Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals): 124455311
Help
Entry
124455311 CDS
T08024
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: mitochondrial DNA mismatch repair protein mutS homolog
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
xen
Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals)
Pathway
xen03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xen00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
124455311
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
xen03400
]
124455311
DNA repair and recombination proteins [BR:
xen03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
124455311
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
HNH
MutS_I
AAA_29
AAA_23
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124455311
NCBI-ProteinID:
XP_046861942
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
977 aa
AA seq
DB search
MNQIPMQYFNLAEENYSKYGLSVIQLIQIGKFYELWHEPDTPSRQQAYSQAELLIESSMR
SKPLEVMPSIEQVASLLDMKIIRRSLLQMGFPTYSLTTHLSTLLNKGWTVIVIDELVTGK
SGPKQRAVSQVYSPSCNLEDCSELPYVLSIYFSQDDLLGITLFSAMNGHSIMFPVSWMDR
DKVVRLLINYRIREIVIWANSDGDSEILINKIYNLLIGWNLFPSEPNVKIEVMGEAPINF
PCYFSFRYENDNKEWLLLHIFLGINAEWFNKNYQEYTLSKIFQSTWTEDVNQVNIISLLG
ALQFIKDRNPNLIKNLQLPECYNSVISPLNLILCNQAEYQLDLLPKGKKLGGLLSLVDYC
STAMGKRLLKFRLLNPITDYSELNFRYEDIATFKQLISEKIFDNSELKHIKDLSSLHRQW
AISASSDIILPPKKLSQIYHSYLFANQLINKLINNIQLPPSIKPQLESLIKAIGLIFQVD
NLLGDFKDVLQPSDNLTKLLSQQTLRAQLTKWAEQTSNIVFQDTISIKVDCFNKEGYAFS
ILSKNLTKLEHYMTSASISNNSIIVLGKRRNYLIITSPTIQKVSIELNLLEEQINVYVKQ
TYKRELKRLYFSHFELFSPLENMISRIDIALSGAIAAIKFNYTKPFLTPTKSQQSKGLIE
AINLRHPLVEQLNTQEECVAHNISLEDKGMLIFSVNGAGKSTLLKAIGVNVILAQAGMYV
AADSFRLRPYHYLITRILGGDDLHKGRGTFEVEMRDLSTILKLANYNSLILGDEICHGTE
VSSGAAILAATIERLTTAQTSFALSTHLHQVYSLIDSPVRFYHLSVIQHEDLGLIYERKL
KLGPGPSQYGIEVMGHIINDKKFYNSALKYRKLINWKPPSRSEASSLAVFRPSKYNTQXF
IDSCEICGAPAEAIHHIQPKKLGSRRLNRRSNLVPVCSSCHLDIHRNKISILGWKKXPGH
KKLYWVYLNEXLDSGTE
NT seq
2934 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcagatacctatgcaatattttaacttagcagaggagaattattctaagtatgga
ttatcagtcatccagcttattcaaattggtaagttctatgaactttggcatgagcctgac
acccctagtaggcaacaagcatactctcaagccgagttattaattgagtcctccatgcgg
agtaagcctttagaggtgatgccttctattgaacaagttgcctctttacttgatatgaaa
atcattagaagatctttacttcaaatggggtttccaacttattcccttactactcattta
agtactttattgaataagggttggactgttatagttattgatgaattagttactggtaaa
tcggggccaaaacaacgtgcagtatctcaggtttattctcctagttgtaacttagaggat
tgttcggaattaccatatgtattatcaatctatttttctcaggacgacttattgggtatt
actttattttcagccatgaatggtcatagtataatgtttcctgtctcttggatggacaga
gataaagtagttcggttattaattaattatcgtattagagaaatagtaatttgggcaaat
tcagatggtgattcagaaattttaataaataaaatatataatttattaattggttggaat
ttatttccctctgaacccaatgttaaaattgaagttatgggagaagcgccaatcaatttc
ccatgttatttttcttttaggtacgaaaatgataataaggagtggcttttgttacatata
tttttgggtattaacgcagagtggtttaacaaaaattatcaagaatatactcttagtaag
atatttcaaagtacttggacagaagatgttaatcaggtaaatataattagccttttagga
gcattacaatttattaaagatcgaaatcccaatcttattaagaacttacaacttcccgag
tgttacaattctgttattagtcctttaaacttaatattgtgtaatcaagcagaatatcaa
ttagatttattgcctaaggggaaaaaactaggtggtctacttagtttagttgattattgt
tctactgcaatgggtaaaagactactaaaattcagacttcttaatcctattacagattat
tctgaattaaattttcgttatgaagatattgctacatttaaacaattaattagcgagaaa
atctttgacaattccgagttaaaacacattaaagatttatcttctctacaccgtcaatgg
gcaatatctgcttcaagtgatattatcttaccacctaaaaagcttagtcaaatttatcat
tcttatttatttgctaatcaattaataaacaaattaataaataatattcaattacccccc
tcaattaagccccaattagaatcgttaatcaaagcaataggtctaattttccaggtagat
aatcttctaggcgattttaaagatgtattacaaccatctgataatctaaccaagcttctt
tcacaacaaactttaagggcccaactcacaaagtgggccgagcagacttcaaacattgtg
tttcaagatacaatttctattaaagttgattgttttaataaagagggttatgctttctct
attttatctaaaaatctaactaagttagaacattacatgactagtgcctctatatctaat
aattcaattattgtgttgggtaaaagaagaaactaccttataattactagccccaccatt
cagaaagtgtcaatcgaattaaatttattagaagagcagattaatgtttatgtaaaacag
acttataaacgagaacttaaaagattatattttagtcattttgagttattttcgccttta
gaaaatatgatttctagaatagatattgcattaagcggagctatcgcggctattaaattt
aattatactaaaccttttttgacaccaacaaaatcccaacaatccaagggtctaattgaa
gcaattaatttacgacatccattagtagaacagttaaacactcaagaagaatgtgtggct
cataatataagtctagaagataaaggaatgttaatattctcagtaaatggcgcaggtaaa
tccactttacttaaagcaattggagtcaacgtaatattagctcaagcaggaatgtatgta
gctgcagattcatttaggttaagaccttatcattatttaattactcgtattttaggggga
gatgatcttcataaaggccgaggtacttttgaggtcgaaatgagagatctttcaactata
ttaaagctagctaattataacagtttaattttaggtgatgaaatttgtcatggaacagaa
gttagttcaggagcagcgatattagctgcaacaattgaaagattaacaactgcacaaact
agttttgctctttctactcatttacaccaagtttattctttaattgattcaccagttcgg
ttctatcatttatctgttattcaacacgaagatttgggcctaatttatgaacgtaaatta
aaacttggcccaggaccttcccaatatggcattgaagttatgggccacataattaatgac
aaaaaattttataatagtgctttaaaatatcgtaaacttattaactggaaaccaccatct
cgaagtgaagcaagctctttagcagtattccgcccttctaaatataatactcaangtttt
attgattcatgtgaaatatgcggagctccagcggaggctatccaccacattcaacctaag
aaattaggtagtagaagattaaatcgaaggtcaaacttagtgccagtttgctcaagctgt
catttagatatacatagaaataaaatttctattttaggttggaagaaanacccaggacat
aagaaattatattgggtttatcttaatgagntcttagacagtggaactgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
