccag
ggaagtcctggtcagcttgttcttgtcgccgcgacgaaagagtttctgccacaaggaaag
atgacattaccgatgtctaatgagggaataatttgtttcgtcacggttgattcaaccgga
aaatgggcttgttctcatcaacctgcattgacggcgattaatgaaggggtattttctctg
tatgccgctcagtataaaaaaacaagttcgacggagtttggcgggacttatgaaagaact
tcgcaagtgacgcgcaaatacgaagtcaccaaaacaaaaatacagattactcacccttct
catggagcaaagataacgacgctgccttttactattgcaggtacgggtgaaaaaggggct
aaggtatatatcaaggggtttggaggcactaaagattgtaataccgccgttgacgcatca
ggtaaatggtcttgtggaccttatcagccggaaggggggaaatattctgttgcagcagag
cagtttattgataacacattgaactcaagttcatctgtttcttttgaagtacaaaccaaa
accattaagccagtggttatcacacaaccacacaacggcggcgtgtatcagcatctcgaa
aacattctgcctaaaggcaccggagagccgggaacggtagtgtgtctggacaagaaagcg
ttgtcacagatctgtcagaatggagtcacagtggatgataaagggcattgggaatggatt
gatggtttggatacttccgtcagaggagaacaaaaactggcagctacagcctttttggac
aagataaggcaatccaccgcgaaagttacatttgagatagttcctgctcccggagaaatc
aagctaacagtgaaatcccctaaggaagctgaaatcataaaaacaccttcatatatcttt
agtggtacgatgccgggtaatgcaaaaaccgttacggtaaaagcagttggcggtcatgat
gattgctctgcgaaactcaataaggaagattacacctggacatgtgggccttatagttct
gtgccgggggattacgatgtgacaattgtggatgatgcaggctctcagattattagaggt
tttaaagtgcgttatggggctaatttacaaatgcgtgtgcttaggcctgcggaaggggaa
caaattgcgactccgacgtatgctatcaatggtaaggggcaggcgggggcccgtatcaca
gtttctcttgccggtaagcaaatctgcgaagttgatgtggatgaaaatcagaattgggtt
tgtcctgacgaaatcgaatccaaaccgggagattataggattttggcacagcaatgggta
gataatgagccttcaggaaagccagtaacacgtaattttgaagtgatttacatatcggat
attactattaatcctacagctaaaccgatctgtacagcttcaagtgcaagtaaaattgca
aaatcatcagaggaatttactcccatgatgaaaagtaatgggactatttctattcctatt
acaggaacagcaacaaaaggtgcttatatttctttgaaagctacatctgaaaatggagat
tctcggaactgtggccctgtacaggtttcaaaaacggatggtaaatggagttgtagtcta
cataatgtacagccgggaacatatcagatagaagccacacaatctattacggttaatgac
cagcttcataaaaaaatgaaagaaggtaatgttgatgcgtctgttttgagtatttcagta
ccgtcagaaggggctgttaaagtttcatatcatcctccaatagatgtgaaagtaacggga
aatgcgctgccaaaaataaaagtttcatataacgttcagaatgatggggattttttttgt
catagaactcttttacctaaagagccctttccacctagagatactaaaaaaggaagtata
gtggctgatgatcagggatactggcattttgatgcaaaactcagtcaatttggaaagcaa
aatataacggtttctgcacaattttgtgggcaattcattcaggttgaaagaaagttttgt
tatcgtccatatatgagatga
DBGET
integrated database retrieval system
