Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals): 124454589
Help
Entry
124454589 CDS
T08024
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
xen
Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals)
Pathway
xen04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xen00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
124454589
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xen00536
]
124454589
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xen00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
124454589
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_2
EGF_MSP1_1
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124454589
NCBI-ProteinID:
XP_046861319
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2868 aa
AA seq
DB search
MVCAKVLRLFILLILSVSVIPAISTKKAHRIRRSGPNVCGSQCCSGWQSAQRGRSGQGLC
ILPICNVNCGTGICVSPNLCLCEDGQTASQCTQTGCKAFCLNGGTCKDDKCICVQGYEGR
FCENPTCDKPCLNGGECIRPNTCACPPGFAGPECQSDLRQGPCFKEIKDSKCSGQITTLL
CTKEMCCATVGKAWGQPCEACPDKPAPCAIGYVPNFATRECLDIDECKAVPGVCPANVKC
INTVGSYRCGKCASGFTFNDQLKRCVKPTVTPAVRKDLCFRQILSDNCILPLSNNLTKSS
CCCGEVAGAGWSSNCLTCPLQDSSEYDTLCGNLGECSFEGDVCGGNIGECRTTESGLTCV
CAIGYNYDPDQKLCVDVDECDGGGLICTNALCYNTPGSFRCDCKLGFVPDPFDRLRCTRT
SVRISTPPLGLTNPDSPTPSPPVSSTPSGVCSRVGQRCDNGECVRVDGVIKCRCVSGFND
TTGKCEDVDECQEDSNVCENGMCINEIGGYRCQCAAGYITSSDKKSCVDRNECEESSKCS
NGRCINTKGAWRCTCNQGFTLSDDKKSCIDNDECTTIADVCMNGRCINTAGDYECRCNTG
YTTSTDKHMCLDTMVSMCYAKYDNNVCSQALFRSLTISQCCCGKDNTGESRRAWGSPCMA
CPVPDTDEYTKVCVNGAGKDSGGKDVDECSNNVGSQTVLCENGQCRNTNGDYSCDCNVGY
RRTTDSKTCNEINECRENPSLCNRGRCENSPGSYRCVCPAGFVFDSRTRGCEDVNECSNK
GQCVDGTCVNTIGSFLCRCPQGFTLDSNGRYCRDLRKGKCWRFISDTNVCEDNVNGDVTR
EVCCQTLGKGWGSPCQKCDTIGKRCRSGFLYDNFTCVDIDECQAFPGICRNGRCLNTPGS
YQCVCSEGLTLDESKSVCLDLRDGVCYQAVTRDQCTQPVSGLYKKDICCCSVGAAWGRPC
QECPLRNSREFNELCRQTTLTVFDECTVFPDICINGECIDTSGSFLCECRSGFALDQTGK
NCTDINECQITPDLCGNGTCINTAGGFRCNCREGFKNAPMMMEVCIDVNECDDLPNPCQG
GTCVNTIGSFKCECPTGKRMDSSGLMCQDINECAENSFICPNGNCQNFMGGYQCACFPGF
VSSDDMKSCIDVNECETENGQCEATCENTIGSYRCSCPPGMRLRLDERTCGDIDECVETP
NICGIGNKCQNVHAGHECICSDAYALSEDRKSCIDIDECITDPNLCRNGQCQNLLGSYQC
ICPRGFFIDETTSVAVCSDVNECESDEINDCGRNSFCMNTIGSYSCSCLNGFRKIANICR
DVDECRESELRNICGNNSQCRNTDGSYSCECRQGYFLASDGACKDVDECRILDNVCANGK
CLNLPGSYQCDCDFGYLQTFNEKGCEDLDECEVMKEFCHHGRCENIPGSFQCICDKGFQL
NRYNNNCTDTNECQESGMCLNGRCVNEMGKYRCECDEDFVPNPTNTACIDTRKGNCHLVK
DSETDSCSYLITDSVLRSICCCSVGTTWNDCEECPKNGTDEYRHLCPSVGGYIVDPNTTS
LIDIDECKFPRICVDGTCTNTLGSFMCTCSKGFEYNHEIGVCEDINECEIDRFICGFTGV
CINNEGSYECQCPPGEAMIGTVCIDERPQLCFGDKQDLSNVESLFPGPSCNESITYRPIT
RTECCCSKGTAYGPPDMCKLCPLPLTDEYYALCAIVRPTPTPIRGIGGTAFPPGGTPGVI
PITDVDECSFLRNPCGMGTCRNTYASYECDCEKGFAVKNGNPRCEDQNECLLNPCFGGEC
KNTFGSFMCSCEVGYVVDETGVNCVDHNECHLNDTCVNGNCINEDGGYRCECDQGYQPIR
TGKACADVDECFNGISKCQNGTCVNTPGSYSCQCDEGFREDSRHACQDIDECAESGTQIC
RNGVCKNEFGGFTCLCNVGYVLNATEKHCRDRNECLEIENFCLNGTCTNTLGGSICECRD
GFSLNPSGDSCIDINECDDDPNLCQMDGNCVNTAGSFECVCPVGYEVANYGKMCVDMRKG
YCFNDYDDRGCSNPRMILSTKQVCCCTRGAGWGDPCDICPVEQTEAFSLLCSKGHGYAVK
NNTVDDVNECEYDRLCANGRCVNNDGSFRCECFAGYQLDEFGRNCEDIDECAKPGICGNG
TCNNQLGSYSCDCASGFKRGRFSPTCEDIDECSETRNLCAFRCVNNAGSYQCICPRGYKL
HTNKRHCIDVDECKTGTHNCRYVCKNFHGGFKCICPEGFRRSAGGSCIDINECREGSSRC
RDGNCRNTPGSYICDCNEGYKRTSDGRSCEDLTRGLCFAQVDNGLCKASTKIMILVTKSD
CCCTAGIAWGSQCTICPRKNTVEHRRLCVPFQKTMDECKMIFGLCPNGKCINTADSYRCM
CHQGYKLRRDGKSCVDINECHRIPKPCRTECINTPGSYRCKCPSGYEEISGRCQDINECR
NSSVCPQQCVNTLGSYRCSCRQGYQWQGTSCVDINECDRRNVCRFGSCVNQDGSYTCLCR
HGYRYNSQTKTCVDLNECNVRSCQGTCVNINGGYRCGCPSGFVRQLYWNQCIDVNECTTG
ANKCGRTKCFNIQGGYRCYCPRGYLLDQSSMTCIDKNECVRNPCSTAGCHNIRGGFQCSC
PTGFYAVGGGHCIARYAQQRLKGVVTQNKYKFGEKPKTQREVTPSRYYKDTSQTPFKSQW
GYRRTQTRYTKSDPYRYTYSYSSSSSGRRRRRASHFVHKLNIDIQQNATALQNLLVLTPV
LESLQKKFHYEIVRGNRSLFAVKIENGLSFVFAKKTLRVGRYRLYLKGKLRNAGMSSVFA
SQSHIDFDGKGDVKEKVINSQRSEISLNEINGLSEARKFHLLIAINVQ
NT seq
8607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttgcgcaaaggtgttgcgtctatttatactgctgatattaagtgtctctgtcatc
cctgctatatcgactaaaaaggcgcacaggatacgacgttctggtccaaatgtgtgtggc
tcgcagtgttgctcgggatggcagtcagcacaacgcggtcgctctggccaaggactctgt
attttaccgatctgtaacgtgaattgtggtacaggaatctgtgttagtccaaatctttgt
ctatgtgaggatggacagactgcatctcaatgcactcagacaggatgtaaagccttttgt
ttgaatggtggtacctgtaaggatgataaatgtatctgtgttcaaggatatgaaggaaga
ttttgtgaaaatcctacctgtgataaaccttgtctaaatggaggcgaatgtattcgtcca
aatacttgtgcttgtcctcctggttttgctggtccggaatgtcagtccgatttacgtcaa
ggaccttgtttcaaagaaattaaagattcgaaatgcagtgggcaaataacgaccctgctc
tgcacgaaggagatgtgttgcgcaactgttggaaaagcctggggacaaccatgtgaagca
tgcccggataaaccagctccctgtgctatcggatatgtacctaatttcgccacacgagaa
tgtttagatattgatgaatgtaaagcagtacctggcgtctgtccagctaatgtaaaatgt
ataaacactgttggtagttatcgctgtggaaaatgcgcttctggattcacgtttaatgat
caactaaagagatgtgttaaacctactgtaacccccgctgttcgtaaagacttgtgcttc
aggcaaattcttagcgacaattgtattttaccgttgtcgaacaatcttacaaagtcctcg
tgttgttgtggtgaagttgctggtgctggttggagctccaattgtttaacctgcccttta
caagattccagtgaatatgatactttgtgtggaaatttgggcgagtgtagttttgaaggc
gatgtttgtggtgggaatatcggtgaatgtaggacgacagaatctggtcttacctgtgtt
tgtgctattggttataactatgatcctgaccagaaactttgtgttgatgtagatgaatgt
gatggtggcggcttgatctgcacaaacgctttatgttataacacacctggtagcttcagg
tgtgattgcaaactaggttttgttcccgacccgtttgacagattgagatgcacccgtact
agtgtccgtatcagtacccctcctttgggactaaccaatcctgactctccaacaccttct
cctccagtgtcctctacaccatctggtgtgtgctctcgtgtcggtcagcgatgtgataat
ggtgaatgtgttagggtagatggtgtcatcaagtgtcgctgtgttagtggctttaatgat
acaacggggaaatgtgaggacgttgatgagtgtcaagaggacagcaatgtttgtgagaat
ggtatgtgtatcaacgagattggaggataccgctgtcaatgtgctgcgggctacattaca
tccagcgataagaaaagctgtgttgaccgtaatgaatgtgaagaatcatcgaaatgttcc
aacggtcgttgcataaacacaaagggtgcatggcgttgtacttgtaatcaaggatttact
ttgagtgacgataaaaaatcttgtattgacaatgacgaatgcaccactattgctgacgtt
tgcatgaatggccgctgtatcaatactgctggcgactatgaatgtagatgtaatactggc
tacactacatctacagataaacacatgtgtctagatactatggtatcgatgtgctacgca
aaatatgataacaatgtttgtagtcaggcgttatttagatcattaaccatctctcaatgc
tgttgtggtaaagataatactggcgagagccgccgggcatggggaagtccctgtatggct
tgtcccgtacctgacactgatgagtacacaaaggtatgcgtaaatggtgccggtaaagat
agtggtggaaaagatgttgatgaatgttcaaataatgtcggctcacaaacggtgttgtgt
gaaaatggacaatgtcggaacacaaacggggattattcttgtgattgtaacgtcggctac
agaagaacaactgacagcaagacatgtaatgagattaacgaatgtcgtgaaaatccgtca
ctttgcaatcgtggccgatgtgaaaattcacctggtagctatcgttgtgtatgtcctgca
ggttttgtatttgattcaagaaccagaggatgcgaagacgtgaacgaatgcagcaacaag
ggacaatgtgttgatggcacttgtgtgaacacgatcggtagcttcctttgtcgttgtcca
caaggattcactttggattccaatggtcgctattgtcgagatttacgtaagggaaaatgt
tggagattcataagtgacactaatgtctgtgaagacaatgttaatggtgatgttactcgc
gaagtgtgttgtcaaacccttggaaaaggctggggtagtccttgtcagaaatgtgacacc
atcggtaaaagatgtcgtagtgggtttttatatgacaattttacttgtgtcgatattgac
gaatgtcaagcgttcccaggtatatgccgcaatggacgatgtttaaacactcctggaagc
tatcaatgtgtttgctctgaaggattgactttggatgaaagtaaaagtgtctgtcttgat
ctgcgagatggcgtgtgctatcaagccgtgacacgtgatcaatgtactcaaccggtcagt
gggttatacaagaaagatatctgctgttgctcagttggtgcagcctggggcagaccctgt
caagaatgtcctctaagaaatagcagggagttcaacgaactgtgtcggcaaactactctc
acagtgtttgacgagtgcactgtatttcctgatatttgtataaacggtgaatgcattgat
acaagtggcagtttcctatgtgaatgtcgatcaggttttgctcttgatcaaaccggcaaa
aattgcacagatatcaacgaatgtcagattactccggatttatgcggtaatggaacatgc
attaacacggctggtggattccgatgtaattgtcgagaaggattcaagaatgcaccgatg
atgatggaagtctgtattgatgtgaatgaatgtgatgatttaccgaacccttgtcaaggg
ggtacttgtgtaaatactattggtagcttcaagtgcgagtgtcctacaggaaagcgaatg
gactctagtggattgatgtgtcaagatattaatgaatgtgctgagaattcattcatttgt
ccgaacggcaactgccaaaactttatgggtggctatcaatgtgcatgttttcctggattc
gtctcgagtgatgatatgaaaagttgtatagatgtgaatgagtgtgaaacagaaaatgga
caatgtgaagcaacgtgcgagaacacaattggaagttatcgttgttcgtgtcccccagga
atgagattacgactcgatgaacgaacttgtggcgatatcgatgaatgtgttgaaactcca
aatatttgtggtattggtaacaaatgtcagaatgttcatgctggacacgagtgcatttgt
tcagatgcttacgctttgtctgaagaccgcaaatcttgtattgatatcgatgaatgcata
acggacccgaatttatgtcgcaatgggcaatgtcaaaatttactcggatcttatcaatgt
atttgtcctcggggatttttcattgatgaaactacttctgtcgctgtttgttctgatgta
aacgagtgcgagagtgatgagataaacgattgtggaagaaactcgttttgtatgaacacg
attggatcttacagctgctcttgtctcaatggctttagaaaaatagcaaacatttgtcgt
gacgtggacgaatgtcgtgagtcagaactacgaaatatttgcggtaataattcgcaatgt
cgaaacaccgatggcagttactcatgtgaatgtcgtcagggatattttctggccagtgat
ggcgcgtgtaaagatgtcgatgaatgtcgtattcttgacaatgtttgcgcgaatgggaaa
tgtctcaaccttcctggatcctatcaatgcgattgtgattttgggtatttgcaaactttt
aatgaaaaaggatgtgaagatctggatgaatgtgaagtgatgaaagaattctgtcatcat
ggacggtgtgaaaatatcccaggatcatttcaatgtatttgtgataaaggatttcaatta
aatcgctacaataataattgcacagacactaacgaatgccaagagtccggaatgtgcctc
aatggtcgatgtgttaacgaaatgggaaaataccgttgcgagtgcgatgaagattttgtg
ccaaatcccacgaacacggcttgcatcgatactcggaaaggaaattgtcacttggtgaaa
gatagcgaaaccgattcttgcagttatcttatcacagacagcgttttacgcagcatttgt
tgttgttctgttggtacaacatggaatgattgtgaagaatgtccaaaaaatggcactgat
gaatacaggcatctctgtcctagtgttggcggatatattgtcgatcctaacacaacatcg
ctcattgatattgatgagtgcaagttcccgagaatttgcgttgatgggacgtgcaccaac
acgctaggaagtttcatgtgcacttgttcaaaaggttttgaatacaaccatgaaattggc
gtttgtgaagatattaatgaatgtgagattgacagattcatatgtggctttactggagta
tgtataaacaacgaaggaagttacgaatgtcaatgtcctccaggagaagcaatgattgga
actgtttgcattgatgagcgtccacagctttgtttcggagacaaacaagacttgagcaac
gtggaaagtttgtttccaggtccttcgtgtaatgaatcaataacatatcgtcctattaca
cgaacagaatgttgctgtagcaagggaacagcttacggtcctcctgatatgtgcaaactc
tgtccattacctcttactgatgaatactatgcattgtgcgccattgtaagacctactcct
acaccaattagaggtattggtggcactgcttttcctcctggtggaactccaggggtgatt
cccatcactgacgtggatgaatgttcatttcttagaaatccttgtggtatgggaacatgt
cgcaatacttatgcttcatatgaatgtgactgtgaaaaaggtttcgctgtcaagaatgga
aatccccgatgtgaagatcaaaacgaatgtttactcaatccttgttttggtggggagtgt
aagaatacctttggcagtttcatgtgtagttgtgaagtgggttatgtagttgatgaaaca
ggtgtcaactgtgttgaccacaatgaatgtcatcttaacgatacttgcgtcaatggtaat
tgtatcaatgaagatggtggttacagatgtgaatgcgaccagggttatcagccaatcaga
acaggcaaagcttgtgcagatgttgacgagtgctttaatggcataagtaaatgtcagaat
ggcacatgcgtgaatactcctggttcatattcctgtcagtgtgatgaaggatttcgggaa
gactccagacatgcctgccaagatatcgatgagtgtgctgaatcaggaactcagatttgt
cgaaatggagtgtgtaagaatgaatttggtggtttcacttgtctttgcaatgttggatac
gtgttaaacgcaacagaaaaacactgtcgagataggaatgaatgtctggagatagaaaat
ttttgtttgaacggcacctgtaccaacactcttggcggctcaatatgtgaatgtcgggat
ggattttctttgaatccctctggagattcttgtattgacatcaacgaatgtgatgatgac
cccaatctttgtcaaatggatggtaattgcgtgaatacggctggaagcttcgagtgtgtt
tgtcctgttggttatgaagtggctaactatggcaaaatgtgtgttgacatgcgcaaaggg
tattgttttaatgattacgacgaccgtggttgtagcaatcccaggatgattttgtcaaca
aagcaagtttgttgctgtacacgtggagcaggttggggtgatccatgtgacatatgccct
gtcgaacaaacagaggcattcagtttactttgtagtaaaggtcatggatatgccgtaaag
aacaatacagtcgatgatgtcaacgaatgcgaatacgatcgtctgtgtgctaatggtcgt
tgcgttaacaacgatggcagcttccgctgtgaatgttttgccggctatcagctcgatgaa
tttggaagaaattgtgaagacattgatgaatgtgcgaaaccagggatctgtggtaatggt
acatgtaacaaccagcttggcagttattcttgtgattgcgcttctggattcaaacgtggt
cgtttctcacccacatgtgaagatattgatgaatgttctgagacaagaaacctctgtgca
ttccgttgtgttaataatgctggctcatatcaatgcatctgtcctcgaggatacaaactt
catacaaacaagagacattgtatagacgtggacgagtgcaaaaccggaacacacaactgc
cgttatgtttgtaaaaatttccatggtggttttaaatgcatttgtcccgagggtttccgg
cgttctgctggcggaagttgcattgacatcaatgaatgtagagaaggctcgagtcgttgt
cgtgatggcaattgtcgcaatacccccggtagttatatctgcgactgcaatgaaggatat
aagcggacatctgatggcagaagttgcgaggatcttactcgtggcttatgttttgctcaa
gttgataacggattatgcaaggcatcaacaaagataatgatactagtgacaaagagtgat
tgctgttgtactgcaggaatagcttggggtagtcagtgtacaatatgtcctcgaaaaaat
acagttgaacacaggagactgtgtgttccgtttcagaaaacgatggacgaatgcaaaatg
atattcgggttgtgtcccaatgggaaatgcatcaacactgccgactcgtatcgttgtatg
tgtcaccagggatacaagcttaggcgagatggaaaaagttgtgtagacatcaatgaatgt
catagaataccgaaaccatgtcgtactgaatgcataaacacacctggaagttatagatgt
aaatgtccttctggttatgaagaaatatctggcagatgtcaagacataaacgagtgtcga
aactcttctgtttgtcctcaacaatgtgttaacaccttgggaagttacagatgttcatgt
cgacagggatatcaatggcaggggacgtcatgtgtagacataaacgaatgtgatcgccga
aatgtctgtcgtttcggttcttgtgtcaatcaagatggatcgtatacatgtttatgtcga
catggttatagatataactctcagactaagacctgtgttgatcttaacgagtgcaacgtc
cgaagttgtcaaggtacatgtgtgaacatcaatggtggatacaggtgtggatgtcccagt
ggctttgtaagacaattatactggaatcagtgcatcgatgtgaatgaatgtactacaggt
gcaaataaatgcggtcgtacaaaatgtttcaacattcaaggtggatatcgatgttattgt
ccgcgtggatatctactggatcaatctagcatgacctgcattgataagaatgaatgtgtc
cgcaatccttgctcaacagcaggttgtcacaacattcggggtggtttccaatgctcttgc
ccaacaggattttatgccgttggcggaggtcattgtatagcgaggtacgctcagcaaaga
ctaaaaggcgttgtgacgcaaaacaaatacaagtttggtgagaaaccgaagactcaacgt
gaagttaccccatctagatactacaaagatacctcacaaactccgttcaaatcacaatgg
ggatatcgtcgcactcaaacaagatatactaaatcagatccgtatcgttacacatattct
tacagctcttcgtcatctggacgaagaagaagacgcgcatctcactttgtacacaagttg
aatatagacattcagcaaaacgcgactgctctccaaaacctgctcgtcttaacaccagtt
ttggagagcttgcagaagaagtttcattatgaaattgttcgtggtaatcgtagtttgttt
gctgtgaaaattgaaaatggattaagcttcgtttttgcaaagaagactttgagggttggt
cgttatcgtctctatcttaaaggaaagcttagaaatgcaggaatgtcttctgtatttgct
agtcagagccacattgattttgatggtaaaggagacgtcaaggagaaggtaataaactca
cagcgatctgaaatatctttgaatgaaattaatggcctttctgaagctcgaaagtttcat
cttcttatcgccatcaatgttcaatga
DBGET
integrated database retrieval system