Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514: XFLM_09315
Help
Entry
XFLM_09315 CDS
T01979
Name
(GenBank) surface protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
xff
Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xff00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
xff02000
]
XFLM_09315
Transporters [BR:
xff02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
XFLM_09315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
XdhC_CoxI
YadA_head
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADN63753
LinkDB
All DBs
Position
2031189..2038703
Genome browser
AA seq
2504 aa
AA seq
DB search
MVFIAPHSSKQHGKEPLHTILFAALSLSLPYAEEARAQLYINDGIDGQCQRIVDFGNTTI
ESKTSPLCNEDPWTVTGYARFFGAPGATADQGNASRSLALGGVLYVNSGQFGVNDVLNKT
YSIRMGSVITMNTMAGTNAIAIGSAQSSAADALKASLATKATGARAIAIGAKASADGTDT
VALGSGATAGTGASSVAIGLNASAVNGAVAVGGGALVTVPDGAVALGLNSVASTGKGLSG
YDPKTKTISTDASAAWKSTLAAVSIGDVSSSNFKTRQLSGLAAGTSNTDAVNVAQLKVVD
EIASKGWNLTASGANSGNVGPGSSVDLKNTDKNLTITKAIGSNDVEFNLNKDVKVTTLAV
GDALLNTDGIALGTDVALGTTGLTITNGPAVTASGIDAGSKVISHVAAGEVSETSTDAVN
GSQLNAVQVQASQPVTFSGNEGSVKRSLGQAVVISGESSTAGTYSGGNLKSVVDEAAGAI
HLQLADSPKFGNVVINNGGKISGLTAGTEDTDAVNLSQLKSISDTVDKGWTLTASGANGS
KVVSGGAVDLKNTDGNLTISKSGDSNDVVFNLSKDFKVDGMTSGTTVVNNDGVKVGTDVA
LGTTGLTIANGPAVTASGIDAGSKVISHVAAGEVSETSTDAVNGSQLNAVQAQASQPVTF
SGNEGSVKRTLGQAVVISGESSTAGTYSGGNLKSVVDEAAGAIHLQLADSPKFGNVLINN
GGKISGLTAGTEDTDAVNLSQLKSISDTVDKGWTLTASGANGSKVVSGGAVDLKNTDGNL
TISKSGDSNDVVFNLSKDFKVDGMTSGTTVVNNDGVKVGTDVALGTTGLTIANGPAVTAS
GIDAGSKVISHVAAGEVSETSTDAVNGSQLNAVQAQASQPVTFSGNEGSVKRTLGQAVVI
SGESSTAGTYSGGNLKSVVDEAAGAIHLQLADSPKFGNVLINNGGKISGLTAGTEDTDAV
NLSQLKSISDTVDKGWTLTASGANGSKVVSGGAVDLKNTDGNLTISKSGDSNDVVFNLSK
DFKVDGMTSGTTVVNNDGVKVGSDVALGTTGLTITNGPAVTASGIDAGSKVISHVAAGEV
SETSTDAVNGSQLNAVQAQASQPVTFSGNEGSVKRTLGQAVVISGESSTAGTYSGGNLKS
VVDEAAGAIHLQLADSPKFGNVLINNGGKISGLTAGTEDTDAVNLSQLKSISDTVDKGWT
LTASGANGSKVVSGGAVDLKNTDGNLTISKSGDSNDVVFNLSKDFKVDGMTSGTTVVNND
GVKVGTDVALGTTGLTIANGPAVTASGIDAGSKVISHVAAGEVSETSTDAVNGSQLNAVQ
AQASQPVTFSGNEGSVKRTLGQAVVISGESSTAGTYSGGNLKSVVDEAAGAIHLQLADSP
KFGNVLINNGGKISGLTAGTEDTDAVNLSQLKSISDTVDKGWTLTASGANGSKVVSGGAV
DLKNTDGNLTISKSGDSNDVVFNLSKDFKVDGMTSGTTVVNNDGVKVGSDVALGTTGLTI
TNGPAVTASGIDAGSKVISHVAAGEVSETSTDAVNGSQLNAVQAQASQPVTFSGNEGSVK
RTLGQAVVISGESSTAGTYSGGNLKSVVDEAAGAIHLQLADSPKFGNVLINNGGKISGLT
AGTEDTDAVNLSQLKSISDTVDKGWTLTASGANGSKVVSGGAVDLKNTDGNLTISKSGDS
NDVVFNLSKDFKVDGMTSGTTVVNNDGVKVGSDVALGTTGLTITNGPAVTASGIDAGSKV
ISHVAAGEVSETSTDAVNGSQLNAVQAQASQPVTFSGNEGSVKRTLGQAVVISGESSTAG
TYSGGNLKSVVDEAAGAIHLQLADSPKFGNVLINNGGKISGLTAGTEDTDAVNLSQLKSI
SDTVDKGWTLTASGANGSKVVSGGAVDLKNTDGNLTISKSGDSNDVVFNLSEDLKEKSVT
VGNTQLDKDGVKVSSDVLLNSKSLVIMSHSSTSSVKTLEDGESVVNRTVVNGDGVNIDDV
VVVNDLGLSIVGGASVTLSGINAGSHKITNVTAGTEDTDAVNLSQLKSVSEAVDKGWTLT
ASGANGSSVVSGGTVDLKNTDGNLTISKSSDSNDVVFNLSKDFKVDGVTAGNTVVNTDGV
KVGSDVSLGAMGLFIANGPSVTASGFNAGDKVISHVAVGMADTDAVNVSQLKQAVQNVSV
KATRYYSTNDGGTQGGNYDGDGATGSKAVAAGVGTQASGEGATAVGSGAASSGKGSTAIG
RNAIASADGSVALGDGAKDGGRGAESYTGKYSGVQNNTMGTVSVGDAAKGETRSISNVAD
AKEETDAVNLRQLDAVAQKSNLQTDDMRHEINNIEDVFKVTKGDSTPSVKGMGVNAMAIG
TNAAVSGTDSVALGKNTNVSADNAVAIGNDSVADRANSVSVGSAGSQRQVTNVAAGTADT
DAVNVSQLNQGLITAKQYTDGMVGNLRRETNGGVAAAIATANLPQAYVQGRGMTSVGVSS
YQGQSAIAVGVSAVSDSGHWVFKFSGSANTRSHVGVGAGVGYQW
NT seq
7515 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatttatagctccacatagtagtaaacagcatgggaaggaaccgctgcatactatt
ttatttgctgcgttgtcgctgtcgcttccatatgctgaagaggctagagcccaactttat
atcaatgatggtattgatgggcaatgtcagaggatcgttgattttggaaacacgaccatt
gagtcgaaaacttcccccctatgcaatgaagatccgtggactgtgacaggttacgctcgt
ttcttcggtgcccctggagccactgctgaccaggggaacgcatcaagaagtcttgcgctg
ggtggggttttatatgtcaattcgggtcaattcggtgttaatgacgttttaaataaaacg
tattcgatccgtatgggcagtgtgataaccatgaacactatggcgggaaccaacgcaatt
gcgattggttcggcgcagagtagtgcggctgatgcactgaaagcgagcttggcaaccaaa
gcaactggtgcacgcgcaattgcaattggtgcaaaggcgtctgccgatggtaccgataca
gtggcattagggtctggagcaacggcgggtacgggtgcttcttcggttgctattggtctt
aatgcctcggcagtcaatggtgccgttgcggttggtgggggtgcgctggttacagtacca
gatggagcggtggcattgggattgaactcggttgcttctactggcaagggcctctcaggg
tacgacccaaaaacaaaaacgatttccactgacgcttcagcggcctggaaaagcacactg
gcagcagtcagtatcggcgatgtatctagtagcaattttaagacgcgtcagctctcaggt
ttggcggcaggcacatcaaataccgatgcagtgaatgttgctcagcttaaggtcgttgac
gagattgccagtaaaggctggaaccttacggcgtccggggccaacagtggcaacgtaggt
ccaggaagttcagtggacctgaaaaacaccgacaaaaatctgacgattacaaaagcgatc
ggaagtaatgatgtggaattcaatttgaacaaggatgtcaaagttacaacattggctgtt
ggtgatgctttgctgaataccgatgggatcgcgttaggcactgatgttgcattgggtacg
acgggtttgacgattaccaatggtcctgcggtgactgcatcgggtattgatgcgggcagc
aaggtgattagccatgttgcggcgggtgaggtgtcggagacgtcgacggatgcggtgaac
ggctcgcagttgaatgcagtgcaagtgcaagccagtcagccggtaacgtttagtggaaac
gaagggtcggtgaaacgtagcctaggtcaggcggtggtgatcagtggcgagagcagtact
gcggggacgtattcaggtgggaatttaaagagtgtggtggatgaagcggctggtgcgatt
catttacaactggcggattctccgaagtttggcaatgtggtgatcaacaacggcggcaag
atcagcgggttgacggcagggacagaggatacggatgcggtcaacttgagtcagttgaag
tcgatcagcgatacggtggataaggggtggacgctgacggcgtcaggtgccaatgggagc
aaagtggtctctggcggtgcggtggacctgaagaacacagatgggaatctgacgatcagc
aaatccggtgatagcaatgatgtggtgtttaacctgtccaaggatttcaaagtggatggg
atgacctcaggcaccacggtcgtgaataacgatggcgtgaaggtaggcactgatgttgcg
ttaggtacgacgggtttgacgattgccaatggtcctgcggtgactgcatcgggtattgat
gcgggcagcaaggtgattagccatgttgcggccggtgaggtgtcagagacgtcgacggat
gcggtgaacggctcgcagttgaatgcagtgcaagcgcaagccagtcagccggtaacgttt
agtggaaacgaaggctcggtgaaacggaccctgggtcaggcggtggtgattagtggtgaa
agtagtactgcggggacgtattcaggtgggaatttaaagagtgtggtggatgaagcagct
ggtgcgattcatttacaactggcggattctccgaagtttggcaatgtgttgatcaacaac
ggcggcaagatcagcgggttgacagcagggacagaggatacggatgcggtcaacttgagt
cagttgaagtcgatcagcgatacggtggataaggggtggacgctgacagcgtcaggtgcc
aatgggagcaaagtggtctctggcggtgcggtggacctgaagaacacagatgggaatctg
acgatcagcaaatccggtgatagcaatgatgtggtgtttaacctgtccaaggatttcaaa
gtggatgggatgacctcaggcaccacggtcgtgaataacgatggcgtgaaggtaggcact
gatgttgcgttaggtacgacgggtttgacgattgccaatggtcctgcggtgactgcatcg
ggtattgatgcgggcagcaaggtgattagccatgttgcggccggtgaggtgtcggagacg
tcgacggatgcggtgaacggctcgcagttgaatgcagtgcaagcgcaagccagtcagccg
gtaacgtttagtggaaacgaaggctcggtgaaacggaccctgggtcaggcggtggtgatt
agtggtgaaagcagtactgcggggacgtattcaggtgggaatttaaagagtgtggtggat
gaagcagctggtgcgattcatttacaactggcggattctccgaagtttggcaatgtgttg
atcaacaacggcggcaagattagcgggcttacggcagggacagaggatacggatgcggtc
aacttgagtcagttgaagtcgatcagcgatacggtggataaggggtggacgctgacagcg
tcaggtgccaatgggagcaaagtggtctctggcggtgcggtggacctgaagaacacagat
gggaatctgacgatcagcaaatccggtgatagcaatgatgtggtgtttaacctgtccaag
gatttcaaagtggatgggatgacctcaggcaccacggtcgtgaataacgatggcgtgaag
gtcggtagcgatgttgcgttaggtacgacgggtttgacgattaccaatggtcctgcggtg
actgcatcgggtattgatgcaggcagcaaggtgattagccatgtggcggccggtgaggtg
tcagagacgtcgacggatgcggtgaacggctcgcagttgaatgcagtgcaagcgcaagcc
agtcagccggtaacgtttagtggaaacgaaggctcggtgaaacggaccctgggtcaggcg
gtggtgattagtggtgaaagcagtactgcggggacgtattcaggtgggaatttaaagagt
gtggtggatgaagcagctggtgcgattcatttacaactggcggattctccgaagtttggc
aatgtgttgatcaacaacggcggcaagattagcgggcttacggcagggacagaggatacg
gatgcggtcaacttgagtcagttgaagtcgatcagcgatacggtggataaggggtggacg
ctgacagcgtcaggtgccaatgggagcaaagtggtctctggcggtgcggtggacctgaag
aacacagatgggaatctgacgatcagcaaatccggtgatagcaatgatgtggtgtttaac
ctgtccaaggatttcaaagtggatgggatgacctcaggcaccacggtcgtgaataacgat
ggcgtgaaggtaggcactgatgttgcgttaggtacgacgggtttgacgattgccaatggt
cctgcggtgactgcatcgggtattgatgcgggcagcaaggtgattagccatgttgcggcc
ggtgaggtgtcggagacgtcgacggatgcggtgaacggctcgcagttgaatgcagtgcaa
gcgcaagccagtcagccggtaacgtttagtggaaacgaaggctcggtgaaacggaccctg
ggtcaggcggtggtgattagtggtgaaagcagtactgcggggacgtattcaggtgggaat
ttgaagagtgtggtggatgaagcagctggtgcgattcatttacaactggcggattctccg
aagtttggcaatgtgttgatcaacaacggcggcaagattagcgggttgacggcagggaca
gaggatacggatgcggtcaacttgagtcagttgaagtcgatcagcgatacggtggataag
gggtggacgctgacagcgtcaggtgccaatgggagcaaagtggtctctggcggtgcggtg
gacctgaagaacacagatgggaatctgacgatcagcaaatccggtgatagcaatgatgtg
gtgtttaacctgtccaaggatttcaaagtggatgggatgacctcaggcaccacggtcgtg
aataacgatggcgtgaaggtcggtagcgatgttgcgttaggtacgacgggtttgacgatt
accaatggtcctgcggtgactgcatcgggtattgatgcgggcagcaaggtgattagccat
gtggcggccggtgaggtgtcagagacgtcgacggatgcggtgaacggctcgcagttgaat
gcagtgcaagcgcaagccagtcagccggtaacgtttagtggaaacgaaggctcggtgaaa
cggaccctgggtcaggcggtggtgatcagtggcgagagcagtactgcggggacgtattca
ggtgggaatttaaagagtgtggtggatgaagcggctggtgcgattcatttacaactggcg
gattctccgaagtttggcaatgtgttgatcaacaacggcggcaagattagcgggctgacg
gcagggacagaggatacggatgcggtcaacttgagtcagttgaagtcgatcagcgatacg
gtggataaggggtggacgctgacagcgtcaggtgccaatgggagcaaagtggtctctggy
ggtgcggtggacctgaagaacacagatgggaatctgacgatcagcaaatccggtgatagc
aatgatgtggtgtttaacctgtccaaggatttcaaagtggatgggatgacctcaggcacc
acggtcgtgaataacgatggcgtgaaggtcggtagcgatgttgcgttaggtacgacgggt
ttgacgattaccaatggtcctgcggtgactgcatcgggtattgatgcaggcagcaaggtg
attagccatgtggcggccggtgaggtgtcagagacgtcgacggatgcggtgaacggctcg
cagttgaatgcagtgcaagcgcaagccagtcagccggtaacgtttagtggaaacgaaggc
tcggtgaaacggaccctgggtcaggcggtggtgattagtggtgaaagcagtactgcgggg
acgtattcaggtgggaatttaaagagtgtggtggatgaagcrgctggtgcgattcattta
caactggcggattctccgaagtttggcaatgtgttgatcaacaacggcggcaagattagc
gggctkacggcagggacagaggatacggatgcggtcaacttgagtcagttgaagtcgatc
agcgatacggtggataaggggtggacgctgacagcgtcaggtgccaatgggagcaaagtg
gtctctggtggtgcggtggacctgaagaacacagatgggaatctgacgatcagcaaatcc
ggtgatagcaatgatgtggtgtttaacttgtctgaggatcttaaggagaaaagtgtaacg
gtgggtaacactcagctggacaaggatggggtgaaggtgagcagtgatgttttgctgaat
tctaagtcgttagtgattatgagccattcatccacttcatctgtcaagactttggaagat
ggagaaagtgttgttaacaggacggttgtgaatggcgatggtgtgaatattgatgatgtt
gttgttgttaatgatcttgggttatcaattgtcggtggggcgtcggttacgttgagtggt
atcaatgctggcagccataagatcactaatgtgacggcagggacggaggatacggatgcg
gtcaacttgagtcagttgaagtcggtcagcgaggcggttgataaggggtggacgttgacg
gcgtcgggtgccaatgggagcagtgtggtgtctggcggtacggtggatctgaagaatacg
gatgggaatctgacgatcagtaaatccagcgatagcaatgatgtggtgtttaacctgtcc
aaggatttcaaagtggatggggtgactgcaggcaatactgtggtgaacaccgatggtgtg
aaggtgggtagcgatgtttcgttgggtgcaatgggattattcattgctaatggaccttcg
gtgacggcttcagggttcaatgcgggtgacaaagtcatcagccatgttgcagtgggtatg
gcagatacagatgcggttaacgtcagtcaattgaagcaggcagtacagaatgtgagtgtc
aaagcgactcgctattacagtacgaatgatggtggcacccagggaggtaactatgatggt
gatggtgcgacaggcagtaaggctgtcgcggccggtgttggtacgcaggcatctggtgaa
ggggcgacagcggtgggatctggtgctgcttcgagtggcaaaggttctacggcgattggc
cgtaatgcgattgctagtgctgatggcagtgtggctttgggtgatggtgcaaaggatggt
gggcgtggtgcagaaagttacactgggaaatattcaggtgtacagaacaatacgatggga
actgtttcggtaggtgatgctgctaagggggaaacccgttcgatcagtaatgtggctgat
gctaaggaggagacggatgcggtgaatttgcgccagcttgatgctgtggcccagaagtca
aatcttcaaacggatgatatgaggcatgagatcaataatatagaggatgtttttaaggtc
actaaaggtgacagtactccaagtgttaaagggatgggggtcaatgcgatggccattggt
accaatgctgcagtttcaggtacagatagtgttgcgttgggtaagaatacgaatgtgtct
gctgataatgcggttgctattggtaatgattcagtagctgaccgcgcaaacagtgtttcg
gtgggatctgcgggttctcagaggcaggtgacgaatgtggctgcaggcactgctgatacg
gatgcggtcaatgtaagtcaactcaatcaaggcttgatcactgccaagcagtacacggat
gggatggtagggaatctccgtagggagactaacgggggtgtggccgcagcgattgcgacg
gcaaatctcccgcaggcttatgttcagggacgagggatgacctctgttggagtcagtagt
tatcagggtcagtcggcgattgcggtgggtgtttcagcggtttctgacagtgggcattgg
gtgttcaagttcagtggtagtgcgaatacccgtagtcacgtgggtgtaggtgcaggtgtg
ggttatcagtggtga
DBGET
integrated database retrieval system
