Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals): 124455313
Help
Entry
124455313 CDS
T08024
Name
(RefSeq) mitochondrial DNA mismatch repair protein mutS homolog
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
xen
Xenia sp. Carnegie-2017 (soft corals)
Pathway
xen03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xen00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
124455313
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
xen03400
]
124455313
DNA repair and recombination proteins [BR:
xen03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
124455313
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
HNH
MutS_I
AAA_29
AAA_23
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124455313
NCBI-ProteinID:
XP_046861943
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MNQIPMQYFNLAEENYSKYGLSVIQLIQIGKFYELWHEPDTPSRQQAYSQAELLIESSMR
SKPLEVMPSIEQVASLLDMKIIRRSLLQMGFPTYSLTTHLSTLLNKGWTVIVIDELVTGK
SGPKQRAVSQVYSPSCNLEDCSELPYVLSIYFSQDDLLGITLFSAMNGHSIMFPVSWMDR
DKVVRLLINYRIREIVIWANSDGDSEILINKIYNLLIGWNLFPSEPNVKIEVMGEAPINF
PCYFSFRYENDNKEWLLLHIFLGINAEWFNKNYQEYTLSKIFQSTWTEDVNQVNIISLLG
ALQFIKDRNPNLIKNLQLPECYNSVISPLNLILCNQAEYQLDLLPKGKKLGGLLSLVDYC
STAMGKRLLKFRLLNPITDYSELNFRYEDIATFKQLISEKIFDNSELKHIKDLSSLHRQW
AISASSDIILPPKKLSQIYHSYLFANQLINKLINNIQLPPSIKPQLESLIKAIGLIFQVD
NLLGDFKDVLQPSDNLTKLLSQQQTLRAQLTKWAEQTSNIVFQDTISIKVDCFNKEGYAF
SILSKNLTKLEHYMTSASISNNSIIVLGKRRNYLIITSPTIQKVSIELNLLEEQINVYVK
QTYKRELKRLYFSHFELFSPLENMISRIDIALSGAIAAIKFNYTKPFLTPTKSQQSKGLI
EAINLRHPLVEQLNTQEECVAHNISLEDKGMLIFSVNGAGKSTLLKAIGVNVILAQAGMY
VAADSFRLRPYHYLITRILGGDDLHKGRGTFEVEMRDLSTILKLANYNSLILGDEICHGT
EVSSGAAILAATIERLTTAQTSFALSTHLHQVYSLIDSPVRFYHLSVIQHEDLGLIYERK
LKLGPGPSQYGIEVMGHIINDKKFYNSALKYRKLINWKPPSRSEASSLAVFRPSKYNTQV
FIDSCEICGAPAEAIHHIQPKKLGSRRLNRRSNLVPVCSSCHLDIHRNKISILGWKKTPG
HKKLYWVYLNES
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcagatacctatgcaatattttaacttagcagaggagaattattctaagtatgga
ttatcagtcatccagcttattcaaattggtaagttctatgaactttggcatgagcctgac
acccctagtaggcaacaagcatactctcaagccgagttattaattgagtcctccatgcgg
agtaagcctttagaggtgatgccttctattgaacaagttgcctctttacttgatatgaaa
atcattagaagatctttacttcaaatggggtttccaacttattcccttactactcattta
agtactttattgaataagggttggactgttatagttattgatgaattagttactggtaaa
tcggggccaaaacaacgtgcagtatctcaggtttattctcctagttgtaacttagaggat
tgttcggaattaccatatgtattatcaatctatttttctcaggacgacttattgggtatt
actttattttcagccatgaatggtcatagtataatgtttcctgtctcttggatggacaga
gataaagtagttcggttattaattaattatcgtattagagaaatagtaatttgggcaaat
tcagatggtgattcagaaattttaataaataaaatatataatttattaattggttggaat
ttatttccctctgaacccaatgttaaaattgaagttatgggagaagcgccaatcaatttc
ccatgttatttttcttttaggtacgaaaatgataataaggagtggcttttgttacatata
tttttgggtattaacgcagagtggtttaacaaaaattatcaagaatatactcttagtaag
atatttcaaagtacttggacagaagatgttaatcaggtaaatataattagccttttagga
gcattacaatttattaaagatcgaaatcccaatcttattaagaacttacaacttcccgag
tgttacaattctgttattagtcctttaaacttaatattgtgtaatcaagcagaatatcaa
ttagatttattgcctaaggggaaaaaactaggtggtctacttagtttagttgattattgt
tctactgcaatgggtaaaagactactaaaattcagacttcttaatcctattacagattat
tctgaattaaattttcgttatgaagatattgctacatttaaacaattaattagcgagaaa
atctttgacaattccgagttaaaacacattaaagatttatcttctctacaccgtcaatgg
gcaatatctgcttcaagtgatattatcttaccacctaaaaagcttagtcaaatttatcat
tcttatttatttgctaatcaattaataaacaaattaataaataatattcaattacccccc
tcaattaagccccaattagaatcgttaatcaaagcaataggtctaattttccaggtagat
aatcttctaggcgattttaaagatgtattacaaccatctgataatctaaccaagcttctt
tcacaacaacaaactttaagggcccaactcacaaagtgggccgagcagacttcaaacatt
gtgtttcaagatacaatttctattaaagttgattgttttaataaagagggttatgctttc
tctattttatctaaaaatctaactaagttagaacattacatgactagtgcctctatatct
aataattcaattattgtgttgggtaaaagaagaaactaccttataattactagccccacc
attcagaaagtgtcaatcgaattaaatttattagaagagcagattaatgtttatgtaaaa
cagacttataaacgagaacttaaaagattatattttagtcattttgagttattttcgcct
ttagaaaatatgatttctagaatagatattgcattaagcggagctatcgcggctattaaa
tttaattatactaaaccttttttgacaccaacaaaatcccaacaatccaagggtctaatt
gaagcaattaatttacgacatccattagtagaacagttaaacactcaagaagaatgtgtg
gctcataatataagtctagaagataaaggaatgttaatattctcagtaaatggcgcaggt
aaatccactttacttaaagcaattggagtcaacgtaatattagctcaagcaggaatgtat
gtagctgcagattcatttaggttaagaccttatcattatttaattactcgtattttaggg
ggagatgatcttcataaaggccgaggtacttttgaggtcgaaatgagagatctttcaact
atattaaagctagctaattataacagtttaattttaggtgatgaaatttgtcatggaaca
gaagttagttcaggagcagcgatattagctgcaacaattgaaagattaacaactgcacaa
actagttttgctctttctactcatttacaccaagtttattctttaattgattcaccagtt
cggttctatcatttatctgttattcaacacgaagatttgggcctaatttatgaacgtaaa
ttaaaacttggcccaggaccttcccaatatggcattgaagttatgggccacataattaat
gacaaaaaattttataatagtgctttaaaatatcgtaaacttattaactggaaaccacca
tctcgaagtgaagcaagctctttagcagtattccgcccttctaaatataatactcaagtt
tttattgattcatgtgaaatatgcggagctccagcggaggctatccaccacattcaacct
aagaaattaggtagtagaagattaaatcgaaggtcaaacttagtgccagtttgctcaagc
tgtcatttagatatacatagaaataaaatttctattttaggttggaagaaaaccccagga
cataagaaattatattgggtttatcttaatgagtcttag
DBGET
integrated database retrieval system
